Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Henkilöt

Ei valokuvaa Alan Medlar

Alan Medlar

Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY

20102019
Ei valokuvaa Petri Törönen

Petri Törönen

Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY

19992019
Valokuva Reda Younsi
20042019

Projektit

Julkaisut

Benchmarking fold detection by DaliLite v.5

Holm, L., 15 joulukuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 24, s. 5326-5327 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

DALI and the persistence of protein shape

Holm, L., 13 marraskuuta 2019, julkaisussa : Protein Science. 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Novel comparison of evaluation metrics for gene ontology classifiers reveals drastic performance differences

Plyusnin, I., Holm, L. & Toronen, P., marraskuuta 2019, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 15, 11, 27 Sivumäärä, 1007419.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens

Zhou, N., Jiang, Y., Bergquist, T. R., Lee, A. J., Kacsoh, B. Z., Crocker, A. W., Lewis, K. A., Georghiou, G., Nguyen, H. N., Hamid, M. N., Davis, L., Dogan, T., Atalay, V., Rifaioglu, A. S., Dalkiran, A., Atalay, R. C., Zhang, C., Hurto, R. L., Freddolino, P. L., Zhang, Y. & 147 muuta, Bhat, P., Supek, F., Fernandez, J. M., Gemovic, B., Perovic, V. R., Davidovic, R. S., Sumonja, N., Veljkovic, N., Asgari, E., Mofrad, M. R. K., Profiti, G., Savojardo, C., Martelli, P. L., Casadio, R., Boecker, F., Schoof, H., Kahanda, I., Thurlby, N., McHardy, A. C., Renaux, A., Saidi, R., Gough, J., Freitas, A. A., Antczak, M., Fabris, F., Wass, M. N., Hou, J., Cheng, J., Wang, Z., Romero, A. E., Paccanaro, A., Yang, H., Goldberg, T., Zhao, C., Holm, L., Törönen, P., Medlar, A. J., Zosa, E., Borukhov, I., Novikov, I., Wilkins, A., Lichtarge, O., Chi, P-H., Tseng, W-C., Linial, M., Rose, P. W., Dessimoz, C., Vidulin, V., Dzeroski, S., Sillitoe, I., Das, S., Lees, J. G., Jones, D. T., Wan, C., Cozzetto, D., Fa, R., Torres, M., Vesztrocy, A. W., Rodriguez, J. M., Tress, M. L., Frasca, M., Notaro, M., Grossi, G., Petrini, A., Re, M., Valentini, G., Mesiti, M., Roche, D. B., Reeb, J., Ritchie, D. W., Aridhi, S., Alborzi, S. Z., Devignes, M-D., Koo, D. C. E., Bonneau, R., Gligorijevic, V., Barot, M., Fang, H., Toppo, S., Lavezzo, E., Falda, M., Berselli, M., Tosatto, S. C. E., Carraro, M., Piovesan, D., Rehman, H. U., Mao, Q., Zhang, S., Vucetic, S., Black, G. S., Jo, D., Suh, E., Dayton, J. B., Larsen, D. J., Omdahl, A. R., McGuffin, L. J., Brackenridge, D. A., Babbitt, P. C., Yunes, J. M., Fontana, P., Zhang, F., Zhu, S., You, R., Zhang, Z., Dai, S., Yao, S., Tian, W., Cao, R., Chandler, C., Amezola, M., Johnson, D., Chang, J-M., Liao, W-H., Liu, Y-W., Pascarelli, S., Frank, Y., Hoehndorf, R., Kulmanov, M., Boudellioua, I., Politano, G., Di Carlo, S., Benso, A., Hakala, K., Ginter, F., Mehryary, F., Kaewphan, S., Bjorne, J., Moen, H., Tolvanen, M. E. E., Salakoski, T., Kihara, D., Jain, A., Smuc, T., Altenhoff, A., Ben-Hur, A., Rost, B., Brenner, S. E., Orengo, C. A., Jeffery, C. J., Bosco, G., Hogan, D. A., Martin, M. J., O'Donovan, C., Mooney, S. D., Greene, C. S., Radivojac, P. & Friedberg, I., 19 marraskuuta 2019, julkaisussa : Genome Biology. 20, 1, 23 Sivumäärä, 244.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Aktiviteetit

  • 4 Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
  • 1 Public Talks
  • 1 Jäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä
  • 1 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon

International Society for Computational Biology 2017

Petri Törönen (Osallistuja)
21 heinäkuuta 201725 heinäkuuta 2017

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitPublic Talks

Science Foundation Ireland (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Jäsen)
16 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä

Tieteellinen valtuuskunta (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Jäsen)
1 tammikuuta 201130 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Knut och Alice Wallenbergs stiftelse (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Asiantuntija)
12 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Suomen Akatemia (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Puheenjohtaja)
14 lokakuuta 2011

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa