Julkaisut 2001 2020

Suodatin
Artikkeli
2018

Genomitiedon arkaluonteisuus on tiukassa elävä myytti

Palotie, A., Kaunisto, M., Kääriäinen, H., Perola, M., Pitkänen, K., Ripatti, S., Soini, S. & Widén, E., 2018, julkaisussa : Suomen lääkärilehti. 73, 15, s. 916-917 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Open access
Tiedosto

GPrank: an R package for detecting dynamic elements from genome-wide time series

Topa, H. & Honkela, A., 4 lokakuuta 2018, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 19, 6 Sivumäärä, 367.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Haplotype Sharing Provides Insights into Fine-Scale Population History and Disease in Finland

Martin, A. R., Karczewski, K. J., Kerminen, S., Kurki, M. I., Sarin, A-P., Artomov, M., Eriksson, J. G., Esko, T., Genovese, G., Havulinna, A. S., Kaprio, J., Konradi, A., Korányi, L., Kostareva, A., Männikkö, M., Metspalu, A., Perola, M., Prasad, R. B., Raitakari, O., Rotar, O. & 7 muutaSalomaa, V., Groop, L., Palotie, A., Neale, B. M., Ripatti, S., Pirinen, M. & Daly, M. J., 3 toukokuuta 2018, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 102, 5, s. 760-775 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of a Novel Genomic Island Associated with vanD-Type Vancomycin Resistance in Six Dutch Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium Isolates

Top, J., Sinnige, J. C., Brouwer, E. C., Werner, G., Corander, J., Severin, J. A., Jansen, R., Bathoorn, E., Bonten, M. J. M., Rossen, J. W. A. & Willems, R. J. L., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 3, 7 Sivumäärä, e01793-17.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Identifying gene targets for brain-related traits using transcriptomic and methylomic data from blood

eQTLGen Consortium, 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Insights into the genetic epidemiology of Crohn's and rare diseases in the Ashkenazi Jewish population

Int IBD Genetics Consortium, NIDDK IBD Genetics Consortium, T2D-Genes Consortium, Rivas, M. A., Koskela, J., Pirinen, M., Kurki, M., Saavalainen, P., Farkkila, M., Kontula, K., Palotie, A. & Daly, M. J., toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS Genetics. 14, 5, 25 Sivumäärä, 1007329.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Inverse finite-size scaling for high-dimensional significance analysis

Xu, Y., Puranen, S., Corander, J. & Kabashima, Y., 6 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 6, 9 Sivumäärä, 062112.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Kpax3: Bayesian bi-clustering of large sequence datasets

Pessia, A. & Corander, J., 15 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 12, s. 2132-2133 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Macroevolution of gastric Helicobacter species unveils interspecies admixture and time of divergence

Smet, A., Yahara, K., Rossi, M., Tay, A., Backert, S., Armin, E., Fox, J. G., Flahou, B., Ducatelle, R., Haesebrouck, F. & Corander, J., 25 kesäkuuta 2018, julkaisussa : ISME Journal. 12, 10, s. 2518-2531 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

mlplasmids: a user-friendly tool to predict plasmid- and chromosome-derived sequences for single species

Arredondo-Alonso, S., Rogers, M. R. C., Braat, J. C., Verschuuren, T. D., Top, J., Corander, J., Willems, R. J. L. & Schürch, A. C., 1 marraskuuta 2018, julkaisussa : Microbial Genomics. 4, 11, 15 Sivumäärä, 000224.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Obstructive sleep apnoea and the risk for coronary heart disease and type 2 diabetes: a longitudinal population-based study in Finland

Strausz, S., Havulinna, A. S., Tuomi, T., Bachour, A., Groop, L., Mäkitie, A., Koskinen, S., Salomaa, V., Palotie, A., Ripatti, S. & Palotie, T., lokakuuta 2018, julkaisussa : BMJ Open. 8, 10, 8 Sivumäärä, 022752.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Phenome-wide association studies across large population cohorts support drug target validation

23andMe Res Team, 16 lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 13 Sivumäärä, 4285.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

pyseer: a comprehensive tool for microbial pangenome-wide association studies

Lees, J. A., Galardini, M., Bentley, S. D., Weiser, J. N. & Corander, J., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4310-4312 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Quantifying the Impact of Rare and Ultra-rare Coding Variation across the Phenotypic Spectrum

GoT2D T2D-GENES Consortium, SIGMA Consortium Helmsley IBD Exom, FinMetSeq Consortium, iPSYCH-Broad Consortium, Ganna, A., Kurki, M., Havulinna, A. S., Saarentaus, E., Ripatti, S., Hämäläinen, E., Moilanen, J. S., Kuismin, O., Palotie, A. & Neale, B. M., 7 kesäkuuta 2018, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 102, 6, s. 1204-1211 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The evolution of ecological facilitation within mixed-species biofilms in the mouse gastrointestinal tract

Lin, X. B., Wang, T., Stothard, P., Corander, J., Wang, J., Baines, J. F., Knowles, S. C. L., Baltrunaité, L., Tasseva, G., Schmaltz, R., Tollenaar, S., Cody, L. A., Grenier, T., Wu, W., Ramer-Tait, A. E. & Walter, J., 16 heinäkuuta 2018, julkaisussa : ISME Journal. 12, 11, s. 2770-2784 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Transancestral GWAS of alcohol dependence reveals common genetic underpinnings with psychiatric disorders

23andMe Res Team & Räikkönen, K., joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Neuroscience. 21, 12, s. 1656-+ 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2017

A genome-wide association study of anorexia nervosa suggests a risk locus implicated in dysregulated leptin signaling

Li, D., Chang, X., Connolly, J. J., Tian, L., Liu, Y., Bhoj, E. J., Robinson, N., Abrams, D., Li, Y. R., Bradfield, J. P., Kim, C. E., Li, J., Wang, F., Snyder, J., Lemma, M., Hou, C., Wei, Z., Guo, Y., Qiu, H., Mentch, F. D. & 12 muutaThomas, K. A., Chiavacci, R. M., Cone, R., Li, B., Sleiman, P. A., Hakonarson, H., Eating Disorders Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium, Kaprio, J., Palotie, A., Raevuori-Helkamaa, A., Ripatti, S. & Price Fdn Collaborative Grp, 19 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Scientific Reports. 7, 9 Sivumäärä, 3847.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A Low-Frequency Inactivating AKT2 Variant Enriched in the Finnish Population Is Associated With Fasting Insulin Levels and Type 2 Diabetes Risk

Manning, A., Highland, H. M., Gasser, J., Sim, X., Tukiainen, T., Fontanillas, P., Grarup, N., Rivas, M. A., Mahajan, A., Locke, A. E., Cingolani, P., Pers, T. H., Vinuela, A., Brown, A. A., Wu, Y., Flannick, J., Fuchsberger, C., Gamazon, E. R., Gaulton, K. J., Im, H. K. & 243 muutaTeslovich, T. M., Blackwell, T. W., Bork-Jensen, J., Burtt, N. P., Chen, Y., Green, T., Hartl, C., Kang, H. M., Kumar, A., Ladenvall, C., Ma, C., Moutsianas, L., Pearson, R. D., Perry, J. R. B., Rayner, N. W., Robertson, N. R., Scott, L. J., van de Bunt, M., Eriksson, J. G., Jula, A., Koskinen, S., Lehtimaki, T., Palotie, A., Raitakari, O. T., Jacobs, S. B. R., Wessel, J., Chu, A. Y., Scott, R. A., Goodarzi, M. O., Blancher, C., Buck, G., Buck, D., Chines, P. S., Gabriel, S., Gjesing, A. P., Groves, C. J., Hollensted, M., Huyghe, J. R., Jackson, A. U., Jun, G., Justesen, J. M., Mangino, M., Murphy, J., Neville, M., Onofrio, R., Small, K. S., Stringham, H. M., Trakalo, J., Banks, E., Carey, J., Carneiro, M. O., DePristo, M., Farjoun, Y., Fennell, T., Goldstein, J. I., Grant, G., de Angelis, M. H., Maguire, J., Neale, B. M., Poplin, R., Purcell, S., Schwarzmayr, T., Shakir, K., Smith, J. D., Strom, T. M., Wieland, T., Lindstrom, J., Brandslund, I., Christensen, C., Surdulescu, G. L., Lakka, T. A., Doney, A. S. F., Nilsson, P., Wareham, N. J., Langenberg, C., Varga, T. V., Franks, P. W., Rolandsson, O., Rosengren, A. H., Farook, V. S., Thameem, F., Puppala, S., Kumar, S., Lehman, D. M., Jenkinson, C. P., Curran, J. E., Hale, D. E., Fowler, S. P., Arya, R., DeFronzo, R. A., Abboud, H. E., Syvanen, A-C., Hicks, P. J., Palmer, N. D., Ng, M. C. Y., Bowden, D. W., Freedman, B. I., Esko, T., Magi, R., Milani, L., Mihailov, E., Metspalu, A., Narisu, N., Kinnunen, L., Bonnycastle, L. L., Swift, A., Pasko, D., Wood, A. R., Fadista, J., Pollin, T. I., Barzilai, N., Atzmon, G., Glaser, B., Thorand, B., Strauch, K., Peters, A., Roden, M., Mueller-Nurasyid, M., Liang, L., Kriebel, J., Illig, T., Grallert, H., Gieger, C., Meisinger, C., Lannfelt, L., Musani, S. K., Griswold, M., Taylor, H. A., Wilson, G., Correa, A., Oksa, H., Scott, W. R., Afzal, U., Tan, S-T., Loh, M., Chambers, J. C., Sehmi, J., Kooner, J. S., Lehne, B., Cho, Y. S., Lee, J-Y., Han, B-G., Karajamaki, A., Qi, Q., Qi, L., Huang, J., Hu, F. B., Melander, O., Orho-Melander, M., Below, J. E., Aguilar, D., Wong, T. Y., Liu, J., Khor, C-C., Chia, K. S., Lim, W. Y., Cheng, C-Y., Chan, E., Tai, E. S., Aung, T., Linneberg, A., Isomaa, B., Meitinger, T., Tuomi, T., Hakaste, L., Kravic, J., Jorgensen, M. E., Lauritzen, T., Deloukas, P., Stirrups, K. E., Owen, K. R., Farmer, A. J., Frayling, T. M., O'Rahilly, S. P., Walker, M., Levy, J. C., Hodgkiss, D., Hattersley, A. T., Kuulasmaa, T., Stancakova, A., Barroso, I., Bharadwaj, D., Chan, J., Chandak, G. R., Daly, M. J., Donnelly, P. J., Ebrahim, S. B., Elliott, P., Fingerlin, T., Froguel, P., Hu, C., Jia, W., Ma, R. C. W., McVean, G., Park, T., Prabhakaran, D., Sandhu, M., Scott, J., Sladek, R., Tandon, N., Teo, Y. Y., Zeggini, E., Watanabe, R. M., Koistinen, H. A., Kesaniemi, Y. A., Uusitupa, M., Spector, T. D., Salomaa, V., Rauramaa, R., Palmer, C. N. A., Prokopenko, I., Morris, A. D., Bergman, R. N., Collins, F. S., Lind, L., Ingelsson, E., Tuomilehto, J., Karpe, F., Groop, L., Jorgensen, T., Hansen, T., Pedersen, O., Kuusisto, J., Abecasis, G., Bell, G. I., Blangero, J., Cox, N. J., Duggirala, R., Seielstad, M., Wilson, J. G., Dupuis, J., Ripatti, S., Hanis, C. L., Florez, J. C., Mohlke, K. L., Meigs, J. B., Laakso, M., Morris, A. P., Boehnke, M., Altshuler, D., McCarthy, M. I., Gloyn, A. L. & Lindgren, C. M., 1 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Diabetes. 66, 7, s. 2019-2032 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

An Expanded Genome-Wide Association Study of Type 2 Diabetes in Europeans

Scott, R. A., Scott, L. J., Maegi, R., Marullo, L., Gaulton, K. J., Kaakinen, M., Pervjakova, N., Pers, T. H., Johnson, A. D., Eicher, J. D., Jackson, A. U., Ferreira, T., Lee, Y., Ma, C., Steinthorsdottir, V., Thorleifsson, G., Qi, L., Van Zuydam, N. R., Mahajan, A., Chen, H. & 31 muutaAlmgren, P., Voight, B. F., Grallert, H., Mueller-Nurasyid, M., Ried, J. S., Rayner, N. W., Robertson, N., Karssen, L. C., Van Leeuwen, E. M., Willems, S. M., Fuchsberger, C., Kwan, P., Teslovich, T. M., Chanda, P., Li, M., Lu, Y., Dina, C., Thuillier, D., Yengo, L., Jiang, L., Chheda, H., Tuomi, T., Koistinen, H. A., Kinnunen, L., Eriksson, J. G., Peltonen, L., Tikkanen, E., Ripatti, S., Tuomilehto, J., Groop, L. C. & Diabetes Genetics Replicat, 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Diabetes. 66, 11, s. 2888-2902 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Asymptotic Analysis of Rayleigh Product Channels: A Free Probability Approach

Zheng, Z., Wei, L., Speicher, R., Muller, R. R., Hämäläinen, J. & Corander, J., maaliskuuta 2017, julkaisussa : IEEE Transactions on Information Theory. 63, 3, s. 1731-1745 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

biMM: efficient estimation of genetic variances and covariances for cohorts with high-dimensional phenotype measurements

Pirinen, M., Benner, C., Marttinen, P., Jarvelin, M-R., Rivas, M. A. & Ripatti, S., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 15, s. 2405-2407 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Does expecting more pain make it more intense? Factors associated with the first week pain trajectories after breast cancer surgery

Sipila, R. M., Haasio, L., Meretoja, T. J., Ripatti, S., Estlander, A-M. & Kalso, E. A., toukokuuta 2017, julkaisussa : Pain. 158, 5, s. 922-930 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Enrichment of low-frequency functional variants revealed by whole-genome sequencing of multiple isolated European populations

Xue, Y., Mezzavilla, M., Haber, M., McCarthy, S., Chen, Y., Narasimhan, V., Gilly, A., Ayub, Q., Colonna, V., Southam, L., Finan, C., Massaia, A., Chheda, H., Palta, P., Ritchie, G., Asimit, J., Dedoussis, G., Gasparini, P., Palotie, A., Ripatti, S. & 6 muutaSoranzo, N., Toniolo, D., Wilson, J. F., Durbin, R., Tyler-Smith, C. & Zeggini, E., 23 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 7 Sivumäärä, 15927.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Family aggregation of cardiovascular disease mortality: a register-based prospective study of pooled Nordic twin cohorts

Silventoinen, K., Hjelmborg, J., Moller, S., Ripatti, S., Skythe, A., Tikkanen, E., Pedersen, N. L., Magnusson, P. K. E., Christensen, K. & Kaprio, J., elokuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Epidemiology. 46, 4, s. 1223-1229 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Gaussian processs framework for temporal dependence and discrepancy functions in Ricker-type population growth models

Hartmann, M., Hosack, G. R., Hillary, R. M. & Vanhatalo, J. P., syyskuuta 2017, julkaisussa : Annals of Applied Statistics. 11, 3, s. 1375-1402 28 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genetic effects on life-history traits in the Glanville fritillary butterfly

Duplouy, A., Wong, S. C., Corander, J., Lehtonen, R. & Hanski, I., 25 toukokuuta 2017, julkaisussa : PeerJ. 5, 23 Sivumäärä, 3371.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genetic loci associated with coronary artery disease harbor evidence of selection and antagonistic pleiotropy

Byars, S. G., Huang, Q. Q., Gray, L-A., Bakshi, A., Ripatti, S., Abraham, G., Stearns, S. C. & Inouye, M., kesäkuuta 2017, julkaisussa : PLoS Genetics. 13, 6, 27 Sivumäärä, 1006328.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide association analysis identifies novel blood pressure loci and offers biological insights into cardiovascular risk

Warren, H. R., Evangelou, E., Cabrera, C. P., Gao, H., Ren, M., Mifsud, B., Ntalla, I., Surendran, P., Liu, C., Cook, J. P., Kraja, A. T., Drenos, F., Loh, M., Verweij, N., Marten, J., Karaman, I., Lepe, M. P. S., O'Reilly, P. F., Knight, J., Snieder, H. & 284 muutaKato, N., He, J., Tai, E. S., Said, M. A., Porteous, D., Alver, M., Poulter, N., Farrall, M., Gansevoort, R. T., Padmanabhan, S., Magi, R., Stanton, A., Connell, J., Bakker, S. J. L., Metspalu, A., Shields, D. C., Thom, S., Brown, M., Sever, P., Esko, T., Hayward, C., van der Harst, P., Saleheen, D., Chowdhury, R., Chambers, J. C., Chasman, D. I., Chakravarti, A., Newton-Cheh, C., Lindgren, C. M., Levy, D., Kooner, J. S., Keavney, B., Tomaszewski, M., Samani, N. J., Howson, J. M. M., Tobin, M. D., Munroe, P. B., Ehret, G. B., Wain, L. V., Barnes, M. R., Tzoulaki, J., Caulfield, M. J., Elliott, P., Wain, L. V., Vaez, A., Jansen, R., Joehanes, R., van der Most, P. J., Erzurumluoglu, A. M., O'Reilly, P., Cabrera, C. P., Warren, H. R., Rose, L. M., Verwoert, G. C., Hottenga, J-J., Strawbridge, R. J., Esko, T., Arking, D. E., Hwang, S-J., Guo, X., Kutalik, Z., Trompet, S., Shrine, N., Teumer, A., Ried, J. S., Bis, J. C., Smith, A. V., Amin, N., Nolte, I. M., Lyytikainen, L-P., Mahajan, A., Wareham, N. J., Hofer, E., Joshi, P. K., Kristiansson, K., Traglia, M., Havulinna, A. S., Goel, A., Nalls, M. A., Sober, S., Vuckovic, D., Luan, J., Del Greco M, F., Ayers, K. L., Marrugat, J., Ruggiero, D., Lopez, L. M., Niiranen, T., Enroth, S., Jackson, A. U., Nelson, C. P., Huffman, J. E., Zhang, W., Marten, J., Gandin, I., Harris, S. E., Zemonik, T., Lu, Y., Evangelou, E., Shah, N., de Borst, M. H., Mangino, M., Prins, B. P., Campbell, A., Li-Gao, R., Chauhan, G., Oldmeadow, C., Abecasis, G., Abedi, M., Barbieri, C. M., Barnes, M. R., Batini, C., Blake, T., Boehnke, M., Bottinger, E. P., Braund, P. S., Brown, M., Brumat, M., Campbell, H., Chambers, J. C., Cocca, M., Collins, F., Connell, J., Cordell, H. J., Damman, J. J., Davies, G., de Geus, E. J., de Mutsert, R., Deelen, J., Demirkale, Y., Doney, A. S. F., Dorr, M., Farrall, M., Ferreira, T., Franberg, M., Gao, H., Giedraitis, V., Gieger, C., Giulianini, F., Gow, A. J., Hamsten, A., Harris, T. B., Hofman, A., Holliday, E. G., Jarvelin, M-R., Johansson, A., Johnson, A. D., Jousilahti, P., Jula, A., Kahonen, M., Kathiresan, S., Khaw, K-T., Kolcic, I., Koskinen, S., Langenberg, C., Larson, M., Launer, L. J., Lehne, B., Liewald, D. C. M., Lin, L., Lind, L., Mach, F., Mamasoula, C., Menni, C., Mifsud, B., Milaneschi, Y., Morgan, A., Morris, A. D., Morrison, A. C., Munson, P. J., Nandakumar, P., Quang Tri Nguyen, Nutile, T., Oldehinkel, A. J., Oostra, B. A., Org, E., Padmanabhan, S., Palotie, A., Pare, G., Pattie, A., Penninx, B. W. J. H., Poulter, N., Pramstaller, P. P., Raitakari, O. T., Ren, M., Rice, K., Ridker, P. M., Riese, H., Ripatti, S., Robino, A., Rotter, J. I., Rudan, I., Saba, Y., Saint Pierre, A., Sala, C. F., Sarin, A-P., Schmidt, R., Scott, R., Seelen, M. A., Shields, D. C., Siscovick, D., Sorice, R., Stanton, A., Stott, D. J., Sundstrom, J., Swertz, M., Taylor, K. D., Thom, S., Tzoulaki, I., Tzourio, C., Uitterlinden, A. G., Volker, U., Vollenweider, P., Wild, S., Willemsen, G., Wright, A. F., Yao, J., Theriault, S., Conen, D., John, A., Sever, P., Debette, S., Mook-Kanamori, D. O., Zeggini, E., Spector, T. D., van der Harst, P., Palmer, C. N. A., Vergnaud, A-C., Loos, R. J. F., Polasek, O., Starr, J. M., Girotto, G., Hayward, C., Kooner, J. S., Lindgren, C. M., Vitart, V., Samani, N. J., Tuomilehto, J., Gyllensten, U., Knekt, P., Deary, I. J., Ciullo, M., Elosua, R., Keavney, B. D., Hicks, A. A., Scott, R. A., Gasparini, P., Laan, M., Liu, Y., Watkins, H., Hartman, C. A., Salomaa, V., Toniolo, D., Perola, M., Wilson, J. F., Schmidt, H., Zhao, J. H., Lehtimaki, T., van Duijn, C. M., Gudnason, V., Psaty, B. M., Peters, A., Rettig, R., James, A., Jukema, J. W., Strachan, D. P., Palmas, W., Metspalu, A., Ingelsson, E., Boomsma, D. I., Franco, O. H., Bochud, M., Newton-Cheh, C., Munroe, P. B., Elliott, P., Chasman, D. I., Chakravarti, A., Knight, J., Morris, A. P., Levy, D., Tobin, M. D., Snieder, H., Caulfield, M. J. & Ehret, G. B., maaliskuuta 2017, julkaisussa : Nature Genetics. 49, 3, s. 403-415 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Genome-wide Association Study Identifies 27 Loci Influencing Concentrations of Circulating Cytokines and Growth Factors

Ahola-Olli, A. V., Wurtz, P., Havulinna, A. S., Aalto, K., Pitkanen, N., Lehtimaki, T., Kahonen, M., Lyytikainen, L-P., Raitoharju, E., Seppala, I., Sarin, A-P., Ripatti, S., Palotie, A., Perola, M., Viikari, J. S., Jalkanen, S., Maksimow, M., Salomaa, V., Salmi, M., Kettunen, J. & 1 muutaRaitakari, O. T., 5 tammikuuta 2017, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 100, 1, s. 40-50 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Identification of new susceptibility loci for type 2 diabetes and shared etiological pathways with coronary heart disease

Zhao, W., Rasheed, A., Tikkanen, E., Lee, J-J., Butterworth, A. S., Howson, J. M. M., Assimes, T. L., Chowdhury, R., Orho-Melander, M., Damrauer, S., Small, A., Asma, S., Imamura, M., Yamauch, T., Chambers, J. C., Chen, P., Sapkota, B. R., Shah, N., Jabeen, S., Surendran, P. & 33 muutaLu, Y., Zhang, W., Imran, A., Abbas, S., Majeed, F., Trindade, K., Qamar, N., Mallick, N. H., Yaqoob, Z., Saghir, T., Rizvi, S. N. H., Memon, A., Rasheed, S. Z., Memon, F-R., Mehmood, K., Ahmed, N., Qureshi, I. H., Tanveer-us-Salam, Iqbal, W., Malik, U., Mehra, N., Kuo, J. Z., Sheu, W. H-H., Guo, X., Hsiung, C. A., Juang, J-M. J., Taylor, K. D., Hung, Y-J., Lee, W-J., Ripatti, S., CHD Exome Consortium, EPIC-CVD Consortium & EPIC-Interact Consortium, lokakuuta 2017, julkaisussa : Nature Genetics. 49, 10, s. 1450-+ 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Impacts of eutrophication and oil spills on the Gulf of Finland herring stock

Rahikainen, M. K., Hoviniemi, K-M., Mäntyniemi, S. H. P., Vanhatalo, J. P., Helle, S. I., Lehtiniemi, M., Pönni, J. & Kuikka, O. S., 2017, julkaisussa : Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 74, 8, s. 1218-1232 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Interacting networks of resistance, virulence and core machinery genes identified by genome-wide epistasis analysis

Skwark, M. J., Croucher, N. J., Puranen, S., Chewapreecha, C., Pesonen, M., Xu, Y. Y., Turner, P., Harris, S. R., Beres, S. B., Musser, J. M., Parkhill, J., Bentley, S. D., Aurell, E. & Corander, J., helmikuuta 2017, julkaisussa : PLoS Genetics. 13, 2, 24 Sivumäärä, 1006508.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Large meta-analysis of genome-wide association studies identifies five loci for lean body mass

Zillikens, M. C., Demissie, S., Hsu, Y-H., Yerges-Armstrong, L. M., Chou, W-C., Stolk, L., Livshits, G., Broer, L., Johnson, T., Koller, D. L., Kutalik, Z., Luan, J., Malkin, I., Ried, J. S., Smith, A. V., Thorleifsson, G., Vandenput, L., Zhao, J. H., Zhang, W., Aghdassi, A. & 173 muutaAkesson, K., Amin, N., Baier, L. J., Barroso, I., Bennett, D. A., Bertram, L., Biffar, R., Bochud, M., Boehnke, M., Borecki, I. B., Buchman, A. S., Byberg, L., Campbell, H., Obanda, N. C., Cauley, J. A., Cawthon, P. M., Cederberg, H., Chen, Z., Cho, N. H., Choi, H. J., Claussnitzer, M., Collins, F., Cummings, S. R., De Jager, P. L., Demuth, I., Dhonukshe-Rutten, R. A. M., Diatchenko, L., Eiriksdottir, G., Enneman, A. W., Erdos, M., Eriksson, J. G., Eriksson, J., Estrada, K., Evans, D. S., Feitosa, M. F., Fu, M., Garcia, M., Gieger, C., Girke, T., Glazer, N. L., Grallert, H., Grewal, J., Han, B-G., Hanson, R. L., Hayward, C., Hofman, A., Hoffman, E. P., Homuth, G., Hsueh, W-C., Hubal, M. J., Hubbard, A., Huffman, K. M., Husted, L. B., Illig, T., Ingelsson, E., Ittermann, T., Jansson, J-O., Jordan, J. M., Jula, A., Karlsson, M., Khaw, K-T., Kilpainen, T. O., Klopp, N., Kloth, J. S. L., Koistinen, H. A., Kraus, W. E., Kritchevsky, S., Kuulasmaa, T., Kuusisto, J., Laakso, M., Lahti, J., Lang, T., Langdahl, B. L., Launer, L. J., Lee, J-Y., Lerch, M. M., Lewis, J. R., Lind, L., Lindgren, C., Liu, Y., Liu, T., Liu, Y., Ljunggren, O., Lorentzon, M., Luben, R. N., Maixner, W., McGuigan, F. E., Medina-Gomez, C., Meitinger, T., Melhus, H., Mellstrom, D., Melov, S., Michaelsson, K., Mitchell, B. D., Morris, A. P., Mosekilde, L., Newman, A., Nielson, C. M., O'Connell, J. R., Oostra, B. A., Orwoll, E. S., Palotie, A., Parker, S. C. J., Peacock, M., Perola, M., Peters, A., Polasek, O., Prince, R. L., Raikkonen, K., Ralston, S. H., Ripatti, S., Robbins, J. A., Rotter, J. I., Rudan, I., Salomaa, V., Satterfield, S., Schadt, E. E., Schipf, S., Scott, L., Sehmi, J., Shen, J., Shin, C. S., Sigurdsson, G., Smith, S., Soranzo, N., Stancakova, A., Steinhagen-Thiessen, E., Streeten, E. A., Styrkarsdottir, U., Swart, K. M. A., Tan, S-T., Tarnopolsky, M. A., Thompson, P., Thomson, C. A., Thorsteinsdottir, U., Tikkanen, E., Tranah, G. J., Tuomilehto, J., van Schoor, N. M., Verma, A., Vollenweider, P., Voelzke, H., Wactawski-Wende, J., Walker, M., Weedon, M. N., Welch, R., Wichmann, H. -E., Widen, E., Williams, F. M. K., Wilson, J. F., Wright, N. C., Xie, W., Yu, L., Zhou, Y., Chambers, J. C., Doring, A., van Duijn, C. M., Econs, M. J., Gudnason, V., Kooner, J. S., Psaty, B. M., Spector, T. D., Stefansson, K., Rivadeneira, F., Uitterlinden, A. G., Wareham, N. J., Ossowski, V., Waterworth, D., Loos, R. J. F., Karasik, D., Harris, T. B., Ohlsson, C. & Kiel, D. P., 19 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 13 Sivumäärä, 80.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Learning discrete decomposable graphical models via constraint optimization

Janhunen, T., Gebser, M., Rintanen, J., Nyman, H., Pensar, J. & Corander, J., tammikuuta 2017, julkaisussa : Statistics and Computing. 27, 1, s. 115-130 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Mendelian randomisation implicates hyperlipidaemia as a risk factor for colorectal cancer

Rodriguez-Broadbent, H., Law, P. J., Sud, A., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Ripatti, S., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Palotie, A. & 36 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Passarelli, M. N., Figueiredo, J. C., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Tomlinson, I. P., Dunlop, M. G. & Houlston, R. S., 15 kesäkuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Cancer. 140, 12, s. 2701-2708 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Modeling the spatial distribution of larval fish abundance provides essential information for management

Kallasvuo, M., Vanhatalo, J. & Veneranta, L., toukokuuta 2017, julkaisussa : Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 74, 5, s. 636-649 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Neuregulin signaling pathway in smoking behavior

Gupta, R., Qaiser, B., He, L., Hiekkalinna, T. S., Zheutlin, A. B., Therman, S., Ollikainen, M., Ripatti, S., Perola, M., Salomaa, V., Milani, L., Cannon, T. D., Madden, P. A. F., Korhonen, T., Kaprio, J. & Loukola, A., 22 elokuuta 2017, julkaisussa : Translational Psychiatry. 7, 8 Sivumäärä, 1212.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Novel Blood Pressure Locus and Gene Discovery Using Genome-Wide Association Study and Expression Data Sets From Blood and the Kidney

Wain, L. V., Vaez, A., Jansen, R., Joehanes, R., van der Most, P. J., Erzurumluoglu, A. M., O'Reilly, P. F., Cabrera, C. P., Warren, H. R., Rose, L. M., Verwoert, G. C., Hottenga, J-J., Strawbridge, R. J., Esko, T., Arking, D. E., Hwang, S-J., Guo, X., Kutalik, Z., Trompet, S., Shrine, N. & 33 muutaTeumer, A., Ried, J. S., Bis, J. C., Smith, A. V., Amin, N., Nolte, I. M., Lyytikainen, L-P., Mahajan, A., Wareham, N. J., Hofer, E., Joshi, P. K., Kristiansson, K., Traglia, M., Havulinna, A. S., Goel, A., Nalls, M. A., Sober, S., Vuckovic, D., Luan, J., Del Greco M, F., Ayers, K. L., Marrugat, J., Ruggiero, D., Lopez, L. M., Niiranen, T., Enroth, S., Palotie, A., Ripatti, S., Sarin, A-P., Perola, M., BIOS Consortium, Lifelines Cohort Study & Understanding Soc Sci Grp, syyskuuta 2017, julkaisussa : Hypertension. 70, 3, s. E4-+ 49 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Predicting ice-induced load amplitudes on ship bow conditional on ice thickness and ship speed in the Baltic Sea

Kotilainen, M., Vanhatalo, J. P., Suominen, M. & Kujala, P., maaliskuuta 2017, julkaisussa : Cold Regions Science and Technology. 135, s. 116–126 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Preparing for the unprecedented - Towards quantitative oil risk assessment in the Arctic marine areas

Nevalainen, M., Helle, I. & Vanhatalo, J., 15 tammikuuta 2017, julkaisussa : Marine Pollution Bulletin. 114, 1, s. 90-101 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Pro-inflammatory fatty acid profile and colorectal cancer risk: A Mendelian randomisation analysis

May-Wilson, S., Sud, A., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A. & 34 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Böhm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Fisher, D., Kerr, R., Kerr, D., Passarelli, M. N., Figueiredo, J. C., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Tomlinson, I. P., Dunlop, M. G. & Houlston, R. S., lokakuuta 2017, julkaisussa : European Journal of Cancer. 84, s. 228-238 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Sepelvaltimotautiriskin arviointi genomitietoa hyödyntämällä

Widén, E. & Ripatti, S., 2017, julkaisussa : Duodecim. 133, 8, s. 776-781 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Open access
Tiedosto

Spatiotemporal modelling of crown-of-thorns starfish outbreaks on the Great Barrier Reef to inform control strategies

Vanhatalo, J. P., Hosack, G. & Sweatman, H., tammikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Applied Ecology. 54, 1, s. 188-197

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Stratified Gaussian graphical models

Nyman, H., Pensar, J. & Corander, J., 2017, julkaisussa : Communications in Statistics: Theory and Methods. 46, 11, s. 5556-5578 23 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Suomi luomassa genomiikan ja terveystiedon internetiä

Palotie, A. & Ripatti, S., 2017, julkaisussa : Duodecim. 133, 8, s. 771-775 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Open access
Tiedosto

Variation in monitoring and treatment policies for intracranial hypertension in traumatic brain injury: a survey in 66 neurotrauma centers participating in the CENTER-TBI study

Cnossen, M. C., Huijben, J. A., van der Jagt, M., Volovici, V., van Essen, T., Polinder, S., Nelson, D., Ercole, A., Stocchetti, N., Citerio, G., Peul, W. C., Maas, A. I. R., Menon, D., Steyerberg, E. W., Lingsma, H. F., CENTER-TBI Investigators, Palotie, A., Pirinen, M., Raj, R. & Ripatti, S., 6 syyskuuta 2017, julkaisussa : Critical Care. 21, 12 Sivumäärä, 233.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Whole-genome view of the consequences of a population bottleneck using 2926 genome sequences from Finland and United Kingdom

Chheda, H., Palta, P., Pirinen, M., McCarthy, S., Walter, K., Koskinen, S., Salomaa, V., Daly, M., Durbin, R., Palotie, A., Aittokallio, T., Ripatti, S. & Sequencing Initiative Suomi SISu P, huhtikuuta 2017, julkaisussa : European Journal of Human Genetics. 25, 4, s. 477-484 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
2016

Analysis of differential splicing suggests different modes of short-term splicing regulation

Topa, H. & Honkela, A., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. 147-155 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

An object oriented Python interface for atomistic simulations

Hynninen, T., Himanen, L., Parkkinen, V., Musso, T., Corander, J. & Foster, A. S., tammikuuta 2016, julkaisussa : Computer Physics Communications. 198, s. 230-237 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A reference panel of 64,976 haplotypes for genotype imputation

McCarthy, S., Das, S., Kretzschmar, W., Delaneau, O., Wood, A. R., Teumer, A., Kang, H. M., Fuchsberger, C., Danecek, P., Sharp, K., Luo, Y., Sidorel, C., Kwong, A., Timpson, N., Koskinen, S., Vrieze, S., Scott, L. J., Zhang, H., Mahajan, A., Veldink, J. & 31 muutaPeters, U., Pato, C., van Duijn, C. M., Gillies, C. E., Gandin, I., Mezzavilla, M., Gilly, A., Cocca, M., Traglia, M., Angius, A., Barrett, J. C., Boomsma, D., Branham, K., Breen, G., Brummett, C. M., Busonero, F., Campbell, H., Chan, A., Che, S., Chew, E., Collins, F. S., Corbin, L. J., Smith, G. D., Dedoussis, G., Dorr, M., Farmaki, A-E., Ferrucci, L., Groop, L., Palotie, A., Ripatti, S. & Haplotype Reference Consortium, lokakuuta 2016, julkaisussa : Nature Genetics. 48, 10, s. 1279-1283 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu