• P.O. Box (Viikinkaari 1), Biocentre 3

    00014 Helsinki University

    Suomi

Julkaisut 2007 2020

  • 27 Artikkeli
  • 4 Kirjan luku tai artikkeli
  • 1 Katsausartikkeli
2020

CRK2 and C-terminal Phosphorylation of NADPH Oxidase RBOHD Regulate Reactive Oxygen Species Production in Arabidopsis

Kimura, S., Hunter, K., Vaahtera, L., Tran, C., Citterico, M., Vaattovaara, A., Rokka, A., Stolze, S. C., Harzen, A., Meißner, L., Wilneks, M. M. T., Hamann, T., Toyoga, M., Nakagami, H. & Wrzaczek, M., 6 helmikuuta 2020, julkaisussa : Plant Cell.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
2019

Arabidopsis RCD1 coordinates chloroplast and mitochondrial functions through interaction with ANAC transcription factors

Shapiguzov, A., Vainonen, J., Hunter, K. A., Tossavainen, H. P. M., Tiwari, A., Järvi, S., Hellman, M. H., Aarabi, F., Alseekh, S., Wybouw, B., Van Der Kelen, K., Nikkanen, L., Krasensky-Wrzaczek, J., Sipari, N. H., Keinänen, M., Tyystjaervi, E., Rintamäki, E., De Rybel, B., Salojärvi, J. T., Van Breusegem, F. & 6 muuta, Fernie, A. R., Brosche, M. J., Permi, P. E. I., Aro, E-M., Wrzaczek, M. A. & Kangasjärvi, J. S., 15 helmikuuta 2019, julkaisussa : eLife. 8, 35 Sivumäärä, e43284.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

CRK2 Enhances Salt Tolerance by Regulating Callose Deposition in Connection with PLDα1

Hunter, K., Kimura, S., Rokka, A., Huy Cuong Tran, Toyota, M., Kukkonen, J. P. & Wrzaczek, M., elokuuta 2019, julkaisussa : Plant Physiology. 180, 4, s. 2004-2021 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

High-throughput sequencing data and the impact of plant gene annotation quality

Vaattovaara, A. F. M., Leppälä, J. M., Salojärvi, J. T. & Wrzaczek, M. A., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Journal of Experimental Botany. 70, 4, s. 1069-1076 8 Sivumäärä, ery43.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Mechanistic insights into the evolution of DUF26-containing proteins in land plants

Vaattovaara, A., Brandt, B., Rajaraman, S., Safronov, O., Veidenberg, A., Luklová, M., Kangasjärvi, J., Löytynoja, A., Hothorn, M., Salojärvi, J. & Wrzaczek, M., 8 helmikuuta 2019, julkaisussa : Communications Biology. 2, 18 Sivumäärä, 56.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Arabidopsis downy mildew effector HaRxL106 suppresses plant immunity by binding to RADICAL-INDUCED CELL DEATH1

Wirthmueller, L., Asai, S., Rallapalli, G., Sklenar, J., Fabro, G., Kim, D. S., Lintermann, R., Jaspers, P., Wrzaczek, M., Kangasjärvi, J., MacLean, D., Menke, F. L. H., Banfield, M. J. & Jones, J. D. G., lokakuuta 2018, julkaisussa : New Phytologist. 220, 1, s. 232-248 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

CRK2 enhances salt tolerance in Arabidopsis thaliana by regulating endocytosis and callose deposition in connection with PLDα1

Hunter, K. A., Kimura, S., Rokka, A., Tran, H. C., Toyota, M., Kukkonen, J. P. & Wrzaczek, M. A., 7 joulukuuta 2018, (Jätetty) julkaisussa : bioRxiv : the preprint server for biology .

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

2017

Bound by Fate: The Role of Reactive Oxygen Species in Receptor-Like Kinase Signaling

Kimura, S., Waszczak, C. M., Hunter, K. A. & Wrzaczek, M. A., 3 huhtikuuta 2017, julkaisussa : Plant Cell. 29, 4, s. 638 654 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Extraction and Curation of Gene Models for Plant Receptor Kinases for Phylogenetic Analysis

Vaattovaara, A. F. M., Salojärvi, J. T. & Wrzaczek, M. A., 2017, Plant Receptor Kinases : Methods and Protocols. Aalen, R. (toim.). New York: Springer, s. 79-91 79 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; nro 1621).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKirjan luku tai artikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch

Salojärvi, J., Smolander, O-P., Nieminen, K., Rajaraman, S., Safronov, O., Safdari, P., Lamminmäki, A., Immanen, J., Lan, T., Tanskanen, J., Rastas, P., Amiryousefi, A., Jayaprakash, B., Kammonen, J. I., Hagqvist, R., Eswaran, G., Ahonen, V. H., Serra, J. A., Asiegbu, F. O., Barajas-Lopez, J. D. D. & 65 muuta, Blande, D., Blokhina, O., Blomster, T., Broholm, S., Brosche, M., Cui, F., Dardick, C., Ehonen, S. E., Elomaa, P., Escamez, S., Fagerstedt, K. V., Fujii, H., Gauthier, A., Gollan, P. J., Halimaa, P., Heino, P. I., Himanen, K., Hollender, C., Kangasjarvi, S., Kauppinen, L., Kelleher, C. T., Kontunen-Soppela, S., Koskinen, J. P., Kovalchuk, A., Karenlampi, S. O., Kärkönen, A. K., Lim, K-J., Leppälä, J., Macpherson, L., Mikola, J., Mouhu, K., Mähönen, A. P., Niinemets, U., Oksanen, E., Overmyer, K., Palva, E. T., Pazouki, L., Pennanen, V., Puhakainen, T., Poczai, P., Possen, B. J. H. M., Punkkinen, M., Rahikainen, M. M., Rousi, M., Ruonala, R., van der Schoot, C., Shapiguzov, A., Sierla, M., Sipilä, T. P., Sutela, S., Teeri, T. H., Tervahauta, A. I., Vaattovaara, A., Vahala, J., Vetchinnikova, L., Welling, A., Wrzaczek, M., Xu, E., Paulin, L. G., Schulman, A. H., Lascoux, M., Albert, V. A., Auvinen, P., Helariutta, Y. & Kangasjarvi, J., 8 toukokuuta 2017, julkaisussa : Nature Genetics. 49, 6, s. 904-912 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

High rate of adaptive evolution in two widespread European pines

Grivet, D., Avia, K., Vaattovaara, A., Eckert, A. J., Neale, D. B., Savolainen, O. & Gonzalez-Martinez, S. C., joulukuuta 2017, julkaisussa : Molecular Ecology. 26, 24, s. 6857-6870 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The IDA-LIKE peptides IDL6 and IDL7 are negative modulators of stress responses in Arabidopsis thaliana

Vie, A. K., Najafi, J., Winge, P., Cattan, E., Wrzaczek, M. A., Kangasjärvi, J. S., Miller, G., Brembu, T. & Bones, A. M., 6 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Journal of Experimental Botany. 68, 13, s. 3557-3571 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

MultiSite Gateway-Compatible Cell Type-Specific Gene-Inducible System for Plants

Siligato, R., Wang, X., Yadav, S. R., Lehesranta, S., Ma, G., Ursache, R., Sevilem, I., Zhang, J., Gorte, M., Prasad, K., Wrzaczek, M., Heidstra, R., Murphy, A., Scheres, B. & Mähönen, A. P., helmikuuta 2016, julkaisussa : Plant Physiology. 170, 2, s. 627-641 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Plant PARPs, PARGs and PARP-like Proteins

Vainonen, J. P., Shapiguzov, A., Vaattovaara, A. & Kangasjarvi, J., 2016, julkaisussa : Current Protein and Peptide Science. 17, 7, s. 713-723 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuKatsausartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

Apoplastic ROS production upon pollination by RbohH and RbohJ in Arabidopsis

Kaya, H., Iwano, M., Takeda, S., Kanaoka, M. M., Kimura, S., Abe, M. & Kuchitsu, K., 9 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Plant Signalling & Behavior. 10, 2, 3 Sivumäärä, e989050.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

GRIM REAPER peptide binds to receptor kinase PRK5 to trigger cell death in Arabidopsis

Wrzaczek, M., Vainonen, J. P., Stael, S., Tsiatsiani, L., Help-Rinta-Rahko, H., Gauthier, A., Kaufholdt, D., Bollhöner, B., Lamminmäki, A., Staes, A., Gevaert, K., Tuominen, H., Van Breusegem, F., Helariutta, Y. & Kangasjärvi, J., 2015, julkaisussa : EMBO Journal. 34, 1, s. 55-66 12 Sivumäärä, e201488582.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Integration of photosynthesis, development and stress as an opportunity for plant biology

Allahverdieyeva, Y., Battchikova, N., Brosche, M., Fujii, H., Kangasjärvi, S., Mulo, P., Mähönen, A. P., Nieminen, K. P. M., Overmyer, K. L., Salojärvi, J. T. & Wrzaczek, M. A., 14 heinäkuuta 2015, julkaisussa : New Phytologist. 208, 3, s. 647-655 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Large-scale phenomics identifies primary and fine-tuning roles for CRKs in responses related to oxidative stress

Bourdais, G., Burdiak, P., Gauthier, A. G. B., Nitsch, L., Salojärvi, J. T., Rayapuram, C., Idänheimo, N. J., Hunter, K. A., Kimura, S., Merilo, E., Vaattovaara, A. F. M., Oracz, K., Kaufholdt, D., Pallon, A., Anggoro, D. T., Glow, D., Lowe, J., Zhou, J., Safronov, O., Puukko, T. & 13 muuta, Albert, A., Lang, H., Ernst, D., Kollist, H., Brosche, M. J., Durner, J., Borst, J. W., Collinge, D. B., Karpinski, S., Lyngkjaer, M. F., Robatzek, S., Wrzaczek, M. A. & Kangasjärvi, J. S., 21 heinäkuuta 2015, julkaisussa : PLoS Genetics. 11, 7, 36 Sivumäärä, e1005373.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2014

Specificity in ROS signaling and transcript signatures

Vaahtera, L., Brosche, M., Wrzaczek, M. & Kangasjärvi, J., 2014, julkaisussa : Antioxidants & Redox Signaling. 21, 9, s. 1422-1441 20 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The Arabidopsis thaliana cysteine-rich receptor-like kinases CRK6 and CRK7 protect against apoplastic oxidative stress

Idänheimo, N., Gauthier, A., Salojärvi, J., Siligato, R., Brosche, M., Kollist, H., Mähönen, A. P., Kangasjärvi, J. & Wrzaczek, M., 7 maaliskuuta 2014, julkaisussa : Biochemical and Biophysical Research Communications. 445, 2, s. 457-462 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2013

ROS signaling loops—production, perception, regulation

Wrzaczek, M., Brosche, M. & Kangasjärvi, J., 31 lokakuuta 2013, julkaisussa : Current Opinion in Plant Biology. 16, 5, s. 575-582 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2012

RCD1-DREB2A interaction in leaf senescence and stress responses in Arabidopsis thaliana

Vainonen, J. P., Jaspers, P., Wrzaczek, M., Lamminmäki, A., Reddy, R., Vaahtera, L., Brosche, M. & Kangasjärvi, J., 2012, julkaisussa : Biochemical Journal. 442, s. 573-581 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2011

Reactive Oxygen in Abiotic Stress Perception-From Genes to Proteins

Wrzaczek, M., Vainonen, J., Gauthier, A., Overmyer, K. & Kangasjärvi, J., 2011, Abiotic Stress Response in Plants : Physiological, Biochemical and Genetic Perspectives. Shanker, A. K. & Venkateswarlu, B. (toim.). Croatia: INTECHopen, s. 27-54 28 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKirjan luku tai artikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Tiedosto

Regulatory Subunit B'{gamma} of Protein Phosphatase 2A Prevents Unnecessary Defense Reactions under Low Light in Arabidopsis.

Trotta, A., Wrzaczek, M., Scharte, J., Tikkanen, M., Konert, G., Raahikainen, M., Holmström, M., Hiltunen, H-M., Rips, S., Sipari, N. H., Mulo, P., Weis, E., von Schaewen, A., Aro, E-M. & Kangasjärvi, S., heinäkuuta 2011, julkaisussa : Plant Physiology. 156, 3, s. 1464-1480 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2010

Plant ROS and RNS: making plant science more radical than ever

Wrzaczek, M., Overmyer, K. & Kangasjärvi, J., 2010, julkaisussa : Physiologia Plantarum. 138, 4, s. 357-359 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Stress signaling III: Reactive oxygen species (ROS)

Brosche, M., Overmyer, K., Wrzaczek, M., Kangasjärvi, J. & Kangasjärvi, S., 2010, Abiotic Stress Adaptation in Plants: Physiological, Molecular and Genomic Foundation. Pareek, A., Sopory, S. K., Bohnert, H. J. & Govindjee (toim.). Dordrecht: Springer, s. 91-102 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKirjan luku tai artikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The RST and PARP-like domain containing SRO protein family: Analysis of protein structure, function and conservation in land plants

Jaspers, P., Overmyer, K., Wrzaczek, M., Vainonen, J. P., Blomster, T., Salojarvi, J., Reddy, R. A. & Kangasjärvi, J., 2010, julkaisussa : BMC Genomics. 11, 170, s. - 20 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Tiedosto

Transcriptional regulation of the CRK/DUF26 group of Receptor-like protein kinases by ozone and plant hormones in Arabidopsis

Wrzaczek, M., Brosche, M., Salojärvi, J. T., Kangasjärvi, S., Idänheimo, N., Mersmann, S., Robatzek, S., Karpiński, S., Karpińska, B. & Kangasjärvi, J., 2010, julkaisussa : BMC Plant Biology. 10, 95

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2009

Arabidopsis GRI is involved in the regulation of cell death induced by extracellular ROS

Wrzaczek, M., Brosche, M., Kollist, H. & Kangasjärvi, J., 2009, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 13, s. 5412-5417 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Tiedosto

Reactive Oxygen Species in Ozone Toxicity

Overmyer, K., Wrzaczek, M. & Kangasjärvi, J., 2009, Reactive Oxygen Species in Plant Signaling. Del Rio, L. A. & Puppo, A. (toim.). Dordrecht: Springer, s. 191-208 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKirjan luku tai artikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Scorched earth strategy

Wrzaczek, M., Brosche, M. J. & Kangasjärvi, J., 2009, julkaisussa : Plant Signalling & Behavior. 4, 7, s. 631-633 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2007

A proteasome-regulated glycogen synthase kinase-3 modulates disease response in plants

Wrzaczek, M., Rozhon, W. & Jonak, C., 2007, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 282, 8, s. 5249-5255 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu