Julkaisut 1992 2018

Suodatin
Artikkeli
2018

Early transcriptional response pathways in Daphnia magna are coordinated in networks of crustacean-specific genes

Orsini, L., Brown, J. B., Solari, O. S., Li, D., He, S., Podicheti, R., Stoiber, M. H., Spanier, K. I., Gilbert, D., Jansen, M., Rusch, D. B., Pfrender, M. E., Colbourne, J. K., Frilander, M. J., Kvist, J., Decaestecker, E., De Schamphelaere, K. A. C. & De Meester, L., helmikuuta 2018, julkaisussa : Molecular Ecology. 27, 4, s. 886-897 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

IntEREst: Intron-exon retention estimator

Oghabian, A., Greco, D. & Frilander, M. J., 11 huhtikuuta 2018, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 19, 10 Sivumäärä, 130.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Mutations in the U11/U12-65K protein associated with isolated growth hormone deficiency lead to structural destabilization and impaired binding of U12 snRNA

Norppa, A. J., Kauppala, T. M., Heikkinen, H. A., Verma, B., Iwai, H. & Frilander, M. J., maaliskuuta 2018, julkaisussa : RNA. 24, 3, s. 396-409 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Response to growth hormone in patients with RNPC3 mutations

Martos-Moreno, G. A., Travieso-Suarez, L., Pozo-Roman, J., Munoz-Calvo, M. T., Chowen, J. A., Frilander, M. J., Perez-Jurado, L. A., Hawkins, F. G. & Argente, J., heinäkuuta 2018, julkaisussa : EMBO molecular medicine. 10, 7, 4 Sivumäärä, 9143.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

Alternative exon definition events control the choice between nuclear retention and cytoplasmic export of U11/U12-65K mRNA

Verbeeren, J., Verma, B., Niemela, E. H., Yap, K., Makeyev, E. V. & Frilander, M. J., toukokuuta 2017, julkaisussa : PLoS Genetics. 13, 5, 28 Sivumäärä, 1006824.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome sequences of a capulavirus infecting Plantago lanceolata in the land archipelago of Finland

Susi, H., Laine, A-L., Filloux, D., Kraberger, S., Farkas, K., Bernardo, P., Frilander, M. J., Martin, D. P., Varsani, A. & Roumagnac, P., heinäkuuta 2017, julkaisussa : Archives of Virology. 162, 7, s. 2041-2045 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2016

Complete androgen insensitivity syndrome caused by a deep intronic pseudoexon-activating mutation in the androgen receptor gene

Känsäkoski, J., Jaaskelainen, J., Jaaskelainen, T., Tommiska, J., Saarinen, L., Lehtonen, R., Hautaniemi, S., Frilander, M. J., Palvimo, J. J., Toppari, J. & Raivio, T., 9 syyskuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 7 Sivumäärä, 32819.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Daphnia magna transcriptome by RNA-Seq across 12 environmental stressors

Orsini, L., Gilbert, D., Podicheti, R., Jansen, M., Brown, J. B., Solari, O. S., Spanier, K. I., Colbourne, J. K., Rush, D., Decaestecker, E., Asselman, J., De Schamphelaere, K. A. C., Ebert, D., Haag, C. R., Kvist, J., Laforsch, C., Petrusek, A., Beckerman, A. P., Little, T. J., Chaturvedi, A. & 3 muutaPfrender, M. E., De Meester, L. & Frilander, M. J., 2016, julkaisussa : Scientific data . 3, 160030.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2015

Evolutionarily conserved exon definition interactions with U11 snRNP mediate alternative splicing regulation on U11-48K and U11/U12-65K genes

Niemelä, E., Verbeeren, J., Singha, P., Nurmi, V. & Frilander, M. J., 2 marraskuuta 2015, julkaisussa : RNA Biology. 12, 11, s. 1256-1264 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Flight-induced changes in gene expression in the Glanville fritillary butterfly

Kvist, J., Mattila, A. L. K., Somervuo, P., Ahola, V., Koskinen, P., Paulin, L., Salmela, L., Fountain, T., Rastas, P., Ruokolainen, A., Taipale, M., Holm, L., Auvinen, P., Lehtonen, R., Frilander, M. J. & Hanski, I., lokakuuta 2015, julkaisussa : Molecular Ecology. 24, 19, s. 4886-4900 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Temperature- and sex-related effects of serine protease alleles on larval development in the Glanville fritillary butterfly

Ahola, V., Koskinen, P., Wong, S. C., Kvist, J., Paulin, L., Auvinen, P., Saastamoinen, M., Frilander, M. J., Lehtonen, R. & Hanski, I., joulukuuta 2015, julkaisussa : Journal of Evolutionary Biology. 28, 12, s. 2224-2235 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2014

Defective minor spliceosome mRNA processing results in isolated familial growth hormone deficiency

Argente, J., Flores, R., Gutierrez-Arumi, A., Verma, B., Martos-Moreno, G. A., Cusco, I., Oghabian, A., Chowen, J. A., Frilander, M. J. & Perez-Jurado, L. A. ., maaliskuuta 2014, julkaisussa : EMBO molecular medicine. 6, 3, s. 299-306 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Global analysis of the nuclear processing of transcripts with unspliced U12-type introns by the exosome

Niemelä, E. H., Oghabian, A., Staals, R. H. J., Greco, D., Pruijn, G. J. M. & Frilander, M. J., 2014, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 42, 11, s. 7358-7369 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera

Ahola, V., Lehtonen, R., Somervuo, P., Salmela, L., Koskinen, P., Rastas, P., Valimaki, N., Paulin, L., Kvist, J., Wahlberg, N., Tanskanen, J., Hornett, E. A., Ferguson, L. C., Luo, S., Cao, Z., de Jong, M. A., Duplouy, A., Smolander, O-P., Vogel, H., McCoy, R. C. & 27 muutaQian, K., Wong, S. C., Zhang, Q., Ahmad, F., Haukka, J. K., Joshi, A., Salojarvi, J., Wheat, C. W., Grosse-Wilde, E., Hughes, D., Katainen, R., Pitkanen, E., Ylinen, J., Waterhouse, R. M., Turunen, M., Vaharautio, A., Ojanen, S. P., Schulman, A. H., Taipale, M., Lawson, D., Ukkonen, E., Makinen, V., Goldsmith, M. R., Holm, L., Auvinen, P., Frilander, M. J. & Hanski, I., syyskuuta 2014, julkaisussa : Nature Communications. 5, 9 Sivumäärä, 4737.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Transcriptome Analysis Reveals Signature of Adaptation to Landscape Fragmentation

Somervuo, P., Kvist, J., Ikonen, S., Auvinen, P., Paulin, L., Koskinen, P., Holm, L., Taipale, M., Duplouy, A., Ruokolainen, A., Saarnio, S., Siren, J., Kohonen, J., Corander, J., Frilander, M. J., Ahola, V. & Hanski, I., 2 heinäkuuta 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 7, 12 Sivumäärä, 101467.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Virus-Encapsulated DNA Origami Nanostructures for Cellular Delivery

Mikkilä, J., Eskelinen, A-P., Niemelä, E. H., Linko, V., Frilander, M. J., Törmä, P. & Kostiainen, M. A., huhtikuuta 2014, julkaisussa : Nano Letters. 14, 4, s. 2196-2200 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2013

HnRNPH1/H2, U1 snRNP, and U11 snRNP cooperate to regulate the stability of the U11-48K pre-mRNA

Turunen, J. J., Verma, B., Nyman, T. A. & Frilander, M. J., maaliskuuta 2013, julkaisussa : RNA. 19, 3, s. 380-389 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification and Validation of Human Papillomavirus Encoded microRNAs

Qian, K., Pietila, T., Rönty, M. J., Michon, F., Frilander, M. J., Ritari, J., Tarkkanen, J., Paulin, L., Auvinen, P. & Auvinen, E., 30 heinäkuuta 2013, julkaisussa : PLoS One. 8, 7, s. Article Number: e70202 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Temperature treatments during larval development reveal extensive heritable and plastic variation in gene expression and life history traits

Kvist, J., Wheat, C. W., Kallioniemi, E., Saastamoinen, M., Hanski, I. & Frilander, M. J., 2013, julkaisussa : Molecular Ecology. 22, 3, s. 602-619 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2012

Effects of p27Kip1- and p53-shRNAs on kanamycin damaged mouse cochlea.

Pietola, L., Jero, J., Jalkanen, R., Kinnari, T. J., Jero, O., Frilander, M., Pajusola, K., Salminen, M. & Aarnisalo, A. A., 28 helmikuuta 2012, julkaisussa : World journal of otorhinolaryngology. 2, 1, s. 1-7 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

SNP Design from 454 Sequencing of Podosphaera plantaginis Transcriptome Reveals a Genetically Diverse Pathogen Metapopulation with High Levels of Mixed-Genotype Infection

Tollenaere, C. M. J., Susi, H., Nokso-Koivisto, J. P., Koskinen, P., Tack, A. J. M., Auvinen, P., Paulin, L., Frilander, M., Lehtonen, R. J. & Laine, A-L., 2012, julkaisussa : PLoS One. 7, 12, s. e52492 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2011

Functional genomics of life history variation in a butterfly metapopulation

Wheat, C. W., Fescemyer, H. W., Kvist, J., Tas, E., Vera, J. C., Frilander, M. J., Hanski, I. & Marden, J. H., 2011, julkaisussa : Molecular Ecology. 20, 9, s. 1813-1828 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Missing-in-metastasis MIM/MTSS1 promotes actin assembly at intercellular junctions and is required for integrity of kidney epithelia

Saarikangas, J., Mattila, P. K., Varjosalo, M., Bovellan, M., Hakanen, J., Calzada-Wack, J., Tost, M., Jennen, L., Rathkolb, B., Hans, W., Horsch, M., Hyvönen, M. E., Perälä, N., Fuchs, H., Gailus-Durner, V., Esposito, I., Wolf, E., de Angelis, M. H., Frilander, M. J., Savilahti, H. & 6 muutaSariola, H., Sainio, K., Lehtonen, S., Taipale, J., Salminen, M. & Lappalainen, P., 2011, julkaisussa : Journal of Cell Science. 124, 8, s. 1245-1255 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Requirement of TFIIH kinase subunit Mat1 for RNA Pol II C-terminal domain Ser5 phosphorylation, transcription and mRNA turnover

Helenius, K., Yang, Y., Tselykh, T. V., Pessa, H. K. J., Frilander, M. J. & Makela, T. P., 2011, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 39, 12, s. 5025-5035 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2010

An Ancient Mechanism for Splicing Control: U11 snRNP as an Activator of Alternative Splicing

Verbeeren, J., Niemelä, E., Turunen, J., Will, C. L., Ravantti, J., Luehrmann, R. & Frilander, M. J., 2010, julkaisussa : Molecular Cell. 37, 6, s. 821-833 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Gene Expression Profiling of U12-Type Spliceosome Mutant Drosophila Reveals Widespread Changes in Metabolic Pathways

Julkaisun otsikon käännös: Gene Expression Profiling of U12-Type Spliceosome Mutant Drosophila Reveals Widespread Changes in Metabolic Pathways: PLoS ONEPessa, H. K. J., Greco, D., Kvist, J., Wahlström, G. M., Heino, T. I., Auvinen, P. & Frilander, M. J., 2010, julkaisussa : PLoS One. 5, 10, s. e13215 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Nucleotide Polymorphism at a Gene (Pgi) under Balancing Selection in a Butterfly Metapopulation

Wheat, C. W., Haag, C., Marden, J. H., Hanski, I. & Frilander, M. J., 2010, julkaisussa : Molecular Biology and Evolution. 27, 2, s. 267-281 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Tooth morphogenesis and ameloblast differentiation are regulated by micro-RNAs

Michon, F., Tummers, M., Kyyronen, M., Frilander, M. J. & Thesleff, I., 2010, julkaisussa : Developmental Biology. 340, s. 355-368 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2009

Fitness differences associated with Pgi SNP genotypes in the Glanville fritillary butterfly (Melitaea cinxia)

Orsini, L., Wheat, C. W., Haag, C., Kvist, J., Frilander, M. J. & Hanski, I., 2009, julkaisussa : Journal of Evolutionary Biology. 22, 2, s. 367-375 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Kemian Nobel ribosomien rakenteen selvittäjille

Frilander, M. J., 2009, julkaisussa : Duodecim. 125, 22, s. 2476-2477 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

Tudor staphylococcal nuclease is an evolutionarily conserved component of the programmed cell death degradome

Sundström, J. F., Vaculova, A., Smertenko, A. P., Savenkov, E. I., Golovko, A., Minina, E., Tiwari, B. S., Rodriguez-Nieto, S., Zamyatnin, A. A. J., Välineva, T., Saarikettu, J., Frilander, M. J., Suarez, M. F., Zavialov, A., Ståhl, U., Hussey, P. J., Silvennoinen, O., Sundberg, E., Zhivotovsky, B. & Bozhkov, P. V., 2009, julkaisussa : Nature Cell Biology. 11, 11, s. 1347-1354 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2008

Bacteriophage Mu integration in yeast and mammalian genomes

Paatero, A. O., Turakainen, H., Happonen, L. J., Olsson, C., Palomäki, T., Pajunen, M. I., Meng, X., Otonkoski, T., Tuuri, T., Berry, C., Malani, N., Frilander, M. J., Bushman, F. & Savilahti, H., 2008, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 36, 22, s. e148 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Minor spliceosome components are predominantly localized in the nucleus

Pessa, H. K. J., Will, C. L., Meng, X., Schneider, C., Watkins, N. J., Perälä, N., Nymark, M., Turunen, J. J., Lührmann, R. & Frilander, M. J., 2008, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 25, s. 8655-8660 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Rapid transcriptome characterization for a nonmodel organism using 454 pyrosequencing

Vera, J. C., Wheat, C. W., Fescemyer, H. W., Frilander, M. J., Crawford, D. L., Hanski, I. & Marden, J. H., 2008, julkaisussa : Molecular Ecology. 17, 7, s. 1636-1647 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The U11-48K protein contacts the 5' splice site of U12-type introns and the U11-59K protein

Turunen, J. J., Will, C. L., Grote, M., Luhrmann, R. & Frilander, M. J., 2008, julkaisussa : Molecular and Cellular Biology. 28, 10, s. 3548-3560 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Täpläverkkoperhonen liiti genomiaikaan

Frilander, M. J., 2008, julkaisussa : Duodecim. 124, 19, s. 2242-2243 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

Weight and nutrition affect pre-mRNA splicing of a muscle gene associated with performance, energetics and life history

Marden, J. H., Fescemyer, H. W., Saastamoinen, M., MacFarland, S. P., Vera, J. C., Frilander, M. J. & Hanski, I., 2008, julkaisussa : Journal of Experimental Biology. 211, 23, s. 3653-3660 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2007

Transcriptional co-activator protein p100 interacts with snRNP proteins and facilitates the assembly of the spliceosome

Yang, J., Välineva, T., Hong, J., Bu, T., Yao, Z., Jensen, O. N., Frilander, M. J. & Silvennoinen, O., 2007, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 35, 13, s. 4485-4494 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2006

The abundance of the spliceosomal snRNPs is not limiting the splicing of U12-type introns

Pessa, H. K. J., Ruokolainen, A. & Frilander, M. J., 2006, julkaisussa : RNA. 12, s. 1883-1892 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2005

Proximity of the U12 snRNA with both the 5' splice site and the branch point during early stages of spliceosome assembly

Frilander, M. J. & Meng, X., 2005, julkaisussa : Molecular and Cellular Biology. 25, 12, s. 4813-4825 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2004

Identification of an evolutionarily divergent U11 small nuclear ribonucleoprotein particle in Drosophila

Schneider, C., Will, C. L., Brosius, J., Frilander, M. J. & Lührmann, R., 2004, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101, 26, s. 9584-9589 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2002

Nonspecific Nucleoside Triphosphatase P4 of Double-Stranded RNA Bacteriophage f6 Is Required for Single-Stranded RNA Packaging and Transcription

Pirttimaa, M. J., Paatero, A. O., Frilander, M. J. & Bamford, D. H., 2002, julkaisussa : Journal of Virology. 76, 20, s. 10122-10127 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2001

Dynamic Exchanges of RNA Interactions Leading to Catalytic Core Formation in the U12-Dependent Spliceosome

Frilander, M. & Steitz, J. A., 2001, julkaisussa : Molecular Cell. 7, 1, s. 217-226. 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

1994

Identification Of The Packaging Regions Within The Genomic RNA Segments Of Bacteriophage φ6

GOTTLIEB, P., QIAO, X. Y., STRASSMAN, J., FRILANDER, M. & MINDICH, L., 1994, julkaisussa : Virology. 200, s. 42-47 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

RNA Structural Requirements For Stability And Minus-Strand Synthesis In The dsRNA Bacteriophage φ6

MINDICH, L., QIAO, X. Y., ONODERA, S., GOTTLIEB, P. & FRILANDER, M., 1994, julkaisussa : Virology. 202, s. 258-263 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

1993

RNA Structure And Heterologous Recombination In The Double-Stranded-RNA Bacteriophage φ6

ONODERA, S., QIAO, X., GOTTLIEB, P., STRASSMAN, J., FRILANDER, M. & MINDICH, L., 1993, julkaisussa : Journal of Virology. 67, s. 4914-4922 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

1992

Dependence Of Minus-Strand Synthesis On Complete Genomic Packaging In The Double-Stranded-RNA Bacteriophage φ6

FRILANDER, M., GOTTLIEB, P., STRASSMAN, J., BAMFORD, D. H. & MINDICH, L., 1992, julkaisussa : Journal of Virology. 66, s. 5013-5017 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

In Vitro Packaging And Replication Of Individual Genomic Segments Of Bacteriophage φ6 RNA

GOTTLIEB, P., STRASSMAN, J., QIAO, X. Y., FRILANDER, M., FRUCHT, A. & MINDICH, L., 1992, julkaisussa : Journal of Virology. 66, s. 2611-2616 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu