Organisaation profiili

Yksikön profiili

Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.

The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.

Focus area of the program include:

  • environmental microbiology
  • microbial biotechnology
  • genetics and genomics of microbes
  • food microbiology
  • human and animal microbiota
  • microbe evolution
  • microbe-host interactions
  • infection microbiology
  • virology

The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.

The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Projektit 2016 2022

Julkaisut 2006 2019

Antibacterial polymer fibres by rosin compounding and melt-spinning

Kanerva, M., Puolakka, A., Takala, T. M., Elert, A. M., Mylläri, V., Jönkkäri, I., Sarlin, E., Seitsonen, J., Ruokolainen, J., Saris, P. & Vuorinen, J., 8 toukokuuta 2019, julkaisussa : Materials Today Communications.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Antibiotic resistance in European wastewater treatment plants mirrors the pattern of clinical antibiotic resistance prevalence

Parnanen, K. M. M., Narciso-da-Rocha, C., Kneis, D., Berendonk, T. U., Cacace, D., Thi Thuy Do, Elpers, C., Fatta-Kassinos, D., Henriques, I., Jaeger, T., Karkman, A., Luis Martinez, J., Michael, S. G., Michael-Kordatou, I., O'Sullivan, K., Rodriguez-Mozaz, S., Schwartz, T., Sheng, H., Sorum, H., Stedtfeld, R. D. & 6 muutaTiedje, J. M., Varela Della Giustina, S., Walsh, F., Vaz-Moreira, I., Virta, M. & Manaia, C. M., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Science Advances. 5, 3, 10 Sivumäärä, 9124.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Draft genome sequences of three monokaryotic isolates of the white-rot basidiomycete fungus Dichomitus squalens

Casado López, S., Peng, M., Daly, P., Andreopoulos, B., Pangilinan, J., Lipzen, A., Riley, R., Ahrendt, S., Ng, V., Barry, K., Daum, C., Grigoriev, I. V., Hilden, S. K., Mäkelä, M. R. & de Vries, R. P., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Microbiology Resource Announcements.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Enzymatic modification of technical lignins for the production of high quality bio-based fibres

Mikkilä, J. A., Kontro, J., Kuuskeri, J., Trogen, M., Maltari, R., Dekere, Z., Kemell, M., Nousiainen, P. A., Hummel, M., Sipilä, J. & Hilden, K., 12 kesäkuuta 2019.

Tutkimustuotos: KonferenssimateriaalitPosteriTutkimus

Fecal pollution can explain antibiotic resistance gene abundances in anthropogenically impacted environments

Karkman, A., Parnanen, K. & Larsson, D. G. J., 8 tammikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 8 Sivumäärä, 80.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Aktiviteetit 2011 2019

Statement for the promotion to docent, Chalmers University of Technology

Maija Tenkanen (Osallistuja)
11 tammikuuta 2019

Aktiviteetti: Muiden aktiviteettien tyypitMuu

79th FIP World Congress of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences

Marko Virta (Kutsuttu puhuja)
23 syyskuuta 2019

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitKutsuesitelmä

JPI Water Scientific and Technological Board (Ulkoinen yksikkö)

Marko Virta (Hallituksen jäsen)
20192022

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

HiLIFE Symposium: Exploring Cellular Complexity by Cryo-EM

Juha Huiskonen (Puheenjohtaja)
28 helmikuuta 2019

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Co-supervisor of PhD thesis / Veera Brusila

Jarkko Hantula (Sivuohjaaja), Hannu Fritze (Sivuohjaaja), Minna Poranen (Sivuohjaaja)
2019 → …

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja