Advancing microbiome research with machine learning: key findings from the ML4Microbiome COST action

D'Elia, D., Truu, J., Lahti, L., Berland, M., Papoutsoglou, G., Ceci, M., Zomer, A., Lopes, M. B., Ibrahimi, E., Gruca, A., Nechyporenko, A., Frohme, M., Klammsteiner, T., Pau, E. C. S., Marcos-Zambrano, L. J., Hron, K., Pio, G., Simeon, A., Suharoschi, R., Moreno-Indias, I., & 21 othersTemko, A., Nedyalkova, M., Apostol, E-S., Truica, C-O., Shigdel, R., Telalovic, J. H., Bongcam-Rudloff, E., Przymus, P., Jordamovic, N. B., Falquet, L., Tarazona, S., Sampri, A., Isola, G., Perez-Serrano, D., Trajkovik, V., Klucar, L., Loncar-Turukalo, T., Havulinna, A. S., Jansen, C., Bertelsen, R. J. & Claesson, M. J., 25 Sep 2023, In: Frontiers in Microbiology. 14, 8 p., 1257002.

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

Data Resource Profile: Nationwide registry data for high-throughput epidemiology and machine learning (FinRegistry)

Finn Gen, Viippola, E., Kuitunen, S., Rodosthenous, R. S., Vabalas, A., Hartonen, T., Vartiainen, P., Demmler, J., Vuorinen, A-L., Liu, A., Havulinna, A. S., Llorens, V., Detrois, K. E., Wang, F., Ferro, M., Karvanen, A., German, J., Jukarainen, S., Gracia-Tabuenca, J., Hiekkalinna, T., & 12 othersKoskelainen, S., Kiiskinen, T., Lahtela, E., Lemmelä, S., Paajanen, T., Siirtola, H., Reeve, M. P., Kristiansson, K., Brunfeldt, M., Aavikko, M., Perola, M. & Ganna, A., 2 Aug 2023, In: International Journal of Epidemiology. 52, 4, p. e195–e200 6 p.

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

Genetic predictors of lifelong medication-use patterns in cardiometabolic diseases

Kiiskinen, T., Helkkula, P., Krebs, K., Karjalainen, J., Saarentaus, E., Mars, N., Lehisto, A., Zhou, W., Cordioli, M., Jukarainen, S., Rämö, J. T., Mehtonen, J., Veerapen, K., Räsänen, M., Ruotsalainen, S., Maasha, M., Niiranen, T., Tuomi, T., Salomaa, V., Kurki, M., & 7 othersPirinen, M., Palotie, A., Daly, M., Ganna, A., Havulinna, A. S., Milani, L. & Ripatti, S., Jan 2023, In: Nature Medicine. 29, 1, p. 209–218 28 p.

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

Genome-wide screen of otosclerosis in population biobanks: 27 loci and shared associations with skeletal structure

FinnGen, Rämö, J. T., Kiiskinen, T., Seist, R., Krebs, K., Kanai, M., Karjalainen, J., Kurki, M., Hämäläinen, E., Häppölä, P. S., Havulinna, A. S., Hautakangas, H., Mägi, R., Palta, P., Esko, T., Metspalu, A., Pirinen, M. J., Karczewski, K. J., Ripatti, S., Milani, L. M., & 4 othersStankovic, K., Mäkitie, A., Daly, M. & Palotie, A., 18 Jan 2023, In: Nature Communications. 14, 1, 14 p., 157.

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

Greengenes2 unifies microbial data in a single reference tree

McDonald, D., Jiang, Y., Balaban, M., Cantrell, K., Zhu, Q., Gonzalez, A., Morton, J. T. T., Nicolaou, G., Parks, D. H. H., Karst, S. M., Albertsen, M., Hugenholtz, P., DeSantis, T., Song, S. J., Bartko, A., Havulinna, A. S. S., Jousilahti, P., Cheng, S., Inouye, M., Niiranen, T., & 5 othersJain, M., Salomaa, V., Lahti, L., Mirarab, S. & Knight, R., Jul 2023, (E-pub ahead of print) In: Nature Biotechnology. 10 p.

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review