Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Henkilöt
-
Veli Mäkinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - professori, dosentuuri
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Genome-scale algorithmics
- Algorithmic Bioinformatics
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Tuukka Norri
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tutkijatohtori
- Genome-scale algorithmics
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: Väitöskirjatutkija, U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Projektit
- 2 Päättynyt
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Algoritmeja ja tietorakenteita yksilöiden genomien tutkimukseen
01/08/2010 → 31/12/2012
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Accurate spliced alignment of long RNA sequencing reads
Sahlin, K. & Mäkinen, V., 15 jouluk. 2021, julkaisussa: Bioinformatics. 37, 24, s. 4643-4651 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Algorithms and Complexity on Indexing Elastic Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Mäkinen, V., 30 marrask. 2021, 32nd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2021). Ahn, H-K. & Sadakane, K. (toim.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 18 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 212).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Buffering updates enables efficient dynamic de Bruijn graphs
Alanko, J., Alipanahi, B., Settle, J., Boucher, C. & Gagie, T., 2021, julkaisussa: Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, s. 4067-4078 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Distributed hybrid-indexing of compressed pan-genomes for scalable and fast sequence alignment
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Mäkinen, V. & Heljanko, K., 3 elok. 2021, julkaisussa: PLoS One. 16, 8, 19 Sivumäärä, 0255260.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Founder reconstruction enables scalable and seamless pangenomic analysis
Norri, T., Cazaux, B., Dönges, S., Valenzuela, D. & Mäkinen, V., 15 jouluk. 2021, julkaisussa: Bioinformatics. 37, 24, s. 4611-4619 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Founder graphs and sequences for pangenomics
Veli Mäkinen (Puhuja)
helmik. 2022Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Suullinen esitys
-
33rd International Workshop on Combinatorial Algorithms
Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
tammik. 2022 → huhtik. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
ISMB 2022
Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
helmik. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
CPM 2022
Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
helmik. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Algorithms for Molecular Biology (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
tammik. 2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
Google Scholarship for Students with Disabilities 2015
Kuosmanen, Anna (Vastaanottaja), 27 toukok. 2015
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Hyvä tutkija -palkinto 2007
Mäkinen, Veli (Vastaanottaja), 19 jouluk. 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset