Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Maryam Abidizadegan
Henkilö: Väitöskirjatutkija, U5 Muu opetus- ja tutkimushenkilöstö (myös osa-aikainen tuntiopetus)
-
Bartosz Adamczyk
- Tiedekunnan yhteiset (Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta) - dosentuuri
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö
-
Tero Ahola
- Mikrobiologian osasto - vanhempi yliopistonlehtori
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
- Doctoral Programme in Drug Research - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY, Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Laura Alakukku
- Maataloustieteiden osasto - professori
- Kestävyystieteen instituutti (HELSUS)
- Agroteknologia
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
Laitteet
-
Biomolecular Interactions - Biacore T100
Minna Poranen (Johtaja) & Maria Aatonen (Operaattori)
Laitteistot/tilat: Laitteet
-
HAMBI Mikrobikantakokoelmat
Pekka Oivanen (Operaattori) & Kaarina Sivonen (Johtaja)
Mikrobiologian osastoLaitteistot/tilat: Laitteet
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Sarah Butcher (Johtaja), Ausra Domanska (Operaattori), Pasi Laurinmäki (Operaattori) & Behnam Lak (Operaattori)
Biotekniikan instituuttiLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Antibioottiresistenssin evoluutio maatalouden historiassa
01/05/2023 → 30/04/2026
Projekti: Rahastot ja säätiöt
-
METAFUNG: Intracellular metabolism of lignocellulose-derived sugars and aromatic compounds in wood-degrading white rot fungi, Academy of Finland
01/09/2022 → 31/08/2026
Projekti: Tutkimusprojekti
-
ARADOX: Plants as source of novel biocatalysts: exploring Arabidopsis AA3 family enzymes for targeted oxidations of carbohydrates and alcohols
Tenkanen, M., Paasela, T., Zhao, H., Sun, M. & Karppi, J.
01/07/2022 → 30/06/2025
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Resurssit: Resurssitehokkuuden lisääminen ja GHG päästöjen vähentäminen
Mäkelä, P., Alakukku, L., Simojoki, A. & Juvonen, S. T.
01/06/2022 → 31/05/2025
Projekti: Tutkimusprojekti
-
LuoVaMix: Luomuviljelyn viljelyvarmuuden ja ilmastokestävyyden parantaminen sekaviljelyn ja syyskylvöisten valkuaiskasvien avulla
Mäkelä, P., Alakukku, L., Simojoki, A. & Juvonen, S. T.
01/01/2022 → 31/10/2024
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee
Turner, D., Shkoporov, A. N., Lood, C., Millard, A. D., Dutilh, B. E., Alfenas-Zerbini, P., van Zyl, L. J., Aziz, R. K., Oksanen, H. M., Poranen, M., Kropinski, A. M., Barylski, J., Brister, J. R., Chanisvili, N., Edwards, R., Enault, F., Gillis, A., Knezevic, P., Krupovic, M., Kurtboke, I., & 16 muuta , 2023, julkaisussa: Archives of Virology. 168, 74Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
-
Desulfovibrio bacteria enhance alpha-synuclein aggregation in a Caenorhabditis elegans model of Parkinson's disease
Huynh, V. A., Takala, T. M., Murros, K. E., Diwedi, B. & Saris, P. E. J., 1 toukok. 2023, julkaisussa: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 13, 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Dietary micro-fibrillated cellulose improves growth, reduces diarrhea, modulates gut microbiota, and increases butyrate production in post-weaning piglets
Uddin, M. K., Mahmud, M. R., Hasan, S. M. K., Peltoniemi, O. & Oliviero, C., 16 huhtik. 2023, julkaisussa: Scientific Reports. 13, 6194, 6194.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Effects of monospecific and mixed-algae culture on performance of algae-sludge membrane bioreactors
Radmehr, S., Peltomaa, E., Kallioinen-Manttari, M. & Manttari, M., maalisk. 2023, julkaisussa: Bioresource Technology. 371, 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Finger Millet (Eleusine coracana) Plant–Endophyte Dynamics: Plant Growth, Nutrient Uptake, and Zinc Biofortification
Chaudhary, R., Kumar, V., Gupta, S., Naik, B., Prasad, R., Mishra, S., Saris, P. E. & Kumar, V., huhtik. 2023, julkaisussa: Microorganisms. 11, 4, 24 Sivumäärä, 973.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
The Finnish Society for the Study of Infectious Diseases (Ulkoinen yksikkö)
Vinaya Venkat (Hallituksen jäsen)
1 maalisk. 2023Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli suomalaisessa tai kansainvälisessä julkisen sektorin organisaatiossa
-
Oppimisseikkailu 2023
Silja Åvall-Jääskeläinen (Osallistuja)
7 maalisk. 2023Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Schistosoma haematobium: pathogenicity, co-infection and carcinogenesis
Ravi Kant (Ohjaaja), Tarja Sironen (Ohjaaja) & Seppo Meri (Ohjaaja)
maalisk. 2023 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
-
Characterization of Aspergillus niger sugar transportome
Miia Mäkelä (Kutsuttu puhuja)
2023Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Kutsuesitelmä
-
Member of Noora Salokorpi thesis committee
Ravi Kant (Jäsenyys seurantaryhmässä)
helmik. 2023 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen
Palkinnot
-
-
Doctoral research grant (Finnish Cultural Foundation)
Zhao, Hongbo (Vastaanottaja), 28 helmik. 2021
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, Kaisa (Vastaanottaja), Jouhten, Hanne (Vastaanottaja), Ronkainen, Aki (Vastaanottaja), Hartikainen, Anna (Vastaanottaja), Kainulainen, Veera (Vastaanottaja), Jalanka, Jonna (Vastaanottaja) & Satokari, Reetta (Vastaanottaja), 7 syysk. 2020
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Vanhemman yliopistonlehtorin titteli
Niku, Mikael (Vastaanottaja), 31 maalisk. 2022
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Vuoden pedagogi -palkinto
Niku, Mikael (Vastaanottaja), huhtik. 2022
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Tietoaineistot
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Luoja), Pessa-Morikawa, T. (Luoja), Husso, A. (Luoja) & Iivanainen, A. (Luoja), EUDAT, 2021
DOI - pysyväislinkki: http://doi.org/10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Tietoaineisto
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Luoja), European Nucleotide Archive, 27 elok. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Tietoaineisto
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Luoja), Alakukku, L. (Työnjohtaja), Regina, K. (Työnjohtaja) & Heikkinen, J. I. (Työnjohtaja), HARVARD UNIVERSITY, 12 lokak. 2021
DOI - pysyväislinkki: https://doi.org/10.7910/DVN/0DJGYJ
Tietoaineisto
Lehtileikkeet
-
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
26/10/2022
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
29/06/2022
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
The coronavirus epidemic of 2020 in Finland began with five virus lineages
Ravi Kant, Teemu Smura, Tarja Sironen, Phuoc Truong & Olli Vapalahti
14/06/2022
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
25/05/2022
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media