Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Yksikön profiili
Our longstanding interest is to characterize signaling pathways regulating mammalian cell growth and how these impinge on transcriptional responses in human disease
Two critical mediators of transcriptional responses involved in cancer and metabolism aretranscriptional kinases Cdk7 and Cdk8 mediating signals to RNA polymerase II. We are investigating the molecular mechanisms and in vivo functions of Cdk7 and Cdlk8 combining mouse molecular genetics with Drosophila knockdown strategies and cell-based screening approaches. Recent discoveries include identifying that Cdk7 acts as a roadblock to adipogenesis and that this presumed ubiquitous basal transcription factor is not expressed in fat tissues. Our goal is to understand the basis for the specificity of transcriptional regulation by metazoan Cdk7 and Cdk8 and their contribution to growth control and differentiation.
One of the rare kinases acting normally to restrict tumor growth is the LKB1ser- ine/threonine kinase critical for activation of at least 14 related kinases involved in metabolism and polarity regulation. We are interested in how LKB1 mediates its tumor suppressing function, and recently identified that LKB1 signaling in mesen- chymal cells is required for suppression of epithelial hyperproliferation in a mouse polyposis model and likely also in the human Peutz-Jeghers syndrome. We are cur- rently extending investigations of tumor suppression mechanisms of the LKB1 tu- mor suppressor kinase from hereditary polyposis to sporadic cancer (lung, uterine cervix). For this a combination of tissue- and cell type specific targeting approaches in vivo (conditional mouse models) and in vitro (2D and 3D RNAi & conditional dele- tions) of LKB1 and LKB1 substrate mutations will be used with a specific interest in the Nuak2 and AMPK kinases and cytoskeletal regulation.
Tieteenalat
- 118 Biotieteet
- 318 Lääketieteen bioteknologia
- 311 Peruslääketieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.
Henkilöt
Tomi Mäkelä
- Biokemian ja kehitysbiologian osasto - professori
- Tomi Mäkelä / Vastuullinen tutkija
- Helsinki Institute of Life Science HiLIFE - tutkimusjohtaja
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
Projektit
- 1 Aktiivinen
Kinase signaling linking metabolism and growth control
Conversion, U. P. M.
01/01/1996 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
LKB1 Represses ATOH1 via PDK4 and Energy Metabolism and Regulates Intestinal Stem Cell Fate
Gao, Y., Yan, Y., Tripathi, S., Pentinmikko, N., Amaral, A., Päivinen, P., Domenech-Moreno, E., Andersson, S., Wong, I. P. L., Clevers, H., Katajisto, P. & Mäkelä, T. P., huhtikuuta 2020, julkaisussa : Gastroenterology. 158, 5, s. 1389-+ 23 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Depletion of Mediator Kinase Module Subunits Represses Superenhancer-Associated Genes in Colon Cancer Cells
Kuuluvainen, E., Domenech-Moreno, E., Niemela, E. H. & Makela, T. P., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Molecular and Cellular Biology. 38, 12, 15 Sivumäärä, UNSP e00573-17.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Tiedosto
Increased alpha-actinin-1 destabilizes E-cadherin-based adhesions and associates with poor prognosis in basal-like breast cancer
Kovac, B., Makela, T. P. & Vallenius, T., 9 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS One. 13, 5, 20 Sivumäärä, 0196986.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Tiedosto
Stromal Lkb1 deficiency leads to gastrointestinal tumorigenesis involving the IL-11-JAK/STAT3 pathway
Ollila, S., Domenech-Moreno, E., Laajanen, K., Wong, I. P. L., Tripathi, S., Pentinmikko, N., Gao, Y., Yan, Y., Niemelä, E. H., Wang, T. C., Viollet, B., Leone, G., Katajisto, P., Vaahtomeri, K. & Mäkelä, T. P., 2 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Clinical Investigation. 128, 1, s. 402-414 13 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
AMPK negatively regulates tensin-dependent integrin activity
Georgiadou, M., Lilja, J., Jacquemet, G., Guzman, C., Rafaeva, M., Alibert, C., Yan, Y., Sahgal, P., Lerche, M., Manneville, J-B., Makela, T. P. & Ivaska, J., huhtikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Cell Biology. 216, 4, s. 1107-1121 15 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Tiedosto
Aktiviteetit
- 15 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
- 11 Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
- 9 Jäsenyys tai muu rooli suomalaisessa tai kansainvälisessä julkisen sektorin organisaatiossa
- 4 Jäsenyys tai muu rooli tutkimusverkostossa
-
7
Muut aineistot
ENFIN (Ulkoinen yksikkö)
Tomi Mäkelä (Puheenjohtaja)
5 lokakuuta 2010 → 6 lokakuuta 2010
Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
Scientific Reports (Lehti)
Tomi Mäkelä (Arvioitsija (reviewer))
6 joulukuuta 2010 → …
Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Tiedelehden toimittaja
Biocenter Finland (Ulkoinen yksikkö)
Tomi Mäkelä (Hallituksen jäsen)
1 tammikuuta 2010 → …
Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli suomalaisessa tai kansainvälisessä julkisen sektorin organisaatiossa
Studia Medicina
Tomi Mäkelä (Osallistuja)
27 tammikuuta 2010
Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Public Talks
European Research Council, ERC (Ulkoinen yksikkö)
Tomi Mäkelä (Puheenjohtaja)
lokakuuta 2010 → 31 joulukuuta 2013
Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Lausunnot virantäytöissä
Palkinnot
Anders Jahre Young Investigator Award
Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 1 tammikuuta 2005
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Helsingin Yliopiston Biotieteellisen Tiedekunnan Pro Gradu palkinto 2007
Kuuluvainen, Emilia (Vastaanottaja), 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Membeship of the Finnish Academy of Science and Letters
Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 2002
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
The1st prize for the poster, GSBM 2008 annual graduate student meeting
Ying Yang (Vastaanottaja), 2008
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
Annual Centre of Excellence seminar: Peer review easier in life sciences
14/12/2010
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
Tomi Mäkelä Helsingin biotekniikan instituutin johtoon
16/01/2009
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
Science Days Finland 2007: Opportunities from Cancer Biology
10/01/2007
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media