Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Manuel Ariel Caceres Reyes
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tohtorikoulutettava
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Massimo Equi
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tohtorikoulutettava
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Shahbaz Khan
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tutkijatohtori
- Algorithmic Bioinformatics
Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Juha Kärkkäinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - yliopistonlehtori
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Algorithmic Bioinformatics
- Juha Kärkkäinen / Vastuullinen tutkija
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Projektit
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö / Mäkinen
01/01/2015 → 31/12/2017
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Julkaisut
-
Dynamic Matching Algorithms in Practice
Henzinger, M., Khan, S., Paul, R. & Schulz, C., 8 syyskuuta 2020, 28th Annual European Symposium on Algorithms (ESA 2020). Grandoni, F., Herman, G. & Sanders, P. (toim.). Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 20 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 173).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Fast and accurate correction of optical mapping data via spaced seeds
Salmela, L., Mukherjee, K., Puglisi, S. J., Muggli, M. D. & Boucher, C., 1 helmikuuta 2020, julkaisussa : Bioinformatics. 36, 3, s. 682-689 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Fast and efficient Rmap assembly using bi-labelled de Bruijn graph
Mukherjee, K., Rossi, M., Salmela, L. & Boucher, C., 2020, 20th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2020). Kingsford, C. & Pisanti, N. (toim.). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 9:1-9:16 16 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 172).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Fast Indexes for Gapped Pattern Matching
Cáceres, M., Puglisi, S. & Zhukova, B., 17 tammikuuta 2020, s. 493-504. 12 Sivumäärä.Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiesitys › vertaisarvioitu
-
Finding all maximal perfect haplotype blocks in linear time
Alanko, J., Bannai, H., Cazaux, B., Peterlongo, P. & Stoye, J., 10 helmikuuta 2020, julkaisussa : Algorithms for Molecular Biology. 15, 1, 7 Sivumäärä, 2.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Bioinformatics (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
tammikuuta 2021Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Research Foundation Flanders (Ulkoinen yksikkö)
Veli Mäkinen (Assessment)
kesäkuuta 2020Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
-
SPIRE 2020 (Tapahtuma)
Veli Mäkinen (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
2020Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Massimo Cairo
Alexandru Tomescu (Isäntä)
3 helmikuuta 2020 → 25 helmikuuta 2020Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Brendan Mumey
Veli Mäkinen (Isäntä)
tammikuuta 2020 → maaliskuuta 2020Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa