Julkaisut 2001 2020

2016

Low-Rank Doubly Stochastic Matrix Decomposition for Cluster Analysis

Yang, Z., Corander, J. & Oja, E., 2016, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 17, 187, s. 1-25 25 Sivumäärä, 1.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Marginal and simultaneous predictive classification using stratified graphical models

Nyman, H., Xiong, J., Pensar, J. & Corander, J., syyskuuta 2016, julkaisussa : Advances in Data Analysis and Classification. 10, 3, s. 305-326 22 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Mendelian randomisation analysis strongly implicates adiposity with risk of developing colorectal cancer

Jarvis, D., Mitchell, J. S., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Kaprio, J., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S. & 37 muutaPalotie, A., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Taipale, J., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P. & Houlston, R. S., 12 heinäkuuta 2016, julkaisussa : British Journal of Cancer. 115, 2, s. 266-272 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Mergeomics: multidimensional data integration to identify pathogenic perturbations to biological systems

Shu, L., Zhao, Y., Kurt, Z., Byars, S. G., Tukiainen, T., Kettunen, J., Orozco, L. D., Pellegrini, M., Lusis, A. J., Ripatti, S., Zhang, B., Inouye, M., Makinen, V-P. & Yang, X., 4 marraskuuta 2016, julkaisussa : BMC Genomics. 17, 16 Sivumäärä, 874.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Meta-analysis of 49 549 individuals imputed with the 1000 Genomes Project reveals an exonic damaging variant in ANGPTL4 determining fasting TG levels

van Leeuwen, E. M., Sabo, A., Bis, J. C., Huffman, J. E., Manichaikul, A., Smith, A. V., Feitosa, M. F., Demissie, S., Joshi, P. K., Duan, Q., Marten, J., van Klinken, J. B., Surakka, I., Nolte, I. M., Zhang, W., Mbarek, H., Li-Gao, R., Trompet, S., Verweij, N., Evangelou, E. & 31 muutaLyytikainen, L-P., Tayo, B. O., Deelen, J., van der Most, P. J., van der Laan, S. W., Arking, D. E., Morrison, A., Dehghan, A., Franco, O. H., Hofman, A., Rivadeneira, F., Sijbrands, E. J., Uitterlinden, A. G., Mychaleckyj, J. C., Campbell, A., Hocking, L. J., Padmanabhan, S., Brody, J. A., Rice, K. M., White, C. C., Harris, T., Isaacs, A., Campbell, H., Lange, L. A., Rudan, I., Kolcic, I., Navarro, P., Zemunik, T., Salomaa, V., Ripatti, S. & CHARGE Lipids Working Grp, heinäkuuta 2016, julkaisussa : Journal of Medical Genetics. 53, 7, s. 441-449 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

metaCCA: summary statistics-based multivariate meta-analysis of genome-wide association studies using canonical correlation analysis

Cichonska, A., Rousu, J., Marttinen, P., Kangas, A. J., Soininen, P., Lehtimaki, T., Raitakari, O. T., Jarvelin, M-R., Salomaa, V., Ala-Korpela, M., Ripatti, S. & Pirinen, M., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 13, s. 1981-1989 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Monomorphic genotypes within a generalist lineage of Campylobacter jejuni show signs of global dispersion

Llarena, A-K., Zhang, J., Vehkala, M., Välimäki, N., Hakkinen, M., Hänninen, M-L., Roasto, M., Mäesaar, M., Taboada, E., Barker, D., Garofolo, G., Cammà, C., Di Giannatale, E., Corander, J. & Rossi, M., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Microbial Genomics. 2, 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Multiple Output Regression with Latent Noise

Gillberg, J., Marttinen, P., Pirinen, M., Kangas, A. J., Soininen, P., Ali, M., Havulinna, A. S., Järvelin, M-R., Ala-Korpela, M. & Kaski, S., 1 tammikuuta 2016, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 17, 1, s. 4170-4204 35 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

New loci for body fat percentage reveal link between adiposity and cardiometabolic disease risk

Lu, Y., Day, F. R., Gustafsson, S., Buchkovich, M. L., Na, J., Bataille, V., Cousminer, D. L., Dastani, Z., Drong, A. W., Esko, T., Evans, D. M., Falchi, M., Feitosa, M. F., Ferreira, T., Hedman, A. K., Haring, R., Hysi, P. G., Iles, M. M., Justice, A. E., Kanoni, S. & 239 muutaLagou, V., Li, R., Li, X., Locke, A., Lu, C., Magi, R., Perry, J. R. B., Pers, T. H., Qi, Q., Sanna, M., Schmidt, E. M., Scott, W. R., Shungin, D., Teumer, A., Vinkhuyzen, A. A. E., Walker, R. W., Westra, H-J., Zhang, M., Zhang, W., Zhao, J. H., Zhu, Z., Afzal, U., Ahluwalia, T. S., Bakker, S. J. L., Bellis, C., Bonnefond, A., Borodulin, K., Buchman, A. S., Cederholm, T., Choh, A. C., Choi, H. J., Curran, J. E., de Groot, L. C. P. G. M., De Jager, P. L., Dhonukshe-Rutten, R. A. M., Enneman, A. W., Eury, E., Evans, D. S., Forsen, T., Friedrich, N., Fumeron, F., Garcia, M. E., Gartner, S., Han, B-G., Havulinna, A. S., Hayward, C., Hernandez, D., Hillege, H., Ittermann, T., Kent, J. W., Kolcic, I., Laatikainen, T., Lahti, J., Leach, I. M., Lee, C. G., Lee, J-Y., Liu, T., Liu, Y., Lobbens, S., Loh, M., Lyytikainen, L-P., Medina-Gomez, C., Michaelsson, K., Nalls, M. A., Nielson, C. M., Oozageer, L., Pascoe, L., Paternoster, L., Polasek, O., Ripatti, S., Sarzynski, M. A., Shin, C. S., Narancic, N. S., Spira, D., Srikanth, P., Steinhagen-Thiessen, E., Sung, Y. J., Swart, K. M. A., Taittonen, L., Tanaka, T., Tikkanen, E., van der Velde, N., van Schoor, N. M., Verweij, N., Wright, A. F., Yu, L., Zmuda, J. M., Pellikka, N., Forrester, T., Grarup, N., Jackson, A. U., Kristiansson, K., Kuulasmaa, T., Kuusisto, J., Lichtner, P., Luan, J., Mahajan, A., Mannisto, S., Palmer, C. D., Ried, J. S., Scott, R. A., Stancakova, A., Wagner, P. J., Demirkan, A., Doring, A., Gudnason, V., Kiel, D. P., Kuhnel, B., Mangino, M., Mcknight, B., Menni, C., O'Connell, J. R., Oostra, B. A., Shuldiner, A. R., Song, K., Vandenput, L., van Duijn, C. M., Vollenweider, P., White, C. C., Boehnke, M., Boettcher, Y., Cooper, R. S., Forouhi, N. G., Gieger, C., Grallert, H., Hingorani, A., Jorgensen, T., Jousilahti, P., Kivimaki, M., Kumari, M., Laakso, M., Langenberg, C., Linneberg, A., Luke, A., Mckenzie, C. A., Palotie, A., Pedersen, O., Peters, A., Strauch, K., Tayo, B. O., Wareham, N. J., Bennett, D. A., Bertram, L., Blangero, J., Bluher, M., Bouchard, C., Campbell, H., Cho, N. H., Cummings, S. R., Czerwinski, S. A., Demuth, I., Eckardt, R., Eriksson, J. G., Ferrucci, L., Franco, O. H., Froguel, P., Gansevoort, R. T., Hansen, T., Harris, T. B., Hastie, N., Heliovaara, M., Hofman, A., Jordan, J. M., Jula, A., Kahonen, M., Kajantie, E., Knekt, P. B., Koskinen, S., Kovacs, P., Lehtimaki, T., Lind, L., Liu, Y., Orwoll, E. S., Osmond, C., Perola, M., Perusse, L., Raitakari, O. T., Rankinen, T., Rao, D. C., Rice, T. K., Rivadeneira, F., Rudan, I., Salomaa, V., Sorensen, T. I. A., Stumvoll, M., Tonjes, A., Towne, B., Tranah, G. J., Tremblay, A., Uitterlinden, A. G., van der Harst, P., Vartiainen, E., Viikari, J. S., Vitart, V., Vohl, M-C., Volzke, H., Walker, M., Wallaschofski, H., Wild, S., Wilson, J. F., Yengo, L., Bishop, D. T., Borecki, I. B., Chambers, J. C., Cupples, L. A., Dehghan, A., Deloukas, P., Fatemifar, G., Fox, C., Furey, T. S., Franke, L., Han, J., Hunter, D. J., Karjalainen, J., Karpe, F., Kaplan, R. C., Kooner, J. S., McCarthy, M. I., Murabito, J. M., Morris, A. P., Bishop, J. A. N., North, K. E., Ohlsson, C., Ong, K. K., Prokopenko, I., Richards, J. B., Schadt, E. E., Spector, T. D., Widen, E., Willer, C. J., Yang, J., Ingelsson, E., Mohlke, K. L., Hirschhorn, J. N., Pospisilik, J. A., Zillikens, M. C., Lindgren, C., Kilpelainen, T. O. & Loos, R. J. F., helmikuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 15 Sivumäärä, 10495.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

No Association of Coronary Artery Disease with X-Chromosomal Variants in Comprehensive International Meta-Analysis

Loley, C., Alver, M., Assimes, T. L., Bjonnes, A., Goel, A., Gustafsson, S., Hernesniemi, J., Hopewell, J. C., Kanoni, S., Kleber, M. E., Lau, K. W., Lu, Y., Lyytikainen, L-P., Nelson, C. P., Nikpay, M., Qu, L., Salfati, E., Scholz, M., Tukiainen, T., Willenborg, C. & 58 muutaWon, H-H., Zeng, L., Zhang, W., Anand, S. S., Beutner, F., Bottinger, E. P., Clarke, R., Dedoussis, G., Do, R., Esko, T., Eskola, M., Farrall, M., Gauguier, D., Giedraitis, V., Granger, C. B., Hall, A. S., Hamsten, A., Hazen, S. L., Huang, J., Kahonen, M., Kyriakou, T., Laaksonen, R., Lind, L., Lindgren, C., Magnusson, P. K. E., Marouli, E., Mihailov, E., Morris, A. P., Nikus, K., Pedersen, N., Rallidis, L., Salomaa, V., Shah, S. H., Stewart, A. F. R., Thompson, J. R., Zalloua, P. A., Chambers, J. C., Collins, R., Ingelsson, E., Iribarren, C., Karhunen, P. J., Kooner, J. S., Lehtimaki, T., Loos, R. J. F., Maerz, W., McPherson, R., Metspalu, A., Reilly, M. P., Ripatti, S., Sanghera, D. K., Thiery, J., Watkins, H., Deloukas, P., Kathiresan, S., Samani, N. J., Schunkert, H., Erdmann, J. & Koenig, I. R., 12 lokakuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 9 Sivumäärä, 35278.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Notably improved inversion of differential mobility particle sizer data obtained under conditions of fluctuating particle number concentrations

Molgaard, B., Vanhatalo, J. P., Aalto, P. P., Prisle, N. L. & Hämeri, K. J., 29 helmikuuta 2016, julkaisussa : Atmospheric Measurement Techniques. 9, s. 741-751 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

On the Identifiability of Transmission Dynamic Models for Infectious Diseases

Lintusaari, J., Gutmann, M. U., Kaski, S. & Corander, J., maaliskuuta 2016, julkaisussa : Genetics. 202, 3, s. 911-918 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

On the inconsistency of ℓ1-penalised sparse precision matrix estimation

Heinävaara, O., Leppä-Aho, J., Corander, J. & Honkela, A., 13 joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17, Suppl 16, s. 99-107 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Orthogonal parallel MCMC methods for sampling and optimization

Martino, L., Elvira, V., Luengo, D., Corander, J. & Louzada, F., marraskuuta 2016, julkaisussa : Digital Signal Processing. 58, s. 64-84 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Rare Functional Variant in TM2D3 is Associated with Late-Onset Alzheimer's Disease

Jakobsdottir, J., van der Lee, S. J., Bis, J. C., Chouraki, V., Li-Kroeger, D., Yamamoto, S., Grove, M. L., Naj, A., Vronskaya, M., Salazar, J. L., DeStefano, A. L., Brody, J. A., Smith, A. V., Amin, N., Sims, R., Ibrahim-Verbaas, C. A., Choi, S-H., Satizabal, C. L., Lopez, O. L., Beiser, A. & 32 muutaIkram, M. A., Garcia, M. E., Hayward, C., Varga, T. V., Ripatti, S., Franks, P. W., Hallmans, G., Rolandsson, O., Jansson, J-H., Porteous, D. J., Salomaa, V., Eiriksdottir, G., Rice, K. M., Bellen, H. J., Levy, D., Uitterlinden, A. G., Emilsson, V., Rotter, J. I., Aspelund, T., O'Donnell, C. J., Fitzpatrick, A. L., Launer, L. J., Hofman, A., Wang, L-S., Williams, J., Schellenberg, G. D., Boerwinkle, E., Psaty, B. M., Seshadri, S., Shulman, J. M., Cohorts Heart Aging Res Genomic Ep & Genetic Environm Risk Alzheimer's, lokakuuta 2016, julkaisussa : PLoS Genetics. 12, 10, 17 Sivumäärä, 1006327.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Recursive learning for sparse Markov models

Xiong, J., Jääskinen, V. & Corander, J., 2016, julkaisussa : Bayesian analysis. 11, 1, s. 247-263 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

RNA Production Delays Shape Transcriptional Response Dynamics

Honkela, A. J. H. & Rattray, M., 25 toukokuuta 2016, julkaisussa : Cell Systems. 2, 5, s. 291 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

Open access

Sequence element enrichment analysis to determine the genetic basis of bacterial phenotypes

Lees, J. A., Vehkala, M., Välimäki, N., Harris, S. R., Chewapreecha, C., Croucher, N. J., Marttinen, P., Davies, M. R., Steer, A. C., Tong, S. Y. C., Honkela, A., Parkhill, J., Bentley, S. & Corander, J., 16 syyskuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 8 Sivumäärä, 12797.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Simultaneous Predictive Gaussian Classifiers

Cui, Y., Siren, J., Koski, T. & Corander, J., huhtikuuta 2016, julkaisussa : Journal of Classification. 33, 1, s. 73-102 30 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Statistical properties of the allelic mismatch distribution in neutrally evolving haploid populations

Shubin, M., Numminen, S. E., Gutmann, U. M., Hanage, W. P. & Corander, J. I., 2016, (Jätetty) julkaisussa : American Naturalist.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The Contribution of GWAS Loci in Familial Dyslipidemias

Ripatti, P., Ramo, J. T., Soderlund, S., Surakka, I., Matikainen, N., Pirinen, M., Pajukanta, P., Sarin, A-P., Service, S. K., Laurila, P-P., Ehnholm, C., Salomaa, V., Wilson, R. K., Palotie, A., Freimer, N. B., Taskinen, M-R. & Ripatti, S., toukokuuta 2016, julkaisussa : PLoS Genetics. 12, 5, 14 Sivumäärä, 1006078.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The de novo genome assembly and annotation of a female domestic dromedary of North African origin

Fitak, R. R., Mohandesan, E., Corander, J. & Burger, P. A., tammikuuta 2016, julkaisussa : Molecular Ecology Resources. 16, 1, s. 314-324 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The impact of host metapopulation structure on the population genetics of colonizing bacteria

Numminen, S. E., Gutmann, U. M., Shubin, M., Marttinen, P. E., Méric, G., van Schaik, W., Coque, T. M., Baquero, F., Willems, R. J. L., Sheppard, S. K., Feil, E. J., Hanage, W. P. & Corander, J. I., 2016, julkaisussa : Journal of Theoretical Biology. 396, s. 53-62 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The role of local partial independence in learning of Bayesian networks

Pensar, J., Nyman, H., Lintusaari, J. & Corander, J., helmikuuta 2016, julkaisussa : International Journal of Approximate Reasoning. 69, s. 91-105 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Trans-ancestry meta-analyses identify rare and common variants associated with blood pressure and hypertension

Surendran, P., Drenos, F., Young, R., Warren, H., Cook, J. P., Manning, A. K., Grarup, N., Sim, X., Barnes, D. R., Witkowska, K., Staley, J. R., Tragante, V., Tukiainen, T., Yaghootkar, H., Masca, N., Freitag, D. F., Ferreira, T., Giannakopoulou, O., Tinker, A., Harakalova, M. & 44 muutaMihailov, E., Liu, C., Kraja, A. T., Nielsen, S. F., Rasheed, A., Samue, M., Zhao, W., Bonnycastle, L. L., Jackson, A. U., Narisu, N., Swift, A. J., Southam, L., Marten, J., Huyghe, J. R., Stancakova, A., Fava, C., Ohlsson, T., Matchan, A., Stirrups, K. E., Bork-Jensen, J., Gjesing, A. P., Kontto, J., Perola, M., Shaw-Hawkins, S., Havulinna, A. S., Kajantie, E., Tuomi, T., Groop, L., Palotie, A., Ripatti, S., CHARGE Heart Failure Consortiumm, EchoGen Consortiumm, Metastroke Consortiumm, Giant Consortiumm, EPIC-InterAct Consortium, Lifelines Cohort Study, Wellcome Trust Case Control Consor, Understanding Soc Sci Grp, EPIC-CVD Consortium, CHARGE Exome Chip Blood Pressure C, T2D-GENES Consortium, GoT2DGenes Consortium, ExomeBP Consortium & CHD Exome Consortium, lokakuuta 2016, julkaisussa : Nature Genetics. 48, 10, s. 1151-1161 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Transcriptome Remodeling Contributes to Epidemic Disease Caused by the Human Pathogen Streptococcus pyogenes

Beres, S. B., Kachroo, P., Nasser, W., Olsen, R. J., Zhu, L., Flores, A. R., de la Riva, I., Paez-Mayorga, J., Jimenez, F. E., Cantu, C., Vuopio, J., Jalava, J., Kristinsson, K. G., Gottfredsson, M., Corander, J., Fittipaldi, N., Di Luca, M. C., Petrelli, D., Vitali, L. A., Raiford, A. & 2 muutaJenkins, L. & Musser, J. M., 2016, julkaisussa : mBio. 7, 3, 14 Sivumäärä, ARTN 00403-16.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Understanding pneumococcal serotype 1 biology through population genomic analysis

Chaguza, C., Cornick, J. E., Harris, S. R., Andam, C. P., Bricio-Moreno, L., Yang, M., Yalcin, F., Ousmane, S., Govindpersad, S., Senghore, M., Ebruke, C., Du Plessis, M., Kiran, A. M., Pluschke, G., Sigauque, B., McGee, L., Klugman, K. P., Turner, P., Corander, J., Parkhill, J. & 10 muutaCollard, J-M., Antonio, M., von Gottberg, A., Heyderman, R. S., French, N., Kadioglu, A., Hanage, W. P., Everett, D. B., Bentley, S. D. & PAGe Consortium, 8 marraskuuta 2016, julkaisussa : BMC Infectious Diseases. 16, 14 Sivumäärä, 649.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

USF1 deficiency activates brown adipose tissue and improves cardiometabolic health

Laurila, P-P., Soronen, J., Kooijman, S., Forsstrom, S., Boon, M. R., Surakka, I., Kaiharju, E., Coomans, C. P., Van den Berg, S. A. A., Autio, A., Sarin, A-P., Kettunen, J., Tikkanen, E., Manninen, T., Metso, J., Silvennoinen, R., Merikanto, K., Ruuth, M., Perttila, J., Makela, A. & 27 muutaIsomi, A., Tuomainen, A. M., Tikka, A., Ramadan, U. A., Seppala, I., Lehtimaki, T., Eriksson, J., Havulinna, A., Jula, A., Karhunen, P. J., Salomaa, V., Perola, M., Ehnholm, C., Lee-Rueckert, M., Van Eck, M., Roivainen, A., Taskinen, M-R., Palotie, L., Mervaala, E., Jalanko, A., Hohtola, E., Olkkonen, V. M., Ripatti, S., Kovanen, P. T., Rensen, P. C. N., Suomalainen, A. & Jauhiainenit, M., 27 tammikuuta 2016, julkaisussa : Science translational medicine. 8, 323, 19 Sivumäärä, ARTN 323ra13.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Variation at 2q35 (PNKD and TMBIM1) influences colorectal cancer risk and identifies a pleiotropic effect with inflammatory bowel disease

Orlando, G., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Kaprio, J., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A. & 37 muutaJärvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Tenesa, A., Farrington, S., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J., Jenkins, M., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Taipale, J., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P., Aaltonen, L. A. & Houlston, R. S., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Human Molecular Genetics. 25, 11, s. 2349-2359 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

What's in a Name? Species-Wide Whole-Genome Sequencing Resolves Invasive and Noninvasive Lineages of Salmonella enterica Serotype Paratyphi B

Connor, T. R., Owen, S. V., Langridge, G., Connell, S., Nair, S., Reuter, S., Dallman, T. J., Corander, J., Tabing, K. C., Le Hello, S., Fookes, M., Doublet, B., Zhou, Z., Feltwell, T., Ellington, M. J., Herrera, S., Gilmour, M., Cloeckaert, A., Achtman, M., Parkhill, J. & 5 muutaWain, J., De Pinna, E., Weill, F-X., Peters, T. & Thomson, N., 2016, julkaisussa : mBio. 7, 4, 9 Sivumäärä, e00527-16.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Volume of Metric Balls in High-Dimensional Complex Grassmann Manifolds

Pitaval, R-A., Wei, L., Tirkkonen, O. & Corander, J., syyskuuta 2016, julkaisussa : IEEE Transactions on Information Theory. 62, 9, s. 5105-5116 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

A Bayesian Predictive Model for Clustering Data of Mixed Discrete and Continuous Type

Blomstedt, P., Tang, J., Xiong, J., Granlund, C. & Corander, J., maaliskuuta 2015, julkaisussa : IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 37, 3, s. 489-498 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A comprehensive 1000 Genomes-based genome-wide association meta-analysis of coronary artery disease

Nikpay, M., Goel, A., Won, H-H., Hall, L. M., Willenborg, C., Kanoni, S., Saleheen, D., Kyriakou, T., Nelson, C. P., Hopewell, J. C., Webb, T. R., Zeng, L., Dehghan, A., Alver, M., Armasu, S. M., Auro, K., Bjonnes, A., Chasman, D. I., Chen, S., Ford, I. & 132 muutaFranceschini, N., Gieger, C., Grace, C., Gustafsson, S., Huang, J., Hwang, S-J., Kim, Y. K., Kleber, M. E., Lau, K. W., Lu, X., Lu, Y., Lyytikainen, L-P., Mihailov, E., Morrison, A. C., Pervjakova, N., Qu, L., Rose, L. M., Salfati, E., Saxena, R., Scholz, M., Smith, A. V., Tikkanen, E., Uitterlinden, A., Yang, X., Zhang, W., Zhao, W., de Andrade, M., de Vries, P. S., van Zuydam, N. R., Anand, S. S., Bertram, L., Beutner, F., Dedoussis, G., Frossard, P., Gauguier, D., Goodall, A. H., Gottesman, O., Haber, M., Han, B-G., Huang, J., Jalilzadeh, S., Kessler, T., Koenig, I. R., Lannfelt, L., Lieb, W., Lind, L., Lindgren, C. M., Lokki, M-L., Magnusson, P. K., Mallick, N. H., Mehra, N., Meitinger, T., Memon, F-R., Morris, A. P., Nieminen, M. S., Pedersen, N. L., Peters, A., Rallidis, L. S., Rasheed, A., Samuel, M., Shah, S. H., Sinisalo, J., Stirrups, K. E., Trompet, S., Wang, L., Zaman, K. S., Ardissino, D., Boerwinkle, E., Borecki, I. B., Bottinger, E. P., Buring, J. E., Chambers, J. C., Collins, R., Cupples, L. A., Danesh, J., Demuth, I., Elosua, R., Epstein, S. E., Esko, T., Feitosa, M. F., Franco, O. H., Franzosi, M. G., Granger, C. B., Gu, D., Gudnason, V., Hall, A. S., Hamsten, A., Harris, T. B., Hazen, S. L., Hengstenberg, C., Hofman, A., Ingelsson, E., Iribarren, C., Jukema, J. W., Karhunen, P. J., Kim, B-J., Kooner, J. S., Kullo, I. J., Lehtimaki, T., Loos, R. J. F., Melander, O., Metspalu, A., Maerz, W., Palmer, C. N., Perola, M., Quertermous, T., Rader, D. J., Ridker, P. M., Ripatti, S., Roberts, R., Salomaa, V., Sanghera, D. K., Schwartz, S. M., Seedorf, U., Stewart, A. F., Stott, D. J., Thiery, J., Zalloua, P. A., O'Donnell, C. J., Reilly, M. P., Assimes, T. L., Thompson, J. R., Erdmann, J., Clarke, R., Watkins, H., Kathiresan, S., McPherson, R., Deloukas, P., Schunkert, H., Samani, N. J., Farrall, M. & CARDIoGRAMplusC4D Consortium, lokakuuta 2015, julkaisussa : Nature Genetics. 47, 10, s. 1121-+ 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Adaptive importance sampling in signal processing

Bugallo, M. F., Martino, L. & Corander, J., joulukuuta 2015, julkaisussa : Digital Signal Processing. 47, s. 36-49 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Adiposity as a cause of cardiovascular disease: a Mendelian randomization study

Haegg, S., Fall, T., Ploner, A., Maegi, R., Fischer, K., Draisma, H. H. M., Kals, M., de Vries, P. S., Dehghan, A., Willems, S. M., Sarin, A-P., Kristiansson, K., Nuotio, M-L., Havulinna, A. S., de Bruijn, R. F. A. G., Ikram, M. A., Kuningas, M., Stricker, B. H., Franco, O. H., Benyamin, B. & 44 muutaGieger, C., Hall, A. S., Huikari, V., Jula, A., Jarvelin, M-R., Kaakinen, M., Kaprio, J., Kobl, M., Mangino, M., Nelson, C. P., Palotie, A., Samani, N. J., Spector, T. D., Strachan, D. P., Tobin, M. D., Whitfield, J. B., Uitterlinden, A. G., Salomaa, V., Syvanen, A-C., Kuulasmaa, K., Magnusson, P. K., Esko, T., Hofman, A., de Geus, E. J. C., Lind, L., Giedraitis, V., Perola, M., Evans, A., Ferrieres, J., Virtamo, J., Kee, F., Tregouet, D-A., Arveiler, D., Amouyel, P., Gianfagna, F., Brambilla, P., Ripatti, S., van Duijn, C. M., Metspalu, A., Prokopenko, I., McCarthy, M. I., Pedersen, N. L., Ingelsson, E. & European Network Genetic Genomic E, huhtikuuta 2015, julkaisussa : International Journal of Epidemiology. 44, 2, s. 578-586 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A fast universal self-tuned sampler within Gibbs sampling

Martino, L., Yang, H., Luengo, D., Kanniainen, J. & Corander, J., joulukuuta 2015, julkaisussa : Digital Signal Processing. 47, s. 68-83 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Age- and Sex-Specific Causal Effects of Adiposity on Cardiovascular Risk Factors

Fall, T., Hagg, S., Ploner, A., Maegi, R., Fischer, K., Draisma, H. H. M., Sarin, A-P., Benyamin, B., Ladenvall, C., Akerlund, M., Kals, M., Esko, T., Nelson, C. P., Kaakinen, M., Huikari, V., Mangino, M., Meirhaeghe, A., Kristiansson, K., Nuotio, M-L., Kobl, M. & 31 muutaGrallert, H., Dehghan, A., Kuningas, M., de Vries, P. S., de Bruijn, R. F. A. G., Willems, S. M., Heikkila, K., Silventoinen, K., Pietilainen, K. H., Legry, V., Giedraitis, V., Goumidi, L., Syvanen, A-C., Strauch, K., Koenig, W., Lichtner, P., Herder, C., Palotie, A., Menni, C., Uitterlinden, A. G., Kuulasmaa, K., Havulinna, A. S., Moreno, L. A., Gonzalez-Gross, M., Evans, A., Tregouet, D-A., Perola, M., Kaprio, J., Groop, L., Ripatti, S. & ENGAGE Consortium, toukokuuta 2015, julkaisussa : Diabetes. 64, 5, s. 1841-1852 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A Genome-Wide Association Study of a Biomarker of Nicotine Metabolism

Loukola, A., Buchwald, J., Gupta, R., Palviainen, T., Hallfors, J., Tikkanen, E., Korhonen, T., Ollikainen, M., Sarin, A-P., Ripatti, S., Lehtimaki, T., Raitakari, O., Salomaa, V., Rose, R. J., Tyndale, R. F. & Kaprio, J., syyskuuta 2015, julkaisussa : PLoS Genetics. 11, 9, 23 Sivumäärä, 1005498.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A GRADIENT ADAPTIVE POPULATION IMPORTANCE SAMPLER

Elvira, V., Martino, L., Luengo, D. & Corander, J., 2015, 2015 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON ACOUSTICS, SPEECH, AND SIGNAL PROCESSING (ICASSP). s. 4075-4079 5 Sivumäärä (International Conference on Acoustics Speech and Signal Processing ICASSP).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

An Adaptive Population Importance Sampler: Learning From Uncertainty

Martino, L., Elvira, V., Luengo, D. & Corander, J., 15 elokuuta 2015, julkaisussa : IEEE Transactions on Signal Processing. 63, 16, s. 4422-4437 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

ARK: Aggregation of Reads by K-Means for Estimation of Bacterial Community Composition

Koslicki, D., Chatterjee, S., Shahrivar, D., Walker, A. W., Francis, S. C., Fraser, L. J., Vehkaperae, M., Lan, Y. & Corander, J., 23 lokakuuta 2015, julkaisussa : PLoS One. 10, 10, 16 Sivumäärä, 0140644.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data

Pirinen, M., Lappalainen, T., Zaitlen, N. A., Dermitzakis, E. T., Donnelly, P., McCarthy, M. I., Rivas, M. A. & GTEx Consortium, 1 elokuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 15, s. 2497-2504 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Baseline adjustment increases accurate interpretation of posturographic sway scores

Tietavainen, A., Corander, J. & Haeggstrom, E., syyskuuta 2015, julkaisussa : Gait & Posture. 42, 3, s. 285-288 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cell Specific eQTL Analysis without Sorting Cells

Westra, H-J., Arends, D., Esko, T., Peters, M. J., Schurmann, C., Schramm, K., Kettunen, J., Yaghootkar, H., Fairfax, B. P., Andiappan, A. K., Li, Y., Fu, J., Karjalainen, J., Platteel, M., Visschedijk, M., Weersma, R. K., Kasela, S., Milani, L., Tserel, L., Peterson, P. & 38 muutaReinmaa, E., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Rivadeneira, F., Homuth, G., Petersmann, A., Lorbeer, R., Prokisch, H., Meitinger, T., Herder, C., Roden, M., Grallert, H., Ripatti, S., Perola, M., Wood, A. R., Melzer, D., Ferrucci, L., Singleton, A. B., Hernandez, D. G., Knight, J. C., Melchiotti, R., Lee, B., Poidinger, M., Zolezzi, F., Larbi, A., Wang, D. Y., van den Berg, L. H., Veldink, J. H., Rotzschke, O., Makino, S., Salomaa, V., Strauch, K., Voelker, U., van Meurs, J. B. J., Metspalu, A., Wijmenga, C., Jansen, R. C. & Franke, L., toukokuuta 2015, julkaisussa : PLoS Genetics. 11, 5, 17 Sivumäärä, 1005223.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Climate induces seasonality in pneumococcal transmission

Numminen, E., Chewapreecha, C., Turner, C., Goldblatt, D., Nosten, F., Bentley, S. D., Turner, P. & Corander, J., 12 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Scientific Reports. 5, 14 Sivumäärä, 11344.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
Open access
Tiedosto

Core Genome Multilocus Sequence Typing Scheme for High-Resolution Typing of Enterococcus faecium

de Been, M., Pinholt, M., Top, J., Bletz, S., Mellmann, A., van Schaik, W., Brouwer, E., Rogers, M., Kraat, Y., Bonten, M., Corander, J., Westh, H., Harmsen, D. & Willems, R. J. L., joulukuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Microbiology. 53, 12, s. 3788-3797 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Denoising Cluster Analysis

Zhang, R., Yang, Z. & Corander, J., 2015, Neural Information Processing: 22nd International Conference, ICONIP 2015, Istanbul, Turkey, November 9-12, 2015, Proceedings Part III. Arik, S., Huang, T., Lai, W. K. & Liu, Q. (toim.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 435-442 8 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 9491).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Discovery and Fine-Mapping of Glycaemic and Obesity-Related Trait Loci Using High-Density Imputation

Horikoshi, M., Maegi, R., van de Bunt, M., Surakka, I., Sarin, A-P., Mahajan, A., Marullo, L., Thorleifsson, G., Haegg, S., Hottenga, J-J., Ladenvall, C., Ried, J. S., Winkler, T. W., Willems, S. M., Tsernikova, N., Esko, T., Beekman, M., Nelson, C. P., Willenborg, C., Wiltshire, S. & 31 muutaFerreira, T., Fernandez, J., Gaulton, K. J., Steinthorsdottir, V., Hamsten, A., Magnusson, P. K. E., Willemsen, G., Milaneschi, Y., Robertson, N. R., Groves, C. J., Bennett, A. J., Lehtimaeki, T., Viikari, J. S., Rung, J., Lyssenko, V., Perola, M., Heid, I. M., Herder, C., Grallert, H., Mueller-Nurasyid, M., Roden, M., Hypponen, E., Isaacs, A., van Leeuwen, E. M., Karssen, L. C., Mihailov, E., Kaprio, J., Eriksson, J. G., Groop, L., Ripatti, S. & Engage Consortium, heinäkuuta 2015, julkaisussa : PLoS Genetics. 11, 7, 24 Sivumäärä, 1005230.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Ecological Overlap and Horizontal Gene Transfer in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis

Meric, G., Miragaia, M., de Been, M., Yahara, K., Pascoe, B., Mageiros, L., Mikhail, J., Harris, L. G., Wilkinson, T. S., Rolo, J., Lamble, S., Bray, J. E., Jolley, K. A., Hanage, W. P., Bowden, R., Maiden, M. C. J., Mack, D., de Lencastre, H., Feil, E. J., Corander, J. & 1 muutaSheppard, S. K., toukokuuta 2015, julkaisussa : Genome Biology and Evolution. 7, 5, s. 1313-1328 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto