FIMM High Throughput Biomedicine Unit

Tutkimustuotos

Tutkimustuotoksia vuodessa 2012 2014 2015 2021

• 28 Artikkeli
• 1 Kirjan luku tai artikkeli

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2021

  Aminopeptidase Expression in Multiple Myeloma Associates with Disease Progression and Sensitivity to Melflufen

  Miettinen, J., Kumari, R., Traustadottir, G. A., Huppunen, M-E. A., Sergeev, P., Majumder, M. M., Schepsky, A., Gudjonsson, T., Lievonen, J., Bazou, D., Dowling, P., O'Gorman, P., Slipicevic, A., Anttila, P., Silvennoinen, R., Nupponen, N. N., Lehmann, F. & Heckman, C., huhtik. 2021, julkaisussa: Cancers. 13, 7, 21 Sivumäärä, 1527.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2017

  HOX gene expression predicts response to BCL-2 inhibition in acute myeloid leukemia

  Kontro, M., Kumar, A., Majumder, M. M., Eldfors, S., Parsons, A., Pemovska, T., Saarela, J. S., Yadav, B., Malani, D. R., Fløisand, Y., Höglund, M., Remes, K., Gjertsen, B-T., Kallioniemi, O-P., Wennerberg, J. K., Heckman, C. A. & Porkka, K. V. K., 2017, julkaisussa: Leukemia. 31, 2, s. 301-309 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Tiedosto
• 2016

  BRCA1-deficient breast cancer cell lines are resistant to MEK inhibitors and show distinct sensitivities to 6-thioguanine

  Gu, Y., Helenius, M., Vaananen, K., Bulanova, D., Saarela, J., Sokolenko, A., Martens, J., Imyanitov, E. & Kuznetsov, S., 17 kesäk. 2016, julkaisussa: Scientific Reports. 6, 9 Sivumäärä, 28217.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• High Throughput siRNA Screening Using Reverse Transfection

  von Schantz-Fant, C. & Saarela, J., 2016, High-Throughput RNAi Screening : Methods and Protocols. Azorsa, D. O. & Arora, S. (toim.). Springer, s. 25-37 13 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1470).

  Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen

• Precision Cancer Medicine in the Acoustic Dispensing Era: Ex Vivo Primary Cell Drug Sensitivity Testing

  Kulesskiy, E., Saarela, J., Turunen, L. & Wennerberg, K., helmik. 2016, julkaisussa: Journal of Laboratory Automation. 21, 1, s. 27-36 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2015

  Axitinib effectively inhibits BCR-ABL1(T315I) with a distinct binding conformation

  Pemovska, T., Johnson, E., Kontro, M., Repasky, G. A., Chen, J., Wells, P., Cronin, C. N., McTigue, M., Kallioniemi, O., Porkka, K., Murray, B. W. & Wennerberg, K., 5 maalisk. 2015, julkaisussa: Nature. 519, 7541, s. 102-U225 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Bioluminescent, Nonlytic, Real-Time Cell Viability Assay and Use in Inhibitor Screening

  Duellman, S. J., Zhou, W., Meisenheimer, P., Vidugiris, G., Cali, J. J., Gautam, P., Wennerberg, K. & Vidugiriene, J., 1 lokak. 2015, julkaisussa: Assay and drug development technologies. 13, 8, s. 456-465 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Discovery of MINC1, a GTPase-Activating Protein Small Molecule Inhibitor, Targeting MgcRacGAP

  van Adrichem, A. J., Fagerholm, A., Turunen, L., Lehto, A., Saarela, J., Koskinen, A., Repasky, G. A. & Wennerberg, K., 2015, julkaisussa: Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 18, 1, s. 3-17 15 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• From drug response profiling to target addiction scoring in cancer cell models

  Yadav, B., Gopalacharyulu, P., Pemovska, T., Khan, S. A., Szwajda, A., Tang, J., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., lokak. 2015, julkaisussa: Disease Models & Mechanisms. 8, 10, s. 1255-1264 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Impact of normalization methods on high-throughput screening data with high hit rates and drug testing with dose-response data

  Mpindi, J-P., Potdar, S., Bychkov, D., Saarela, J., Saeed, K., Wennerberg, K., Aittokallio, T., Östling, P. & Kallioniemi, O., 1 jouluk. 2015, julkaisussa: Bioinformatics. 31, 23, s. 3815-3821 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Novel drug candidates for blast phase chronic myeloid leukemia from high-throughput drug sensitivity and resistance testing

  Pietarinen, P. O., Pemovska, T., Kontro, M., Yadav, B., Mpindi, J. P., Andersson, E. I., Majumder, M. M., Kuusanmaki, H., Koskenvesa, P., Kallioniemi, O., Wennerberg, K., Heckman, C. A., Mustjoki, S. & Porkka, K., toukok. 2015, julkaisussa: Blood cancer journal. 5, 6 Sivumäärä, 309.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Rational Polypharmacology: Systematically Identifying and Engaging Multiple Drug Targets To Promote Axon Growth

  Al-Ali, H., Lee, D-H., Danzi, M. C., Nassif, H., Gautam, P., Wennerberg, K., Zuercher, B., Drewry, D. H., Lee, J. K., Lemmon, V. P. & Bixby, J. L., elok. 2015, julkaisussa: ACS Chemical Biology. 10, 8, s. 1939-1951 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Relevance Rank Platform (RRP) for Functional Filtering of High Content Protein-Protein Interaction Data

  Pokharel, Y. R., Saarela, J., Szwajda, A., Rupp, C., Rokka, A., Karna, S. K. L., Teittinen, K., Corthals, G., Kallioniemi, O., Wennerberg, K., Aittokallio, T. & Westermarck, J., jouluk. 2015, julkaisussa: Molecular & Cellular Proteomics. 14, 12, s. 3274-3283 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Systematic Mapping of Kinase Addiction Combinations in Breast Cancer Cells by Integrating Drug Sensitivity and Selectivity Profiles

  Szwajda, A., Gautam, P., Karhinen, L., Jha, S. K., Saarela, J., Shakyawar, S., Turunen, L., Yadav, B., Tang, J., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 20 elok. 2015, julkaisussa: Chemistry & Biology. 22, 8, s. 1144-1155 12 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• The higher frequency of IgA deficiency among Swedish twins is not explained by HLA haplotypes

  Frankowiack, M., Kovanen, R-M., Repasky, G. A., Lim, C. K., Song, C., Pedersen, N. L. & Hammarstom, L., 2015, julkaisussa: Genes and Immunity. 16, 3, s. 199-205 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2014

  Akt Inhibitor MK2206 Prevents Influenza pH1N1 Virus Infection In Vitro

  Denisova, O., Soderholm, S., Virtanen, S., von Schantz, C., Bychkov, D., Vashchinkina, E., Desloovere, J., Tynell, J., Ikonen, N., Theisen, L. L., Nyman, T. A., Matikainen, S., Kallioniemi, O., Julkunen, I., Muller, C. P., Saelens, X., Verkhusha, V. V. & Kainov, D. E., heinäk. 2014, julkaisussa: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 7, s. 3689-3696 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Antifungal Application of Nonantifungal Drugs

  Stylianou, M., Kulesskiy, E., Lopes, J. P., Granlund, M., Wennerberg, K. & Urban, C. F., helmik. 2014, julkaisussa: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 2, s. 1055-1062 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Bioluminescent Cell-Based NAD(P)/NAD(P)H Assays for Rapid Dinucleotide Measurement and Inhibitor Screening

  Vidugiriene, J., Leippe, D., Sobol, M., Vidugiris, G., Zhou, W., Meisenheimer, P., Gautam, P., Wennerberg, K. & Cali, J. J., 1 jouluk. 2014, julkaisussa: Assay and drug development technologies. 12, 9-10, s. 514-526 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Novel activating STAT5B mutations as putative drivers of T-cell acute lymphoblastic leukemia

  Kontro, M., Kuusanmaki, H., Eldfors, S., Burmeister, T., Andersson, E. I., Bruserud, O., Bruemmendorf, T. H., Edgren, H., Gjertsen, B. T., Itala-Remes, M., Lagström, S., Lohi, O., Lundan, T., Marti, J. M. L., Majumder, M. M., Parsons, A., Pemovska, T., Rajala, H., Vettenranta, K., Kallioniemi, O., & 3 muutaMustjoki, S., Porkka, K. & Heckman, C. A., elok. 2014, julkaisussa: Leukemia. 28, 8, s. 1738-1742 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Quantitative scoring of differential drug sensitivity for individually optimized anticancer therapies

  Yadav, B., Pemovska, T., Szwajda, A., Kulesskiy, E., Kontro, M., Karjalainen, R., Majumder, M. M., Malani, D., Murumagi, A., Knowles, J., Porkka, K., Heckman, C., Kallioniemi, O., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 5 kesäk. 2014, julkaisussa: Scientific Reports. 4, 10 Sivumäärä, 5193.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Suppression of BRCA1 sensitizes cells to proteasome inhibitors

  Gu, Y., Bouwman, P., Greco, D., Saarela, J., Yadav, B., Jonkers, J. & Kuznetsov, S., 18 jouluk. 2014, julkaisussa: Cell Death and Disease. 5, 12 Sivumäärä, e1580.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• The High Throughput Biomedicine Unit at the Institute for Molecular Medicine Finland: High Throughput Screening Meets Precision Medicine

  Pietiainen, V., Saarela, J., von Schantz, C., Turunen, L., Ostling, P. & Wennerberg, K., toukok. 2014, julkaisussa: Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 17, 4, s. 377-386 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Utilization of in situ ELISA method for examining Trk receptor phosphorylation in cultured cells

  Antila, H., Autio, H., Turunen, L., Harju, K., Tammela, P., Wennerberg, K., Yli-Kauhaluoma, J., Huttunen, H. J., Castren, E. & Rantamaki, T., 30 tammik. 2014, julkaisussa: Journal of Neuroscience Methods. 222, s. 142-146 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2013

  Antimicrobial assay optimization and validation for HTS in 384-well format using a bioluminescent E. coli K-12 strain

  Nybond, S., Karp, M. & Tammela, P., 2013, julkaisussa: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 49, 4, s. 782-789 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Biolääketiedettä FIMM:issä : solubiologiaa tehoseulonnan keinoin

  Merivirta, R-M., Turunen, L. & Saarela, J., 2013, julkaisussa: Solubiologi. 31, 2, s. 36-39 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Ammatillinen

• Individualized Systems Medicine Strategy to Tailor Treatments for Patients with Chemorefractory Acute Myeloid Leukemia

  Pemovska, T., Kontro, M., Yadav, B., Edgren, H., Eldfors, S., Szwajda, A., Almusa, H., Bespalov, M. M., Ellonen, P., Elonen, E., Gjertsen, B. T., Karjalainen, R., Kulesskiy, E., Lagström, S., Lehto, A., Lepistö, M., Lundan, T., Majumder, M. M., Marti, J. M. L., Mattila, P., & 16 muutaMurumagi, A., Mustjoki, S., Palva, A., Parsons, A., Pirttinen, T., Ramet, M. E., Suvela, M., Turunen, L., Vastrik, I., Wolf, M., Knowles, J., Aittokallio, T., Heckman, C. A., Porkka, K., Kallioniemi, O. & Wennerberg, K., jouluk. 2013, julkaisussa: Cancer Discovery. 3, 12, s. 1416-1429 14 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Target Inhibition Networks: Predicting Selective Combinations of Druggable Targets to Block Cancer Survival Pathways

  Tang, J., Karhinen, L., Xu, T., Szwajda, A., Yadav, B., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., syysk. 2013, julkaisussa: PLoS Computational Biology. 9, 9, s. Article Number: e1003226 16 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2012

  Obatoclax, Saliphenylhalamide, and Gemcitabine Inhibit Influenza A Virus Infection

  Denisova, O. V., Kakkola, L., Feng, L., Stenman, J., Nagaraj, A., Lampe, J., Yadav, B., Aittokallio, T., Kaukinen, P., Ahola, T., Kuivanen, S., Vapalahti, O., Kantele, A., Tynell, J., Julkunen, I., Kallio-Kokko, H., Paavilainen, H., Hukkanen, V., Elliott, R. M., De Brabander, J. K., & 2 muutaSaelens, X. & Kainov, D. E., 12 lokak. 2012, julkaisussa: Journal of Biological Chemistry. 287, 42, s. 35324-35332 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Somatic STAT3 Mutations in Large Granular Lymphocytic Leukemia

  Koskela, H. L. M., Eldfors, S., Ellonen, P., van Adrichem, A. J., Kuusanmäki, H., Andersson, E. I., Lagström, S., Clemente, M. J., Olson, T., Jalkanen, S. E., Majumder, M. M., Almusa, H., Edgren, H., Lepistö, M., Mattila, P., Guinta, K., Koistinen, P., Kuittinen, T., Penttinen, K., Parsons, A., & 9 muutaKnowles, J., Saarela, J., Wennerberg, K., Kallioniemi, O., Porkka, K., Loughran, T. P., Heckman, C. A., Maciejewski, J. P. & Mustjoki, S., 2012, julkaisussa: New England Journal of Medicine. 366, 20, s. 1905-1913 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu