Julkaisut 2001 2020

Suodatin
Artikkeli
2020

High-dimensional structure learning of binary pairwise Markov networks: A comparative numerical study

Pensar, J., Xu, Y., Puranen, S., Pesonen, M., Kabashima, Y. & Corander, J., 2020, julkaisussa : Computational Statistics & Data Analysis. 141, s. 62-76 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2019

A comprehensive evaluation of predictive performance of 33 species distribution models at species and community levels

Norberg, A., Abrego Antia, N., Blanchet, F. G., Adler, F. R., Anderson, B. J., Anttila, J., Araújo, M. B., Dallas, T. A., Dunson, D., Elith, J., Foster, S., Fox, R., Franklin, J., Godsoe, W., Guisan, A., O'Hara, B., Hill, N. A., Holt, R. D., Hui, F. K. C., Husby, M. & 15 muutaKålås, J. A., Lehikoinen, A., Luoto, M., Mod, H. K., Newell, G., Renner, I., Roslin, T. V., Soininen, J., Thuiller, W., Vanhatalo, J. P., Warton, D., White, M., Zimmermann, N. E., Gravel, D. & Ovaskainen, O. T., elokuuta 2019, julkaisussa : Ecological Monographs. 89, 3, 24 Sivumäärä, e01370.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Additive multivariate Gaussian processes for joint species distribution modeling with heterogeneous data

Vanhatalo, J. P., Hartmann, M. & Veneranta, L., 2019, julkaisussa : Bayesian analysis.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A Gaussian process model and Bayesian variable selection for mapping function-valued quantitative traits with incomplete phenotype data

Vanhatalo, J. P., Li, Z. & Sillanpää, M., 2019, julkaisussa : Bioinformatics.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A Logical Approach to Context-Specific Independence

Corander, J., Hyttinen, A., Kontinen, J., Pensar, J. & Väänänen, J., syyskuuta 2019, julkaisussa : Annals of Pure and Applied Logic. 170, 9, s. 975-992 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Association analyses identify 31 new risk loci for colorectal cancer susceptibility

PRACTICAl Consortium, Law, P. J., Timofeeva, M., Fernandez-Rozadilla, C., Palin, K., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Eriksson, J. G., Jousilahti, P., Ripatti, S., Palotie, A., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Aaltonen, L. A., Rissanen, H., Salomaa, V. & 3 muutaBöhm, J., Mecklin, J-P. & Pukkala, E., 14 toukokuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 15 Sivumäärä, 2154.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Bayesian inference of atomistic structure in functional materials

Todorovic, M., Gutmann, M. U., Corander, J. & Rinke, P., 18 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Npj computational materials. 5, 7 Sivumäärä, 35.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Bayesian meta-analysis across genome-wide association studies of diverse phenotypes

Trochet, H., Pirinen, M., Band, G., Jostins, L., McVean, G. & Spencer, C. C. A., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Genetic Epidemiology. 43, 5, s. 532-547 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Disentangling the genetics of lean mass

Karasik, D., Zillikens, M. C., Hsu, Y-H., Aghdassi, A., Akesson, K., Amin, N., Barroso, I., Bennett, D. A., Bertram, L., Bochud, M., Borecki, I. B., Broer, L., Buchman, A. S., Byberg, L., Campbell, H., Campos-Obando, N., Cauley, J. A., Cawthon, P. M., Chambers, J. C., Chen, Z. & 137 muutaCho, N. H., Choi, H. J., Chou, W-C., Cummings, S. R., de Groot, L. C. P. G. M., De Jager, P. L., Demuth, I., Diatchenko, L., Econs, M. J., Eiriksdottir, G., Enneman, A. W., Eriksson, J., Eriksson, J. G., Estrada, K., Evans, D. S., Feitosa, M. F., Fu, M., Gieger, C., Grallert, H., Gudnason, V., Lenore, L. J., Hayward, C., Hofman, A., Homuth, G., Huffman, K. M., Husted, L. B., Illig, T., Ingelsson, E., Ittermann, T., Jansson, J-O., Johnson, T., Biffar, R., Jordan, J. M., Jula, A., Karlsson, M., Khaw, K-T., Kilpelainen, T. O., Klopp, N., Kloth, J. S. L., Koller, D. L., Kooner, J. S., Kraus, W. E., Kritchevsky, S., Kutalik, Z., Kuulasmaa, T., Kuusisto, J., Laakso, M., Lahti, J., Lang, T., Langdahl, B. L., Lerch, M. M., Lewis, J. R., Lill, C., Lind, L., Lindgren, C., Liu, Y., Livshits, G., Ljunggren, O., Loos, R. J. F., Lorentzon, M., Luan, J., Luben, R. N., Malkin, I., McGuigan, F. E., Medina-Gomez, C., Meitinger, T., Melhus, H., Mellstrom, D., Michaelsson, K., Mitchell, B. D., Morris, A. P., Mosekilde, L., Nethander, M., Newman, A. B., O'Connell, J. R., Oostra, B. A., Orwoll, E. S., Palotie, A., Peacock, M., Perola, M., Peters, A., Prince, R. L., Psaty, B. M., Räikkönen, K., Ralston, S. H., Ripatti, S., Rivadeneira, F., Robbins, J. A., Rotter, J. I., Rudan, I., Salomaa, V., Satterfield, S., Schipf, S., Shin, C. S., Smith, A. V., Smith, S. B., Soranzo, N., Spector, T. D., Stancakova, A., Stefansson, K., Steinhagen-Thiessen, E., Stolk, L., Streeten, E. A., Styrkarsdottir, U., Swart, K. M. A., Thompson, P., Thomson, C. A., Thorleifsson, G., Thorsteinsdottir, U., Tikkanen, E., Tranah, G. J., Uitterlinden, A. G., van Duijn, C. M., van Schoor, N. M., Vandenput, L., Vollenweider, P., Volzke, H., Wactawski-Wende, J., Walker, M., Wareham, N. J., Waterworth, D., Weedon, M. N., Wichmann, H-E., Widen, E., Williams, F. M. K., Wilson, J. F., Wright, N. C., Yerges-Armstrong, L. M., Yu, L., Zhang, W., Zhao, J. H., Zhou, Y., Nielson, C. M., Harris, T. B., Demissie, S., Kiel, D. P. & Ohlsson, C., helmikuuta 2019, julkaisussa : American Journal of Clinical Nutrition. 109, 2, s. 276-287 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Diversification of Colonization Factors in a Multidrug-Resistant Escherichia coli Lineage Evolving under Negative Frequency-Dependent Selection

McNally, A., Kallonen, T., Connor, C., Abudahab, K., Aanensen, D. M., Horner, C., Peacock, S. J., Parkhill, J., Croucher, N. J. & Corander, J., 30 huhtikuuta 2019, julkaisussa : mBio. 10, 2, s. e00644-19

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fast and flexible bacterial genomic epidemiology with PopPUNK

Lees, J. A., Harris, S. R., Tonkin-Hill, G., Gladstone, R. A., Lo, S. W., Weiser, J. N., Corander, J., Bentley, S. D. & Croucher, N. J., helmikuuta 2019, julkaisussa : Genome Research. 29, 2, s. 304-316 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fast hierarchical Bayesian analysis of population structure

Tonkin-Hill, G., Lees, J. A., Bentley, S. D., Frost, S. D. W. & Corander, J., 20 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 47, 11, s. 5539-5549 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide association analyses of risk tolerance and risky behaviors in over 1 million individuals identify hundreds of loci and shared genetic influences

23and Me Res Team, eQTLGen Consortium, Int Cannabis Consortium, Soc Sci Genetic Association Con, Linner, R. K., Perola, M., Ripatti, S., Gupta, R., Lahti, J., Eklund, N., Koskinen, S., Latvala, A., Loukola, A., Mäki-Opas, T., Palotie, A., Sarin, A-P., Räikkönen, K., Eriksson, J. G., Kaprio, J., Perola, M. & 3 muutaSalomaa, V., Kaasik, K. & Keltikangas-Järvinen, L., helmikuuta 2019, julkaisussa : Nature Genetics. 51, 2, s. 245-+ 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genome-wide association study in Finnish twins highlights the connection between nicotine addiction and neurotrophin signaling pathway

Hällfors, J., Palviainen, T., Surakka, I., Gupta, R., Buchwald, J., Raevuori, A., Ripatti, S., Korhonen, T., Jousilahti, P., Madden, P. A. F., Kaprio, J. & Loukola, A., toukokuuta 2019, julkaisussa : Addiction Biology. 24, 3, s. 549-561 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genomic and Functional Analysis of Emerging Virulent and Multidrug-Resistant Escherichia coli Lineage Sequence Type 648

Schaufler, K., Semmler, T., Wieler, L. H., Trott, D. J., Pitout, J., Peirano, G., Bonnedahl, J., Dolejska, M., Literak, I., Fuchs, S., Ahmed, N., Grobbel, M., Torres, C., McNally, A., Pickard, D., Ewers, C., Croucher, N. J., Corander, J. & Guenther, S., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 6, 12 Sivumäärä, e00243-19.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genomic determinants of speciation and spread of the Mycobacterium tuberculosis complex

Chiner-Oms, Á., Sánchez-Busó, L., Corander, J., Gagneux, S., Harris, S. R., Young, D., González-Candelas, F. & Comas, I., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Science Advances. 5, 6, 14 Sivumäärä, 3307.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genomics of 1 million parent lifespans implicates novel pathways and common diseases and distinguishes survival chances

eQTLGen Consortium, Timmers, P. R. H. J., Kettunen, J., Perola, M. & Ripatti, S., 15 tammikuuta 2019, julkaisussa : eLife. 8, 40 Sivumäärä, 39856.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Geographic Variation and Bias in the Polygenic Scores of Complex Diseases and Traits in Finland

Kerminen, S., Martin, A. R., Koskela, J., Ruotsalainen, S. E., Havulinna, A. S., Surakka, I., Palotie, A., Perola, M., Salomaa, V., Daly, M. J., Ripatti, S. & Pirinen, M., 6 kesäkuuta 2019, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 104, 6, s. 1169-1181 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Healthcare costs and outcomes in adult patients with juvenile idiopathic arthritis: a population-based study

Mars, N. J., Kerola, A. M., Kauppi, M. J., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 4 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 2, s. 114-120 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Improving Illumina assemblies with Hi-C and long reads: An example with the North African dromedary

Elbers, J. P., Rogers, M. F., Perelman, P. L., Proskuryakova, A. A., Serdyukova, N. A., Johnson, W. E., Horin, P., Corander, J., Murphy, D. & Burger, P. A., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Molecular Ecology Resources. 19, 4, s. 1015-1026 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Index-based approach for estimating vulnerability of Arctic biota to oil spills

Nevalainen, M. K., Vanhatalo, J. & Helle, I., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Ecosphere.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Integrated analysis of population genomics, transcriptomics and virulence provides novel insights into Streptococcus pyogenes pathogenesis

Kachroo, P., Eraso, J. M., Beres, S. B., Olsen, R. J., Zhu, L., Nasser, W., Bernard, P. E., Cantu, C. C., Saavedra, M. O., Arredondo, M. J., Strope, B., Do, H., Kumaraswami, M., Vuopio, J., Gröndahl-Yli-Hannuksela, K., Kristinsson, K. G., Gottfredsson, M., Pesonen, M., Pensar, J., Davenport, E. R. & 11 muutaClark, A. G., Corander, J., Caugant, D. A., Gaini, S., Magnussen, M. D., Kubiak, S. L., Nguyen, H. A. T., Long, S. W., Porter, A. R., DeLeo, F. R. & Musser, J. M., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Nature Genetics. 51, 3, s. 548-563 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Integrating experimental and distribution data to predict future species patterns

Kotta, J., Vanhatalo, J. P., Jänes, H., Orav-Kotta, H., Rugiu, L., Jormalainen, V., Bobsien, I., Viitasalo, M., Virtanen, E., Nyström Sandman, A., Isaeus, M., Leidenberger, S., Jonsson, P. R. & Johannesson, K., 12 helmikuuta 2019, julkaisussa : Scientific Reports. 9, 14 Sivumäärä, 1821.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Laplace approximation and natural gradient for Gaussian process regression with heteroscedastic Student-t model

Hartmann, M. & Vanhatalo, J., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Statistics and Computing. 29, 4, s. 753–773 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Machine learning accelerated likelihood-free event reconstruction in dark matter direct detection

Simola, U., Pelssers, B., Barge, D., Conrad, J. & Corander, J., 6 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Journal of Instrumentation. 14, 28 Sivumäärä, 03004.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Macroevolution of gastric Helicobacter species unveils interspecies admixture and time of divergence (vol 12, pg 2518, 2018)

Smet, A., Yahara, K., Rossi, M., Tay, A., Backert, S., Ensser, A., Fox, J. G., Flahou, B., Ducatelle, R., Haesebrouck, F. & Corander, J., heinäkuuta 2019, julkaisussa : ISME Journal. 13, 7, s. 1890-1890 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Non-stationary Gaussian models with physical barriers

Bakka, H., Vanhatalo, J., Illian, J. B., Simpson, D. & Rue, H., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Spatial statistics. 29, s. 268-288 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

PANINI: Pangenome Neighbour Identification for Bacterial Populations

Abudahab, K., Prada, J. M., Yang, Z., Bentley, S. D., Croucher, N. J., Corander, J. & Aanensen, D. M., huhtikuuta 2019, julkaisussa : Microbial Genomics. 5, 4, 10 Sivumäärä, 000220.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Patients with rheumatic diseases share similar patterns of healthcare resource utilization

Mars, NJ., Kerola, AM., Kauppi, MJ., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 2019, julkaisussa : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 4, s. 300-307 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Patterns of cross-resistance and collateral sensitivity between clinical antibiotics and natural antimicrobials

Colclough, A., Corander, J., Sheppard, S. K., Bayliss, S. C. & Vos, M., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Evolutionary Applications. 12, 5, s. 878-887 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Representation transfer for differentially private drug sensitivity prediction

Niinimaki, T., Heikkila, M. A., Honkela, A. & Kaski, S., 5 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i218-i224 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

rPinecone: Define sub-lineages of a clonal expansion via a phylogenetic tree

Wailan, A. M., Coll, F., Heinz, E., Tonkin-Hill, G., Corander, J., Feasey, N. A. & Thomson, N. R., huhtikuuta 2019, julkaisussa : Microbial Genomics. 5, 4, 9 Sivumäärä, 000264.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Seasonal Variation in Genome-Wide DNA Methylation Patterns and the Onset of Seasonal Timing of Reproduction in Great Tits

Viitaniemi, H. M., Verhagen, I., Visser, M. E., Honkela, A., van Oers, K. & Husby, A., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Genome Biology and Evolution. 11, 3, s. 970-983 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The Contribution of Genetic Variation of Streptococcus pneumoniae to the Clinical Manifestation of Invasive Pneumococcal Disease

Cremers, A. J. H., Mobegi, F. M., van der Gaast-de Jongh, C., van Weert, M., van Opzeeland, F. J., Vehkala, M., Knol, M. J., Bootsma, H. J., Välimaki, N., Croucher, N. J., Meis, J. F., Bentley, S., van Hijum, S. A. F. T., Corander, J., Zomer, A. L., Ferwerda, G. & de Jonge, M. I., 1 tammikuuta 2019, julkaisussa : Clinical Infectious Diseases. 68, 1, s. 61-69 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Variation in neurosurgical management of traumatic brain injury: a survey in 68 centers participating in the CENTER-TBI study

van Essen, T. A., den Boogert, H. F., Cnossen, M. C., CENTER-TBI Investigators Partici, Kaukonen, M., Kivisaari, R., Piippo-Karjalainen, A., Raj, R., Tanskanen, P., Palotie, A., Pirinen, M. & Ripatti, S., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Acta Neurochirurgica. 161, 3, s. 435-449 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Analysis of shared heritability in common disorders of the brain

Brainstorm Consortium, Anttila, V., Bulik-Sullivan, B., Finucane, H. K., Walters, R. K., Bras, J., Duncan, L., Escott-Price, V., Falcone, G. J., Gormley, P., Malik, R., Patsopoulos, N. A., Ripke, S., Wei, Z., Yu, D., Lee, P. H., Turley, P., Grenier-Boley, B., Chouraki, V., Kamatani, Y. & 33 muutaBerr, C., Letenneur, L., Hannequin, D., Amouyel, P., Boland, A., Deleuze, J-F., Duron, E., Vardarajan, B. N., Reitz, C., Goate, A. M., Huentelman, M. J., Kamboh, M. I., Larson, E. B., Rogaeva, E., St George-Hyslop, P., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Palta, P., Wedenoja, J., Artto, V., Kaunisto, M., Vepsäläinen, S., Kurki, M. I., Hämäläinen, E., Kaprio, J., Metspalu, A., Keski-Rahkonen, A., Raevuori, A., Ripatti, S., Lönnqvist, J., Daly, M., Palotie, A. & Neale, B. M., 22 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Science. 360, 6395, s. 1313-+ 13 Sivumäärä, 8757.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Bacmeta: simulator for genomic evolution in bacterial metapopulations

Sipola, A., Marttinen, P. & Corander, J., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. 2308-2310 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Common Variant Burden Contributes to the Familial Aggregation of Migraine in 1,589 Families

23 Me Res Team, IHGC, Gormley, P., Kurki, M. I., Hiekkala, M. E., Häppölä, P., Palta, P., Surakka, I., Kaunisto, M. A., Hämäläinen, E., Vepsäläinen, S., Havanka, H., Harno, H., Ilmavirta, M., Nissilä, M., Säkö, E., Sumelahti, M-L., Liukkonen, J., Sillanpaa, M., Metsähonkala, L. & 15 muutaKoskinen, S., Lehtimaki, T., Raitakari, O., Männikko, M., Jousilahti, P., Anttila, V., Salomaa, V., Artto, V., Färkkilä, M., Daly, M. J., Neale, B. M., Ripatti, S., Kallela, M., Wessman, M. & Palotie, A., 16 toukokuuta 2018, julkaisussa : Neuron. 98, 4, s. 743–753 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Deep-coverage whole genome sequences and blood lipids among 16,324 individuals

NHLBI TOPMED Lipids Working Grp, 23 elokuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 12 Sivumäärä, 3391.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Exact Bayesian learning of Partition Directed Acyclic Graphs

Pensar, J., Kohonen, J. & Corander, J. I., 27 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Physics : Conference Series. 1036, 12 Sivumäärä, 012017.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genetic analysis of over 1 million people identifies 535 new loci associated with blood pressure traits

Million Vet Program, lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature Genetics. 50, 10, s. 1412-+ 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide association analyses identify 143 risk variants and putative regulatory mechanisms for type 2 diabetes

Xue, A., Wu, Y., Zhu, Z., Zhang, F., Kemper, K. E., Zheng, Z., Yengo, L., Lloyd-Jones, L. R., Sidorenko, J., Agbessi, M., Ahsan, H., Alves, I., Andiappan, A., Awadalla, P., Battle, A., Beutner, F., Bonder, M. J., Boomsma, D., Christiansen, M., Claringbould, A. & 62 muutaDeelen, P., Esko, T., Favé, M-J., Franke, L., Frayling, T., Gharib, S., Gibson, G., Hemani, G., Jansen, R., Kähönen, M., Kalnapenkis, A., Kasela, S., Kettunen, J., Kim, Y., Kirsten, H., Kovacs, P., Krohn, K., Kronberg-Guzman, J., Kukushkina, V., Kutalik, Z., Lee, B., Lehtimäki, T., Loeffler, M., Marigorta, U. M., Metspalu, A., Milani, L., Müller-Nurasyid, M., Nauck, M., Nivard, M., Penninx, B., Perola, M., Pervjakova, N., Pierce, B., Powell, J., Prokisch, H., Psaty, B., Raitakari, O., Ring, S., Ripatti, S., Rotzschke, O., Ruëger, S., Saha, A., Scholz, M., Schramm, K., Seppälä, I., Stumvoll, M., Sullivan, P., Teumer, A., Thiery, J., Tong, L., Tönjes, A., van Dongen, J., van Meurs, J., Verlouw, J., Völker, U., Võsa, U., Yaghootkar, H., Zeng, B., McRae, A. F., Visscher, P. M., Zeng, J. & Yang, J., 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 14 Sivumäärä, 2941.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide association study and meta-analysis in Northern European populations replicate multiple colorectal cancer risk loci

Tanskanen, T., van den Berg, L., Valimaki, N., Aavikko, M., Ness-Jensen, E., Hveem, K., Wettergren, Y., Lindskog, E. B., Tonisson, N., Metspalu, A., Silander, K., Orlando, G., Law, P. J., Tuupanen, S., Gylfe, A. E., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Kondelin, J., Sarin, A-P., Pukkala, E. & 40 muutaJousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A., Jarvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Tenesa, A., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J., Jenkins, M. A., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F. R., Casey, G., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P., Houlston, R. S., Palin, K. & Aaltonen, L. A., 1 helmikuuta 2018, julkaisussa : International Journal of Cancer. 142, 3, s. 540-546 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genome-wide association study in 79,366 European-ancestry individuals informs the genetic architecture of 25-hydroxyvitamin D levels

Jiang, X., O'Reilly, P. F., Aschard, H., Hsu, Y-H., Richards, J. B., Dupuis, J., Ingelsson, E., Karasik, D., Pilz, S., Berry, D., Kestenbaum, B., Zheng, J., Luan, J., Sofianopoulou, E., Streeten, E. A., Albanes, D., Lutsey, P. L., Yao, L., Tang, W., Econs, M. J. & 84 muutaWallaschofski, H., Voelzke, H., Zhou, A., Power, C., McCarthy, M. I., Michos, E. D., Boerwinkle, E., Weinstein, S. J., Freedman, N. D., Huang, W-Y., Van Schoor, N. M., van der Velde, N., de Groot, L. C. P. G. M., Enneman, A., Cupples, L. A., Booth, S. L., Vasan, R. S., Liu, C-T., Zhou, Y., Ripatti, S., Ohlsson, C., Vandenput, L., Lorentzon, M., Eriksson, J. G., Shea, M. K., Houston, D. K., Kritchevsky, S. B., Liu, Y., Lohman, K. K., Ferrucci, L., Peacock, M., Gieger, C., Beekman, M., Slagboom, E., Deelen, J., van Heemst, D., Kleber, M. E., Maerz, W., de Boer, I. H., Wood, A. C., Rotter, J. I., Rich, S. S., Robinson-Cohen, C., den Heijer, M., Jarvelin, M-R., Cavadino, A., Joshi, P. K., Wilson, J. F., Hayward, C., Lind, L., Michaelsson, K., Trompet, S., Zillikens, M. C., Uitterlinden, A. G., Rivadeneira, F., Broer, L., Zgaga, L., Campbell, H., Theodoratou, E., Farrington, S. M., Timofeeva, M., Dunlop, M. G., Valdes, A. M., Tikkanen, E., Lehtimaki, T., Lyytikainen, L-P., Kahonen, M., Raitakari, O. T., Mikkila, V., Ikram, M. A., Sattar, N., Jukema, J. W., Wareham, N. J., Langenberg, C., Forouhi, N. G., Gundersen, T. E., Khaw, K-T., Butterworth, A. S., Danesh, J., Spector, T., Wang, T. J., Hypponen, E., Kraft, P. & Kiel, D. P., 17 tammikuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 12 Sivumäärä, 260.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genomic Dissection of Bipolar Disorder and Schizophrenia, Including 28 Subphenotypes

Psychiat Genomics Consortium, Psychiat Genomics Consortium, Psychosis Endophenotypes Inter, Wellcome Trust Case Control, Ruderfer, D. M., Daly, M. J., Eriksson, J., Karjalainen, J., Lonnqvist, J., Meier, S., Neale, B. M., Palotie, A., Paunio, T., Pietilainen, O., Pirinen, M., Rautanen, A. & Suvisaari, J., 14 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Cell. 173, 7, s. 1705–1715.e1–e12 27 Sivumäärä, ARTN 1715.e16.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genomitiedon arkaluonteisuus on tiukassa elävä myytti

Palotie, A., Kaunisto, M., Kääriäinen, H., Perola, M., Pitkänen, K., Ripatti, S., Soini, S. & Widén, E., 2018, julkaisussa : Suomen lääkärilehti. 73, 15, s. 916-917 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Open access
Tiedosto

GPrank: an R package for detecting dynamic elements from genome-wide time series

Topa, H. & Honkela, A., 4 lokakuuta 2018, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 19, 6 Sivumäärä, 367.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Haplotype Sharing Provides Insights into Fine-Scale Population History and Disease in Finland

Martin, A. R., Karczewski, K. J., Kerminen, S., Kurki, M. I., Sarin, A-P., Artomov, M., Eriksson, J. G., Esko, T., Genovese, G., Havulinna, A. S., Kaprio, J., Konradi, A., Korányi, L., Kostareva, A., Männikkö, M., Metspalu, A., Perola, M., Prasad, R. B., Raitakari, O., Rotar, O. & 7 muutaSalomaa, V., Groop, L., Palotie, A., Neale, B. M., Ripatti, S., Pirinen, M. & Daly, M. J., 3 toukokuuta 2018, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 102, 5, s. 760-775 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of a Novel Genomic Island Associated with vanD-Type Vancomycin Resistance in Six Dutch Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium Isolates

Top, J., Sinnige, J. C., Brouwer, E. C., Werner, G., Corander, J., Severin, J. A., Jansen, R., Bathoorn, E., Bonten, M. J. M., Rossen, J. W. A. & Willems, R. J. L., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 3, 7 Sivumäärä, e01793-17.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto