Julkaisut 2001 2019

Suodatin
Artikkeli
2019

A Novel Interaction Network Used by Potyviruses in Virus-Host Interactions at the Protein Level

Ala-Poikela, M., Rajamäki, M. & Valkonen, J., 2019, julkaisussa : Viruses. 11, 1158, 24 Sivumäärä, 1158.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Phenotyping viral infection in sweetpotato using a high-throughput chlorophyll fluorescence and thermal imaging platform

Wang, L., Poque, S. & Valkonen, J. P. T., 22 lokakuuta 2019, julkaisussa : Plant Methods. 15, 1, 14 Sivumäärä, 116.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Small-RNA analysis of pre-basic mother plants and conserved accessions of plant genetic resources for the presence of viruses

Rajamäki, M-L., Lemmetty, A., Laamanen, J., Roininen, E., Vishwakarma, A., Streng, J., Latvala, S. & Valkonen, J. P. T., 7 elokuuta 2019, julkaisussa : PLoS One. 14, 8, 21 Sivumäärä, 0220621.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Sunagoke Moss (Racomitrium japonicum) Used for Greening Roofs Is Severely Damaged by Sclerotium delphinii and Protected by a Putative Bacillus amyloliquefaciens Isolate

Tamura, M., Tanabe, M., Valkonen, J. P. T. & Akita, M., 28 helmikuuta 2019, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 10, 10 Sivumäärä, 372.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Molecular detection and characterisation of black raspberry necrosis virus and raspberry bushy dwarf virus isolates in wild raspberries

Susi, H., Rajamäki, M. L., Artola, K., Jayaraj-Mallika, F. R. & Valkonen, J. P. T., syyskuuta 2018, julkaisussa : Annals of Applied Biology. 173, 2, s. 97-111 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Phytotoxin produced by the netted scab pathogen, Streptomyces turgidiscabies strain 65, isolated in Sweden

Natsume, M., Nagagata, A., Aittamaa, M., Okaniwa, N., Somervuo, P., Fiedler, H-P., Kreuze, J. F., Rokka, V-M., Bang, H., Kawaide, H. & Valkonen, J. P. T., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Journal of General Plant Pathology. 84, 2, s. 108-117 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Sensitivity of Small RNA-Based Detection of Plant Viruses

Santala, J. & Valkonen, J. P. T., 14 toukokuuta 2018, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 9, 7 Sivumäärä, 939.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Species-specific synergistic effects of two plant growth-Promoting microbes on green roof plant biomass and photosynthetic efficiency

Xie, L., Lehvävirta, S., Timonen, S., Kasurinen, J., Niemikapee, J. & Valkonen, J. P. T., 31 joulukuuta 2018, julkaisussa : PLoS One. 13, 12, 16 Sivumäärä, 0209432.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

A Framework for the Evaluation of Biosecurity, Commercial, Regulatory, and Scientific Impacts of Plant Viruses and Viroids Identified by NGS Technologies

Massart, S., Candresse, T., Gil, J., Lacomme, C., Predajna, L., Ravnikar, M., Reynard, J-S., Rumbou, A., Saldarelli, P., Skoric, D., Vainio, E. J., Valkonen, J. P. T., Vanderschuren, H., Varveri, C. & Wetzel, T., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 8, 7 Sivumäärä, 45.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Differential Requirement of the Ribosomal Protein S6 and Ribosomal Protein S6 Kinase for Plant-Virus Accumulation and Interaction of S6 Kinase with Potyviral VPg

Rajamaki, M-L., Xi, D., Sikorskaite-Gudziuniene, S., Valkonen, J. P. T. & Whitham, S. A., toukokuuta 2017, julkaisussa : Molecular Plant - Microbe Interactions. 30, 5, s. 374-384 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Graphical genotyping as a method to map Ny ((o,n)sto) and Gpa5 using a reference panel of tetraploid potato cultivars

van Eck, H. J., Vos, P. G., Valkonen, J. P. T., Uitdewilligen, J. G. A. M. L., Lensing, H., de Vetten, N. & Visser, R. G. F., maaliskuuta 2017, julkaisussa : Theoretical and Applied Genetics. 130, 3, s. 515-528 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Pathogenic seedborne viruses are rare but Phaseolus vulgaris endornaviruses are common in bean varieties grown in Nicaragua and Tanzania

Nordenstedt, N., Marcenaro, D., Chilagane, D., Mwaipopo, B., Rajamaki, M-L., Nchimbi-Msolla, S., Njau, P. J. R., Mbanzibwa, D. R. & Valkonen, J. P. T., 25 toukokuuta 2017, julkaisussa : PLoS One. 12, 5, 18 Sivumäärä, 0178242.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Repeated Applications of a Nonpathogenic Streptomyces Strain Enhance Development of Suppressiveness to Potato Common Scab

Hiltunen, L. H., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., tammikuuta 2017, julkaisussa : Plant Disease. 101, 1, s. 224-232 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Strigolactone biosynthesis is evolutionarily conserved, regulated by phosphate starvation and contributes to resistance against phytopathogenic fungi in a moss, Physcomitrella patens

Decker, E. L., Alder, A., Hunn, S., Ferguson, J., Lehtonen, M. T., Scheler, B., Kerres, K. L., Wiedemann, G., Safavi-Rizi, V., Nordzieke, S., Balakrishna, A., Baz, L., Avalos, J., Valkonen, J. P. T., Reski, R. & Al-Babili, S., lokakuuta 2017, julkaisussa : New Phytologist. 216, 2, s. 455-468 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Utilization of engineered resistance to viruses in crops of the developing world, with emphasis on sub-Saharan Africa

Kreuze, J. F. & Valkonen, J. PT., 2017, julkaisussa : Current opinion in virology. 26, s. 90 - 97 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

A novel sweet potato potyvirus open reading frame (ORF) is expressed via polymerase slippage and suppresses RNA silencing

Untiveros, M., Olspert, A., Artola, K., Firth, A. E., Kreuze, J. F. & Valkonen, J. P. T., syyskuuta 2016, julkaisussa : Molecular Plant Pathology. 17, 7, s. 1111-1123 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Dissecting Abscisic Acid Signaling Pathways Involved in Cuticle Formation

Cui, F., Brosche, M., Lehtonen, M. T., Amiryousefi, A., Xu, E., Punkkinen, M., Valkonen, J. P. T., Fujii, H. & Overmyer, K., 6 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Molecular Plant. 9, 6, s. 926-938 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Evaluation of a diagnostic microarray for the detection of major bacterial pathogens of potato from tuber samples

Degefu, Y., Somervuo, P. J., Aittamaa, M., Virtanen, E. & Valkonen, J. P. T., 8 maaliskuuta 2016, julkaisussa : EPPO Bulletin. 46, 1, s. 103-111 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Occurrence and genetic diversity of Raspberry leaf blotch virus (RLBV) infecting cultivated and wild Rubus species in Finland

Dong, L., Lemmetty, A., Latvala, S., Samuilova, O. & Valkonen, J. P. T., tammikuuta 2016, julkaisussa : Annals of Applied Biology. 168, 1, s. 122-132 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Seedborne Pathogenic Fungi in Common Bean (Phaseolus vulgaris cv. INTA Rojo) in Nicaragua

Marcenaro, D. & Valkonen, J. P. T., 2016, julkaisussa : PLoS One. 11, 12, 18 Sivumäärä, 0168662.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The adoption of cv. Igorota in the Philippines and Vietnam

Chien, D. H., Ganga, Z. N., Simongo, D. K., Kiswa, C. G., Gonzales, I. C., Perez, J., Tung, P. X., Hau, N. T., Artola, K., Valkonen, J. P. T., Li, C. & VanderZaag, P., 2016, julkaisussa : American Journal of Potato Research. 93, 3, s. 296-301 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Viral RNase3 Co-Localizes and Interacts with the Antiviral Defense Protein SGS3 in Plant Cells

Weinheimer, I., Haikonen, T., Ala-Poikela, M., Moser, M., Streng, J., Rajamaki, M-L. & Valkonen, J. P. T., 8 heinäkuuta 2016, julkaisussa : PLoS One. 11, 7, 16 Sivumäärä, 0159080.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2015

Biologisesta torjunnasta apua ruvenhallintaan

Hiltunen, L., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., 2015, julkaisussa : Tuottava peruna. 42, 2, s. 4-6 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Comparative Analysis of Prokaryotic Communities Associated with Organic and Conventional Farming Systems

Pershina, E., Valkonen, J. P. T., Kurki, P., Ivanova, E., Chirak, E., Korvigo, I., Provorov, N. & Andronov, E., 18 joulukuuta 2015, julkaisussa : PLoS One. 10, 12, 16 Sivumäärä, 0145072.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Control of downy mildew (Peronospora sparsa) in arctic bramble (Rubus arcticus ssp arcticus)

Kostamo, K., Toljamo, A., Palonen, P., Valkonen, J. P. T., Karenlampi, S. O. & Kokko, H., 2015, julkaisussa : Annals of Applied Biology. 167, 1, s. 90-101 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Diagnosis and discovery of fungal viruses using deep sequencing of small RNAs

Vainio, E. J., Jurvansuu, J., Streng, J., Rajamaki, M-L., Hantula, J. & Valkonen, J. P. T., 2015, julkaisussa : Journal of General Virology. 96, s. 714-725 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Diversity and evolution of potato mop-top virus

Beuch, U., Berlin, S., Akerblom, J., Nicolaisen, M., Nielsen, S. L., Crosslin, J. M., Hamm, P. B., Santala, J., Valkonen, J. P. T. & Kvarnheden, A., 2015, julkaisussa : Archives of Virology. 160, 5, s. 1345-1351 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Recombination of strain O segments to HCpro-encoding sequence of strain N of Potato virus Y modulates necrosis induced in tobacco and in potatoes carrying resistance genes Ny or Nc

Tian, Y. & Valkonen, J. P. T., syyskuuta 2015, julkaisussa : Molecular Plant Pathology. 16, 7, s. 735-747 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Suppression of RNAi by dsRNA-Degrading RNaseIII Enzymes of Viruses in Animals and Plants

Weinheimer, I., Jiu, Y., Rajamäki, M., Matilainen, O., Kallijärvi, J., Cuellar, W., Lu, R., Saarma, M., Holmberg, C. I., Jäntti, J. & Valkonen, J., 6 maaliskuuta 2015, julkaisussa : PLoS Pathogens. 11, 3, 25 Sivumäärä, e1004711.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2014

Analysis of Potato virus Y Coat Protein Epitopes Recognized by Three Commercial Monoclonal Antibodies

Tian, Y-P., Hepojoki, J., Ranki, H., Lankinen, H. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 12, 20 Sivumäärä, 0115766.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Binding and processing of small dsRNA molecules by the class 1 RNase III protein encoded by sweet potato chlorotic stunt virus

Weinheimer, I., Boonrod, K., Moser, M., Wassenegger, M., Krczal, G., Butcher, S. J. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Journal of General Virology. 95, s. 486-495 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Comparison of Straw Mulch, Insecticides, Mineral Oil, and Birch Extract for Control of Transmission of Potato virus Y in Seed Potato Crops

Kirchner, S. M., Hiltunen, L. H., Santala, J., Doering, T. F., Ketola, J., Kankaala, A., Virtanen, E. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Potato Research. 57, 1, s. 59-75 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Composite potato plants with transgenic roots on non-transgenic shoots: a model system for studying gene silencing in roots

Horn, P., Santala, J., Nielsen, S. L., Huehns, M., Broer, I. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Plant Cell Reports. 33, 12, s. 1977-1992 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

First Report of Streptomyces europaeiscabiei Causing Common Scab on Potato in Finland.

Hiltunen, L. H., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Plant disease. 98, 9, s. 1267-1268 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

fPoxDB: fungal peroxidase database for comparative genomics

Choi, J., Detry, N., Kim, K-T., Asiegbu, F. O., Valkonen, J. P. T. & Lee, Y-H., 8 toukokuuta 2014, julkaisussa : BMC Microbiology. 14, 8 Sivumäärä, 117.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Functional diversification of duplicated chalcone synthase genes in anthocyanin biosynthesis of Gerbera hybrida

Deng, X., Bashandy, H., Ainasoja, M., Kontturi, J., Pietiäinen, M., Laitinen, R. A. E., Albert, V. A., Valkonen, J., Elomaa, P. & Teeri, T., 2014, julkaisussa : New Phytologist. 201, 4, s. 1469-1483 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Global gene expression in the common scab pathogen, Streptomyces scabies, exposed to potato microtubers

Dees, M. W., Lysoe, E., Brurberg, M. B., Somervuo, P., Almvik, M. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Annals of Applied Biology. 165, 1, s. 43-52 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Infection Cycle of Artichoke Italian Latent Virus in Tobacco Plants: Meristem Invasion and Recovery from Disease Symptoms

Santovito, E., Mascia, T., Siddiqui, S. A., Minutillo, S. A., Valkonen, J. P. T. & Gallitelli, D., 9 kesäkuuta 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 6, 15 Sivumäärä, 99446.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Kasvivirologian väitöksiä

Rastas, M. & Valkonen, J., 2014, julkaisussa : Kasvinsuojelulehti. 47, 3, s. 86-88 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Physcomitrella patens Has Kinase-LRR R Gene Homologs and Interacting Proteins

Tanigaki, Y., Ito, K., Obuchi, Y., Kosaka, A., Yamato, K. T., Okanami, M., Lehtonen, M. T., Valkonen, J. P. T. & Akita, M., 18 huhtikuuta 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 4, 10 Sivumäärä, 95118.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Protein Secretome of Moss Plants (Physcomitrella patens) with Emphasis on Changes Induced by a Fungal Elicitor

Lehtonen, M. T., Takikawa, Y., Rönnholm, G., Akita, M., Kalkkinen, N., Ahola-Iivarinen, E., Somervuo, P., Varjosalo, M. & Valkonen, J. P. T., helmikuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 2, s. 447-459 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Secret lifestyles of Neurospora crassa

Kuo, H-C., Sun, H., Choi, J., Asiegbu, F. O., Valkonen, J. P. T. & Lee, Y-H., 30 toukokuuta 2014, julkaisussa : Scientific Reports. 4, 6 Sivumäärä, 5135.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Siemenperunan tuotanto on käynnistynyt Tansaniassa

Palohuhta, J-P., Ranta, H., Kosamo, J., Hiltunen, L., Pisilä, E., Sohlo, J., Ala-Poikela, M. & Valkonen, J., 2014, julkaisussa : Tuottava peruna. 41, 1, s. 12-17

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Silencing Suppressor Protein VPg of a Potyvirus Interacts With the Plant Silencing-Related Protein SGS3

Rajamaki, M-L., Streng, J. & Valkonen, J. P. T., 2014, julkaisussa : Molecular Plant - Microbe Interactions. 27, 11, s. 1199-1210 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2013

Characterization of Beet necrotic yellow vein virus infecting sugar beet in Lithuania

Zizyte, M., Valkonen, J. & Staniulis, J., 2013, julkaisussa : Journal of Plant Pathology. 95, 1, s. 211-216 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

First report of five viruses infecting potatoes in Tanzania

Chiunga, E. & Valkonen, J., 2013, julkaisussa : Plant Disease. 97, 9, s. 1260 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genetic Determinants of Potato virus Y Required to Overcome or Trigger Hypersensitive Resistance to PVY Strain Group O Controlled by the Gene Ny in Potato

Tian, Y. & Valkonen, J., 2013, julkaisussa : Molecular Plant - Microbe Interactions. 26, 3, s. 297-305 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genetic Variability and Evolutionary Implications of RNA Silencing Suppressor Genes in RNA1 of Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus Isolates Infecting Sweetpotato and Related Wild Species

Tugume, A. K., Amayo, R., Weinheimer, I., Mukasa, S. B., Rubaihayo, P. R. & Valkonen, J. P. T., 2013, julkaisussa : PLoS One. 8, 11, 15 Sivumäärä, 81479.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Improved silencing suppression and enhanced heterologous protein expression are achieved using an engineered viral helper component proteinase

Haikonen, T., Rajamaki, M. -L. & Valkonen, J. P. T., 2013, julkaisussa : Journal of Virological Methods. 193, 2, s. 687-692 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu