Projekteja vuodessa
Organisaation profiili
Yksikön profiili
Varjosalo Lab
Our longstanding interest is the global and comprehensive understanding of how key cellular signaling molecules; protein kinases, protein phosphatases and transcription factors mediate their signaling potential and how the signaling is changed in diseases in the immuno-oncology axis. For this purpose, we have developed experimental and computational methods to identify the protein-interactions formed by these signaling molecules. Additionally, we employ quantitative mass spectrometry -based proteomics on assessing the protein abundance changes, as well as phosphorylation status of the tissues/cells. Furthermore, combining the data from the different sets of ‘omics’ data (proteomics, HTS and HiSeq), allows us to generate global and systems level understanding on how disease-causing mutations mediate their effects, enabling also the development of therapeutic or diagnostic approaches. Read more on our website.
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Henkilöt
-
Iftekhar Mahmud Chowdhury
- Biotekniikan instituutti - väitöskirjatutkija
- Molecular Systems Biology – Markku Varjosalon ryhmä
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö
-
Sini Meri Marjaana Huuskonen, M.sc
- Biotekniikan instituutti - väitöskirjatutkija
- Molecular Systems Biology – Markku Varjosalon ryhmä
- Doctoral Programme in Drug Research
Henkilö: U1 Opetus- ja tutkimushenkilöstö, Väitöskirjatutkija
-
Salla Keskitalo
- Biotekniikan instituutti - laboratoriopäällikkö
- Molecular Systems Biology – Markku Varjosalon ryhmä
Henkilö: M5 Opetuksen ja tutkimuksen tukihenkilöstö
Laitteet
-
Instruct-ERIC Structural Biology European Research Infrastructure Centre Finland
Butcher, S. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut), Poranen, M. (Muut), Eskelin , K. (Muut), Permi, P. (Muut), Varjosalo, M. (Muut), Lehtiö, L. (Muut) & Rouvinen, J. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Coordination office
-
Integrated Structural Biology Infrastructure-European Research Infrastructure Consortium (Instruct-ERIC) / Consortium FINStruct and Instruct-ERIC
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja), Eskelin , K. (Osallistuja), Lehtiö, L. (Principal Investigator), Salminen, T. A. (Osallistuja) & Papageorgiou, A. C. (Osallistuja)
01/01/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Generation Green
Sikanen, T. (Osallistuja), Yli-Kauhaluoma, J. (Osallistuja), Hirvonen, J. (Osallistuja), Vuorela, P. (Osallistuja), Kärkkäinen, R. (Osallistuja), Vuorensola, K. (Osallistuja), Teppo, J. (Osallistuja), Salminen, O. (Osallistuja), Sivula, S. (Osallistuja) & Teräsalmi, E. (Osallistuja)
01/01/2015 → …
Projekti: Muu projekti
-
Structural Biology Finland (FINStruct) & Instruct-ERIC Centre FI / Research Infrastructure Roadmap 2021-2024
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Iwai, H. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Co-Principal Investigator), Lehtiö, L. (Co-Principal Investigator), Rouvinen, J. (Co-Principal Investigator), Salminen, T. A. (Co-Principal Investigator), Papageorgiou, A. C. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja) & Eskelin , K. (Osallistuja)
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Genome, transcriptome and proteome of the wood-decay fungus Phlebia radiata
Lundell, T. (Projektinjohtaja), Kuuskeri, J. (Osallistuja), Mäkinen, M. (Osallistuja), Paulin, L. (Osallistuja), Laine, P. (Osallistuja), Smolander, O.-P. (Osallistuja), Varjosalo, M. (Osallistuja) & Auvinen, P. (Osallistuja)
03/01/2011 → 31/12/2017
Projekti: Tutkimusprojekti
Julkaisut
-
Fetal-like reversion in the regenerating intestine is regulated by mesenchymal asporin
Iqbal, S., Andersson, S., Nesta, E., Pentinmikko, N., Kumar, A., Kumar Jha, S., Borshagovski, D., Webb, A., Gebert, N., Viitala, E. W., Ritchie, A., Scharaw, S., Kuuluvainen, E., Larsen, H. L., Saarinen, T., Juuti, A., Ristimäki, A., Jeltsch, M., Ori, A. & Varjosalo, M. & 5 muuta, , 3 huhtik. 2025, julkaisussa: Cell Stem Cell. 32, 4, s. 613-626.e8 23 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
From rare to more common: The emerging role of omics in improving understanding and treatment of severe inflammatory and hyperinflammatory conditions
Keskitalo, S., Seppänen, M. R. J., del Sol, A. & Varjosalo, M., 2025, julkaisussa: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 16 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Insight into the function of the Golgi membrane protein GOLM1 in cholangiocytes through interactomic analysis
Nagaraj, M., Emmagouni, S. K. G., Chaurasiya, V., Li, L., Nguyen, V. D., Keskitalo, S., Varjosalo, M., Zhou, Y., Haridas, P. A. N. & Olkkonen, V. M., helmik. 2025, (E-pub ahead of print) julkaisussa: FEBS Letters. 18 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Nuclear Factor I Family Members are Key Transcription Factors Regulating Gene Expression
Malaymar Pinar, D., Göös, H., Tan, Z., Kumpula, E.-P., Chowdhury, I., Wang, Z., Zhang, Q., Salokas, K., Keskitalo, S., Wei, G. H., Kumbasar, A. & Varjosalo, M., tammik. 2025, julkaisussa: Molecular and Cellular Proteomics. 24, 1, 21 Sivumäärä, 100890.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Pulmonary Aspergillosis and Low HIES Score in a Family with STAT3 N-Terminal Domain Mutation
Lima de Souza, S., Asano, T., Glumoff, V., Keskitalo, S., Pikkarainen, K., Martelius, T., Kaustio, M., Saarela, J., Kuismin, O., Lappi-Blanco, E., Jartti, A., Yannopoulos, F., Tiitto, L., Seppänen, M. R. J., Boisson, B., Casanova, J. L., Varjosalo, M., Hautala, T. & Chen, Z., 2025, julkaisussa: Journal of clinical immunology. 45, 1, 11 Sivumäärä, 73.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Aktiviteetit
-
iCAN retreat 2024
Kremneva, E. (Järjestäjätoimikunnan puheenjohtaja), Kolikova, Y. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Laakkonen, P. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Vanharanta, S. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Varjosalo, M. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Wahl, H. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Sankkila-Forsström, S. S. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Duàn, H. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Karhemo, P.-R. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Miihkinen, M. S. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Liljeström, M. (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Pietiäinen, V. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Ganesan, A. (Posteriesitys), Saad, J. (Posteriesitys), Holmström, S. (Posteriesitys), Brodkin, J. H. (Posteriesitys), Mendoza Ortiz, E. D. (Posteriesitys), Sundaresan, S. (Posteriesitys), Chiaro, J. (Posteriesitys), Giannoula, Y. (Posteriesitys), Portaankorva, A. M. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Mustjoki, S. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Mäkelä, T. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Atarsaikhan, G. (Posteriesitys), Filppu, P. (Posteriesitys), Russo, S. (Posteriesitys), Pikkusaari, S. K. (Posteriesitys), Ryzhenkov, A. (Posteriesitys), Newman, R. G. D. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Arffman, M. E. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Kumari, R. (Posteriesitys), Leppiniemi, S. A. (Posteriesitys), Sanjaya, P. (Posteriesitys), Feodoroff, M. J. (Posteriesitys), Karabayev, D. (Posteriesitys), Jäntti, J. M. (Posteriesitys), Wong Ramirez, J. R. C. (Posteriesitys), Kalander, K. O. (Posteriesitys), Bouhlal, J. O. V. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Kuusela, S. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Fey, E. (Puhuja: esitelmän pitäjä), Krami Senhaji, O. (Posteriesitys), Moradi, N. (Posteriesitys), Polso, M. M. M. (Posteriesitys), Antignani, G. (Posteriesitys), Maljanen, K. J. (Posteriesitys), Langohr, L. (Posteriesitys), Anil, A. (Posteriesitys), Smolander, P. J. (Posteriesitys), Feodoroff, M. J. (Posteriesitys), Alsaed, B. (Posteriesitys), Mogollon Figueroa, I. (Posteriesitys), Ryzhenkov, A. (Posteriesitys) & Henriksson, M. E. J. (Posteriesitys)
3 lokak. 2024Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Serum proteomics to detect early changes in type 1 diabetes and carotid atherosclerosis
Lalowski, M. (Esitarkastaja), Öhman, T. (Esitarkastaja), Lahesmaa, R. (Ohjaaja) & Moulder, R. (Ohjaaja)
10 lokak. 2018Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan esitarkastaja
-
Serum Proteomics to Detect Early Changes in Type 1Diabetes and Carotid Atherosclerosis
Lalowski, M. (Esitarkastaja), Öhman, T. J. (Esitarkastaja), Lahesmaa, R. (Ohjaaja) & Moulder, R. (Ohjaaja)
toukok. 2018Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja