Projekteja vuodessa
Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta
Profiilit
-
Liisa Holm
- Organismi- ja evoluutiobiologian osasto - professori
- Biotekniikan instituutti
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Bioinformatics
- Computational genomics
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Petri Törönen
- Organismi- ja evoluutiobiologian osasto - yliopistotutkija
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Computational genomics
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Projektit
- 5 Päättynyt
-
HiLIFE Grand Challenge "Combatting microbial drug resistance"
Hiltunen, T. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Projektinjohtaja)
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
HiLIFE Grand Challenge: Combatting Antimicrobial Drug Resistance
Virta, M. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Osallistuja)
01/10/2018 → 31/12/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
HiLIFE Grand Challenge consortium "Combatting antimicrobial resistance"
Hiltunen, T. (Projektinjohtaja) & Holm, L. (Projektinjohtaja)
01/10/2018 → 30/09/2021
Projekti: Muu projekti
-
Bugsy: Leikkausalueen patogeenien tunnistus metagenomiikan menetelmiä hyödyntäen (Bugsy)
Kankainen, M. (Projektinjohtaja), Holm, L. (Projektinjohtaja), Kankuri, E. (Principal Investigator), Varmanen, P. (Principal Investigator), Savijoki, K. (Osallistuja), Ojala, T. (Osallistuja), Medlar, A. (Osallistuja) & Vuola, J. (Principal Investigator)
01/09/2015 → 31/08/2019
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Glanville fritillary butterfly genomics and genetics
Lehtonen, R. (Osallistuja), Ahola, V. (Osallistuja), Somervuo, P. J. (Osallistuja), Frilander, M. (Osallistuja), Auvinen, P. (Osallistuja), Paulin, L. (Osallistuja) & Holm, L. (Osallistuja)
02/02/2009 → 30/03/2013
Projekti: Tutkimusprojekti
Tutkimustuotos
-
3-D substructure search by transitive closure in AlphaFold database
Liu, H., Laiho, A., Törönen, P. & Holm, L., 22 toukok. 2025, julkaisussa: Protein Science. 34, 6, 12 Sivumäärä, e70169.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Disentangling User and Item Sequence Patterns in Sequential Recommendation Data Sets
Liu, Y., Medlar, A. J. & Glowacka, D., 7 syysk. 2025, RecSys '25: Proceedings of the Nineteenth ACM Conference on Recommender Systems. Association for Computing Machinery, s. 570-574 5 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Don't Get Ahead of Yourself: A Critical Study on Data Leakage in Offline Evaluation of Sequential Recommenders
Le, H. H., Liu, Y. & Medlar, A. J., 7 syysk. 2025, s. 1164-1168. 5 Sivumäärä.Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu
-
Evaluating the Contextual Integrity of False Positives in Algorithmic Travel Surveillance
Wernick, A., Medlar, A. J., Söderholm, S. A. E. & Glowacka, D., 23 kesäk. 2025, FAccT '25: Proceedings of the 2025 ACM Conference on Fairness, Accountability, and Transparency. New York, NY: Association for Computing Machinery, s. 2056-2070 15 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Genome-wide DNA methylation profiles of colorectal tumors in Lynch syndrome and familial adenomatous polyposis
Mäki-Nevala, S., Kauppinen, A., Olkinuora, A., Laiho, A., Törönen, P., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Seppälä, T. T., Mecklin, J.-P. & Peltomaki, P., 2 elok. 2025, julkaisussa: Clinical epigenetics. 17, 1, 24 Sivumäärä, 137.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Aktiviteetit
-
International Society for Computational Biology 2017
Törönen, P. (Osallistuja)
21 heinäk. 2017 → 25 heinäk. 2017Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Public Talks
-
Tieteellinen valtuuskunta (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Jäsen)
1 tammik. 2011 → 30 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
-
Science Foundation Ireland (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Jäsen)
16 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä
-
Suomen Akatemia (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Puheenjohtaja)
14 lokak. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
-
Knut och Alice Wallenbergs stiftelse (Ulkoinen yksikkö)
Holm, L. (Asiantuntija)
12 jouluk. 2011Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa