Organisaation profiili

Yksikön profiili

Our work aims to understand the structure, assembly and function of biological macromolecule complexes. We embed unstained, unfixed specimens in vitreous ice to preserve their structures. Transmission cryo-electron microscopy is then used to visualize the specimens, but the images recorded are difficult to interpret because they are projections of the specimen degraded by noise. Thus we computationally combine images of the specimen viewed from different angles enabling us to reconstruct a three-dimensional model. Any inherent symmetry present in the structure is also used in this averaging. This method is particularly useful for objects that are too large, unstable or variable to be studied by X-ray crystallography or NMR, such as enveloped viruses.

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Henkilöt

Maria Anastasina

maria.anastasina@helsinki.fi

Macromolecular structure and function
Biotekniikan instituutti
Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa

Henkilö: HY

Sarah Butcher

sarah.butcher@helsinki.fi

Macromolecular structure and function
Biotekniikan instituutti
Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - professori
Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa

Henkilö: HY, Opetus- ja tutkimushenkilöstö

Ausra Domanska

ausra.domanska@helsinki.fi

Macromolecular structure and function
Biotekniikan instituutti - tutkijatohtori
Henkilöstöpalvelut - Dosentti

Henkilö: HY, Opetus- ja tutkimushenkilöstö

Justin Flatt

Macromolecular structure and function

Henkilö: HY

Sergei Gurianov

sergei.gurianov@helsinki.fi

Macromolecular structure and function
Biotekniikan instituutti - tutkijatohtori

Henkilö: HY, Opetus- ja tutkimushenkilöstö

Laitteet

Instruct-HiLIFE CryoEM core facility

Sarah Butcher (Johtaja), Ausra Domanska (Operaattori), Pasi Laurinmäki (Operaattori) & Benita Löflund (Operaattori)

Biotekniikan instituutti

Laitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö

Projektit 2012 2014

1 Päättynyt

Genetic susceptibility for severe influenza infections

Anastasina, M.

01/01/2012 → 31/12/2014

Projekti: Tutkimusprojekti

Julkaisut 1997 2019

100 Artikkeli
6 Katsausartikkeli
5 Kirjan luku tai artikkeli
2 Posteri
3 Muut aineistot

A 2.8-Angstrom-Resolution Cryo-Electron Microscopy Structure of Human Parechovirus 3 in Complex with Fab from a Neutralizing Antibody

Domanska, A., Flatt, J. W., Jukonen, J., Geraets, J. & Butcher, S. J., helmikuuta 2019, julkaisussa : Journal of Virology. 93, 4, 12 Sivumäärä, e01597-18.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

Adenovirus flow in host cell networks

Flatt, J. W. & Butcher, S. J., helmikuuta 2019, julkaisussa : Open biology. 9, 2, 11 Sivumäärä, 190012.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

A novel druggable interprotomer pocket in the capsid of rhino- and enteroviruses

Abdelnabi, R., Geraets, J. A., Ma, Y., Mirabelli, C., Flatt, J. W., Domanska, A., Delang, L., Jochmans, D., Kumar, T. A., Jayaprakash, V., Sinha, B. N., Leyssen, P., Butcher, S. J. & Neyts, J., kesäkuuta 2019, julkaisussa : PLoS Biology. 17, 6, 17 Sivumäärä, 3000281.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

Antibacterial polymer fibres by rosin compounding and melt-spinning

Kanerva, M., Puolakka, A., Takala, T. M., Elert, A. M., Mylläri, V., Jönkkäri, I., Sarlin, E., Seitsonen, J., Ruokolainen, J., Saris, P. & Vuorinen, J., 8 toukokuuta 2019, julkaisussa : Materials Today Communications.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

Extracellular Albumin and Endosomal Ions Prime Enterovirus Particles for Uncoating That Can Be Prevented by Fatty Acid Saturation

Ruokolainen, V., Domanska, A., Laajala, M., Palliccia, M., Butcher, S. & Marjomäki, V., syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of Virology. 93, 17, 19 Sivumäärä, e00599-19.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Aktiviteetit 2000 2019

202 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
50 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon
25 Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
19 Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen
123 Muut aineistot

ScanVir2019 conference

Ausra Domanska (Puhuja: esitelmän pitäjä)

3 kesäkuuta 2019 → 5 kesäkuuta 2019

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

MicroBeta instrument demo

Sergei Gurianov (Osallistuja)

3 tammikuuta 2019

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Chemical registry training Dec 2018

Sergei Gurianov (Osallistuja)

3 joulukuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Viruses Seminar MMB802, 2018

Ausra Domanska (New classification)

22 lokakuuta 2018 → 19 joulukuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen