Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Our work aims to understand the structure, assembly and function of biological macromolecule complexes. We embed unstained, unfixed specimens in vitreous ice to preserve their structures. Transmission cryo-electron microscopy is then used to visualize the specimens, but the images recorded are difficult to interpret because they are projections of the specimen degraded by noise. Thus we computationally combine images of the specimen viewed from different angles enabling us to reconstruct a three-dimensional model. Any inherent symmetry present in the structure is also used in this averaging. This method is particularly useful for objects that are too large, unstable or variable to be studied by X-ray crystallography or NMR, such as enveloped viruses.
Tieteenalat
- 118 Biotieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Maria Anastasina
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - yliopistotutkija
- Biotekniikan instituutti
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Sarah Butcher
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - professori
- Biotekniikan instituutti
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Ausra Domanska
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - yliopistotutkija
- Macromolecular structure and function
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Sergei Gurianov
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - tutkijatohtori
- Macromolecular structure and function
Henkilö: U2 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Laitteet
-
Instruct-ERIC Centre Finland
Sarah Butcher (Johtaja), Hanna M Oksanen (Muut), Minna Poranen (Muut), Katri Eskelin (Muut), Perttu Permi (Muut), Markku Varjosalo (Muut), Lari Lehtiö (Muut) & Juha Rouvinen (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Sarah Butcher (Johtaja), Ausra Domanska (Operaattori), Pasi Laurinmäki (Operaattori) & Behnam Lak (Operaattori)
Biotekniikan instituuttiLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Structural Biology Finland (FINStruct)
Sarah Butcher (Johtaja), Hanna M Oksanen (Muut), Minna Poranen (Muut), Katri Eskelin (Muut), Tommi Kajander (Muut), Perttu Permi (Muut), Lari Lehtiö (Muut), Juha Rouvinen (Muut), Tiina A Salminen (Muut) & Anastassios Papageorgiou (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Integrated Structural Biology Infrastructure-European Research Infrastructure Consortium (Instruct-ERIC) / Consortium FINStruct and Instruct-ERIC
Butcher, S., Poranen, M., Varjosalo, M., Kajander, T., Oksanen, H. M., Eskelin , K., Lehtiö, L., Salminen, T. A. & Papageorgiou, A. C.
01/01/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Structural Biology Finland (FINStruct) & Instruct-ERIC Centre FI / Research Infrastructure Roadmap 2021-2024
Butcher, S., Poranen, M., Kajander, T., Iwai, H., Varjosalo, M., Lehtiö, L., Rouvinen, J., Salminen, T. A., Papageorgiou, A. C., Oksanen, H. M. & Eskelin , K.
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Instruct-HiLIFE: Integrated structural cell biology research infrastructure platform, HiLIFE, University of Helsinki
Poranen, M., Butcher, S., Iwai, H., Kajander, T., Oksanen, H. M. & Eskelin , K.
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Muu projekti
-
Integrated Structural Biology Infrastructure / Consortium: Instruct-Suomi
Butcher, S., Kajander, T., Lehtiö, L., Määttä, J. A. E., Papageorgiou, A., Rouvinen, J., Salminen, T., Iwai, H., Poranen, M., Eskelin , K. & Oksanen, H. M.
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Muu projekti
-
Genetic susceptibility for severe influenza infections
01/01/2012 → 31/12/2014
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Molecular Organisation of Tick-Borne Encephalitis Virus
Pulkkinen, L. I. A., Barrass, S., Domanska, A., Overby, A. K., Anastasina, M. & Butcher, S. J., huhtik. 2022, julkaisussa: Viruses (Basel). 14, 4, 17 Sivumäärä, 792.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
SARS-CoV-2 Production, Purification Methods and UV Inactivation for Proteomics and Structural Studies
Plavec, Z., Domanska, A., Liu, X., Laine, P., Paulin, L., Varjosalo, M., Auvinen, P., Wolf, S. G., Anastasina, M. & Butcher, S. J., syysk. 2022, julkaisussa: Viruses-Basel. 14, 9, 12 Sivumäärä, 1989.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Structural Studies Reveal that Endosomal Cations Promote Formation of Infectious Coxsackievirus A9 A-Particles, Facilitating RNA and VP4 Release
Domanska, A., Plavec, Z., Ruokolainen, V., Löflund, B., Marjomaki, V. & Butcher, S., 21 jouluk. 2022, julkaisussa: Journal of Virology. 96, 4, 20 Sivumäärä, e0136722.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
A comparative analysis of parechovirus protein structures with other picornaviruses
Domanska, A., Guryanov, S. & Butcher, S. J., 28 heinäk. 2021, julkaisussa: Open biology. 11, 7, 14 Sivumäärä, 210008.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Bacterial and Archeal Virus Entry
Poranen, M. & Domanska, A., maalisk. 2021, Encyclopedia of Virology. Zuckerman, M. & Bamford, DH. (toim.). 4 toim. Academic Press, Vuosikerta 1. s. 402-408Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Ensyklopedia-artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Aktiviteetit
-
Pathogens (Lehti)
Ausra Domanska (Arvioitsija (reviewer))
18 tammik. 2023Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Advanced Spectroscopy in Chemistry summer school
Ausra Domanska (Puhuja: esitelmän pitäjä)
20 kesäk. 2022 → 24 kesäk. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Viruses Seminar MMB802, 2022
Ausra Domanska (New classification)
7 helmik. 2022 → 1 toukok. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
IMpaCT Cryo-Electron Tomography Workshop, hands-on
Ausra Domanska (Osallistuja)
20 maalisk. 2022 → 25 maalisk. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
ITQB NOVA, Lisbon University NOVA
Ausra Domanska (Vieraileva tutkija)
8 maalisk. 2022 → 13 maalisk. 2022Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypit › Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon
Palkinnot
-
-
FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG)
Manole, Violeta (Vastaanottaja), 8 syysk. 2009
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Helsingin Yliopiston HEBIOT-koulutusohjelma 800 euroa
Happonen, Lotta (Vastaanottaja), 14 helmik. 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Helsingin Yliopiston Juhlarahaston matka-apuraha 2500 euroa
Happonen, Lotta (Vastaanottaja), 26 maalisk. 2009
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Maikki Friberg award 2013
Butcher, Sarah (Vastaanottaja), 5 kesäk. 2013
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
-
Hong Kong pro-democracy lawmakers to resign as Beijing moves to quash opposition
11/11/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Structure of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase published
15/04/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
-UNIVERSITY OF HELSINKI: A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
Sarah Butcher & Hanna M Oksanen
24/02/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
Sarah Butcher & Hanna M Oksanen
21/02/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Scientists make major breakthrough that could pave the way for cure to common cold
18/12/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media