Mary Patricia Reeve

Publications

Research output per year 2021 2023 2024 2024

• 11 Article
• 4 Conference contribution

Research output per year

Research output per year

Search results

• 2024

  Designing complex network visualisations using the wayfinding map metaphor

  Cerioli, N., Vyas, R., Reeve, M. P. & Masoodian, M., 2024, In: Information Visualization. 20 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Distinct and shared genetic architectures of gestational diabetes mellitus and type 2 diabetes

  Estonian Biobank Res Team, Elliott, A., Walters, R. K., Pirinen, M., Kurki, M., Junna, N., Goldstein, J. I., Reeve, M. P., Siirtola, H., Lemmelä, S. M., Turley, P., Lahtela, E., Mehtonen, J., Reis, K., Elnahas, A. G., Reigo, A., Palta, P., Esko, T., Magi, R. & Metspalu, A. & 8 others, Nelis, M., Milani, L., Hudjashov, G., Siirtola, H., Lahtinen, E., Palotie, A., Daly, M. J. & Widen, E., 2024, In: Nature Genetics. 56, p. 377–382 10 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Mechanisms of thyrotropin receptor-mediated phenotype variability deciphered by gene mutations and M453T-knockin model

  FinnGen, Makkonen, K., Jännäri, M., Crisostomo, L., Kuusi, M., Patyra, K., Melnyk, V., Linnossuo, V., Ojala, J., Ravi, R., Lof, C., Mäkelä, J.-A., Miettinen, P., Laakso, S., Ojaniemi, M., Jääskeläinen, J., Laakso, M., Bossowski, F., Sawicka, B. & Stozek, K. & 5 others, Bossowski, A., Kleinau, G., Scheerer, P., Reeve, M. P. & Kero, J., 9 Jan 2024, In: JCI INSIGHT. 9, 4, 22 p., e167092.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Oral and non-oral lichen planus show genetic heterogeneity and differential risk for autoimmune disease and oral cancer

  FinnGen, Reeve, M. P., Vehviläinen, M., Luo, S., Ritari, J., Karjalainen, J., Gracia-Tabuenca, J., Mehtonen, J., Padmanabhuni, S. S., Kolosov, N., Artomov, M., Siirtola, H., Olilla, H. M., Graham, D., Partanen, J., Xavier, R. J., Daly, M. J., Ripatti, S., Salo, T. & Siponen, M., 6 Jun 2024, In: American Journal of Human Genetics. 111, 6, p. 1047-1060 14 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Towards global model generalizability: independent cross-site feature evaluation for patient-level risk prediction models using the OHDSI network

  Naderalvojoud, B., Curtin, C., Yanover, C., El-Hay, T., Choi, B., Park, R., Tabuenca, J., Reeve, M., Falconer, T., Humphreys, K., Asch, S. & Hernandez-Boussard, T., 27 Feb 2024, In: Journal of the American Medical Informatics Association. 11 p., ocae028.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

• Zoomable Heatmaps: Improving Manhattan Plots to Compare Multiple Genome-Wide Studies

  Simeoni, F., Cerioli, N., Daly, M., Reeve, M. P., Vyas, R. & Masoodian, M., 2024, Design for Equality and Justice - INTERACT 2023 IFIP TC 13 Workshops, 2023, Revised Selected Papers, Part II. Bramwell-Dicks, A., Evans, A., Petrie, H., Winckler, M. & Abdelnour-Nocera, J. (eds.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, p. 147-162 16 p. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); vol. 14536 LNCS).

  Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Scientific › peer-review
• 2023

  Data Resource Profile: Nationwide registry data for high-throughput epidemiology and machine learning (FinRegistry)

  Finn Gen, Viippola, E., Kuitunen, S., Rodosthenous, R. S., Vabalas, A., Hartonen, T., Vartiainen, P., Demmler, J., Vuorinen, A.-L., Liu, A., Havulinna, A. S., Llorens, V., Detrois, K. E., Wang, F., Ferro, M., Karvanen, A., German, J., Jukarainen, S., Gracia-Tabuenca, J. & Hiekkalinna, T. & 15 others, Koskelainen, S., Kiiskinen, T., Lahtela, E., Lemmelä, S., Paajanen, T., Siirtola, H., Reeve, M. P., Kristiansson, K., Brunfeldt, M., Aavikko, M., Perola, M., Ganna, A., Kaprio, J., Mäkitie, A. & Tienari, P., 2 Aug 2023, In: International Journal of Epidemiology. 52, 4, p. e195–e200 6 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Evidence of a causal effect of genetic tendency to gain muscle mass on uterine leiomyomata

  Sliz, E., Tyrmi, J. S., Rahmioglu, N., Zondervan, K. T., Becker, C. M., Uimari, O., Kettunen, J., Palotie, A., Daly, M., Riley-Gills, B., Jacob, H., Paul, D., Matakidou, A., Platt, A., Runz, H., John, S., Okafo, G., Lawless, N., Salminen-Mankonen, H. & Plenge, R. & 306 others, Maranville, J., McCarthy, M., Ehm, M. G., Auro, K., Longerich, S., Fox, C., Malarstig, A., Klinger, K., Chatelain, C., Gossel, M., Estrada, K., Graham, R., Yang, R., O'Donnell, C., Mäkelä, T. P., Kaprio, J., Virolainen, P., Hakanen, A., Kilpi, T., Perola, M., Partanen, J., Pitkäranta, A., Raivio, T., Serpi, R., Laitinen, T., Kosma, V.-M., Laukkanen, J., Hautalahti, M., Tuovila, O., Pakkanen, R., Waring, J., Riley-Gillis, B., Rahimov, F., Tachmazidou, I., Chen, C.-Y., Ding, Z., Jung, M., Biswas, S., Pendergrass, R., Pulford, D., Raghavan, N., Huertas-Vazquez, A., Sul, J.-H., Hu, X., Hedman, A., Rivas, M., Waterworth, D., Renaud, N., Obeidat, M., Ripatti, S., Schleutker, J., Arvas, M., Carpen, O., Hinttala, R., Mannermaa, A., Aalto-Setala, K., Kahonen, M., Mäkelä, J., Kalviainen, R., Julkunen, V., Soininen, H., Remes, A., Hiltunen, M., Peltola, J., Raivio, M., Tienari, P., Rinne, J., Kallionpaa, R., Partanen, J., Abbasi, A., Ziemann, A., Smaoui, N., Lehtonen, A., Eaton, S., Lahdenpera, S., Bowers, N., Teng, E., Xu, F., Addis, L., Eicher, J., Li, Q. S., He, K., Khramtsova, E., Färkkilä, M., Koskela, J., Pikkarainen, S., Jussila, A., Kaukinen, K., Blomster, T., Kiviniemi, M., Voutilainen, M., Lu, T., McCarthy, L., Hart, A., Guan, M., Miller, J., Kalpala, K., Miller, M., Eklund, K., Palomaki, A., Isomaki, P., Pirila, L., Kaipiainen-Seppanen, O., Huhtakangas, J., Mars, N., Lertratanakul, A., Hochfeld, M., Gordillo, J. E., Farias, F., Bing, N., Pelkonen, M., Kauppi, P., Kankaanranta, H., Harju, T., Lahesmaa, R., Lassi, G., Chen, H., Betts, J., Mishra, R., Mouded, M., Ngo, D., Niiranen, T., Vaura, F., Salomaa, V., Metsarinne, K., Aittokallio, J., Hernesniemi, J., Gordin, D., Sinisalo, J., Taskinen, M.-R., Tuomi, T., Elliott, A., Reeve, M. P., Ruotsalainen, S., Challis, B., Chu, A., Reilly, D., Mendelson, M., Parkkinen, J., Meretoja, T., Joensuu, H., Mattson, J., Salminen, E., Auranen, A., Karihtala, P., Auvinen, P., Elenius, K., Pitkänen, E., Popovic, R., Schutzman, J., Kulkarni, D., Porello, A., Loboda, A., Lehtonen, H., McDonough, S., Vuoti, S., Kaarniranta, K., Turunen, J. A., Ollila, T., Uusitalo, H., Karjalainen, J., Liu, M., Loomis, S., Strauss, E., Chen, H., Tasanen, K., Huilaja, L., Hannula-Jouppi, K., Salmi, T., Peltonen, S., Koulu, L., Choy, D., Wu, Y., Pussinen, P., Salminen, A., Salo, T., Rice, D., Nieminen, P., Palotie, U., Siponen, M., Suominen, L., Mäntylä, P., Gursoy, U., Anttonen, V., Sipila, K., Laivuori, H., Kurra, V., Kotaniemi-Talonen, L., Heikinheimo, O., Kalliala, I., Aaltonen, L., Jokimaa, V., Vaarasmaki, M., Morin-Papunen, L., Niinimaki, M., Piltonen, T., Kivinen, K., Widen, E., Tukiainen, T., Välimäki, N., Laakkonen, E., Silven, H., Arffman, R., Savukoski, S., Laisk, T., Pujol, N., Kumar, J., Hovatta, I., Isometsä, E., Ollila, H., Suvisaari, J., Als, T. D., Mäkitie, A., Bizaki-Vallaskangas, A., Toppila-Salmi, S., Willberg, T., Saarentaus, E., Aarnisalo, A., Rahikkala, E., Aittomaki, K., Åberg, F., Kurki, M., Havulinna, A., Mehtonen, J., Palta, P., Hassan, S., Parolo, P. D. B., Zhou, W., Maasha, M., Lemmela, S., Liu, A., Lehisto, A., Ganna, A., Llorens, V., Heyne, H., Rämö, J., Rodosthenous, R., Strausz, S., Palotie, T., Palin, K., Garcia-Tabuenca, J., Siirtola, H., Kiiskinen, T., Lee, J., Tsuo, K., Kristiansson, K., Hyvarinen, K., Ritari, J., Pylkas, K., Karjalainen, M., Mantere, T., Kangasniemi, E., Heikkinen, S., Pitkanen, N., Lessard, S., Chatelain, C., Terho, P., Wahlfors, T., Punkka, E., Siltanen, S., Kuopio, T., Jalanko, A., Shen, H.-Y., Kajanne, R., Aavikko, M., Palin, H., Linna, M.-M., Kanai, M., Zheng, Z., Lahtela, L. E., Kaunisto, M., Kilpeläinen, E., Sipila, T. P., Dada, O. A., Ghazal, A., Kytölä, A., Weldatsadik, R., Donner, K., Loukola, A., Laiho, P., Sistonen, T., Kaiharju, E., Laukkanen, M., Jarvensivu, E., Lahteenmaki, S., Mannikko, L., Wong, R., Toivola, A., Brunfeldt, M., Mattsson, H., Koskelainen, S., Hiekkalinna, T., Paajanen, T., Pärn, K., Kals, M., Luo, S., Padmanabhuni, S. S., Niemi, M., Gracia-Tabuenca, J., Helminen, M., Luukkaala, T., Vahatalo, I., Tammerluoto, J., Smith, S., Southerington, T. & Lehto, P., 1 Feb 2023, In: Nature Communications. 14, 542, 14 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• FinnGen provides genetic insights from a well-phenotyped isolated population

  FinnGen, Kurki, M. I., Karjalainen, J., Palta, P., Sipilä, T. P., Kristiansson, K., Donner, K. M., Reeve, M. P., Laivuori, H., Aavikko, M., Kaunisto, M. A., Loukola, A., Mattsson, H., Laiho, P., Della Briotta Parolo, P., Lehisto, A. A., Mars, N., Rämö, J., Kiiskinen, T. & Heyne, H. O. & 63 others, Rüeger, S., Lemmelä, S., Zhou, W., Ruotsalainen, S., Pärn, K., Hiekkalinna, T., Koskelainen, S., Paajanen, T., Llorens, V., Gracia-Tabuenca, J., Auro, K., Carpen, O., Dada, O. A., Eklund, K., Färkkilä, M., Ganna, A., Ghazal, A., Hovatta, I., Joensuu, H., Julkunen, V., Kajanne, R., Kaprio, J., Kettunen, J., Kilpeläinen, E., Kurra, V., Laukkanen, J., Liu, A., Mäkelä, J., Mäkitie, A., Meretoja, T., Niemi, M. E. K., Niemi, M., Niiranen, T., Ollila, H. M., Palomäki, A., Palotie, T., Partanen, J., Pelkonen, M., Pitkäranta, A., Punkka, E., Pussinen, P., Rodosthenous, R., Saarentaus, E., Salminen, A., Salminen, E., Shen, H.-Y., Silander, K., Soini, S., Tienari, P., Toppila-Salmi, S., Tukiainen, T., Tuomi, T., Turunen, J. A., Vaura, F., Havulinna, A. S., Perola, M., Ripatti, S., Jalanko, A., Laitinen, T., Mäkelä, T. P., Daly, M. J., Palotie, A. & Kanai, M., 19 Jan 2023, In: Nature. 613, 7944, p. 508-+ 20 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• LAVAA: a lightweight association viewer across ailments

  Fauman, E. B., Keppo, S., Cerioli, N., Vyas, R., Kurki, M., Daly, M. & Reeve, M. P., 2023, In: Bioinformatics advances. 3, 1, vbad018.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• LifeTrack : Decades of EHR Data in a Single View

  Siirtola, H., Raisamo, R., Reeve, M. P., Gracia-Tabuenca, J., Llorens, V. & Padmanabhuni, S. S., 2023, Proceedings - 2023 27th International Conference Information Visualisation, IV 2023. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., p. 390-395 6 p. (2023 27th International Conference Information Visualisation, Iv).

  Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Scientific › peer-review
• 2022

  Glyph-based visualization of health trajectories

  Siirtola, H., Gracia-Tabuenca, J., Raisamo, R., Niemi, M., Reeve, M. P. & Laitinen, T., 2022, Proceedings - 2022 26th International Conference Information Visualisation, IV 2022. IEEE, p. 418-425 8 p. (Proceedings of the International Conference on Information Visualisation; vol. 2022-July).

  Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Scientific › peer-review

• Mapping the Colocalization Network: A Wayfinding Approach to Interacting with Complex Network Diagrams

  Cerioli, N., Vyas, R., Reeve, M. P. & Masoodian, M., 2022, Proceedings - 2022 26th International Conference Information Visualisation, IV 2022. IEEE, p. 186-193 8 p. (Proceedings of the International Conference on Information Visualisation; vol. 2022-July).

  Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Scientific › peer-review
• 2021

  An expanded analysis framework for multivariate GWAS connects inflammatory biomarkers to functional variants and disease

  Ruotsalainen, S. E., Partanen, J. J., Cichonska, A., Lin, J., Benner, C., Surakka, I., Reeve, M. P., Palta, P., Salmi, M., Jalkanen, S., Ahola-Olli, A., Palotie, A., Salomaa, V., Daly, M. J., Pirinen, M., Ripatti, S. & Koskela, J., Feb 2021, In: European Journal of Human Genetics. 29, p. 309–324 16 p.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File

• Screening for Mutations in Isolated Central Hypothyroidism Reveals a Novel Mutation in Insulin Receptor Substrate 4

  Patyra, K., Makkonen, K., Haanpää, M., Karppinen, S., Viikari, L., Toppari, J., Reeve, M. P. & Kero, J., 21 May 2021, In: Frontiers in Endocrinology. 12, 7 p., 658137.

  Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

  Open Access

  File