Precision Cancer Pathology

Julkaisut 2015 2019

  • 34 Artikkeli
  • 1 Pääkirjoitus
  • 1 Katsausartikkeli
  • 1 Väitöskirja
2019

BRAF immunohistochemistry predicts sentinel lymph node involvement in intermediate thickness melanomas

Manninen, A. A., Gardberg, M., Juteau, S., Ilmonen, S., Jukonen, J., Andersson, N. & Carpen, O., 30 huhtikuuta 2019, julkaisussa : PLoS One. 14, 4, 13 Sivumäärä, 0216043.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Combined epithelial marker analysis of tumour budding in stage II colorectal cancer

Slik, K., Blom, S., Turkki, R., Välimäki, K., Kurki, S., Mustonen, H., Haglund, C., Carpén, O., Kallioniemi, O., Korkeila, E., Sundström, J. & Pellinen, T., tammikuuta 2019, julkaisussa : The Journal of Pathology: Clinical Research. 5, 1, s. 63-78 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Suomalainen biopankki on potilaita varten

Carpén, O. & Hautalahti, M., 2019, julkaisussa : Duodecim. 135, 10, s. 971-972 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuPääkirjoitusAmmatillinen

Vaginal Microbiota Composition Correlates Between Pap Smear Microscopy and Next Generation Sequencing and Associates to Socioeconomic Status

Virtanen, S., Rantsi, T., Virtanen, A., Kervinen, K., Nieminen, P., Kalliala, I. & Salonen, A., 23 toukokuuta 2019, julkaisussa : Scientific Reports. 9, 9 Sivumäärä, 7750.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

A Functional Homologous Recombination Assay Predicts Primary Chemotherapy Response and Long-Term Survival in Ovarian Cancer Patients

Tumiati, M., Hietanen, S., Hynninen, J., Pietilä, E., Färkkilä, A., Kaipio, K., Roering, P., Huhtinen, K., Alkodsi, A., Li, Y., Lehtonen, R., Erkan, E. P., Tuominen, M. M., Lehti, K., Hautaniemi, S. K., Vähärautio, A., Grenman, S., Carpen, O. & Kauppi, L., 15 syyskuuta 2018, julkaisussa : Clinical Cancer Research. 24, 18, s. 4482-4493 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Combined ASRGL1 and p53 immunohistochemistry as an independent predictor of survival in endometrioid endometrial carcinoma

Huvila, J., Laajala, T. D., Edqvist, P-H., Mardinoglu, A., Talve, L., Ponten, F., Grenman, S., Carpen, O., Aittokallio, T. & Auranen, A., huhtikuuta 2018, julkaisussa : Gynecologic Oncology. 149, 1, s. 173-180 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

EGFR gene copy number decreases during anti-EGFR antibody therapy in colorectal cancer

Birkman, E-M., Avoranta, T., Algars, A., Korkeila, E., Lintunen, M., Lahtinen, L., Kuopio, T., Ristamäki, R., Carpen, O. & Sundström, J., joulukuuta 2018, julkaisussa : Human Pathology. 82, s. 163-171 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Endometriumkarsinooman molekulaarinen luokittelu ja kudosperäiset ennustetekijät

Huvila, J. & Carpén, O., 2018, julkaisussa : Duodecim. 134, 12, s. 1265-1271 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuKatsausartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Formin Proteins FHOD1 and INF2 in Triple-Negative Breast Cancer: Association With Basal Markers and Functional Activities

Heuser, V. D., Mansuri, N., Mogg, J., Kurki, S., Repo, H., Kronqvist, P., Carpen, O. & Gardberg, M., 24 elokuuta 2018, julkaisussa : Breast cancer-Basic and clinical research. 12, 12 Sivumäärä, 1178223418792247.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Gastric cancer: immunohistochemical classification of molecular subtypes and their association with clinicopathological characteristics

Birkman, E-M., Mansuri, N., Kurki, S., Ålgars, A., Lintunen, M., Ristamäki, R., Sundström, J. & Carpen, O., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Virchows Archiv. 472, 3, s. 369-382 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Identifying differentially methylated sites in samples with varying tumor purity

Häkkinen, A., Alkodsi, A., Facciotto, C., Zhang, K., Kaipio, K., Leppa, S., Carpen, O., Grenman, S., Hynninen, J., Hietanen, S., Lehtonen, R. & Hautaniemi, S., 15 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 18, s. 3078-3085 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Integrated genome analysis of uterine leiomyosarcoma to identify novel driver genes and targetable pathways

Cuppens, T., Moisse, M., Depreeuw, J., Annibali, D., Colas, E., Gil-Moreno, A., Huvila, J., Carpen, O., Zikan, M., Matias-Guiu, X., Moerman, P., Croce, S., Lambrechts, D. & Amant, F., 15 maaliskuuta 2018, julkaisussa : International Journal of Cancer. 142, 6, s. 1230-1243 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Mathematical Modeling Predicts Response to Chemotherapy and Drug Combinations in Ovarian Cancer

Kozlowska, E., Färkkilä, A., Vallius, T., Carpen, O., Kemppainen, J., Grenman, S., Lehtonen, R., Hynninen, J., Hietanen, S. & Hautaniemi, S., 15 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Cancer Research. 78, 14, s. 4036-4044 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Miten motivoida kansalaisia syöpäseulontoihin?

Nieminen, P. & Virtanen, A., 2018, julkaisussa : Duodecim. 134, 23, s. 2397-2401 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Nordic Cancer Registries - an overview of their procedures and data comparability

Pukkala, E., Engholm, G., Schmidt, L. K. H., Storm, H., Khan, S., Lambe, M., Pettersson, D., Olafsdottir, E., Tryggvadottir, L., Hakanen, T., Malila, N., Virtanen, A., Johannesen, T. B., Laronningen, S. & Ursin, G., 2018, julkaisussa : Acta Oncologica. 57, 4, s. 440-455 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Prognostic and diagnostic value of REG4 serum and tissue expression in pancreatic ductal adenocarcinoma

Saukkonen, K., Hagström, J., Mustonen, H., Lehtinen, L., Carpen, O., Andersson, L. C., Seppänen, H. & Haglund, C., 2018, julkaisussa : Tumor Biology. 40, 3, 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Real-world features associated with cancer-related venous thromboembolic events

Peippo, M. H., Kurki, S., Lassila, R. & Carpen, O. M., elokuuta 2018, julkaisussa : ESMO open. 3, 5, 10 Sivumäärä, 000363.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The Expression of HSD17B12 Is Associated with COX-2 Expression and Is Increased in High-Grade Epithelial Ovarian Cancer

Kemilainen, H., Huhtinen, K., Auranen, A., Carpen, O., Strauss, L. & Poutanen, M., 2018, julkaisussa : Oncology. 94, 4, s. 233-242 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Transcription Factor GATA6: A Novel Marker and Putative Inducer of Ductal Metaplasia in Biliary Atresia.

Soini, T., Pihlajoki, M., Andersson, N., Lohi, J., Huppert, K. A., Rudnick, D. A., Huppert, S. S., Wilson, D. B., Pakarinen, M. P. & Heikinheimo, M., toukokuuta 2018, julkaisussa : American Journal of Physiology: Gastrointestinal and Liver Physiology. 314, 5, s. G547–G558 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Trends in presentation, treatment and survival of 1777 patients with colorectal cancer over a decade: a Biobank study

Heervä, E., Carpelan, A., Kurki, S., Sundström, J., Huhtinen, H., Rantala, A., Ålgars, A., Ristamäki, R., Carpen, O. & Minn, H., 2018, julkaisussa : Acta Oncologica. 57, 6, s. 735-742 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

Breast cancer in neurofibromatosis type 1: overrepresentation of unfavourable prognostic factors

Uusitalo, E., Kallionpaa, R. A., Kurki, S., Rantanen, M., Pitkaniemi, J., Kronqvist, P., Harkonen, P., Huovinen, R., Carpen, O., Pöyhönen, M., Peltonen, S. & Peltonen, J., 17 tammikuuta 2017, julkaisussa : British Journal of Cancer. 116, 2, s. 211-217 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

EGFR gene copy number predicts response to anti-EGFR treatment in RAS wild type and RAS/BRAF/PIK3CA wild type metastatic colorectal cancer

Algars, A., Sundstrom, J., Lintunen, M., Jokilehto, T., Kytölä, S., Kaare, M., Vainionpää, R., Orpana, A., Österlund, P., Ristimäki, A., Carpen, O. & Ristamäki, R., 2017, julkaisussa : International Journal of Cancer. 140, 4, s. 922-929 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Ezrin expression combined with MSI status in prognostication of stage II colorectal cancer

Silk, K., Kurki, S., Korpela, T., Carpen, O., Korkeila, E. & Sundstrom, J., 27 syyskuuta 2017, julkaisussa : PLoS One. 12, 9, 15 Sivumäärä, 0185436.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

FHOD1 formin is upregulated in melanomas and modifies proliferation and tumor growth

Peippo, M., Gardberg, M., Lamminen, T., Kaipio, K., Carpen, O. & Heuser, V. D., 1 tammikuuta 2017, julkaisussa : Experimental Cell Research. 350, 1, s. 267-278 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Hyper-phosphorylation of Sequestosome-1 Distinguishes Resistance to Cisplatin in Patient Derived High Grade Serous Ovarian Cancer Cells

Nguyen, E. V., Huhtinen, K., Goo, Y. A., Kaipio, K., Andersson, N., Rantanen, V., Hynninen, J., Lahesmaa, R., Carpen, O. & Goodlett, D. R., heinäkuuta 2017, julkaisussa : Molecular & Cellular Proteomics. 16, 7, s. 1377-1392 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Jokainen potilas tutkimuspotilaaksi: Biopankit ja Kansallinen syöpäkeskus yhdenvertaisuuden asialla

Carpén, O. & Helander, T., 2017, julkaisussa : Duodecim. 133, 6, s. 592-598 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Open access
Tiedosto

PLA2G7 associates with hormone receptor negativity in clinical breast cancer samples and regulates epithelial-mesenchymal transition in cultured breast cancer cells

Lehtinen, L., Vainio, P., Wikman, H., Huhtala, H., Mueller, V., Kallioniemi, A., Pantel, K., Kronqvist, P., Kallioniemi, O., Carpèn, O. & Iljin, K., 2017, julkaisussa : The Journal of Pathology: Clinical Research. 3, 2, s. 123-138 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Potential Targets' Analysis Reveals Dual PI3K/mTOR Pathway Inhibition as a Promising Therapeutic Strategy for Uterine Leiomyosarcomas-an ENITEC Group Initiative

Cuppens, T., Annibali, D., Coosemans, A., Trovik, J., ter Haar, N., Colas, E., Garcia-Jimenez, A., Van de Vijver, K., Kruitwagen, R. P. M., Brinkhuis, M., Zikan, M., Dundr, P., Huvila, J., Carpen, O., Haybaeck, J., Moinfar, F., Salvesen, H. B., Stukan, M., Mestdagh, C., Zweemer, R. P. & 11 muutaMassuger, L. F., Mallmann, M. R., Wardelmann, E., Mints, M., Verbist, G., Thomas, D., Gomme, E., Hermans, E., Moerman, P., Bosse, T. & Amant, F., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Clinical Cancer Research. 23, 5, s. 1274-1285 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Syöpärekisteri ja patologi

Nordling, S. & Virtanen, A., 2017, julkaisussa : Moodi.. 41, 3, s. 18-21 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

2016

A Nanoparticle-Lectin Immunoassay Improves Discrimination of Serum CA125 from Malignant and Benign Sources

Gidwani, K., Huhtinen, K., Kekki, H., van Vliet, S., Hynninen, J., Koivuviita, N., Perheentupa, A., Poutanen, M., Auranen, A., Grenman, S., Lamminmaki, U., Carpen, O., van Kooyk, Y. & Pettersson, K., lokakuuta 2016, julkaisussa : Clinical Chemistry (Washington, DC). 62, 10, s. 1390-1400 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Molecularly Defined Adult Granulosa Cell Tumor of the Ovary: The Clinical Phenotype

McConechy, M. K., Farkkila, A., Horlings, H. M., Talhouk, A., Unkila-Kallio, L., van Meurs, H. S., Yang, W., Rozenberg, N., Andersson, N., Zaby, K., Bryk, S., Butzow, R., Halfwerk, J. B. G., Hooijer, G. K. J., van de Vijver, M. J., Buist, M. R., Kenter, G. G., Brucker, S. Y., Kramer, B., Staebler, A. & 6 muutaBleeker, M. C. G., Heikinheimo, M., Kommoss, S., Gilks, C. B., Anttonen, M. & Huntsman, D. G., marraskuuta 2016, julkaisussa : Journal of the National Cancer Institute. 108, 11, 5 Sivumäärä, 134.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Novel Mad2-targeting miR-493-3p controls mitotic fidelity and cancer cells' sensitivity to paclitaxel

Tambe, M., Pruikkonen, S., Maki-Jouppila, J., Chen, P., Elgaaen, B. V., Straume, A. H., Huhtinen, K., Carpen, O., Lonning, P. E., Davidson, B., Hautaniemi, S. & Kallio, M. J., 15 maaliskuuta 2016, julkaisussa : Oncotarget. 7, 11, s. 12267-12285 19 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

REG4 Is Highly Expressed in Mucinous Ovarian Cancer: A Potential Novel Serum Biomarker

Lehtinen, L., Vesterkvist, P., Roering, P., Korpela, T., Hattara, L., Kaipio, K., Mpindi, J-P., Hynninen, J., Auranen, A., Davidson, B., Haglund, C., Iljin, K., Grenman, S., Siitari, H. & Carpen, O., 16 maaliskuuta 2016, julkaisussa : PLoS One. 11, 3, 13 Sivumäärä, 0151590.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2015

Identification of Prognostic Groups in High-Grade Serous Ovarian Cancer Treated with Platinum-Taxane Chemotherapy

Chen, P., Huhtinen, K., Kaipio, K., Mikkonen, P., Aittomaki, V., Lindell, R., Hynninen, J., Auranen, A., Grenman, S., Lehtonen, R., Carpen, O. & Hautaniemi, S., 1 elokuuta 2015, julkaisussa : Cancer Research. 75, 15, s. 2987-2998 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

N-glycomic Profiling as a Tool to Separate Rectal Adenomas from Carcinomas

Kaprio, T., Satomaa, T., Heiskanen, A., Hokke, C. H., Deelder, A. M., Mustonen, H., Hagstrom, J., Carpen, O., Saarinen, J. & Haglund, C., helmikuuta 2015, julkaisussa : Molecular & Cellular Proteomics. 14, 2, s. 277-288 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu