• PO BOX 56 (Viikinkaari 9), 4006

    University of Helsinki

    Suomi

Organisaation profiili

Yksikön profiili

Our longstanding interest is to characterize signaling pathways regulating mammalian cell growth and how these impinge on transcriptional responses in human disease

Two critical mediators of transcriptional responses involved in cancer and metabolism aretranscriptional kinases Cdk7 and Cdk8 mediating signals to RNA polymerase II. We are investigating the molecular mechanisms and in vivo functions of Cdk7 and Cdlk8 combining mouse molecular genetics with Drosophila knockdown strategies and cell-based screening approaches. Recent discoveries include identifying that Cdk7 acts as a roadblock to adipogenesis and that this presumed ubiquitous basal transcription factor is not expressed in fat tissues. Our goal is to understand the basis for the specificity of transcriptional regulation by metazoan Cdk7 and Cdk8 and their contribution to growth control and differentiation.

One of the rare kinases acting normally to restrict tumor growth is the LKB1ser- ine/threonine kinase critical for activation of at least 14 related kinases involved in metabolism and polarity regulation. We are interested in how LKB1 mediates its tumor suppressing function, and recently identified that LKB1 signaling in mesen- chymal cells is required for suppression of epithelial hyperproliferation in a mouse polyposis model and likely also in the human Peutz-Jeghers syndrome. We are cur- rently extending investigations of tumor suppression mechanisms of the LKB1 tu- mor suppressor kinase from hereditary polyposis to sporadic cancer (lung, uterine cervix). For this a combination of tissue- and cell type specific targeting approaches in vivo (conditional mouse models) and in vitro (2D and 3D RNAi & conditional dele- tions) of LKB1 and LKB1 substrate mutations will be used with a specific interest in the Nuak2 and AMPK kinases and cytoskeletal regulation.

Tieteenalat

  • 118 Biotieteet
  • 318 Lääketieteen bioteknologia
  • 311 Peruslääketieteet

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Projektit

Kinase signaling linking metabolism and growth control

Conversion, U. P. M.

01/01/1996 → …

Projekti: Tutkimusprojekti

Julkaisut

LKB1 Represses ATOH1 via PDK4 and Energy Metabolism and Regulates Intestinal Stem Cell Fate

Gao, Y., Yan, Y., Tripathi, S., Pentinmikko, N., Amaral, A., Päivinen, P., Domenech-Moreno, E., Andersson, S., Wong, I. P. L., Clevers, H., Katajisto, P. & Mäkelä, T. P., huhtikuuta 2020, julkaisussa : Gastroenterology. 158, 5, s. 1389-+ 23 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Depletion of Mediator Kinase Module Subunits Represses Superenhancer-Associated Genes in Colon Cancer Cells

Kuuluvainen, E., Domenech-Moreno, E., Niemela, E. H. & Makela, T. P., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Molecular and Cellular Biology. 38, 12, 15 Sivumäärä, UNSP e00573-17.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Increased alpha-actinin-1 destabilizes E-cadherin-based adhesions and associates with poor prognosis in basal-like breast cancer

Kovac, B., Makela, T. P. & Vallenius, T., 9 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS One. 13, 5, 20 Sivumäärä, 0196986.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Stromal Lkb1 deficiency leads to gastrointestinal tumorigenesis involving the IL-11-JAK/STAT3 pathway

Ollila, S., Domenech-Moreno, E., Laajanen, K., Wong, I. P. L., Tripathi, S., Pentinmikko, N., Gao, Y., Yan, Y., Niemelä, E. H., Wang, T. C., Viollet, B., Leone, G., Katajisto, P., Vaahtomeri, K. & Mäkelä, T. P., 2 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Clinical Investigation. 128, 1, s. 402-414 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

AMPK negatively regulates tensin-dependent integrin activity

Georgiadou, M., Lilja, J., Jacquemet, G., Guzman, C., Rafaeva, M., Alibert, C., Yan, Y., Sahgal, P., Lerche, M., Manneville, J-B., Makela, T. P. & Ivaska, J., huhtikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Cell Biology. 216, 4, s. 1107-1121 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Aktiviteetit

ENFIN (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Puheenjohtaja)

5 lokakuuta 20106 lokakuuta 2010

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Scientific Reports (Lehti)

Tomi Mäkelä (Arvioitsija (reviewer))

6 joulukuuta 2010 → …

Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypitTiedelehden toimittaja

Biocenter Finland (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Hallituksen jäsen)

1 tammikuuta 2010 → …

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli suomalaisessa tai kansainvälisessä julkisen sektorin organisaatiossa

Studia Medicina

Tomi Mäkelä (Osallistuja)

27 tammikuuta 2010

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitPublic Talks

European Research Council, ERC (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Puheenjohtaja)

lokakuuta 201031 joulukuuta 2013

Aktiviteetti: JäsenyystyypitLausunnot virantäytöissä

Palkinnot

Anders Jahre Young Investigator Award

Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 1 tammikuuta 2005

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Helsingin Yliopiston Biotieteellisen Tiedekunnan Pro Gradu palkinto 2007

Kuuluvainen, Emilia (Vastaanottaja), 2007

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Membeship of the Finnish Academy of Science and Letters

Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 2002

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

The1st prize for the poster, GSBM 2008 annual graduate student meeting

Ying Yang (Vastaanottaja), 2008

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Lehtileikkeet

Radiaattori: telomeraasista Nobel / Sisko Loikkanen

Tomi Mäkelä

21/10/2010

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Tomi Mäkelä Helsingin biotekniikan instituutin johtoon

Tomi Mäkelä

16/01/2009

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Kiinnostus tutkijan työhön uhkaa hiipua

Tomi Mäkelä

01/01/2009

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Science Days Finland 2007: Opportunities from Cancer Biology

Tomi Mäkelä

10/01/2007

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media