Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Maryam Abidizadegan
- Ekosysteemit ja ympäristö -tutkimusohjelma - apurahatutkija
- Kestävyystieteen instituutti (HELSUS)
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology
Henkilö: vieraileva tutkija, Väitöskirjatutkija, U5 Muu opetus- ja tutkimushenkilöstö (myös osa-aikainen tuntiopetus)
-
Muhammad Nouman Ahmed
- Mikrobiologian osasto - tohtorikoulutettava
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology
Henkilö: Väitöskirjatutkija, Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Tero Ahola
- Mikrobiologian osasto - vanhempi yliopistonlehtori
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
- Doctoral Programme in Drug Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY, Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Laura Alakukku
- Maataloustieteiden osasto - professori
- Kestävyystieteen instituutti (HELSUS)
- Agroteknologia
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Hussein Abas Thamer Alburkat, Tohtori opiskelija
- Emerging Infections Research Group
- Virologian osasto - väitöskirjatutkija
- Helsinki One Health (HOH)
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, Väitöskirjatutkija
Laitteet
-
Biomolecular Interactions - Biacore T100
Minna Poranen (Johtaja) & Maria Aatonen (Operaattori)
Laitteistot/tilat: Laitteet
-
HAMBI Mikrobikantakokoelmat
Pekka Oivanen (Operaattori) & Kaarina Sivonen (Johtaja)
Mikrobiologian osastoLaitteistot/tilat: Laitteet
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Sarah Butcher (Johtaja), Ausra Domanska (Operaattori), Pasi Laurinmäki (Operaattori) & Benita Löflund (Operaattori)
Biotekniikan instituuttiLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Algal blooms from the Baltic Sea as feedstock for a biorefinery
01/02/2022 → 31/12/2022
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Diversilience: Diversifying organic crop production to increase resilience
Mäkelä, P., Alakukku, L., Juvonen, S. T., Keskitalo, M. & Himanen, S.
01/12/2021 → 31/10/2024
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Rhabdoviruses: structural basis for emergence and pathogenesis
01/09/2021 → 31/08/2026
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Mikä on veden tummumisen hinta? - Metsätaloustoimenpiteiden vaikutukset vesistöjen monimuotoisuuteen, ravintoomme ja kasvihuonekaasupäästöihin
Peltomaa, E., Palviainen, M., Miettinen, J. & Hyytiäinen, K.
01/06/2021 → 30/06/2024
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Harvesting harmful algal blooms for a sustainable biorefinery
01/05/2021 → 31/10/2022
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Antifungal Preservation of Food by Lactic Acid Bacteria
Nasrollahzadeh, A., Mokhtari, S., Khomeiri, M. & Saris, P. E. J., 1 helmik. 2022, julkaisussa: Foods. 11, 3, 18 Sivumäärä, 395.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Gut microbiota in relation to diet-induced metabolic worsening and improvements in overweight and obese adults : towards prediction of personalized dietary response
Jian, C., 2022, Helsinki: Helsingin yliopisto. 57 SivumääräTutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
Open access -
Introduction and rapid spread of SARS-CoV-2 Omicron variant and the dynamics of its sub-lineages BA.1 and BA.1.1, December 2021, Finland
Vauhkonen, H. K., Truong, P., Kant, R., Plyusnin, I., Erdin, M., Kurkela, S., Liimatainen, H., Ikonen, N., Blomqvist, S., Liitsola, K., Erika, L., Helve, O., Jarva, H., Longinov, R., Palva, A., Hannunen, T. R., Hannula, S., Perry, M., Kauppi, P., Vaheri, A. & 5 muuta, , kesäk. 2022, (E-pub ahead of print) julkaisussa: Emerging Infectious Diseases. 28, 6Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Maternal microbiota-derived metabolic profile in fetal murine intestine, brain and placenta
Pessa-Morikawa, T., Husso, A., Karkkainen, O., Koistinen, V., Hanhineva, K., Iivanainen, A. & Niku, M., 7 helmik. 2022, julkaisussa: BMC Microbiology. 22, 1, 16 Sivumäärä, 46.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Mechanisms behind the varying severity of Aleutian mink disease virus: comparison of three farms with a different disease status
Virtanen, J. M. E., Aaltonen, K., Moisander, A-M., Nordgren, H., Paulin, L., Peura, J., Vapalahti, O., Kant, R. & Sironen, T., 1 helmik. 2022, julkaisussa: Research Square.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen
Open access
Aktiviteetit
-
PLoS One (Lehti)
Per Saris (Arvioitsija (reviewer))
14 tammik. 2022 → 2 helmik. 2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
iScience (Lehti)
Miia Mäkelä (Arvioitsija (reviewer))
2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Frontiers in Fungal Biology (Lehti)
Miia Mäkelä (Toimittaja (editor))
2022 → …Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Tieteellisen kokooma- tai konferenssiteoksen toimittaja
-
Post-doctoral mentor
Miia Mäkelä (Ohjaaja)
2022 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Post doctoral mentor
-
International Journal of Biological Macromolecules (Lehti)
Miia Mäkelä (Arvioitsija (reviewer))
2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, Kaisa (Vastaanottaja), Jouhten, Hanne (Vastaanottaja), Ronkainen, Aki (Vastaanottaja), Hartikainen, Anna (Vastaanottaja), Kainulainen, Veera (Vastaanottaja), Jalanka, J. (Vastaanottaja) & Satokari, Reetta (Vastaanottaja), 7 syysk. 2020
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Tietoaineistot
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Luoja), Pessa-Morikawa, T. (Luoja), Husso, A. (Luoja) & Iivanainen, A. (Luoja), EUDAT, 2021
DOI - pysyväislinkki: http://doi.org/10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Tietoaineisto
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Luoja), European Nucleotide Archive, 27 elok. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Tietoaineisto
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Luoja), Alakukku, L. (Työnjohtaja), Regina, K. (Työnjohtaja) & Heikkinen, J. I. (Työnjohtaja), HARVARD UNIVERSITY, 12 lokak. 2021
DOI - pysyväislinkki: https://doi.org/10.7910/DVN/0DJGYJ
Tietoaineisto
Lehtileikkeet
-
Three cases of sell-corona have been found in Finland - these things are known about the new variants
28/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Completely new information was found about the origin of the corona pandemic - it takes the basis of the theory of laboratory leakage
Tuomas Aivelo & Olli Vapalahti
17/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
A severe mosquito summer spread pogostan disease all over Finland - these are the symptoms
15/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
HS: Experts delight in new corona hybrid strategy: “A sensible and moderate entity”
Tuomas Aivelo & Olli Vapalahti
07/09/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Granulocytes may weaken immune response in connection with Covid
30/08/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media