Research output per year
Research output per year
Personal profile
Fields of Science
- 3122 Cancers
- Immuno-Oncology
- Bioinformatics
- Systems biology
Collaborations and top research areas from the last five years
Recent external collaboration on country/territory level. Dive into details by clicking on the dots or
-
A spatially resolved multi-omics atlas of tertiary lymphoid structures in ovarian cancer
Liang, Z., Junquera, A., Elomaa, H., Sarkkinen, J., Niemiec, I., Kang, Z., Lehtonen, O., Maltrovsky, L., Shah, S., Shabanova, A., Salko, M., Haltia, U.-M., Kekäläinen, E., Virtanen, A. & Färkkilä, A., 3 Apr 2026, In: Cancer Research. 86, 7, 1 p., 2220.Research output: Contribution to journal › Meeting Abstract › peer-review
-
Ex Vivo Immuno-Oncology Platform Reveals Spatial T-cell Infiltration Patterns Linked to ATR Inhibition Responses in High-Grade Serous Ovarian Cancer
Sakrepatna Nagaraj, A., Salko, M., Sirsikar, A., Kang, Z., Erkan, E. P., Pietilä, E. A., Niemiec, I., Bao, J., Marchi, G., Szabó, A., Hincapié-Otero, M., Lundgren, A., Nowlan, K., Pikkusaari, S., Kanerva, A., Tapper, J., Koivisto-Korander, R., Lassus, H., Kauppi, L. & Hautaniemi, S. & 8 others, , 2 Apr 2026, In: Cancer immunology research. 14, 4, p. 625-639 15 p.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile -
Integrating histopathology, spatial proteomics, and transcriptomics to uncover mechanisms of regression in cervical intraepithelial neoplasia grade 2
Anttila, E. A., Guruprasad, N., Lehtonen, J. O., Zhang, K., Liang, Z., Shah, S., Bergqvist, L., Aro, K., Niemiec, I., Hautaniemi, S., Kalliala, I., Färkkilä, A. & Vähärautio, A., 17 Feb 2026. 1 p.Research output: Conference materials › Abstract › peer-review
-
Kasvaimen MHC II -ilmentyminen ohjaa munasarjasyövän ennustetta ja immuunivastetta = Single-cell spatial atlas of high-grade serous ovarian cancer uncovers MHC class II as a key predictor of spatial tumor ecosystems and clinical outcomes
Perez-Villatoro, F., Shabanova, A., Van Wagensveld, L., Junquera, A., Niemiec, I., Hincapié-Otero, M. M., Kang, Z., Falco, M. M., Birgin, K., Wolf, S., Anttila, E. A., Anandagoda, G., Casado, J., Marcus, E., Gaillard, D., Kahelin, E., Chamchougia, F., Salko, M., Shah, S. & Russo, S. & 14 others, , 2026, In: Duodecim. 142, 6, p. 115-116 2 p.Research output: Contribution to journal › Comment/debate › Professional
-
Single-cell spatial atlas of high-grade serous ovarian cancer uncovers MHC class II as a key predictor of spatial tumor ecosystems and clinical outcomes
iCAN, Perez-Villatoro, F., Shabanova, A., van Wagensveld, L., Junquera, A., Niemiec, I., Hincapié-Otero, M. M., Kang, Z., Falco, M. M., Birgin, K., Wolf, S., Anttila, E., Anandagoda, G., Casado, J., Marcus, E., Gaillard, D., Kahelin, E., Chamchougia, F., Salko, M. & Shah, S. & 15 others, , 9 Feb 2026, In: Cancer Discovery. 16, 6, p. 1100-1125 26 p.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile
-
EU_ERC_Färkkilä Anniina_Space_101076096
Färkkilä, A. (Project manager), Birgin, K. (Participant), Chamchougia, F. (Participant), Chernenko, A. (Participant), Deb, D. (Participant), Elomaa, A. E. (Participant), Elomaa, H. K. (Participant), Guruprasad, N. (Participant), Hincapie Otero, M. M. (Participant), Jukonen, J. J. J. (Participant), Junquera Mencía, A. (Participant), Kaislo, V. E. E. (Participant), Kang, Z. (Participant), Mikhailava, N. (Participant), Niemiec, I. (Participant), Osara, E. A. (Participant), Palomino Echeverria, S. (Participant), Perez Villatoro, F. R. (Participant), Ruuska, E. A. (Participant), Shah, S. (Participant) & Toivanen, A. I. (Participant)
European Commision Joint Research Centre
01/02/2023 → 31/01/2028
Project: The European Research Council (ERC)
-
iCAN - Digital precision cancer medicine for discoveries and improved treatments
Mäkelä, T. (Project manager), Adhikari, S. (Participant), Aldahdooh, J. M. F. (Participant), Ariotta, V. (Participant), Arjama, M. A. (Participant), Atarsaikhan, G. (Participant), Bao, J. (Participant), Barreiro, K. (Participant), Bhalke, M. S. (Participant), Bollepalli, S. (Participant), Brandt, J. A. J. (Participant), Chernenko, A. (Participant), Dashi, G. (Participant), Eloranta, K. (Participant), Eriksson, M. R. (Participant), Feodoroff, M. J. (Participant), Fey, E. (Participant), Gerber, L. J. (Participant), Grönholm, M. (Participant), Hannula, S. A. (Participant), Heistman, V. (Participant), Henriksson, M. E. J. (Participant), Hiitola, E. T. J. (Participant), Huttunen, A. T. (Participant), Hyyppä, S. P. P. (Participant), Högel-Starck, C. S. P. (Participant), Ianevski, A. (Participant), Ikonen, N. (Participant), Jansouz, S. (Participant), Jha, S. (Participant), Junquera Mencía, A. (Participant), Kalashnikov, I. (Participant), Kampanellou, E. (Participant), Karabayev, D. (Participant), Karhemo, P.-R. (Participant), Karling, T. S. (Participant), Kekkonen, J. (Participant), Kolikova, Y. (Participant), Krami Senhaji, O. (Participant), Kuijjer, M. (Participant), Kuisma-van der Linden, M. S. (Participant), Kumari, R. (Participant), Kuosmanen, A. (Participant), Kurki, V. (Participant), Kuusela, S. (Participant), Kücükel, H. (Participant), Langohr, L. (Participant), Lavikka, K. A. (Participant), Le Joncour, V. (Participant), Lehto, T.-P. (Participant), Leivonen, S.-K. (Participant), Liljeström, M. (Participant), Lindfors, I. S. (Participant), Lindgren, H. (Participant), Luck, T. J. (Participant), Lähdeniemi, I. A. K. (Participant), Maarala, A. I. (Participant), Maljanen, K. J. (Participant), Marchi, G. (Participant), Martikainen, E. M. (Participant), Meriranta, L. (Participant), Metsäranta, N. A. C. (Participant), Miihkinen, M. S. (Participant), Moradi, N. (Participant), Nader, K. M. (Participant), Nagaraj, A. (Participant), Nguyen, M. (Participant), Niemeyer, F. (Participant), Niemiec, I. (Participant), Nylén, M. M. (Participant), Palin, K. (Participant), Palva, A. (Participant), Parsons, A. O. (Participant), Peltonen, J. H. H. (Participant), Perez Villatoro, F. R. (Participant), Pietiäinen, V. (Participant), Pirinen, I. E. (Participant), Pirttikoski, A. A. (Participant), Pitko, I. M. (Participant), Polianskyte-Prause, Z. (Participant), Puhka, M. (Participant), Quintero, I. B. (Participant), Rachidi, S. E. (Participant), Rajalaakso, M. T. (Participant), Rodosthenous, R. (Participant), Saad, J. (Participant), Sanjaya, P. (Participant), Seppälä, T. T. (Participant), Seref Vujaklija, C. (Participant), Shah, S. (Participant), Sorri, S. P. (Participant), Suni, V. (Participant), Suutala, A. (Participant), Suvela, M. (Participant), Sysivirta, L. K. M. (Participant), Udayani, J. E. (Participant), Verkasalo, H. M. (Participant), Viiri, L. E. (Participant), Vilkkavaara Cancocak, Y. (Participant), Vähärautio, A. (Participant), Vänttinen, I. M. (Participant), Västrik, I. (Participant), Väänänen, J. (Participant), Wang, W. (Participant) & Zhang, X. (Participant)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Academy of Finland
01/09/2022 → 31/12/2026
Project: Research Council of Finland: Finnish Flagship Programme
-
Discovery and therapeutic exploitation of immunological vulnerabilities in ovarian cancer
Färkkilä, A. (Project manager), Kang, Z. (Participant), Niemiec, I. (Participant), Nagaraj, A. (Participant), Perez Villatoro, F. R. (Participant), Chernenko, A. (Participant) & Shah, S. (Participant)
01/01/2021 → 31/12/2023
Project: University of Helsinki Three-Year Research Project