Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Yksikön profiili
Our research is focused on molecular biology and functional genomics of non-pathogenic (dairy starters, probiotic lactobacilli, propionibacteria) and pathogenic bacteria (streptococci, staphylococci) that are adapted to food-environment.
We exploit gene and omics-level approaches combined with microbiological and biochemical analyses to study cell-physiology in beneficial and pathogenic bacteria in diverse food systems and materials. The ultimate goal of these research projects is to provide novel information to gain maximal benefit of beneficial bacteria as well as to combat pathogens in foods.Tieteenalat
- 412 Kotieläintiede, maitotaloustiede
- 413 Eläinlääketiede
- 118 Biotieteet
- 416 Elintarviketieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Henkilöt
-
Iida Loivamaa
- Elintarvike- ja ravitsemustieteiden osasto - tohtorikoulutettava
- Molecular Dairy Microbiology
- Doctoral Programme in Food Chain and Health
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
-
Pekka Varmanen
- Elintarvike- ja ravitsemustieteiden osasto - yliopistonlehtori
- Elintarviketieteet
- Molecular Dairy Microbiology
- Doctoral Programme in Food Chain and Health - Ohjaaja tohtoriohjelmassa
Henkilö: U3 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, HY
Projektit
-
B12WEGAIN: Natural vitamin B12 fortification of future foods by bioprocessing and controlled cell-lysis of Propionibacterium freudenreichii
Varmanen, P., Piironen, V., Sillanpää, L. A., Loivamaa, I., Savijoki, K., Chamlagain, B. & Edelmann, M.
01/01/2021 → 31/12/2023
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Molecular basis for natural vitamin B12 fortification of emerging new foods by utilization of Propionibacterium freudenreichii
Piironen, V., Loivamaa, I., Edelmann, M., Chamlagain, B., Savijoki, K., Varmanen, P., Sillanpää, L. A. & Zhang, R.
01/09/2019 → 31/08/2023
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Leg4Life: Legumes for sustainable food system and healthy life
Pajari, A., Piironen, V., Vanhatalo, A., Simojoki, A., Jouppila, K., Kariluoto, S., Päivärinta, E., Konttinen, H., Hyytiäinen, K., Lombardini (former Lombardini-Riipinen), C., Lamminen, M., Alakukku, L., Chamlagain, B., Coda, R., Ertbjerg, P., Edelmann, M., Halmemies-Beauchet-Filleau, A., Itkonen, S., Katina, K., Knaapila, A., Kokkonen, T., Kuoppala, K., Lampi, A., Mäkelä, P., Nurmi, V., Ramos-Diaz, J. M., Salonen, A., Sandell, M., Sihvonen, M., Sontag-Strohm, T., Stoddard, F., Tenkanen, M. & Varmanen, P.
01/06/2019 → 31/08/2022
Projekti: Tutkimusprojekti
-
Proteomics and Surfaceomics of Staphylococcus aureus
Frees, D., Mellerkaard Pedersen, M., Savijoki, K. & Nyman, T. A.
05/11/2016 → …
Projekti: Muu projekti
-
Comparative proteomics and immunoproteomics of the consecutive developmental stages (oncosphere, cysticercoid, adult) of the model cestode species Hymenolepis diminuta to uncover mechanisms contributing to adaptation to environmental constraints and host-parasite interaction
Mlocicki, D., Näreaho, A. & Savijoki, K.
01/01/2013 → …
Projekti: Muu projekti
Julkaisut
-
Fermentation of cereal, pseudo-cereal and legume materials with Propionibacterium freudenreichii and Levilactobacillus brevis for vitamin B12 fortification
Xie, C., Coda, R., Chamlagain, B., Edelmann, M., Varmanen, P., Piironen, V. & Katina, K., helmikuuta 2021, julkaisussa : LWT-Food Science and Technology. 137, 9 Sivumäärä, 110431.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Tiedosto -
Metatranscriptomic assessment of burn wound infection clearance
Ojala, T., Lindford, A., Savijoki, K., Lagus, H. M., Tommila, J., Medlar, A., Kuusela, P. I., Varmanen, P., Holm, L., Vuola, J., Kankuri, E. & Kankainen, M., tammikuuta 2021, julkaisussa : Clinical Microbiology and Infection. 27, 1, s. 144-146 3 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Kirje › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Chloroquine fumardiamides as novel quorum sensing inhibitors
Beus, M., Savijoki, K., Patel, J., Yli-Kauhaluoma, J., Fallarero, A. & Zorc, B., 15 elokuuta 2020, julkaisussa : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 30, 16, 8 Sivumäärä, 127336.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Combined Effect of Naturally-Derived Biofilm Inhibitors and Differentiated HL-60 Cells in the Prevention of Staphylococcus aureus Biofilm Formation
Reigada, I., Guarch-Pérez, C. M., Patel, J., Riool, M., Savijoki, K., Yli-Kauhaluoma, J., Zaat, S. A. J. & Fallarero, A., 9 marraskuuta 2020, julkaisussa : Microorganisms. 8, 11, 15 Sivumäärä, 1757.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Complete Genome Sequences and Methylome Analyses of Cutibacterium acnes subsp. acnes Strains DSM 16379 and DSM 1897T
Deptula, P., Laine, P., Auvinen, P., Paulin, L., Roberts, R. J., Johnston, C. D. & Varmanen, P., 16 heinäkuuta 2020, julkaisussa : Microbiology Resource Announcements. 9, 29, 3 Sivumäärä, e00705-20.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
Journal of Microbiological Methods (Lehti)
Kirsi Savijoki (Arvioitsija (reviewer))
2019 → …Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
PhD thesis supervision, DVM Katja Hautala
Kirsi Savijoki (Sivuohjaaja)
1 elokuuta 2018 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
-
Review of PhD-thesis
Pekka Varmanen (Esitarkastaja)
2018Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen
-
Examination of doctoral dissertation
Kirsi Savijoki (Esitarkastaja)
12 lokakuuta 2017Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan esitarkastaja
-
PhD thesis supervision, MSc Shella Gilbert-Girard
Kirsi Savijoki (Sivuohjaaja)
12 syyskuuta 2017 → …Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
Lehtileikkeet
-
A novel bacterial species named after the Finnish Nobelist A.I. Virtanen
Paulina Deptula, Pekka Varmanen, Petri Olli Viljami Auvinen & Vieno Irene Piironen
30/08/2018
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
-
-
Fermentointi tuottaa leipään B-vitamiinia
Vieno Piironen & Pekka Kristian Varmanen
12/01/2017
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
-
Tutkijat kehittivät tavan tuottaa tärkeää B12-vitamiinia – ilouutinen kasvissyöjille
Vieno Piironen & Pekka Kristian Varmanen
10/01/2017
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media
-
Vegaanit pois pilleripakosta – uusi menetelmä kehittää vain eläinkunnan tuotteista saatua vitamiinia kasvisravintoon
Vieno Piironen & Pekka Kristian Varmanen
09/01/2017
1 Median myötävaikutus
Lehdistö/media