Open-Source Software Development in Cheminformatics: A Qualitative Analysis of Rationales

Johannes Pernaa; Aleksi Takala; Veysel Ciftci; José Hernández-Ramos; Lizethly Cáceres-Jensen; Jorge Rodríguez-Becerra

doi:10.3390/app13179516

Open-Source Software Development in Cheminformatics: A Qualitative Analysis of Rationales

Johannes Pernaa, Aleksi Takala, Veysel Ciftci, José Hernández-Ramos, Lizethly Cáceres-Jensen, Jorge Rodríguez-Becerra

Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review

Abstract

Tämä kvalitatiivinen tutkimus tutki keminformatiikan avoimen lähdekoodin kehityksen perusteita. Tavoitteena oli edistää avointa tiedettä kartoittamalla ja luokittelemalla syitä siihen, miksi keminformatiikan alalla tehdäön avoimen lähdekoodin sovelluskehitystä. Tämä aihe on tärkeä, koska keminformatiikalla on teollinen tausta ja avoin lähdekoodi on avainratkaisu edistämään cheminformatiikan kasvua itsenäisenä akateemisena alana. Aineisto koostui 87 tutkimusartikkelista, jotka analysoitiin kvalitatiivisella sisältöanalyysillä. Analyysi tuotti kuusi perusteluluokkaa: (1) uusien ohjelmistojen kehittäminen, (2) nykyisten ominaisuuksien, työkalujen tai prosessien päivittäminen, (3) käytettävyyden parantaminen, (4) avoimen lähdekoodin kehityksen ja avoimen tieteen tukeminen, (5) kemiallisten tietojen täyttäminen Tarvitsee ja (6) tukee kemian oppimista ja opetusta. Tätä luokittelua voidaan käyttää tulevien ohjelmistokehitysprojektien perustelujen suunnittelussa, mikä on yksi kemikaaliformatiikan suurimmista tutkimusalueista. Erityisesti on kehitettävä keminfirmatiikan koulutusta, jolle ohjelmistokehitys voi toimia mielenkiintoisena monitieteisenä viitekehyksenä.

Translated title of the contribution	Programvaruutveckling med öppen källkod inom kemiformatik: En kvalitativ analys av skäl
Original language	English
Article number	9516
Journal	Applied Sciences
Volume	13
Issue number	17
Number of pages	21
ISSN	1454-5101
DOIs	https://doi.org/10.3390/app13179516
Publication status	Published - Sept 2023
MoE publication type	A1 Journal article-refereed

Fields of Science

open source
cheminformatics
software development
qualitative research
content analysis
116 Chemical sciences

Access to Document

10.3390/app13179516Licence: CC BY

http://hdl.handle.net/10138/564392Licence: CC BY

1 Active

Cheminformatics in Science Education
Pernaa, J. (Principal Investigator), Aksela, M. (Participant) & Takala, A. M. J. (Project manager)
01/01/2021 → …
Project: Research project

Cite this

@article{2730dbcc01904e46b3b3df62ff415012,

title = "Open-Source Software Development in Cheminformatics: A Qualitative Analysis of Rationales",

abstract = "T{\"a}m{\"a} kvalitatiivinen tutkimus tutki keminformatiikan avoimen l{\"a}hdekoodin kehityksen perusteita. Tavoitteena oli edist{\"a}{\"a} avointa tiedett{\"a} kartoittamalla ja luokittelemalla syit{\"a} siihen, miksi keminformatiikan alalla tehd{\"a}{\"o}n avoimen l{\"a}hdekoodin sovelluskehityst{\"a}. T{\"a}m{\"a} aihe on t{\"a}rke{\"a}, koska keminformatiikalla on teollinen tausta ja avoin l{\"a}hdekoodi on avainratkaisu edist{\"a}m{\"a}{\"a}n cheminformatiikan kasvua itsen{\"a}isen{\"a} akateemisena alana. Aineisto koostui 87 tutkimusartikkelista, jotka analysoitiin kvalitatiivisella sis{\"a}lt{\"o}analyysill{\"a}. Analyysi tuotti kuusi perusteluluokkaa: (1) uusien ohjelmistojen kehitt{\"a}minen, (2) nykyisten ominaisuuksien, ty{\"o}kalujen tai prosessien p{\"a}ivitt{\"a}minen, (3) k{\"a}ytett{\"a}vyyden parantaminen, (4) avoimen l{\"a}hdekoodin kehityksen ja avoimen tieteen tukeminen, (5) kemiallisten tietojen t{\"a}ytt{\"a}minen Tarvitsee ja (6) tukee kemian oppimista ja opetusta. T{\"a}t{\"a} luokittelua voidaan k{\"a}ytt{\"a}{\"a} tulevien ohjelmistokehitysprojektien perustelujen suunnittelussa, mik{\"a} on yksi kemikaaliformatiikan suurimmista tutkimusalueista. Erityisesti on kehitett{\"a}v{\"a} keminfirmatiikan koulutusta, jolle ohjelmistokehitys voi toimia mielenkiintoisena monitieteisen{\"a} viitekehyksen{\"a}.",

keywords = "open source, cheminformatics, software development, qualitative research, content analysis, open source, cheminformatics, software development, qualitative research, content analysis, 116 Chemical sciences",

author = "Johannes Pernaa and Aleksi Takala and Veysel Ciftci and Jos{\'e} Hern{\'a}ndez-Ramos and Lizethly C{\'a}ceres-Jensen and Jorge Rodr{\'i}guez-Becerra",

year = "2023",

month = sep,

doi = "10.3390/app13179516",

language = "English",

volume = "13",

journal = "Applied Sciences",

issn = "1454-5101",

publisher = "Politechnica University of Bucharest",

number = "17",

}

TY - JOUR

T1 - Open-Source Software Development in Cheminformatics

T2 - A Qualitative Analysis of Rationales

AU - Pernaa, Johannes

AU - Takala, Aleksi

AU - Ciftci, Veysel

AU - Hernández-Ramos, José

AU - Cáceres-Jensen, Lizethly

AU - Rodríguez-Becerra, Jorge

PY - 2023/9

Y1 - 2023/9

N2 - Tämä kvalitatiivinen tutkimus tutki keminformatiikan avoimen lähdekoodin kehityksen perusteita. Tavoitteena oli edistää avointa tiedettä kartoittamalla ja luokittelemalla syitä siihen, miksi keminformatiikan alalla tehdäön avoimen lähdekoodin sovelluskehitystä. Tämä aihe on tärkeä, koska keminformatiikalla on teollinen tausta ja avoin lähdekoodi on avainratkaisu edistämään cheminformatiikan kasvua itsenäisenä akateemisena alana. Aineisto koostui 87 tutkimusartikkelista, jotka analysoitiin kvalitatiivisella sisältöanalyysillä. Analyysi tuotti kuusi perusteluluokkaa: (1) uusien ohjelmistojen kehittäminen, (2) nykyisten ominaisuuksien, työkalujen tai prosessien päivittäminen, (3) käytettävyyden parantaminen, (4) avoimen lähdekoodin kehityksen ja avoimen tieteen tukeminen, (5) kemiallisten tietojen täyttäminen Tarvitsee ja (6) tukee kemian oppimista ja opetusta. Tätä luokittelua voidaan käyttää tulevien ohjelmistokehitysprojektien perustelujen suunnittelussa, mikä on yksi kemikaaliformatiikan suurimmista tutkimusalueista. Erityisesti on kehitettävä keminfirmatiikan koulutusta, jolle ohjelmistokehitys voi toimia mielenkiintoisena monitieteisenä viitekehyksenä.

AB - Tämä kvalitatiivinen tutkimus tutki keminformatiikan avoimen lähdekoodin kehityksen perusteita. Tavoitteena oli edistää avointa tiedettä kartoittamalla ja luokittelemalla syitä siihen, miksi keminformatiikan alalla tehdäön avoimen lähdekoodin sovelluskehitystä. Tämä aihe on tärkeä, koska keminformatiikalla on teollinen tausta ja avoin lähdekoodi on avainratkaisu edistämään cheminformatiikan kasvua itsenäisenä akateemisena alana. Aineisto koostui 87 tutkimusartikkelista, jotka analysoitiin kvalitatiivisella sisältöanalyysillä. Analyysi tuotti kuusi perusteluluokkaa: (1) uusien ohjelmistojen kehittäminen, (2) nykyisten ominaisuuksien, työkalujen tai prosessien päivittäminen, (3) käytettävyyden parantaminen, (4) avoimen lähdekoodin kehityksen ja avoimen tieteen tukeminen, (5) kemiallisten tietojen täyttäminen Tarvitsee ja (6) tukee kemian oppimista ja opetusta. Tätä luokittelua voidaan käyttää tulevien ohjelmistokehitysprojektien perustelujen suunnittelussa, mikä on yksi kemikaaliformatiikan suurimmista tutkimusalueista. Erityisesti on kehitettävä keminfirmatiikan koulutusta, jolle ohjelmistokehitys voi toimia mielenkiintoisena monitieteisenä viitekehyksenä.

KW - open source

KW - cheminformatics

KW - software development

KW - qualitative research

KW - content analysis

KW - open source

KW - cheminformatics

KW - software development

KW - qualitative research

KW - content analysis

KW - 116 Chemical sciences

U2 - 10.3390/app13179516

DO - 10.3390/app13179516

M3 - Article

SN - 1454-5101

VL - 13

JO - Applied Sciences

JF - Applied Sciences

IS - 17

M1 - 9516

ER -

Open-Source Software Development in Cheminformatics: A Qualitative Analysis of Rationales

Abstract

Fields of Science

Access to Document

Projects

Cheminformatics in Science Education

Cite this