Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Liisa Holm
- Organismi- ja evoluutiobiologian tutkimusohjelma - professori
- Biotekniikan instituutti
- Bioinformatics
- Computational genomics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Alan Medlar
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - yliopistotutkija
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Petri Törönen
- Organismi- ja evoluutiobiologian tutkimusohjelma - tutkijatohtori
- Computational genomics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Projektit
- 5 Päättynyt
-
HiLIFE Grand Challenge "Combatting microbial drug resistance"
Hiltunen, T. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Projektinjohtaja)
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
HiLIFE Grand Challenge consortium "Combatting antimicrobial resistance"
Hiltunen, T. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Projektinjohtaja)
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Muu projekti
-
HiLIFE Grand Challenge: Combatting Antimicrobial Drug Resistance
Virta, M. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Osallistuja)
01/10/2018 → 31/12/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Bugsy: Leikkausalueen patogeenien tunnistus metagenomiikan menetelmiä hyödyntäen (Bugsy)
Kankainen, M. (Projektinjohtaja), Holm, L. (Projektinjohtaja), Kankuri, E. (Principal Investigator), Varmanen, P. (Principal Investigator), Savijoki, K. (Osallistuja), Ojala, T. (Osallistuja), Medlar, A. (Osallistuja) & Vuola, J. (Principal Investigator)
01/09/2015 → 31/08/2019
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Glanville fritillary butterfly genomics and genetics
Lehtonen, R. (Osallistuja), Ahola, V. (Osallistuja), Somervuo, P. J. (Osallistuja), Frilander, M. (Osallistuja), Auvinen, P. (Osallistuja), Paulin, L. (Osallistuja) & Holm, L. (Osallistuja)
02/02/2009 → 30/03/2013
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Mitotic abnormalities precede microsatellite instability in lynch syndrome-associated colorectal tumourigenesis
Pussila, M., Laiho, A., Törönen, P., Björkbacka, P., Nykänen, S., Pylvänäinen, K., Holm, L., Mecklin, J.-P., Renkonen-Sinisalo, L., Lehtonen, T., Lepistö, A., Linden, J., Mäki-Nevala, S., Peltomäki, P. & Nyström, M., toukok. 2024, julkaisussa: EBioMedicine. 103, 17 Sivumäärä, 105111.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Multiomics profiling of DNA methylation, microRNA, and mRNA in skeletal muscle from monozygotic twin pairs discordant for type 2 diabetes identifies dysregulated genes controlling metabolism
Ling, C., Vavakova, M., Ahmad Mir, B., Säll, J., Perfilyev, A., Martin, M., Jansson, P.-A., Davegårdh, C., Asplund, O., Hansson, O., Vaag, A. & Nilsson, E., 2 jouluk. 2024, julkaisussa: BMC Medicine. 22, 1, 19 Sivumäärä, 572.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Sample, Nudge and Rank: Exploiting Interpretable GAN Controls for Exploratory Search
Liu, Y., Medlar, A. & Glowacka, D., 5 huhtik. 2024, Proceedings of the 29th International Conference on Intelligent User Interfaces. Association for Computing Machinery, s. 582-596 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
A faba bean pan-genome for advancing sustainable protein security
Auvinen, P., Chang, W., Holm, L., James, M., Jääskeläinen, M., Khazaei, H., Laine, P., Paulin, L., Guedes Salgado, M. P., Stoddard, F., Tanskanen, J., Törönen, P. & Schulman, A., jouluk. 2023, julkaisussa: Legume perspectives. 24, s. 7-9Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
DALI shines a light on remote homologs: one hundred discoveries
Holm, L., Laiho, A. H. T., Törönen, P. & Guedes Salgado, M. P., tammik. 2023, julkaisussa: Protein Science. 32, 1, 18 Sivumäärä, e4519.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
International Society for Computational Biology 2017
Törönen, P. (Osallistuja)
21 heinäk. 2017 → 25 heinäk. 2017Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Public Talks
-
Suomen Akatemia (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Puheenjohtaja)
14 lokak. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
-
Science Foundation Ireland (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Jäsen)
16 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä
-
Knut och Alice Wallenbergs stiftelse (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Asiantuntija)
12 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
-
Tieteellinen valtuuskunta (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Jäsen)
1 tammik. 2011 → 30 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa