Julkaisut

Suodatin
Artikkeli
2020

Genome-wide association meta-analysis of nicotine metabolism and cigarette consumption measures in smokers of European descent

Buchwald, J., Chenoweth, M. J., Palviainen, T., Zhu, G., Benner, C., Gordon, S., Korhonen, T., Ripatti, S., Madden, P. A. F., Lehtimaki, T., Raitakari, O. T., Salomaa, V., Rose, R. J., George, T. P., Lerman, C., Pirinen, M., Martin, N. G., Kaprio, J., Loukola, A. & Tyndale, R. F., 10 maaliskuuta 2020, julkaisussa : Molecular Psychiatry. 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2019

Bayesian meta-analysis across genome-wide association studies of diverse phenotypes

Trochet, H., Pirinen, M., Band, G., Jostins, L., McVean, G. & Spencer, C. C. A., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Genetic Epidemiology. 43, 5, s. 532-547 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Contribution of rare and common variants to intellectual disability in a sub-isolate of Northern Finland

Kurki, M. I., Saarentaus, E. C., Pietiläinen, O., Gormley, P., Lal, D., Kerminen, S., Torniainen-Holm, M., Hämäläinen, E., Rahikkala, E., Keski-Filppula, R., Rauhala, M., Korpi-Heikkila, S., Komulainen-Ebrahim, J., Helander, H., Vieira, P., Männikkö, M., Peltonen, M., Havulinna, A., Salomaa, V., Pirinen, M. & 6 muuta, Suvisaari, J., Moilanen, J. S., Körkkö, J., Kuismin, O., Daly, M. & Palotie, A., 24 tammikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 15 Sivumäärä, 410.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Coronary Artery Disease Risk and Lipidomic Profiles Are Similar in Hyperlipidemias With Family History and Population-Ascertained Hyperlipidemias

Ramo, J. T., Ripatti, P., Tabassum, R., Soderlund, S., Matikainen, N., Gerl, M. J., Klose, C., Surma, M. A., Stitziel, N. O., Havulinna, A. S., Pirinen, M., Salomaa, V., Freimer, N. B., Jauhiainen, M., Palotie, A., Taskinen, M-R., Simons, K. & Ripatti, S., 2 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Heart Association. 8, 13, 38 Sivumäärä, 012415.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Exome sequencing of Finnish isolates enhances rare-variant association power

FinnGen Project, Locke, A. E., Havulinna, A. S., Pirinen, M., Eriksson, J. G., Ala-Korpela, M., Järvelin, M-R., Männikkö, M., Laivuori, H., Palotie, A., Salomaa, V., Laakso, M. & Ripatti, S., 15 elokuuta 2019, julkaisussa : Nature. 572, 7769, s. 323–+ 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genetic architecture of human plasma lipidome and its link to cardiovascular disease

FinnGen Project, Tabassum, R., Rämö, J. T., Ripatti, P., Koskela, J. T., Kurki, M., Karjalainen, J., Palta, P., Hassan, S., Nunez-Fontarnau, J., Kiiskinen, T. T. J., Söderlund, S., Matikainen, N., Laivuori, H., Havulinna, A. S., Pirinen, M., Jalanko, A., Kaprio, J., Donner, K., Kaunisto, M. & 70 muuta, Mars, N., Dada, A., Shcherban, A., Ganna, A., Lehisto, A., Kilpeläinen, E., Brein, G., Awaisa, G., Harju, J., Pärn, K., Parolo, P. D. B., Kajanne, R., Lemmelä, S., Sipilä, T. P., Sipilä, T., Lyhs, U., Llorens, V., Niiranen, T., Kristiansson, K., Jiménez, M. G., Perola, M., Hiekkalinna, T., Mattsson, H., Laiho, P., Soini, S., Lehtonen, A., Pulkki, K., Heikkinen, S., Laukkanen, J., Laaksonen, R., Ritari, J., Partanen, J., Hyvärinen, K., Auro, K., Pitkänen, K., Mäkelä, T., Loukola, A., Joensuu, H., Sinisalo, J., Eklund, K., Aaltonen, L., Färkkilä, M., Carpen, O., Kauppi, P., Tienari, P., Ollila, T., Tuomi, T., Meretoja, T., Pitkäranta, A., Turunen, J., Hannula-Jouppi, K., Pikkarainen, S., Seitsonen, S., Koskinen, M., Palomäki, A., Voutilainen, M., Kettunen, J., Pelkonen, M., Julkunen, V., Lehtonen, H., Parkkinen, J., Linden, K., Jussila, A., Laitinen, T., Palin, K., Jauhiainen, M., Daly, M. J., Palotie, A., Taskinen, M-R. & Ripatti, S., 24 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 14 Sivumäärä, 4329.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Geographic Variation and Bias in the Polygenic Scores of Complex Diseases and Traits in Finland

Kerminen, S., Martin, A. R., Koskela, J., Ruotsalainen, S. E., Havulinna, A. S., Surakka, I., Palotie, A., Perola, M., Salomaa, V., Daly, M. J., Ripatti, S. & Pirinen, M., 6 kesäkuuta 2019, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 104, 6, s. 1169-1181 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Healthcare costs and outcomes in adult patients with juvenile idiopathic arthritis: a population-based study

Mars, N. J., Kerola, A. M., Kauppi, M. J., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 4 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 2, s. 114-120 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Hemap: An Interactive Online Resource for Characterizing Molecular Phenotypes across Hematologic Malignancies

Pölönen, P., Mehtonen, J., Lin, J., Liuksiala, T., Häyrynen, S., Teppo, S., Mäkinen, A., Kumar, A., Malani, D., Pohjolainen, V., Porkka, K., Heckman, C. A., May, P., Hautamäki, V., Granberg, K. J., Lohi, O., Nykter, M. & Heinäniemi, M., 15 toukokuuta 2019, julkaisussa : Cancer Research. 79, 10, s. 2466-2479 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Interrogation of human hematopoiesis at single-cell and single-variant resolution

Ulirsch, J. C., Lareau, C. A., Bao, E. L., Ludwig, L. S., Guo, M. H., Benner, C., Satpathy, A. T., Kartha, V. K., Salem, R. M., Hirschhorn, J. N., Finucane, H. K., Aryee, M. J., Buenrostro, J. D. & Sankaran, V. G., huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Genetics. 51, 4, s. 683-+ 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Metagenomics of the faecal virome indicate a cumulative effect of enterovirus and gluten amount on the risk of coeliac disease autoimmunity in genetically at risk children: the TEDDY study

Lindfors, K., Lin, J., Hyöty, H., Lee, H-S. & Agardh, D., 19 marraskuuta 2019, julkaisussa : Gut. s. 1-7 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Patients with rheumatic diseases share similar patterns of healthcare resource utilization

Mars, NJ., Kerola, AM., Kauppi, MJ., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 4 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 4, s. 300-307 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Variation in neurosurgical management of traumatic brain injury: a survey in 68 centers participating in the CENTER-TBI study

van Essen, T. A., den Boogert, H. F., Cnossen, M. C., CENTER-TBI Investigators Partici, Kaukonen, M., Kivisaari, R., Piippo-Karjalainen, A., Raj, R., Tanskanen, P., Palotie, A., Pirinen, M. & Ripatti, S., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Acta Neurochirurgica. 161, 3, s. 435-449 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Genomic Dissection of Bipolar Disorder and Schizophrenia, Including 28 Subphenotypes

Psychiat Genomics Consortium, Psychiat Genomics Consortium, Psychosis Endophenotypes Inter, Wellcome Trust Case Control, Ruderfer, D. M., Daly, M. J., Eriksson, J., Karjalainen, J., Lonnqvist, J., Meier, S., Neale, B. M., Palotie, A., Paunio, T., Pietilainen, O., Pirinen, M., Rautanen, A. & Suvisaari, J., 14 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Cell. 173, 7, s. 1705–1715.e1–e12 27 Sivumäärä, ARTN 1715.e16.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

GPrank: an R package for detecting dynamic elements from genome-wide time series

Topa, H. & Honkela, A., 4 lokakuuta 2018, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 19, 6 Sivumäärä, 367.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Haplotype Sharing Provides Insights into Fine-Scale Population History and Disease in Finland

Martin, A. R., Karczewski, K. J., Kerminen, S., Kurki, M. I., Sarin, A-P., Artomov, M., Eriksson, J. G., Esko, T., Genovese, G., Havulinna, A. S., Kaprio, J., Konradi, A., Korányi, L., Kostareva, A., Männikkö, M., Metspalu, A., Perola, M., Prasad, R. B., Raitakari, O., Rotar, O. & 7 muuta, Salomaa, V., Groop, L., Palotie, A., Neale, B. M., Ripatti, S., Pirinen, M. & Daly, M. J., 3 toukokuuta 2018, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 102, 5, s. 760-775 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Insights into the genetic epidemiology of Crohn's and rare diseases in the Ashkenazi Jewish population

Int IBD Genetics Consortium, NIDDK IBD Genetics Consortium, T2D-Genes Consortium, Rivas, M. A., Koskela, J., Pirinen, M., Kurki, M., Saavalainen, P., Farkkila, M., Kontula, K., Palotie, A. & Daly, M. J., toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS Genetics. 14, 5, 25 Sivumäärä, 1007329.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Non-operative meningiomas: long-term follow-up of 136 patients

Romani, R., Ryan, G., Benner, C. & Pollock, J., elokuuta 2018, julkaisussa : Acta Neurochirurgica. 160, 8, s. 1547-1553 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Risk of nontyphoidal Salmonella bacteraemia in African children is modified by STAT4

Gilchrist, J. J., Rautanen, A., Fairfax, B. P., Mills, T. C., Naranbhai, V., Trochet, H., Pirinen, M., Muthumbi, E., Mwarumba, S., Njuguna, P., Mturi, N., Msefula, C. L., Gondwe, E. N., MacLennan, J. M., Chapman, S. J., Molyneux, M. E., Knight, J. C., Spencer, C. C. A., Williams, T. N., MacLennan, C. A. & 2 muuta, Scott, J. A. G. & Hill, A. V. S., 9 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 11 Sivumäärä, 1014.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Tumour budding in oral squamous cell carcinoma: a meta-analysis

Almangush, A., Pirinen, M., Heikkinen, I., Mäkitie, A. A., Salo, T. & Leivo, I., 20 helmikuuta 2018, julkaisussa : British Journal of Cancer. 118, 4, s. 577-586 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

biMM: efficient estimation of genetic variances and covariances for cohorts with high-dimensional phenotype measurements

Pirinen, M., Benner, C., Marttinen, P., Jarvelin, M-R., Rivas, M. A. & Ripatti, S., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 15, s. 2405-2407 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fine-Scale Genetic Structure in Finland

Kerminen, S., Havulinna, A. S., Hellenthal, G., Martin, A. R., Sarin, A-P., Perola, M., Palotie, A., Salomaa, V., Daly, M. J., Ripatti, S. & Pirinen, M., lokakuuta 2017, julkaisussa : G3 - Genes genomes genetics. 7, 10, s. 3459-3468 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Prospects of Fine-Mapping Trait-Associated Genomic Regions by Using Summary Statistics from Genome-wide Association Studies

Benner, C., Havulinna, A. S., Järvelin, M-R., Salomaa, V., Ripatti, S. & Pirinen, M., 5 lokakuuta 2017, julkaisussa : American Journal of Human Genetics. 101, 4, s. 539-551 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Variation in monitoring and treatment policies for intracranial hypertension in traumatic brain injury: a survey in 66 neurotrauma centers participating in the CENTER-TBI study

Cnossen, M. C., Huijben, J. A., van der Jagt, M., Volovici, V., van Essen, T., Polinder, S., Nelson, D., Ercole, A., Stocchetti, N., Citerio, G., Peul, W. C., Maas, A. I. R., Menon, D., Steyerberg, E. W., Lingsma, H. F., CENTER-TBI Investigators, Palotie, A., Pirinen, M., Raj, R. & Ripatti, S., 6 syyskuuta 2017, julkaisussa : Critical Care. 21, 12 Sivumäärä, 233.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Whole-genome view of the consequences of a population bottleneck using 2926 genome sequences from Finland and United Kingdom

Chheda, H., Palta, P., Pirinen, M., McCarthy, S., Walter, K., Koskinen, S., Salomaa, V., Daly, M., Durbin, R., Palotie, A., Aittokallio, T., Ripatti, S. & Sequencing Initiative Suomi SISu P, huhtikuuta 2017, julkaisussa : European Journal of Human Genetics. 25, 4, s. 477-484 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
2016

Crowdsourced assessment of common genetic contribution to predicting anti-TNF treatment response in rheumatoid arthritis

Sieberts, S. K., Zhu, F., Garcia-Garcia, J., Stahl, E., Pratap, A., Pandey, G., Pappas, D., Aguilar, D., Anton, B., Bonet, J., Eksi, R., Fornes, O., Guney, E., Li, H., Marin, M. A., Panwar, B., Planas-Iglesias, J., Poglayen, D., Cui, J., Falcao, A. O. & 31 muuta, Suver, C., Hoff, B., Balagurusamy, V. S. K., Dillenberger, D., Neto, E. C., Norman, T., Aittokallio, T., Ammad-ud-din, M., Azencott, C-A., Bellon, V., Boeva, V., Bunte, K., Chheda, H., Cheng, L., Corander, J., Dumontier, M., Goldenberg, A., Gopalacharyulu, P., Hajiloo, M., Hidru, D., Jaiswal, A., Kaski, S., Khalfaoui, B., Khan, S. A., Kramer, E. R., Marttinen, P., Pirinen, M., Saarela, J., Tang, J., Wennerberg, K. & Rheumatoid Arth Challenge, elokuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 9 Sivumäärä, 12460.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

FINEMAP: efficient variable selection using summary data from genome-wide association studies

Benner, C., Spencer, C. C. A., Havulinna, A. S., Salomaa, V., Ripatti, S. & Pirinen, M., 15 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 10, s. 1493-1501 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genetic support for the causal role of insulin in coronary heart disease

Tikkanen, E., Pirinen, M., Sarin, A-P., Havulinna, A. S., Mannisto, S., Saltevo, J., Lokki, M-L., Sinisalo, J., Lundqvist, A., Jula, A., Salomaa, V. & Ripatti, S., 2016, julkaisussa : Diabetologia. 59, 11, s. 2369-2377 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-Wide Meta-Analysis of Sciatica in Finnish Population

Lemmelä, S., Solovieva, S., Shiri, R., Benner, C., Heliovaara, M., Kettunen, J., Anttila, V., Ripatti, S., Perola, M., Seppala, I., Juonala, M., Kahonen, M., Salomaa, V., Viikari, J., Raitakari, O. T., Lehtimaki, T., Palotie, A., Viikari-Juntura, E. & Husgafvel-Pursiainen, K., 20 lokakuuta 2016, julkaisussa : PLoS One. 11, 10, 18 Sivumäärä, 0163877.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide study for circulating metabolites identifies 62 loci and reveals novel systemic effects of LPA

Kettunen, J., Demirkan, A., Wurtz, P., Draisma, H. H. M., Haller, T., Rawal, R., Vaarhorst, A., Kangas, A. J., Lyytikäinen, L-P., Pirinen, M., Pool, R., Sarin, A-P., Soininen, P., Tukiainen, T., Wang, Q., Tiainen, M., Tynkkynen, T., Amin, N., Zeller, T., Beekman, M. & 30 muuta, Deelen, J., van Dijk, K. W., Esko, T., Hottenga, J-J., van Leeuwen, E. M., Lehtimaki, T., Mihailov, E., Rose, R. J., de Craen, A. J. M., Gieger, C., Kahonen, M., Perola, M., Blankenberg, S., Savolainen, M. J., Verhoeven, A., Viikari, J., Willemsen, G., Boomsma, D. I., van Duijn, C. M., Eriksson, J., Jula, A., Jarvelin, M-R., Kaprio, J., Metspalu, A., Raitakari, O., Salomaa, V., Slagboom, P. E., Waldenberger, M., Ripatti, S. & Ala-Korpela, M., maaliskuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 9 Sivumäärä, 11122.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

metaCCA: summary statistics-based multivariate meta-analysis of genome-wide association studies using canonical correlation analysis

Cichonska, A., Rousu, J., Marttinen, P., Kangas, A. J., Soininen, P., Lehtimaki, T., Raitakari, O. T., Jarvelin, M-R., Salomaa, V., Ala-Korpela, M., Ripatti, S. & Pirinen, M., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 13, s. 1981-1989 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Multiple Output Regression with Latent Noise

Gillberg, J., Marttinen, P., Pirinen, M., Kangas, A. J., Soininen, P., Ali, M., Havulinna, A. S., Järvelin, M-R., Ala-Korpela, M. & Kaski, S., 1 tammikuuta 2016, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 17, 1, s. 4170-4204 35 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The Contribution of GWAS Loci in Familial Dyslipidemias

Ripatti, P., Ramo, J. T., Soderlund, S., Surakka, I., Matikainen, N., Pirinen, M., Pajukanta, P., Sarin, A-P., Service, S. K., Laurila, P-P., Ehnholm, C., Salomaa, V., Wilson, R. K., Palotie, A., Freimer, N. B., Taskinen, M-R. & Ripatti, S., toukokuuta 2016, julkaisussa : PLoS Genetics. 12, 5, 14 Sivumäärä, 1006078.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2015
Open access
Tiedosto

Genetic Variants on Chromosome 1p13.3 Are Associated with Non-ST Elevation Myocardial Infarction and the Expression of DRAM2 in the Finnish Population

Salo, P. P., Vaara, S., Kettunen, J., Pirinen, M., Sarin, A-P., Huikuri, H., Karhunen, P. J., Eskola, M., Nikus, K., Lokki, M-L., Ripatti, S., Havulinna, A. S., Salomaa, V., Palotie, A., Nieminen, M. S., Sinisalo, J. & Perola, M., 28 lokakuuta 2015, julkaisussa : PLoS One. 10, 10, 16 Sivumäärä, 0140576.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-Wide Analysis of Evolutionary Markers of Human Influenza A(H1N1)pdm09 and A(H3N2) Viruses May Guide Selection of Vaccine Strain Candidates

Belanov, S. S., Bychkov, D., Benner, C., Ripatti, S., Ojala, T., Kankainen, M., Lee, H. K., Tang, J. W-T. & Kainov, D. E., joulukuuta 2015, julkaisussa : Genome Biology and Evolution. 7, 12, s. 3472-3483 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto