Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Tero Aittokallio
- Suomen molekyylilääketieteen instituutti - vanhempi tutkija
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Biomedicine - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Clinical Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Drug Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Sampsa Hautaniemi
- Tiedekunnan yhteiset (Lääketieteellinen tiedekunta) - dosentuuri
- Biokemian ja kehitysbiologian osasto - professori
- Bioinformatics
- Sampsa Hautaniemi / Vastuullinen tutkija
- Doctoral Programme in Biomedicine - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Clinical Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Liisa Holm
- Bioinformatics
- Computational genomics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Organismi- ja evoluutiobiologian tutkimusohjelma - professori
- Biotekniikan instituutti
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Juha Kärkkäinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - yliopistonlehtori
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Algorithmic Bioinformatics
- Juha Kärkkäinen / Vastuullinen tutkija
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Ari Löytynoja
- Organismi- ja evoluutiobiologian tutkimusohjelma - yliopistonlehtori
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
DECIDER: DECIDER (Clinical Decision via Integrating Multiple Data Levels to Overcome Chemotherapy Resistance in High-Grade Serous Ovarian Cancer)
Korpisaari (ex. Tiilikka), P. (Principal Investigator), Hautaniemi, S. (Projektinjohtaja) & Mansnérus, J. (Muu)
01/02/2021 → 31/01/2026
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Suomalais-Ugrilainen muinaisgenomi
Onkamo, P. (Projektinjohtaja), Oikkonen, J. (Osallistuja), Översti, S. (Osallistuja), Salmela, E. (Osallistuja), Salo, K. H. (Osallistuja), Nordqvist, K. (Osallistuja) & Junno, A. (Osallistuja)
Koneen Säätiö, Jane and Aatos Erkko Foundation
01/01/2016 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Elucidation of mechanisms of action of the natural stilbenoid pinosylvin via network pharmacology computational methods
Kibble, M. M. (Projektinjohtaja), Aittokallio, T. (Principal Investigator), Mäkelä, S. (Principal Investigator), Saarinen, N. (Osallistuja) & Martinez Chacon , G. (Osallistuja)
01/01/2014 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Gene-culture evolution in music
Ukkola-Vuoti, L. (Osallistuja), Oikkonen, J. (Osallistuja), Onkamo, P. (Osallistuja), Raijas, P. (Osallistuja) & Karma, K. (Osallistuja)
01/04/2002 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
HiLIFE Grand Challenge "Combatting microbial drug resistance"
Hiltunen, T. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Projektinjohtaja)
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Advancements in Rational Multi-Targeted Drug Discovery: Improving the Efficacy-Safety Balance of Small Molecule Cancer Therapeutics
Ravikumar, B., Cichońska, A., Sahni, N., Aittokallio, T. & Rahman, R., 1 tammik. 2025, Polypharmacology: Strategies for Multi-Target Drug Discovery. Peters, J.-U. (toim.). Hoboken, New Jersey: Wiley, s. 109-125 17 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Batched k-mer lookup on the Spectral Burrows-Wheeler Transform
Alanko, J., Biagi, E., Mackenzie, J. & Puglisi, S., 7 tammik. 2025, 2025 Proceedings of the Symposium on Algorithm Engineering and Experiments (ALENEX). Chowdhury, R., Berry, J., Hanauer, K. & Ren, B. (toim.). Society for Industrial and Applied Mathematics, s. 95 - 106 12 Sivumäärä ( Proceedings of the Workshop on Algorithm Engineering and Experiments).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Complex Origins and History of the Relict Fennoscandian Ringed Seals
Olsen, M. T., Löytynoja, A., Valtonen, M., Knudsen, S. W., Bang, S., Gunnersen, C., Rosing-Asvid, A., Ferguson, S. H., Dietz, R., Kovacs, K. M., Lydersen, C., Jernvall, J., Auvinen, P. & Galatius, A., maalisk. 2025, julkaisussa: Ecology and Evolution. 15, 3, 17 Sivumäärä, e71067.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Computational drug repurposing: approaches, evaluation of in silico resources and case studies
Tanoli, Z., Fernandez-Torras, A., Özcan, U. O., Kushnir, A., Nader, K. M., Gadiya, Y., Fiorenza, L., Ianevski, A., Vähä-Koskela, M., Miihkinen, M., Seemab, U., Leinonen, H., Seashore-Ludlow, B., Tampere, M., Kalman, A., Ballante, F., Benfenati, E., Saunders, G., Potdar, S. & Garcia, I. G. & 23 muuta, , 2025, julkaisussa: Nature Reviews Drug Discovery. 22 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
-
Jellyfish: integrative visualization of spatio-temporal tumor evolution and clonal dynamics
Lavikka, K., Maarala, A. I., Oikkonen, J. & Hautaniemi, S., 11 maalisk. 2025, julkaisussa: Bioinformatics. 41, 3, 4 Sivumäärä, btaf091.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
ISMB/ECCB 2025 (Tapahtuma)
Mäkinen, V. (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
helmik. 2025Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Genome Research (Lehti)
Mäkinen, V. (Arvioitsija (reviewer))
huhtik. 2025Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Algorithms (Lehti)
Mäkinen, V. (Arvioitsija (reviewer))
lokak. 2024Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Journal of Computational Biology (Lehti)
Mäkinen, V. (Arvioitsija (reviewer))
lokak. 2024Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
RECOMB 2025 (Tapahtuma)
Mäkinen, V. (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
marrask. 2024 → jouluk. 2024Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
Alberto Apostolico Best Paper Award
Puglisi, S. (Vastaanottaja), Raman, R. (Vastaanottaja), Belazzougui, D. (Vastaanottaja) & Kosolobov, D. (Vastaanottaja), 6 heinäk. 2021
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
-
University of Helsinki: Researchers Identified Factors That Turn Normal Cells Into Liver Cancer Cells
08/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
388123-2021: Finland-Helsingin yliopisto: Services provided by medical laboratories
30/07/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Tender Notice: HELSINGIN YLIOPISTO Seeks "Next Generation Sequencing Services for Decider" (118211-2021)
09/03/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
118211-2021: Finland-Helsinki: Services provided by medical laboratories
09/03/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-