Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
The Microbial Natural Products group is headed by Dr. David Fewer. Natural products are low molecular weight metabolites with diverse chemical structures and potent biological activities that play key roles in advancing our understanding of biology and in the development of medicine. Natural products are either the direct basis or inspiration for the majority of drugs approved for clinical use. Half of all approved small-molecule anticancer drugs and antibiotics in clinical use today derive from natural products. Bacteria produce a stunning array of natural products with exotic chemical structures and dense functionalization. This chemical diversity is achieved using highly diverse biosynthetic pathways encoding an array of tailoring enzymes.
Our research focuses on the genomics and biochemistry of natural products biosynthetic pathways. We use a combination of bioinformatics, genomics, molecular biology, biochemistry, synthetic biology and structural chemistry to guide the discovery of new natural products from cyanobacteria. Cyanobacteria are found in freshwater lakes, reservoirs and ponds worldwide. They are infamous producers of toxins and are linked to the death of wild and domestic animals. However, they are also a prolific and promising source of biologically active natural products. Using this approach we hope to unravel the genetic and chemical diversity of cyanobacterial natural products and discovered new natural products.
Tieteenalat
- 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
David Fewer
- Mikrobiologian osasto - Dosenttisopimus
- Elintarvike- ja ravitsemustieteiden osasto - dosentuuri
- Kestävyystieteen instituutti (HELSUS)
- Microbial Natural Products
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: HY
-
.Sequestration of UV-absorbing additives from a natural product biosynthetic pathway into polysaccharide matrices
Fewer, D., King, A., Pollari, M. & Arsin, S.
01/08/2019 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Algal blooms from the Baltic Sea as feedstock for a biorefinery
01/02/2022 → 31/12/2022
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Harvesting harmful algal blooms for a sustainable biorefinery
01/05/2021 → 31/10/2022
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Novo Nordisk Funding: Sequestration of UV-absorbing additives from a natural product biosynthetic pathway into polysaccharide matrices
31/12/2018 → 31/12/2021
Projekti: Tutkimusprojekti
-
-
A cylindrospermopin-producing cyanobacterium isolated from a microbial mat in the Baltic Sea
Shishido, T. K., Delbaje, E., Wahlsten, M., Vuori, I. T., Jokela, J., Gugger, M., Fiore, M. F. & Fewer, D., 15 elok. 2023, julkaisussa: Toxicon. 232, 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
A Plastic Biosynthetic Pathway for the Production of Structurally Distinct Microbial Sunscreens
Arsin, S., Delbaje, E., Jokela, J., Wahlsten, M., Farrar, Z. M., Permi, P. & Fewer, D., 21 elok. 2023, (E-pub ahead of print) julkaisussa: ACS Chemical Biology. 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Direct pathway cloning and expression of the radiosumin biosynthetic gene cluster
Ouyang, X., D'Agostino, P. M., Wahlsten, M., Delbaje, E., Jokela, J., Permi, P., Gaiani, G., Poso, A., Bartos, P., Gulder, T. A. M., Koistinen, H. & Fewer, D. P., 14 kesäk. 2023, julkaisussa: Organic & Biomolecular Chemistry. 21, 23, s. 4893-4908 16 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Biochemical characterization of a cyanobactin arginine-N-prenylase from the autumnalamide biosynthetic pathway
Clemente, C., Johnson, N., Ouyang, X., Popin, R., Dall'Angelo, S., Wahlsten, M., Jokela, J., Colombano, A., Nardone, B., Fewer, D. P. & Houssen, W. E., 27 lokak. 2022, julkaisussa: Chemical Communications. 58, 86, s. 12054-12057 4 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Discovery of varlaxins, new aeruginosin-type inhibitors of human trypsins
Heinilä, L., Jokela, J., Ahmed, M. N., Wahlsten, M., Kumar, S., Hrouzek, P., Permi, P., Koistinen, H., Fewer, D. & Sivonen, K., 30 maalisk. 2022, julkaisussa: Organic & Biomolecular Chemistry. 20, 13, s. 2681–2692 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Member of doctoral thesis committee (Vy Huynh)
David Fewer (Ohjaaja)
2021 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen
-
K. Sivonen: supervisor of Ph D thesis by Rafael Popin
Kaarina Sivonen (Ohjaaja), David Fewer (Sivuohjaaja) & Jouni Jokela (Sivuohjaaja)
24 marrask. 2021Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
-
Chemical Science (Lehti)
David Fewer (Arvioitsija (reviewer))
2 marrask. 2021Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Environmental Science & Technology (Lehti)
David Fewer (Arvioitsija (reviewer))
8 lokak. 2021Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
K. Sivonen: supervisor of Ph D thesis by Lassi Heinilä
Kaarina Sivonen (Ohjaaja), Jouni Jokela (Sivuohjaaja) & David Fewer (Sivuohjaaja)
7 jouluk. 2021Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja