Projekteja vuodessa
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.
Henkilöt
-
Veli Mäkinen
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - professori, dosentuuri
- Genome-scale algorithmics
- Helsingin tietotekniikan tutkimuslaitos
- Algorithmic Bioinformatics
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Tuukka Norri
- Tietojenkäsittelytieteen osasto - tohtorikoulutettava
- Genome-scale algorithmics
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, Tohtorikoulutettava, HY
Projektit
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Algoritmeja ja tietorakenteita yksilöiden genomien tutkimukseen
01/08/2010 → 31/12/2012
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Tight Upper and Lower Bounds on Suffix Tree Breadth
Badkobeh, G., Gawrychowski, P., Kärkkäinen, J., Puglisi, S. & Zhukova, B., 16 tammikuuta 2021, julkaisussa: Theoretical Computer Science. 854, s. 63-67 5 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Fast Indexes for Gapped Pattern Matching
Cáceres, M., Puglisi, S. & Zhukova, B., 17 tammikuuta 2020, SOFSEM 2020: Theory and Practice of Computer Science: 46th International Conference on Current Trends in Theory and Practice of Informatics, SOFSEM 2020, Limassol, Cyprus, January 20–24, 2020, Proceedings. Springer, s. 493-504 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Finding all maximal perfect haplotype blocks in linear time
Alanko, J., Bannai, H., Cazaux, B., Peterlongo, P. & Stoye, J., 10 helmikuuta 2020, julkaisussa: Algorithms for Molecular Biology. 15, 1, 7 Sivumäärä, 2.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Linear Time Construction of Indexable Founder Block Graphs
Mäkinen, V., Cazaux, B., Equi, M., Norri, T. & Tomescu, A., 25 elokuuta 2020, 20th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2020). Kingsford, C. & Pisanti, N. (toim.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1-18 18 Sivumäärä 7. (Leibniz International Proceedings in Informatics; Vuosikerta 172).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Linear-time String Indexing and Analysis in Small Space
Belazzougui, D., Cunial, F., Karkkainen, J. & Makinen, V., maaliskuuta 2020, julkaisussa: ACM Transactions on Algorithms. 16, 2, 54 Sivumäärä, 17.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Algorithms and Complexity of Indexing Elastic Founder Graphs
Veli Mäkinen (Puhuja)
29 huhtikuuta 2021Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Suullinen esitys
-
Algorithms and Complexity on Indexing Founder Graphs
Veli Mäkinen (Puhuja)
30 maaliskuuta 2021Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Suullinen esitys
-
Algorithmica (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
maaliskuuta 2021Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Workshop on Algorithms in Bioinformatics
Veli Mäkinen (Tieteellisen komitean jäsen)
toukokuuta 2021Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
BMC Bioinformatics (Lehti)
Veli Mäkinen (Arvioitsija (reviewer))
huhtikuuta 2021Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
Palkinnot
-
Google Scholarship for Students with Disabilities 2015
Kuosmanen, Anna (Vastaanottaja), 27 toukokuuta 2015
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Hyvä tutkija -palkinto 2007
Mäkinen, Veli (Vastaanottaja), 19 joulukuuta 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset