Julkaisut 2011 2019

  • 42 Artikkeli
  • 7 Konferenssiartikkeli
  • 3 Tutkimusraportti
  • 1 Pro gradu
2019

A comprehensive evaluation of predictive performance of 33 species distribution models at species and community levels

Norberg, A., Abrego Antia, N., Blanchet, F. G., Adler, F. R., Anderson, B. J., Anttila, J., Araújo, M. B., Dallas, T. A., Dunson, D., Elith, J., Foster, S., Fox, R., Franklin, J., Godsoe, W., Guisan, A., O'Hara, B., Hill, N. A., Holt, R. D., Hui, F. K. C., Husby, M. & 15 muutaKålås, J. A., Lehikoinen, A., Luoto, M., Mod, H. K., Newell, G., Renner, I., Roslin, T. V., Soininen, J., Thuiller, W., Vanhatalo, J. P., Warton, D., White, M., Zimmermann, N. E., Gravel, D. & Ovaskainen, O. T., elokuuta 2019, julkaisussa : Ecological Monographs. 89, 3, 24 Sivumäärä, 01370.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Additive multivariate Gaussian processes for joint species distribution modeling with heterogeneous data

Vanhatalo, J. P., Hartmann, M. & Veneranta, L., 2019, julkaisussa : Bayesian analysis.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A Gaussian process model and Bayesian variable selection for mapping function-valued quantitative traits with incomplete phenotype data

Vanhatalo, J. P., Li, Z. & Sillanpää, M., 2019, julkaisussa : Bioinformatics.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

EcoMem: An R package for quantifying ecological memory

Itter, M. S., Vanhatalo, J. & Finley, A. O., syyskuuta 2019, julkaisussa : Environmental Modelling & Software. 119, s. 305-308 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Index-based approach for estimating vulnerability of Arctic biota to oil spills

Nevalainen, M. K., Vanhatalo, J. & Helle, I., 18 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Ecosphere. 10, 6, e02766.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Integrating experimental and distribution data to predict future species patterns

Kotta, J., Vanhatalo, J. P., Jänes, H., Orav-Kotta, H., Rugiu, L., Jormalainen, V., Bobsien, I., Viitasalo, M., Virtanen, E., Nyström Sandman, A., Isaeus, M., Leidenberger, S., Jonsson, P. R. & Johannesson, K., 12 helmikuuta 2019, julkaisussa : Scientific Reports. 9, 14 Sivumäärä, 1821.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Laplace approximation and natural gradient for Gaussian process regression with heteroscedastic Student-t model

Hartmann, M. & Vanhatalo, J., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Statistics and Computing. 29, 4, s. 753–773 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Non-stationary Gaussian models with physical barriers

Bakka, H., Vanhatalo, J., Illian, J. B., Simpson, D. & Rue, H., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Spatial statistics. 29, s. 268-288 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2018

Correcting Boundary Over-Exploration Deficiencies In Bayesian Optimization With Virtual Derivative Sign Observations

Siivola, E., Vehtari, A., Vanhatalo, J., Gonzalez, J. & Andersen, M., marraskuuta 2018, 2018 IEEE 28th International Workshop on Machine Learning for Signal Processing (MLSP). Pustelnik, N., Ma, Z., Tan, ZH. & Larsen, J. (toim.). IEEE, Vuosikerta 28. 6 Sivumäärä (IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Estimating the acute impacts of Arctic marine oil spills using expert elicitation

Nevalainen, M., Helle, I. & Vanhatalo, J., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Marine Pollution Bulletin. 131, s. 782-792 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Hierarchical Bayesian model reveals the distributional shifts of Arctic marine mammals

Julkaisun otsikon käännös: Hierarkkinen Bayes-malli osoittaa Arktisten merinisäkkäiden levinneisyyksien muutoksetMäkinen, J. & Vanhatalo, J., lokakuuta 2018, julkaisussa : Diversity and Distributions. 24, 10, s. 1381-1394 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Inferring dispersal across a fragmented landscape using reconstructed families in the Glanville fritillary butterfly

Fountain, T., Husby, A., Nonaka, E., DiLeo, M., Korhonen, J. H., Rastas, P., Schulz, T. M., Saastamoinen, M. A. K. & Hanski, I. A., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Evolutionary Applications. 11, 3, s. 287-297 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Metapopulation dynamics in a changing climate: Increasing spatial synchrony in weather conditions drives metapopulation synchrony of a butterfly inhabiting a fragmented landscape

Kahilainen, A., van Nouhuys, S., Schulz, T. M. & Saastamoinen, M. A. K., syyskuuta 2018, julkaisussa : Global Change Biology. 24, 9, s. 4316-4329 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Predicting local ice loads on ship bow as a function of ice and operational conditions in the Southern Sea

Kotilainen, M., Vanhatalo, J., Suominen, M. & Kujala, P., 2 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Ship technology research. 65, 2, s. 87-101 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2017

Bayesian inference for generalized extreme value distributions via Hamiltonian Monte Carlo

Hartmann, M. & Ehlers, R. S., 2017, julkaisussa : Communications in Statistics: Simulation and Computation. 46, 7, s. 5285-5302 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Ecological and genetic basis of metapopulation persistence of the Glanville fritillary butterfly in fragmented landscapes

Hanski, I., Schulz, T., Wong, S. C., Ahola, V., Ruokolainen, A. & Ojanen, S. P., 17 helmikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 11 Sivumäärä, 14504.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Gaussian processs framework for temporal dependence and discrepancy functions in Ricker-type population growth models

Hartmann, M., Hosack, G. R., Hillary, R. M. & Vanhatalo, J. P., syyskuuta 2017, julkaisussa : Annals of Applied Statistics. 11, 3, s. 1375-1402 28 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Impacts of eutrophication and oil spills on the Gulf of Finland herring stock

Rahikainen, M. K., Hoviniemi, K-M., Mäntyniemi, S. H. P., Vanhatalo, J. P., Helle, S. I., Lehtiniemi, M., Pönni, J. & Kuikka, O. S., 2017, julkaisussa : Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 74, 8, s. 1218-1232 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Modeling the spatial distribution of larval fish abundance provides essential information for management

Kallasvuo, M., Vanhatalo, J. & Veneranta, L., toukokuuta 2017, julkaisussa : Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 74, 5, s. 636-649 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Predicting ice-induced load amplitudes on ship bow conditional on ice thickness and ship speed in the Baltic Sea

Kotilainen, M., Vanhatalo, J. P., Suominen, M. & Kujala, P., maaliskuuta 2017, julkaisussa : Cold Regions Science and Technology. 135, s. 116–126 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Preparing for the unprecedented - Towards quantitative oil risk assessment in the Arctic marine areas

Nevalainen, M., Helle, I. & Vanhatalo, J., 15 tammikuuta 2017, julkaisussa : Marine Pollution Bulletin. 114, 1, s. 90-101 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Spatiotemporal modelling of crown-of-thorns starfish outbreaks on the Great Barrier Reef to inform control strategies

Vanhatalo, J. P., Hosack, G. & Sweatman, H., tammikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Applied Ecology. 54, 1, s. 188-197

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
2016

Detailed temperature mapping-Warming characterizes archipelago zones

Veneranta, L., Vanhatalo, J. & Urho, L., 5 joulukuuta 2016, julkaisussa : Estuarine, Coastal and Shelf Science. 182, s. 123-135 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Downscaling and extrapolating dynamic seasonal marine forecasts for coastal ocean users

Vanhatalo, J. P., Hobday, A. J., Little, L. R. & Spillman, C. M., huhtikuuta 2016, julkaisussa : Ocean Modelling. 100, s. 20-30 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Hydrographic responses to regional covariates across the Kara Sea

Mäkinen, J. A-E. & Vanhatalo, J. P., joulukuuta 2016, julkaisussa : Journal of Geophysical Research : Oceans. 121, 12, s. 8872-8887 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Karanmeren ravintoverkot - hajanaista tietoa ja valikoituja veikkauksia

Nevalainen, M. K., 2016, julkaisussa : Natura. 53, 2, s. 40-42 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Notably improved inversion of differential mobility particle sizer data obtained under conditions of fluctuating particle number concentrations

Molgaard, B., Vanhatalo, J. P., Aalto, P. P., Prisle, N. L. & Hämeri, K. J., 29 helmikuuta 2016, julkaisussa : Atmospheric Measurement Techniques. 9, s. 741-751 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2015

Education of maritime doctoral students as part of international university network

Kujala, P., Veitch, B., Ehlers, S., Leira, B., Khan, F. & Vanhatalo, J., 10 joulukuuta 2015, International Conference on Education and Professional Development of Engineers in the Maritime Industry 2015. London: The Royal Institution of Naval Architects, s. 59-65 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinen

General state-space population dynamics model for Bayesian stock assessment

Mäntyniemi, S. H. P., Whitlock, R. E., Perälä, T. A., Blomstedt, P. A., Vanhatalo, J. P., Rincón, M. M., Kuparinen, A. K., Pulkkinen, H. P. & Kuikka, O. S., 7 elokuuta 2015, julkaisussa : ICES Journal of Marine Science. 72, 8, s. 2209-2222 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2014

By-Catch of Grey Seals (Halichoerus grypus) in Baltic Fisheries-A Bayesian Analysis of Interview Survey

Vanhatalo, J., Vetemaa, M., Herrero, A., Aho, T. & Tiilikainen, R., 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 11, 16 Sivumäärä, 113836.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Experiences in Bayesian Inference in Baltic Salmon Management

Kuikka, S., Vanhatalo, J., Mäntyniemi, S., Pulkkinen, H. & Corander, J., toukokuuta 2014, julkaisussa : Statistical Science. 29, 1, s. 42-49

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Scenario based risk management for arctic shipping and operations

Ehlers, S., Kujula, P., Veitch, B., Khan, F. & Vanhatalo, J., 8 kesäkuuta 2014, ASME 2014 33rd International Conference on Ocean, Offshore and Arctic Engineering: Polar and Arctic Science and Technology. California, USA: The American Society of Mechanical Engineers, Vuosikerta 10. 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Toward Integrative Management Advice of Water Quality, Oil Spills, and Fishery in the Gulf of Finland: A Bayesian Approach

Rahikainen, M., Helle, I., Haapasaari, P., Oinonen, S., Kuikka, S., Vanhatalo, J., Mantyniemi, S. & Hoviniemi, K-M., helmikuuta 2014, julkaisussa : Ambio. 43, 1, s. 115-123 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Vain ongelmayksilöihin kohdistuva hylkeenmetsästys vähentää kalavahinkoja

Ahola, M., Jounela, P., Kauhala, K. & Vanhatalo, J., 20 joulukuuta 2014, julkaisussa : Turun Sanomat. 2014

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliYleistajuinen

2013

Experiences in developing risk analysis tools for oil spills in the Gulf of Finland – how to create learning systems to oil spill risk analysis?

Kuikka, S., Helle, I., Lehikoinen, A., Rahikainen, M., Vanhatalo, J., Mäntyniemi, S. & Hänninen, M., 2013, Asian Simulation and Modeling 2013 (ASIMMOD 2013). Bangkok: Centre of Excellence in Mathematics (CEM), s. 19-25

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

GPstuff: Bayesian Modeling with Gaussian Processes

Vanhatalo, J., Riihimäki, J., Hartikainen, J., Jylänki, P., Tolvanen, V. & Vehtari, A., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 14, s. 1175-1179 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Havslekande sikens och siklöjans yngelproduktionsområden

Hudd, R., Veneranta, L. & Vanhatalo, J., huhtikuuta 2013, Helsinki: Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos. 38 Sivumäärä (Vilt- och fiskeriforskningsinstitutes arbetsrapporter; Vuosikerta 2013, nro 7)

Tutkimustuotos: Kirja/raporttiTutkimusraporttiAmmatillinen

Merikutuisen siian ja muikun poikastuotantoalueet

Veneranta, L., Hudd, R. & Vanhatalo, J., huhtikuuta 2013, Helsinki: Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos. 40 Sivumäärä (RKTL:n työraportteja; Vuosikerta 2013, nro 8)

Tutkimustuotos: Kirja/raporttiTutkimusraporttiAmmatillinen

Probabilistic Ecosystem Model for Predicting the Nutrient Concentrations in the Gulf of Finland under Diverse Management Actions

Vanhatalo, J., Tuomi, L., Inkala, A., Helle, I. & Pitkänen, H., 2013, julkaisussa : Environmental Science & Technology. 47, 1, s. 334–341 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Reproduction areas of sea-spawning coregonids reflect the environment in shallow coastal waters

Veneranta, L., Hudd, R. & Vanhatalo, J., 12 maaliskuuta 2013, julkaisussa : Marine Ecology. Progress Series. 477, s. 231-250 20 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Siiat tarvitsevat puhtaita matalikkoja

Veneranta, L., Hudd, R. & Vanhatalo, J., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Suomen kalastuslehti. 2013, 4, s. 8-10

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

2012

Bayesian Modeling with Gaussian Processes using the MATLAB Toolbox GPstuff (v3.4)

Vanhatalo, J., Riihimäki, J., Hartikainen, J., Jylänki, P., Tolvanen, V. & Vehtari, A., 5 lokakuuta 2012, 58 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Kirja/raporttiTutkimusraporttiAmmatillinen

Bayesian spatial multispecies modelling to assess pelagic fish stocks from acoustic- and trawl-survey data

Juntunen, T., Vanhatalo, J., Peltonen, H. & Mäntyniemi, S., 2012, julkaisussa : ICES Journal of Marine Science. 69, 1, s. 95-104

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Integrated Bayesian risk analysis of ecosystem management in the Gulf of Finland, the Baltic Sea: How to do it?

Helle, I., Vanhatalo, J., Rahikainen, M., Mäntyniemi, S. & Kuikka, S., 2012, Joint ICES/PICES Session I Multidisciplinary perspectives in the use (and misuse) of science and scientific advice in Marine Spatial Planning. International Council for the Exploration of the Sea, 16 Sivumäärä (ICES CM; Vuosikerta I, nro 04).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinen

Itämeren suojelussa tarvitaan numeroita

Vanhatalo, J., Helle, I. & Mäntyniemi, S., 9 helmikuuta 2012, julkaisussa : Helsingin Sanomat.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliYleistajuinen

Species distribution modeling with Gaussian processes: A case study with the youngest stages of sea spawning whitefish (Coregonus lavaretus L. s.l.) larvae

Vanhatalo, J., Veneranta, L. & Hudd, R., 2012, julkaisussa : Ecological Modelling. 228, s. 49-58 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The Value of Reducing Eutrophication in European Marine Areas - A Bayesian Meta-analysis

Julkaisun otsikon käännös: The Value of Reducing Eutrophication in European Marine Areas - A Bayesian Meta AnalysisAhtiainen, H. & Vanhatalo, J., 2012, julkaisussa : Ecological Economics. 83, s. 1-10 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2011

Additive Gaussian process model to predict the spatial presence of the youngest stages of sea spawning whitefish (Coregonus lavaretus L. s.l.) larvae

Vanhatalo, J., Veneranta, L. & Hudd, R., syyskuuta 2011, ICES Annual Science Conference 2011. International Council for the Exploration of the Sea, 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinen