Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Elena Biagi
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - väitöskirjatutkija
- Algorithmic Bioinformatics
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Manuel Ariel Caceres Reyes
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - väitöskirjatutkija
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, Väitöskirjatutkija
-
Fernando Hugo Cunha Dias
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tutkijatohtori
- Algorithmic Bioinformatics
Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Diego Alejandro Diaz Dominguez, Postdoctoral researcher
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tutkijatohtori
- Algorithmic Bioinformatics
Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
SAFEBIO: Safe and Complete Algorithms for Bioinformatics
Khan, S., Schmidt, S. S. & Ma, J.
01/03/2020 → 28/02/2025
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö / Mäkinen
01/01/2015 → 31/12/2017
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Julkaisut
-
Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads
Prjibelski, A. D., Mikheenko, A., Joglekar, A., Smetanin, A., Jarroux, J., Lapidus, A. L. & Tilgner, H. U., 2 tammik. 2023, (E-pub ahead of print) julkaisussa: Nature Biotechnology.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
3coSoKu and its declarative modeling
Rizzo, N. & Dovier, A., 26 helmik. 2022, julkaisussa: Journal of Logic and Computation. 32, 2, s. 307-330 24 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Computing all-vs-all MEMs in run-length encoded collections of HiFi reads
Díaz-Domínguez, D., Puglisi, S. & Salmela, L., 2022, String Processing and Information Retrieval. SPIRE 2022. Cham: Springer, s. 198-213 (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 13617).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Computing Longest (Common) Lyndon Subsequences
Bannai, H., Tomohiro, I., Kociumaka, T., Koppl, D. & Puglisi, S. J., 2022, IWOCA 2022: Combinatorial Algorithms. Bazgan, C. & Fernau, H. (toim.). Springer, s. 128-142 15 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 13270).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Efficient Minimum Flow Decomposition via Integer Linear Programming
Dias, F. H. C., Williams, L., Mumey, B. & Tomescu, A. I., 2022, julkaisussa: Journal of Computational Biology. 29, 11, s. 1155-1267Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms (SODA 2023) (Tapahtuma)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
elok. 2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Brendan Mumey
Alexandru Tomescu (Isäntä)
14 toukok. 2022 → 21 toukok. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Efficient solutions to biological problems using de Bruijn graphs
Leena Salmela (Puhuja)
7 syysk. 2022Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Kutsuesitelmä
-
Massimo Cairo
Alexandru Tomescu (Isäntä)
20 maalisk. 2022 → 2 huhtik. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Algorithms for Molecular Biology (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
tammik. 2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
Alberto Apostolico Best Paper Award
Puglisi, Simon (Vastaanottaja), Raman, Rajeev (Vastaanottaja), Belazzougui, Djamal (Vastaanottaja) & Kosolobov, Dmitry (Vastaanottaja), 6 heinäk. 2021
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Researcher of the Year Award for junior researchers
Caceres Reyes, Manuel Ariel (Vastaanottaja), 2021
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
-
The daily brief: 4 September 2019
Federico Bianchi & Alexandru Tomescu
04/09/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
-UNIVERSITY OF HELSINKI: An algorithm shedding light on the evolution of tumours helps individualise cancer therapies
05/02/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
An algorithm shedding light on the evolution of tumours helps individualise cancer therapies
04/02/2019 → 05/02/2019
2 kohdetta/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media