• PL 63 (Haartmaninkatu 8)

    00014

    Finland

20112019
If you made any changes in Pure these will be visible here soon.

Publications 2011 2019

2019

Candidate susceptibility variants in angioimmunoblastic T-cell lymphoma

Donner, I., Katainen, R., Kaasinen, E., Aavikko, M., Sipilä, L. J., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., Jan 2019, In : Familial Cancer. 18, 1, p. 113-119 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File

Exome and immune cell score analyses reveal great variation within synchronous primary colorectal cancers

Hanninen, U. A., Wirta, E-V., Katainen, R., Tanskanen, T., Hamberg, J., Taipale, M., Böhm, J., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Forsström, L. M., Pitkänen, E., Palin, K., Seppälä, T. T., Mäkinen, N., Mecklin, J-P. & Aaltonen, L. A., 30 Apr 2019, In : British Journal of Cancer. 120, 9, p. 922-930 9 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Impact of constitutional TET2 haploinsufficiency on molecular and clinical phenotype in humans

Kaasinen, E., Kuismin, O., Rajamäki, K., Ristolainen, H., Aavikko, M., Kondelin, J., Saarinen, S., Berta, D. G., Katainen, R., Hirvonen, E. A. M., Karhu, A., Taira, A., Tanskanen, T., Alkodsi, A., Taipale, M., Morgunova, E., Franssila, K., Lehtonen, R., Mäkinen, M., Aittomäki, K. & 15 othersPalotie, A., Kurki, M., Pietiläinen, O., Hilpert, M., Saarentaus, E., Niinimäki, J., Junttila, J., Kaikkonen, K., Vahteristo, P., Skoda, R. C., Seppänen, M. R. J., Eklund, K. K., Taipale, J., Kilpivaara, O. & Aaltonen, L. A., 19 Mar 2019, In : Nature Communications. 10, 17 p., 1252.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File
2018

Comprehensive evaluation of coding region point mutations in microsatellite-unstable colorectal cancer

Kondelin, J., Salokas, K., Saarinen, L., Ovaska, K., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M., Hamberg, J., Liu, X., Yadav, L., Gylfe, A. E., Cajuso, T., Hänninen, U. A., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Tanskanen, T., Aavikko, M., Taipale, M., Taipale, J. & 17 othersRenkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Koskensalo, S., Böhm, J., Mecklin, J-P., Ongen, H., Dermitzakis, E. T., Kilpivaara, O., Vahteristo, P., Turunen, M., Hautaniemi, S., Tuupanen, S., Karhu, A., Välimäki, N., Varjosalo, M., Pitkänen, E. & Aaltonen, L. A., 2018, In : EMBO molecular medicine. 10, 9, 20 p., e8552.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File

Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer

Palin, K., Pitkänen, E., Turunen, M., Sahu, B., Pihlajamaa, P., Kivioja, T., Kaasinen, E., Välimäki, N., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Aavikko, M., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., van den Berg, L., Kondelin, J., Tanskanen, T., Katainen, R., Grau, M., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M. & 20 othersTaira, A., Sulo, P., Hartonen, T., Dave, K., Schmierer, B., Botla, S., Sokolova, M., Vähärautio, A., Gladysz, K., Ongen, H., Dermitzakis, E., Bramsen, J. B., Orntoft, T. F., Andersen, C. L., Ristimäki, A., Lepistö, A., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Taipale, J. & Aaltonen, L. A., 10 Sep 2018, In : Nature Communications. 9, 9 p., 3664.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File

Exome-wide somatic mutation characterization of small bowel adenocarcinoma

Hänninen, U. A., Katainen, R., Tanskanen, T., Plaketti, R-M., Laine, R., Hamberg, J., Ristimäki, A., Pukkala, E., Taipale, M., Mecklin, J-P., Forsström, L. M., Pitkänen, E., Palin, K., Välimäki, N., Mäkinen, N. & Aaltonen, L. A., Mar 2018, In : PLoS Genetics. 14, 3, 23 p., 1007200.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File

Germline mutations in young non-smoking women with lung adenocarcinoma

Donner, I., Katainen, R., Sipilä, L. J., Aavikko, M., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., Aug 2018, In : Lung Cancer. 122, p. 76-82 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File
2017

Candidate susceptibility variants for esophageal squamous cell carcinoma

Donner, I., Katainen, R., Tanskanen, T., Kaasinen, E., Aavikko, M., Ovaska, K., Artama, M., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., Jun 2017, In : Genes, Chromosomes & Cancer. 56, 6, p. 453-459 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Comprehensive Evaluation of Protein Coding Mononucleotide Microsatellites in Microsatellite-Unstable Colorectal Cancer

Kondelin, J., Gylfe, A. E., Lundgren, S., Tanskanen, T., Hamberg, J., Aavikko, M., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Jarvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Aaltonen, L. A. & Pitkanen, E., 1 Aug 2017, In : Cancer Research. 77, 15, p. 4078-4088 11 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File
Open Access
File

Systematic Analysis of Human Protein Phosphatase Interactions and Dynamics

Yadav, L., Tamene, F., Goos, H., van Drogen, A., Katainen, R., Aebersold, R., Gstaiger, M. & Varjosalo, M., 26 Apr 2017, In : Cell Systems. 4, 4, p. 430-+ 20 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

2015

AIP inactivation leads to pituitary tumorigenesis through defective G alpha(i)-cAMP signaling

Tuominen, I., Heliovaara, E., Raitila, A., Rautiainen, M-R., Mehine, M., Katainen, R., Donner, I., Aittomaki, V., Lehtonen, H. J., Ahlsten, M., Kivipelto, L., Schalin-Jantti, C., Arola, J., Hautaniemi, S. & Karhu, A., 26 Feb 2015, In : Oncogene. 34, 9, p. 1174-1184 11 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Autoimmunity, hypogammaglobulinemia, lymphoproliferation, and mycobacterial disease in patients with activating mutations in STAT3

Haapaniemi, E. M., Kaustio, M., Rajala, H. L. M., van Adrichem, A. J., Kainulainen, L., Glumoff, V., Doffinger, R., Kuusanmaki, H., Heiskanen-Kosma, T., Trotta, L., Chiang, S., Kulmala, P., Eldfors, S., Katainen, R., Siitonen, S., Karjalainen-Lindsberg, M-L., Kovanen, P. E., Otonkoski, T., Porkka, K., Heiskanen, K. & 7 othersHanninen, A., Bryceson, Y. T., Uusitalo-Seppala, R., Saarela, J., Seppanen, M., Mustjoki, S. & Kere, J., 22 Jan 2015, In : Blood. 125, 4, p. 639-648 10 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Clonally related uterine leiomyomas are common and display branched tumor evolution

Mehine, M., Heinonen, H-R., Sarvilinna, N., Pitkanen, E., Makinen, N., Katainen, R., Tuupanen, S., Butzow, R., Sjoberg, J. & Aaltonen, L. A., 1 Aug 2015, In : Human Molecular Genetics. 24, 15, p. 4407-4416 10 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer

Katainen, R., Dave, K., Pitkänen, E., Palin, K., Kivioja, T., Valimaki, N., Gylfe, A. E., Ristolainen, H., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Kondelin, J., Tanskanen, T., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Kaasinen, E., Kilpivaara, O., Tuupanen, S., Enge, M. & 2 othersTaipale, J. & Aaltonen, L. A., 1 Jul 2015, In : Nature Genetics. 47, 7, p. 818-+

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Systematic search for rare variants in Finnish early-onset colorectal cancer patients

Tanskanen, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Bohm, J., Kilpivaara, O., Pitkanen, E., Palin, K., Vahteristo, P., Tuupanen, S. & Aaltonen, L. A., 2015, In : Cancer Genetics. 208, 1-2, p. 35-U100 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

2014

Exome sequencing reveals frequent inactivating mutations in ARID1A, ARID1B, ARID2 and ARID4A in microsatellite unstable colorectal cancer

Cajuso Pons, T., Hänninen, U. A., Kondelin, J., Gylfe, A. E., Tanskanen, T., Katainen, R., Pitkanen, E., Ristolainen, H., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Bohm, J., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Jarvinen, H., Tuupanen, S., Kilpivaara, O. & Vahteristo, P., 1 Aug 2014, In : International Journal of Cancer. 135, 3, p. 611-623 13 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Frequent L1 retrotranspositions originating from TTC28 in colorectal cancer

Pitkanen, E., Cajuso Pons, T., Katainen, R., Kaasinen, E., Valimaki, N., Palin, K., Taipale, J., Aaltonen, L. A. & Kilpivaara, O., 2014, In : Oncotarget. 5, 3, p. 853-859 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Identification of 33 candidate oncogenes by screening for base-specific mutations

Tuupanen, S., Hanninen, U. A., Kondelin, J., von Nandelstadh, P., Cajuso, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Tanskanen, T., Ristolainen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Andersen, C. L., Taipale, M., Taipale, J., Vahteristo, P., Lehti, K., Pitkanen, E. & Aaltonen, L. A., 14 Oct 2014, In : British Journal of Cancer. 111, 8, p. 1657-1662 6 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera

Ahola, V., Lehtonen, R., Somervuo, P., Salmela, L., Koskinen, P., Rastas, P., Valimaki, N., Paulin, L., Kvist, J., Wahlberg, N., Tanskanen, J., Hornett, E. A., Ferguson, L. C., Luo, S., Cao, Z., de Jong, M. A., Duplouy, A., Smolander, O-P., Vogel, H., McCoy, R. C. & 27 othersQian, K., Wong, S. C., Zhang, Q., Ahmad, F., Haukka, J. K., Joshi, A., Salojarvi, J., Wheat, C. W., Grosse-Wilde, E., Hughes, D., Katainen, R., Pitkanen, E., Ylinen, J., Waterhouse, R. M., Turunen, M., Vaharautio, A., Ojanen, S. P., Schulman, A. H., Taipale, M., Lawson, D., Ukkonen, E., Makinen, V., Goldsmith, M. R., Holm, L., Auvinen, P., Frilander, M. J. & Hanski, I., Sep 2014, In : Nature Communications. 5, 9 p., 4737.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

2013

Characterization of Uterine Leiomyomas by Whole-Genome Sequencing

Mehine, M., Kaasinen, E., Mäkinen, N., Katainen, R., Kämpjärvi, K., Pitkänen, E., Heinonen, H-R., Butzow, R., Kilpivaara, O., Kuosmanen, A., Ristolainen, H., Gentile, M., Sjöberg, J., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 4 Jul 2013, In : New England Journal of Medicine. 369, 1, p. 43-53 11 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Eleven Candidate Susceptibility Genes for Common Familial Colorectal Cancer

Gylfe, A. E., Katainen, R., Kondelin, J., Tanskanen, T., Cajuso Pons, T., Hänninen, U., Taipale, J., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Kilpivaara, O., Pitkänen, E., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Karhu, A. & Aaltonen, L. A., 18 Oct 2013, In : PLoS Genetics. 9, 10, 8 p., e1003876.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Open Access
File

Exome sequencing in diagnostic evaluation of colorectal cancer predisposition in young patients

Tanskanen, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., Jun 2013, In : Scandinavian Journal of Gastroenterology. 48, 6, p. 672-678 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Identification of Candidate Oncogenes in Human Colorectal Cancers With Microsatellite Instability

Gylfe, A. E., Kondelin, J., Turunen, M., Ristolainen, H., Katainen, R., Pitkänen, E., Kaasinen, E., Rantanen, V., Tanskanen, T., Varjosalo, M., Lehtonen, H., Palin, K., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Ristimäki, A., Kilpivaara, O. & 4 othersTuupanen, S., Karhu, A., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., Sep 2013, In : Gastroenterology. 145, 3, p. 540-+ 26 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

Primary mediastinal large B-cell lymphoma segregating in a family: exome sequencing identifies MLL as a candidate predisposition gene

Saarinen, S., Kaasinen, E., Karjalainen-Lindsberg, M., Vesanen, K., Aavikko, M., Katainen, R., Taskinen, M., Kytola, S., Leppä, S. M., Hietala, M., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 25 Apr 2013, In : Blood. 121, 17, p. 3428-3430 3 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review

2011

MED12, the Mediator Complex Subunit 12 Gene, Is Mutated at High Frequency in Uterine Leiomyomas

Mäkinen, N., Mehine, M., Tolvanen, J., Kaasinen, E., Li, Y., Lehtonen, H. J., Gentile, M., Yan, J., Enge, M., Taipale, M., Aavikko, M., Katainen, R., Virolainen, E., Böhling, T., Koski, T. A., Launonen, V., Sjöberg, J., Taipale, J., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 2011, In : Science Progress. 334, 6053, p. 252-255 4 p.

Research output: Contribution to journalArticleScientificpeer-review