Original language | English |
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Article number | 244 |
Journal | Genome Biology |
Volume | 20 |
Issue number | 1 |
Number of pages | 23 |
ISSN | 1474-760X |
DOIs | |
Publication status | Published - 19 Nov 2019 |
MoE publication type | A1 Journal article-refereed |
Fields of Science
- Protein function prediction
- Long-term memory
- Biofilm
- Critical assessment
- Community challenge
- CANDIDA-ALBICANS
- ONTOLOGY
- IDENTIFICATION
- GENERATION
- LIBRARY
- 318 Medical biotechnology
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The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens. / Zhou, Naihui; Jiang, Yuxiang; Bergquist, Timothy R.; Lee, Alexandra J.; Kacsoh, Balint Z.; Crocker, Alex W.; Lewis, Kimberley A.; Georghiou, George; Nguyen, Huy N.; Hamid, Md Nafiz; Davis, Larry; Dogan, Tunca; Atalay, Volkan; Rifaioglu, Ahmet S.; Dalkiran, Alperen; Atalay, Rengul Cetin; Zhang, Chengxin; Hurto, Rebecca L.; Freddolino, Peter L.; Zhang, Yang; Bhat, Prajwal; Supek, Fran; Fernandez, Jose M.; Gemovic, Branislava; Perovic, Vladimir R.; Davidovic, Radoslav S.; Sumonja, Neven; Veljkovic, Nevena; Asgari, Ehsaneddin; Mofrad, Mohammad R. K.; Profiti, Giuseppe; Savojardo, Castrense; Martelli, Pier Luigi; Casadio, Rita; Boecker, Florian; Schoof, Heiko; Kahanda, Indika; Thurlby, Natalie; McHardy, Alice C.; Renaux, Alexandre; Saidi, Rabie; Gough, Julian; Freitas, Alex A.; Antczak, Magdalena; Fabris, Fabio; Wass, Mark N.; Hou, Jie; Cheng, Jianlin; Wang, Zheng; Romero, Alfonso E.; Paccanaro, Alberto; Yang, Haixuan; Goldberg, Tatyana; Zhao, Chenguang; Holm, Liisa; Törönen, Petri; Medlar, Alan J.; Zosa, Elaine; Borukhov, Itamar; Novikov, Ilya; Wilkins, Angela; Lichtarge, Olivier; Chi, Po-Han; Tseng, Wei-Cheng; Linial, Michal; Rose, Peter W.; Dessimoz, Christophe; Vidulin, Vedrana; Dzeroski, Saso; Sillitoe, Ian; Das, Sayoni; Lees, Jonathan Gill; Jones, David T.; Wan, Cen; Cozzetto, Domenico; Fa, Rui; Torres, Mateo; Vesztrocy, Alex Warwick; Rodriguez, Jose Manuel; Tress, Michael L.; Frasca, Marco; Notaro, Marco; Grossi, Giuliano; Petrini, Alessandro; Re, Matteo; Valentini, Giorgio; Mesiti, Marco; Roche, Daniel B.; Reeb, Jonas; Ritchie, David W.; Aridhi, Sabeur; Alborzi, Seyed Ziaeddin; Devignes, Marie-Dominique; Koo, Da Chen Emily; Bonneau, Richard; Gligorijevic, Vladimir; Barot, Meet; Fang, Hai; Toppo, Stefano; Lavezzo, Enrico; Falda, Marco; Berselli, Michele; Tosatto, Silvio C. E.; Carraro, Marco; Piovesan, Damiano; Rehman, Hafeez Ur; Mao, Qizhong; Zhang, Shanshan; Vucetic, Slobodan; Black, Gage S.; Jo, Dane; Suh, Erica; Dayton, Jonathan B.; Larsen, Dallas J.; Omdahl, Ashton R.; McGuffin, Liam J.; Brackenridge, Danielle A.; Babbitt, Patricia C.; Yunes, Jeffrey M.; Fontana, Paolo; Zhang, Feng; Zhu, Shanfeng; You, Ronghui; Zhang, Zihan; Dai, Suyang; Yao, Shuwei; Tian, Weidong; Cao, Renzhi; Chandler, Caleb; Amezola, Miguel; Johnson, Devon; Chang, Jia-Ming; Liao, Wen-Hung; Liu, Yi-Wei; Pascarelli, Stefano; Frank, Yotam; Hoehndorf, Robert; Kulmanov, Maxat; Boudellioua, Imane; Politano, Gianfranco; Di Carlo, Stefano; Benso, Alfredo; Hakala, Kai; Ginter, Filip; Mehryary, Farrokh; Kaewphan, Suwisa; Bjorne, Jari; Moen, Hans; Tolvanen, Martti E. E.; Salakoski, Tapio; Kihara, Daisuke; Jain, Aashish; Smuc, Tomislav; Altenhoff, Adrian; Ben-Hur, Asa; Rost, Burkhard; Brenner, Steven E.; Orengo, Christine A.; Jeffery, Constance J.; Bosco, Giovanni; Hogan, Deborah A.; Martin, Maria J.; O'Donovan, Claire; Mooney, Sean D.; Greene, Casey S.; Radivojac, Predrag; Friedberg, Iddo.
In: Genome Biology, Vol. 20, No. 1, 244, 19.11.2019.Research output: Contribution to journal › Article › Scientific › peer-review
TY - JOUR
T1 - The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens
AU - Zhou, Naihui
AU - Jiang, Yuxiang
AU - Bergquist, Timothy R.
AU - Lee, Alexandra J.
AU - Kacsoh, Balint Z.
AU - Crocker, Alex W.
AU - Lewis, Kimberley A.
AU - Georghiou, George
AU - Nguyen, Huy N.
AU - Hamid, Md Nafiz
AU - Davis, Larry
AU - Dogan, Tunca
AU - Atalay, Volkan
AU - Rifaioglu, Ahmet S.
AU - Dalkiran, Alperen
AU - Atalay, Rengul Cetin
AU - Zhang, Chengxin
AU - Hurto, Rebecca L.
AU - Freddolino, Peter L.
AU - Zhang, Yang
AU - Bhat, Prajwal
AU - Supek, Fran
AU - Fernandez, Jose M.
AU - Gemovic, Branislava
AU - Perovic, Vladimir R.
AU - Davidovic, Radoslav S.
AU - Sumonja, Neven
AU - Veljkovic, Nevena
AU - Asgari, Ehsaneddin
AU - Mofrad, Mohammad R. K.
AU - Profiti, Giuseppe
AU - Savojardo, Castrense
AU - Martelli, Pier Luigi
AU - Casadio, Rita
AU - Boecker, Florian
AU - Schoof, Heiko
AU - Kahanda, Indika
AU - Thurlby, Natalie
AU - McHardy, Alice C.
AU - Renaux, Alexandre
AU - Saidi, Rabie
AU - Gough, Julian
AU - Freitas, Alex A.
AU - Antczak, Magdalena
AU - Fabris, Fabio
AU - Wass, Mark N.
AU - Hou, Jie
AU - Cheng, Jianlin
AU - Wang, Zheng
AU - Romero, Alfonso E.
AU - Paccanaro, Alberto
AU - Yang, Haixuan
AU - Goldberg, Tatyana
AU - Zhao, Chenguang
AU - Holm, Liisa
AU - Törönen, Petri
AU - Medlar, Alan J.
AU - Zosa, Elaine
AU - Borukhov, Itamar
AU - Novikov, Ilya
AU - Wilkins, Angela
AU - Lichtarge, Olivier
AU - Chi, Po-Han
AU - Tseng, Wei-Cheng
AU - Linial, Michal
AU - Rose, Peter W.
AU - Dessimoz, Christophe
AU - Vidulin, Vedrana
AU - Dzeroski, Saso
AU - Sillitoe, Ian
AU - Das, Sayoni
AU - Lees, Jonathan Gill
AU - Jones, David T.
AU - Wan, Cen
AU - Cozzetto, Domenico
AU - Fa, Rui
AU - Torres, Mateo
AU - Vesztrocy, Alex Warwick
AU - Rodriguez, Jose Manuel
AU - Tress, Michael L.
AU - Frasca, Marco
AU - Notaro, Marco
AU - Grossi, Giuliano
AU - Petrini, Alessandro
AU - Re, Matteo
AU - Valentini, Giorgio
AU - Mesiti, Marco
AU - Roche, Daniel B.
AU - Reeb, Jonas
AU - Ritchie, David W.
AU - Aridhi, Sabeur
AU - Alborzi, Seyed Ziaeddin
AU - Devignes, Marie-Dominique
AU - Koo, Da Chen Emily
AU - Bonneau, Richard
AU - Gligorijevic, Vladimir
AU - Barot, Meet
AU - Fang, Hai
AU - Toppo, Stefano
AU - Lavezzo, Enrico
AU - Falda, Marco
AU - Berselli, Michele
AU - Tosatto, Silvio C. E.
AU - Carraro, Marco
AU - Piovesan, Damiano
AU - Rehman, Hafeez Ur
AU - Mao, Qizhong
AU - Zhang, Shanshan
AU - Vucetic, Slobodan
AU - Black, Gage S.
AU - Jo, Dane
AU - Suh, Erica
AU - Dayton, Jonathan B.
AU - Larsen, Dallas J.
AU - Omdahl, Ashton R.
AU - McGuffin, Liam J.
AU - Brackenridge, Danielle A.
AU - Babbitt, Patricia C.
AU - Yunes, Jeffrey M.
AU - Fontana, Paolo
AU - Zhang, Feng
AU - Zhu, Shanfeng
AU - You, Ronghui
AU - Zhang, Zihan
AU - Dai, Suyang
AU - Yao, Shuwei
AU - Tian, Weidong
AU - Cao, Renzhi
AU - Chandler, Caleb
AU - Amezola, Miguel
AU - Johnson, Devon
AU - Chang, Jia-Ming
AU - Liao, Wen-Hung
AU - Liu, Yi-Wei
AU - Pascarelli, Stefano
AU - Frank, Yotam
AU - Hoehndorf, Robert
AU - Kulmanov, Maxat
AU - Boudellioua, Imane
AU - Politano, Gianfranco
AU - Di Carlo, Stefano
AU - Benso, Alfredo
AU - Hakala, Kai
AU - Ginter, Filip
AU - Mehryary, Farrokh
AU - Kaewphan, Suwisa
AU - Bjorne, Jari
AU - Moen, Hans
AU - Tolvanen, Martti E. E.
AU - Salakoski, Tapio
AU - Kihara, Daisuke
AU - Jain, Aashish
AU - Smuc, Tomislav
AU - Altenhoff, Adrian
AU - Ben-Hur, Asa
AU - Rost, Burkhard
AU - Brenner, Steven E.
AU - Orengo, Christine A.
AU - Jeffery, Constance J.
AU - Bosco, Giovanni
AU - Hogan, Deborah A.
AU - Martin, Maria J.
AU - O'Donovan, Claire
AU - Mooney, Sean D.
AU - Greene, Casey S.
AU - Radivojac, Predrag
AU - Friedberg, Iddo
PY - 2019/11/19
Y1 - 2019/11/19
KW - Protein function prediction
KW - Long-term memory
KW - Biofilm
KW - Critical assessment
KW - Community challenge
KW - CANDIDA-ALBICANS
KW - ONTOLOGY
KW - IDENTIFICATION
KW - GENERATION
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KW - 318 Medical biotechnology
U2 - 10.1186/s13059-019-1835-8
DO - 10.1186/s13059-019-1835-8
M3 - Article
VL - 20
JO - Genome Biology
JF - Genome Biology
SN - 1474-7596
IS - 1
M1 - 244
ER -