Research output per year
Research output per year
Personal profile
Fields of Science
- 3111 Biomedicine
Collaborations and top research areas from the last five years
Recent external collaboration on country/territory level. Dive into details by clicking on the dots or
-
Computational drug repurposing: approaches, evaluation of in silico resources and case studies
Tanoli, Z., Fernandez-Torras, A., Özcan, U. O., Kushnir, A., Nader, K. M., Gadiya, Y., Fiorenza, L., Ianevski, A., Vähä-Koskela, M., Miihkinen, M., Seemab, U., Leinonen, H., Seashore-Ludlow, B., Tampere, M., Kalman, A., Ballante, F., Benfenati, E., Saunders, G., Potdar, S. & Garcia, I. G. & 23 others, , Jul 2025, In: Nature Reviews Drug Discovery. 24, 7, p. 521-542 22 p.Research output: Contribution to journal › Review Article › peer-review
-
RepurposeDrugs: an interactive web-portal and predictive platform for repurposing mono- and combination therapies
Ianevski, A., Kushnir, A., Nader, K., Miihkinen, M., Xhaard, H., Aittokallio, T. & Tanoli, Z., 1 Jul 2024, In: Briefings in Bioinformatics. 25, 4, bbae328.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile -
ScType enables fast and accurate cell type identification from spatial transcriptomics data
Nader, K., Tasci, M., Ianevski, A., Erickson, A., Verschuren, E. W., Aittokallio, T. & Miihkinen, M., 10 Jul 2024, In: Bioinformatics. 40, 7, 4 p., btae426.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile -
Single-cell transcriptomes identify patient-tailored therapies for selective co-inhibition of cancer clones
Ianevski, A., Nader, K., Driva, K., Senkowski, W., Bulanova, D., Moyano-Galceran, L., Ruokoranta, T., Kuusanmäki, H., Ikonen, N., Sergeev, P., Vähä-Koskela, M., Giri, A. K., Vähärautio, A., Kontro, M., Porkka, K., Pitkänen, E., Heckman, C. A., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., Dec 2024, In: Nature Communications. 15, 1, 16 p., 8579.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
Open AccessFile
-
EU HE/RIA/Aittokallio/REMEDI4ALL
Aittokallio, T. (Project manager), Nader, K. M. (Participant), Schulman, A. (Participant) & Tanoli, Z. (Participant)
01/09/2022 → 31/08/2027
Project: EU Horizon Europe: Research and Innovation Actions (HORIZON-RIA)
-
iCAN - Digital precision cancer medicine for discoveries and improved treatments
Mäkelä, T. (Project manager), Adhikari, S. (Participant), Aldahdooh, J. M. F. (Participant), Ariotta, V. (Participant), Arjama, M. A. (Participant), Atarsaikhan, G. (Participant), Bao, J. (Participant), Barreiro, K. (Participant), Bhalke, M. S. (Participant), Bollepalli, S. (Participant), Brandt, J. A. J. (Participant), Chernenko, A. (Participant), Dashi, G. (Participant), Eloranta, K. (Participant), Eriksson, M. R. (Participant), Feodoroff, M. J. (Participant), Fey, E. (Participant), Gerber, L. J. (Participant), Grönholm, M. (Participant), Hannula, S. A. (Participant), Heistman, V. (Participant), Henriksson, M. E. J. (Participant), Hiitola, E. T. J. (Participant), Huttunen, A. T. (Participant), Hyyppä, S. P. P. (Participant), Högel-Starck, C. S. P. (Participant), Ianevski, A. (Participant), Ikonen, N. (Participant), Jansouz, S. (Participant), Jha, S. (Participant), Junquera Mencía, A. (Participant), Kalashnikov, I. (Participant), Kampanellou, E. (Participant), Karabayev, D. (Participant), Karhemo, P.-R. (Participant), Karling, T. S. (Participant), Kekkonen, J. (Participant), Kolikova, Y. (Participant), Krami Senhaji, O. (Participant), Kuisma-van der Linden, M. S. (Participant), Kumari, R. (Participant), Kuosmanen, A. (Participant), Kurki, V. (Participant), Kuusela, S. (Participant), Kücükel, H. (Participant), Langohr, L. (Participant), Lavikka, K. A. (Participant), Le Joncour, V. (Participant), Lehto, T.-P. (Participant), Leivonen, S.-K. (Participant), Liljeström, M. (Participant), Lindfors, I. S. (Participant), Lindgren, H. (Participant), Luck, T. J. (Participant), Lähdeniemi, I. A. K. (Participant), Maarala, A. I. (Participant), Maljanen, K. J. (Participant), Marchi, G. (Participant), Martikainen, E. M. (Participant), Meriranta, L. (Participant), Metsäranta, N. A. C. (Participant), Miihkinen, M. S. (Participant), Moradi, N. (Participant), Nader, K. M. (Participant), Nagaraj, A. (Participant), Nguyen, M. (Participant), Niemeyer, F. (Participant), Niemiec, I. (Participant), Nylén, M. M. (Participant), Palin, K. (Participant), Palva, A. (Participant), Parsons, A. O. (Participant), Perez Villatoro, F. R. (Participant), Pietiäinen, V. (Participant), Pirinen, I. E. (Participant), Pirttikoski, A. A. (Participant), Pitko, I. M. (Participant), Polianskyte-Prause, Z. (Participant), Puhka, M. (Participant), Quintero, I. B. (Participant), Rachidi, S. E. (Participant), Rajalaakso, M. T. (Participant), Rodosthenous, R. (Participant), Saad, J. (Participant), Sanjaya, P. (Participant), Seppälä, T. T. (Participant), Seref Vujaklija, C. (Participant), Shah, S. (Participant), Sorri, S. P. (Participant), Suni, V. (Participant), Suutala, A. (Participant), Suvela, M. (Participant), Sysivirta, L. K. M. (Participant), Udayani, J. E. (Participant), Verkasalo, H. M. (Participant), Viiri, L. E. (Participant), Vilkkavaara Cancocak, Y. (Participant), Vähärautio, A. (Participant), Vänttinen, I. M. (Participant), Västrik, I. (Participant), Väänänen, J. (Participant), Wang, W. (Participant) & Zhang, X. (Participant)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Academy of Finland
01/09/2022 → 31/12/2026
Project: Research Council of Finland: Finnish Flagship Programme
-
MASF: Koneoppiminen systeemifarmakologiassa
Aittokallio, T. (Project manager), Bentz, F. J. (Participant), Ianevski, A. (Participant), Ianevski, F. (Participant), Kumar, A. (Participant), Linnavirta, N. M. M. (Participant), Nader, K. M. (Participant) & Tanoli, Z. (Participant)
SUOMEN AKATEMIA Vähäkylä Leena
01/09/2021 → 31/08/2025
Project: Research Council of Finland: Academy Project
-
AIB: Tekoälyteknologioita vuorovaikutusten ennustamiseen biolääketieteessä
Aittokallio, T. (Project manager), Bentz, F. J. (Participant), Dias, D. A. A. (Participant), Gorbonos, A. (Participant), Ianevski, A. (Participant), Linnavirta, N. M. M. (Participant), Nader, K. M. (Participant), Schulman, A. (Participant) & Tanoli, Z. (Participant)
01/01/2022 → 31/12/2024
Project: Research Council of Finland: Targeted Academy Project