Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Tero Aittokallio
- Suomen molekyylilääketieteen instituutti - vanhempi tutkija
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Biomedicine - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Clinical Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Drug Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Sampsa Hautaniemi
- Biokemian ja kehitysbiologian osasto - professori
- Sampsa Hautaniemi / Vastuullinen tutkija
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Biomedicine - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Clinical Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Liisa Holm
- Organismi- ja evoluutiobiologian tutkimusohjelma - professori
- Biotekniikan instituutti
- Bioinformatics
- Computational genomics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Juha Kärkkäinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - yliopistonlehtori
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Algorithmic Bioinformatics
- Juha Kärkkäinen / Vastuullinen tutkija
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Ari Löytynoja
- Biotekniikan instituutti - tutkimusjohtaja
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
Laitteet
-
Biodata Analytics Unit
Ville Mustonen (Johtaja), Mirkka Jones (Muut), Pasi Rastas (Muut), Jukka Siren (Muut) & Fatemehsadat Seyednasrollah (Muut)
Biotekniikan instituuttiLaitteistot/tilat: Tutkimuslaboratorio
-
DECIDER: DECIDER (Clinical Decision via Integrating Multiple Data Levels to Overcome Chemotherapy Resistance in High-Grade Serous Ovarian Cancer)
Korpisaari (ex. Tiilikka), P., Hautaniemi, S. & Mansnérus, J.
01/02/2021 → 31/01/2026
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Suomalais-Ugrilainen muinaisgenomi
Onkamo, P., Oikkonen, J., Översti, S., Salmela, E., Salo, K. H., Nordqvist, K. & Junno, A.
Koneen Säätiö, Jane and Aatos Erkko Foundation
01/01/2016 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Elucidation of mechanisms of action of the natural stilbenoid pinosylvin via network pharmacology computational methods
Kibble, M. M., Aittokallio, T., Mäkelä, S., Saarinen, N. & Martinez Chacon , G.
01/01/2014 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Gene-culture evolution in music
Ukkola-Vuoti, L., Oikkonen, J., Onkamo, P., Raijas, P. & Karma, K.
01/04/2002 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
HiLIFE Grand Challenge consortium "Combatting antimicrobial resistance"
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Muu projekti
Julkaisut
-
Artificial intelligence for drug response prediction in disease models
Ballester, P. J., Stevens, R., Haibe-Kains, B., Huang, R. S. & Aittokallio, T., 17 tammik. 2022, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 23, 1, 3 Sivumäärä, 450.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Pääkirjoitus › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Fully-automated and ultra-fast cell-type identification using specific marker combinations from single-cell transcriptomic data
Ianevski, A., Giri, A. K. & Aittokallio, T., 10 maalisk. 2022, julkaisussa: Nature Communications. 13, 10 Sivumäärä, 1246.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Implementing a Functional Precision Medicine Tumor Board for Acute Myeloid Leukemia
Malani, D., Kumar, A., Brück, O., Kontro, M., Yadav, B., Hellesoy, M., Kuusanmäki, H., Dufva, O., Kankainen, M., Eldfors, S., Potdar, S., Saarela, J., Turunen, L., Parsons, A., Västrik, I., Kivinen, K., Saarela, J., Räty, R., Lehto, M., Wolf, M. & 7 muuta, , helmik. 2022, julkaisussa: Cancer Discovery. 12, 2, s. 388-401 14 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer
Zhang, K., Erkan, E. P., Jamalzadeh, S., Dai, J., Andersson, N., Kaipio, K., Lamminen, T., Mansuri, N., Huhtinen, K., Carpen, O., Hietanen, S., Oikkonen, J., Hynninen, J., Virtanen, A., Häkkinen, A., Hautaniemi, S. & Väharautio, A., helmik. 2022, julkaisussa: Science Advances. 8, 8, 18 Sivumäärä, 1831.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
POIBM: batch correction of heterogeneous RNA-seq datasets through latent sample matching
Holmström, S., Hautaniemi, S. & Häkkinen, A., 28 huhtik. 2022, julkaisussa: Bioinformatics. 38, 9, s. 2474-2480 7 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Aktiviteetit
-
Founder graphs and sequences for pangenomics
Veli Mäkinen (Puhuja)
helmik. 2022Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Suullinen esitys
-
Massimo Cairo
Alexandru Tomescu (Isäntä)
20 maalisk. 2022 → 2 huhtik. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
33rd International Workshop on Combinatorial Algorithms
Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
tammik. 2022 → huhtik. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Davide Martincigh
Alexandru Tomescu (Isäntä)
2 toukok. 2022 → 1 kesäk. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Brendan Mumey
Alexandru Tomescu (Isäntä)
14 toukok. 2022 → 21 toukok. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
Palkinnot
-
Alberto Apostolico Best Paper Award
Puglisi, Simon (Vastaanottaja), Raman, R. (Vastaanottaja), Belazzougui, D. (Vastaanottaja) & Kosolobov, D. (Vastaanottaja), 6 heinäk. 2021
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
-
University of Helsinki: Researchers Identified Factors That Turn Normal Cells Into Liver Cancer Cells
Sampsa Hautaniemi & Biswajyoti Sahu
08/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
388123-2021: Finland-Helsingin yliopisto: Services provided by medical laboratories
30/07/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
118211-2021: Finland-Helsinki: Services provided by medical laboratories
09/03/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Tender Notice: HELSINGIN YLIOPISTO Seeks "Next Generation Sequencing Services for Decider" (118211-2021)
09/03/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-