Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Yksikön profiili
Our work aims to understand the structure, assembly and function of biological macromolecule complexes. We embed unstained, unfixed specimens in vitreous ice to preserve their structures. Transmission cryo-electron microscopy is then used to visualize the specimens, but the images recorded are difficult to interpret because they are projections of the specimen degraded by noise. Thus we computationally combine images of the specimen viewed from different angles enabling us to reconstruct a three-dimensional model. Any inherent symmetry present in the structure is also used in this averaging. This method is particularly useful for objects that are too large, unstable or variable to be studied by X-ray crystallography or NMR, such as enveloped viruses.
Tieteenalat
- 118 Biotieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Henkilöt
-
Maria Anastasina
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - vieraileva tutkija
- Biotekniikan instituutti
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: vieraileva tutkija, HY
-
Sarah Butcher
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - professori
- Biotekniikan instituutti
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY, U4 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Ausra Domanska
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - vieraileva tutkija
- Macromolecular structure and function
Henkilö: vieraileva tutkija, HY
-
Sergei Gurianov
- Molekulaaristen ja integratiivisten biotieteiden tutkimusohjelma - yliopistotutkija
- Macromolecular structure and function
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Laitteet
-
FINStruct Structural Biology Finland
Butcher, S. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut), Poranen, M. (Muut), Eskelin , K. (Muut), Kajander, T. (Muut), Permi, P. (Muut), Lehtiö, L. (Muut), Rouvinen, J. (Muut), Salminen, T. A. (Muut) & Papageorgiou, A. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Coordination office
-
Instruct-ERIC Structural Biology European Research Infrastructure Centre Finland
Butcher, S. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut), Poranen, M. (Muut), Eskelin , K. (Muut), Permi, P. (Muut), Varjosalo, M. (Muut), Lehtiö, L. (Muut) & Rouvinen, J. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Coordination office
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Butcher, S. (Johtaja), Domanska, A. (Operaattori), Laurinmäki, P. (Operaattori) & Lak, B. (Operaattori)
Biotekniikan instituuttiLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö
-
Integrated Structural Biology Infrastructure-European Research Infrastructure Consortium (Instruct-ERIC) / Consortium FINStruct and Instruct-ERIC
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja), Eskelin , K. (Osallistuja), Lehtiö, L. (Principal Investigator), Salminen, T. A. (Osallistuja) & Papageorgiou, A. C. (Osallistuja)
01/01/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Structural Biology Finland (FINStruct) & Instruct-ERIC Centre FI / Research Infrastructure Roadmap 2021-2024
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Iwai, H. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Co-Principal Investigator), Lehtiö, L. (Co-Principal Investigator), Rouvinen, J. (Co-Principal Investigator), Salminen, T. A. (Co-Principal Investigator), Papageorgiou, A. C. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja) & Eskelin , K. (Osallistuja)
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Instruct-HiLIFE: Integrated structural cell biology research infrastructure platform, HiLIFE, University of Helsinki
Poranen, M. (Projektinjohtaja), Butcher, S. (Principal Investigator), Iwai, H. (Principal Investigator), Kajander, T. (Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja) & Eskelin , K. (Osallistuja)
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Muu projekti
-
Integrated Structural Biology Infrastructure / Consortium: Instruct-Suomi
Butcher, S. (Projektinjohtaja), Kajander, T. (Principal Investigator), Lehtiö, L. (Principal Investigator), Määttä, J. A. E. (Principal Investigator), Papageorgiou, A. (Principal Investigator), Rouvinen, J. (Principal Investigator), Salminen, T. (Principal Investigator), Iwai, H. (Principal Investigator), Poranen, M. (Principal Investigator), Eskelin , K. (Osallistuja) & Oksanen, H. M. (Osallistuja)
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Muu projekti
-
Genetic susceptibility for severe influenza infections
Anastasina, M. (Osallistuja)
01/01/2012 → 31/12/2014
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Antiviral action of a functionalized plastic surface against human coronaviruses
Shroff, S., Haapakoski, M., Tapio, K., Laajala, M., Leppänen, M., Plavec, Z., Haapala, A., Butcher, S., ihalainen, J., Toppari, J. & Marjomäki, V., 16 tammik. 2024, julkaisussa: Microbiology Spectrum. 12, 2, 24 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Community recommendations on cryoEM data archiving and validation
Kleywegt, G. J., Adams, P. D., Butcher, S. J., Lawson, C., Rohou, A., Rosenthal, P. B., Subramaniam, S., Topf, M., Abbott, S., Baldwin, P. R., Berrisford, J. M., Bricogne, G., Choudhary, P., Croll, T. I., Danev, R., Ganesan, S. J., Grant, T., Gutmanas, A., Henderson, R. & Heymann, J. B. & 27 muuta, , maalisk. 2024, julkaisussa: IUCrJ. . 11, Part 2, s. 140-151 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
SAR Analysis of Novel Coxsackie virus A9 Capsid Binders
Tammaro, C., Plavec, Z., Myllymäki, L., Mitchell, C., Consalvi, S., Biava, M., Ciogli, A., Domanska, A., Leppilampi, V., Buckner, C., Manetto, S., Scio, P., Coluccia, A., Laajala, M., Dondio, G., Bigogno, C., Marjomäki, V., Butcher, S. J. & Poce, G., 18 syysk. 2024, julkaisussa: Journal of Medicinal Chemistry. 18 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Stay closed sesame : structural analysis of virus capsid conformations using cryo-EM and implications for treatment development
Plavec, Z., 2024, Helsinki: Helsingin yliopisto. 81 SivumääräTutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
Open access -
Structure of Human parechovirus 1 RNA-dependent RNA polymerase
Gurianov, S., Kajander, T. & Butcher, S., 21 maalisk. 2024.Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri
Aktiviteetit
-
Virology Days
Gurianov, S. (Osallistuja)
21 maalisk. 2024 → 22 maalisk. 2024Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Instruct-ERIC course on macromolecular X-ray, electron, and neutron crystallography 2023
Gurianov, S. (Osallistuja)
29 toukok. 2023 → 2 kesäk. 2023Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Pathogens (Lehti)
Domanska, A. (Arvioitsija (reviewer))
18 tammik. 2023Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Advanced Spectroscopy in Chemistry summer school
Domanska, A. (Puhuja: esitelmän pitäjä)
20 kesäk. 2022 → 24 kesäk. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Portuguese Centre for Integrated Structural Biology (PCISBIO) meeting
Domanska, A. (Osallistuja) & Butcher, S. (Puhuja: esitelmän pitäjä)
11 maalisk. 2022Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
Palkinnot
-
-
FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG)
Manole, V. (Vastaanottaja), 8 syysk. 2009
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Helsingin Yliopiston HEBIOT-koulutusohjelma 800 euroa
Happonen, L. (Vastaanottaja), 14 helmik. 2007
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Helsingin Yliopiston Juhlarahaston matka-apuraha 2500 euroa
Happonen, L. (Vastaanottaja), 26 maalisk. 2009
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
-
Maikki Friberg award 2013
Butcher, S. (Vastaanottaja), 5 kesäk. 2013
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Lehtileikkeet
-
Hong Kong pro-democracy lawmakers to resign as Beijing moves to quash opposition
11/11/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Structure of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase published
15/04/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
-UNIVERSITY OF HELSINKI: A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
24/02/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
21/02/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media
-
Scientists make major breakthrough that could pave the way for cure to common cold
18/12/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media