Research output per year
Research output per year
Equipments Details
Description
DNA-sekvenointiin ja genomiikkaan liittyvien tutkimuspalveluiden tuottaminen paikallisesti ja kansallisesti. Pääaktiviteetteina ovat DNA-sekvenointi, DNA-mikrosirut sekä edellisiin teknologioihin liittyvä bioinformatiikka. Palveluina yksikkö tarjoaa DNA-sekvensointipalveluita sekä perinteisillä kapil-laarisekvensointitekniikoilla että toisen (454, SOLiD, Illumina) ja kolmannen sukupolven (PacBio) laitteistoilla. Teemme myös DNA eristyksiä mikrotiterlevyformaatissa sekä muita tätä tukevia palveluita, joissa hyödynnetään robotiikkaa. Yksikkö valmistaa, kasvattaa ja organisoi suuria kloonikirjastoja. SNP tyypitystä voidaan tehdä käyttäen Illumina bead-menetelmää. Yksikkö on keskeinen palvelun tuottaja Viikin kampuksella genomiikan, funktionaalisen genomiikan, metagenomiikan ja integratiivisen biologian aloilla.
Type of research infrastructure
- Service
- Equipment
Fields of Science and Free Keywords
- 3111 Biomedicine
- 1182 Biochemistry, cell and molecular biology
- 1184 Genetics, developmental biology, physiology
UH research infrastructure classification
- Core Facility
Research output
- 7 Article
-
Complete mitochondrial genome sequence of the Agaricomycetes brown rot fungus Fomitopsis pinicola isolate FBCC1181
Österman-Udd, J. & Lundell, T., Dec 2023, In: Microbiology Resource Announcements. 12, 12, 3 p.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile -
Microbial communities of Cladonia lichens and their biosynthetic gene clusters potentially encoding natural products
Shishido, T. K., Wahlsten, M., Laine, P., Rikkinen, J., Lundell, T. & Auvinen, P., 22 Jun 2021, In: Microorganisms. 9, 7, 21 p., 1347.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile -
Genome description of Phlebia radiata 79 with comparative genomics analysis on lignocellulose decomposition machinery of phlebioid fungi
Mäkinen, M., Kuuskeri, J., Laine, P., Smolander, O.-P., Kovalchuk, A., Zeng, Z., Asiegbu, F., Paulin, L., Auvinen, P. & Lundell, T., 28 May 2019, In: BMC Genomics. 20, 22 p., 430.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile
-
MOMENT: Museums, morphology, and molecules: new ways of evolution education
Poczai, P. (Principal Investigator), Rikkinen, J. (Participant), Shishido, T. K. (Participant), Miettinen, O. (Principal Investigator), Viner, I. (Principal Investigator), Kenessey, Z. V. (Participant), Deanna, R. (Participant), Volkov, R. (Participant) & Dall’Agnol, L. T. (Participant)
31/08/2023 → 31/12/2025
Project: Other funder
-
Genome, transcriptome and proteome of the wood-decay fungus Phlebia radiata
Lundell, T. (Project manager), Kuuskeri, J. (Participant), Mäkinen, M. (Participant), Paulin, L. (Participant), Laine, P. (Participant), Smolander, O.-P. (Participant), Varjosalo, M. (Participant) & Auvinen, P. (Participant)
03/01/2011 → 31/12/2017
Project: Research project