Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Henkilöt
-
Veli Mäkinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - professori, dosentuuri
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Genome-scale algorithmics
- Algorithmic Bioinformatics
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
Projektit
- 2 Päättynyt
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Algoritmeja ja tietorakenteita yksilöiden genomien tutkimukseen
01/08/2010 → 31/12/2012
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Algorithms and Complexity on Indexing Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Makinen, V., kesäk. 2023, julkaisussa: Algorithmica. 85, 6, s. 1586-1623 38 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Chaining for accurate alignment of erroneous long reads to acyclic variation graphs
Ma, J., Caceres Reyes, M. A., Salmela, L., Mäkinen, V. & Tomescu, A., elok. 2023, julkaisussa: Bioinformatics. 39, 8, 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Chaining of Maximal Exact Matches in Graphs
Rizzo, N., Caceres Reyes, M. A. & Mäkinen, V., 2023, String Processing and Information Retrieval. SPIRE 2023. Cham: Springer, s. 353–366 (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 14240).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Finding Maximal Exact Matches in Graphs
Rizzo, N., Caceres Reyes, M. A. & Mäkinen, V., elok. 2023, 23rd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2023). Belazzougui, D. & Ouangraoua, A. (toim.). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 273).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
From Bit-Parallelism to Quantum String Matching for Labelled Graphs
Equi, M., Meijer-Van de Griend, A. & Mäkinen, V., kesäk. 2023, 34th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, CPM 2023. Bulteau, L. & Liptak, Z. (toim.). Schloss Dagstuhl- Leibniz-Zentrum fur Informatik GmbH, Dagstuhl Publishing, s. 9:1-9:20 9. (Leibniz International Proceedings in Informatics, LIPIcs; Vuosikerta 259).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Väitöskomitean jäsen
Veli Mäkinen (Vastaväittäjä)
heinäk. 2023Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Vastaväittäjä
-
Bioinformatics advances (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
syysk. 2023Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Chaining of Maximal Exact Matches in Graphs
Veli Mäkinen (Kutsuttu puhuja)
toukok. 2023Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Kutsuesitelmä
-
ISMB/ECCB 2023 (Tapahtuma)
Veli Mäkinen (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
helmik. 2023Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2023) (Tapahtuma)
Veli Mäkinen (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
toukok. 2023Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
Google Scholarship for Students with Disabilities 2015
Kuosmanen, Anna (Vastaanottaja), 27 toukok. 2015
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Hyvä tutkija -palkinto 2007
Mäkinen, Veli (Vastaanottaja), 19 jouluk. 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset