• Department of Microbiology, Viikinkaari 9, Biocenter 1

    P.O. Box 56, FIN-00014 University of Helsinki

    Suomi

Organisaation profiili

Yksikön profiili

The Microbial Natural Products group is headed by Dr. David Fewer. Natural products are low molecular weight metabolites with diverse chemical structures and potent biological activities that play key roles in advancing our understanding of biology and in the development of medicine. Natural products are either the direct basis or inspiration for the majority of drugs approved for clinical use. Half of all approved small-molecule anticancer drugs and antibiotics in clinical use today derive from natural products. Bacteria produce a stunning array of natural products with exotic chemical structures and dense functionalization. This chemical diversity is achieved using highly diverse biosynthetic pathways encoding an array of tailoring enzymes.

 

Our research focuses on the genomics and biochemistry of natural products biosynthetic pathways. We use a combination of bioinformatics, genomics, molecular biology, biochemistry, synthetic biology and structural chemistry to guide the discovery of new natural products from cyanobacteria. Cyanobacteria are found in freshwater lakes, reservoirs and ponds worldwide. They  are infamous producers of toxins and are linked to the death of wild and domestic animals. However, they are also a prolific and promising source of biologically active natural products. Using this approach we hope to unravel the genetic and chemical diversity of cyanobacterial natural products and discovered new natural products.

 

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Projektit 2012 2022

Julkaisut 2008 2020

Dereplication of natural products with antimicrobial and anticancer activity from Brazilian cyanobacteria.

Shishido, T. K., Vicentini Popin, R., Jokela, J., Wahlsten, M., Fiore, M. F., Fewer, D., Herfindal, L. & Sivonen, K., tammikuuta 2020, julkaisussa : Toxins. 12, 12, 17 Sivumäärä, 2020, 12, 12.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Alternative Biosynthetic Starter Units Enhance the Structural Diversity of Cyanobacterial Lipopeptides

Mares, J., Hajek, J., Urajova, P., Kust, A., Jokela, J., Saurav, K., Galica, T., Capkova, K., Mattila, A., Haapaniemi, E., Permi, P., Mysterud, I., Skulberg, O. M., Karlsen, J., Fewer, D. P., Sivonen, K., Tonnesen, H. H. & Hrouzek, P., helmikuuta 2019, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 85, 4, 17 Sivumäärä, UNSP e02675-18.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Antitumor astins originate from the fungal endophyte Cyanodermella asteris living within the medicinal plant Aster tataricus

Schafhauser, T., Jahn, L., Kirchner, N., Kulik, A., Flor, L., Lange, A., Caradec, T., Fewer, D., Sivonen, K., van Berkel, W. J. H., Jacques, P., Weber, T., Gross, H., van Pee, K-H., Wohlleben, W. & Ludwig-Mueller, J., 26 joulukuuta 2019, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116, 52, s. 26909-26917 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A Pharmaceutical Model for the Molecular Evolution of Microbial Natural Products

Fewer, D. P. & Metsä-Ketelä, M., 6 marraskuuta 2019, julkaisussa : The FEBS Journal. 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuKatsausartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Biosynthesis of the bis-prenylated alkaloids muscoride A and B

Mattila, A., Andsten, R-M., Jumppanen, M., Assante, M., Jokela, J., Wahlsten, M., Mikula, K. M., Sigindere, C., Kwak, D. H., Gugger, M., Koskela, H., Sivonen, K., Liu, X., Yli-Kauhaluoma, J., Iwaï, H. & Fewer, D., 20 joulukuuta 2019, julkaisussa : ACS Chemical Biology. 14, 12, s. 2683-2690 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Aktiviteetit 2011 2018

Breaking Borders With SmartBIO: SmartBIO Student Symposium

Antti Mattila (Puhuja)
30 elokuuta 2018

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

John Innes/Rudjer Bošković Summer School on "Microbial Specialised Metabolites: From Genome to Molecule"

Antti Mattila (Posteriesitys)
8 syyskuuta 201816 syyskuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Medicinal Chemistry Meets Pharmacology

Antti Mattila (Osallistuja)
24 huhtikuuta 201825 huhtikuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

The 1st Nordic Algae Symposium

Antti Mattila (Osallistuja)
31 tammikuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Centre Algatech, Institute of Microbiology, The Czech Academy of Sciences

Antti Mattila (Vieraileva tutkija)
16 lokakuuta 201720 lokakuuta 2017

Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypitAkateeminen vierailu toiseen organisaatioon