Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tieteenalat
- 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
Distributed hybrid-indexing of compressed pan-genomes for scalable and fast sequence alignment
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Mäkinen, V. & Heljanko, K., 3 elok. 2021, julkaisussa: PLoS One. 16, 8, 19 Sivumäärä, 0255260.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Scalable computational methods for high-throughput sequencing data analytics in population genomics
Maarala, A. I., 17 jouluk. 2021Tutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
Open access -
Scalable Reference Genome Assembly from Compressed Pan-Genome Index with Spark
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Heljanko, K. & Mäkinen, V., 18 syysk. 2020, Big Data -- BigData 2020. Nepal, S., Cao, W., Nasridinov, A., Bhuiyan, M. Z. A., Guo, X. & Zhang, L.-J. (toim.). Cham: Springer International Publishing, s. 68-84 17 Sivumäärä ( Lecture Notes in Computer Science ; Vuosikerta 12402).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
SparkBeagle: Scalable Genotype Imputation from Distributed Whole-Genome Reference Panels in the Cloud
Maarala, A. I., Pärn, K., Nunez Fontarnau, J. & Heljanko, K., syysk. 2020, BCB '20: Proceedings of the 11th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Health Informatics. ACM , 8 Sivumäärä 97Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
ViraPipe: scalable parallel pipeline for viral metagenome analysis from next generation sequencing reads
Maarala, A. I., Bzhalava, Z., Dillner, J., Heljanko, K. & Bzhalava, D., 15 maalisk. 2018, julkaisussa: Bioinformatics. 34, 6, s. 928-935 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access
Projektit
- 2 Aktiivinen
-
Syöpähoitojen yksilöiminen ja hoitotuloksen ennustaminen nestebiopsian avulla
Hautaniemi, S. (Projektinjohtaja), Maarala, A. I. (osallistuja) & Nguyen, M. (osallistuja)
01/01/2025 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: : Suunnattu akatemiahanke
-
iCAN - Digitaalisen yksilöllistetyn syöpälääketieteen lippulaiva
Mäkelä, T. (Projektinjohtaja), Adhikari, S. (osallistuja), Aldahdooh, J. M. F. (osallistuja), Ariotta, V. (osallistuja), Arjama, M. A. (osallistuja), Atarsaikhan, G. (osallistuja), Bao, J. (osallistuja), Barreiro, K. (osallistuja), Bhalke, M. S. (osallistuja), Bollepalli, S. (osallistuja), Brandt, J. A. J. (osallistuja), Chernenko, A. (osallistuja), Dashi, G. (osallistuja), Eloranta, K. (osallistuja), Eriksson, M. R. (osallistuja), Feodoroff, M. J. (osallistuja), Fey, E. (osallistuja), Gerber, L. J. (osallistuja), Grönholm, M. (osallistuja), Hannula, S. A. (osallistuja), Heistman, V. (osallistuja), Henriksson, M. E. J. (osallistuja), Hiitola, E. T. J. (osallistuja), Huttunen, A. T. (osallistuja), Hyyppä, S. P. P. (osallistuja), Högel-Starck, C. S. P. (osallistuja), Ianevski, A. (osallistuja), Ikonen, N. (osallistuja), Jansouz, S. (osallistuja), Jha, S. (osallistuja), Junquera Mencía, A. (osallistuja), Kalashnikov, I. (osallistuja), Kampanellou, E. (osallistuja), Karabayev, D. (osallistuja), Karhemo, P.-R. (osallistuja), Karling, T. S. (osallistuja), Kekkonen, J. (osallistuja), Kolikova, Y. (osallistuja), Krami Senhaji, O. (osallistuja), Kuisma-van der Linden, M. S. (osallistuja), Kumari, R. (osallistuja), Kuosmanen, A. (osallistuja), Kurki, V. (osallistuja), Kuusela, S. (osallistuja), Kücükel, H. (osallistuja), Langohr, L. (osallistuja), Lavikka, K. A. (osallistuja), Le Joncour, V. (osallistuja), Lehto, T.-P. (osallistuja), Leivonen, S.-K. (osallistuja), Liljeström, M. (osallistuja), Lindfors, I. S. (osallistuja), Lindgren, H. (osallistuja), Luck, T. J. (osallistuja), Lähdeniemi, I. A. K. (osallistuja), Maarala, A. I. (osallistuja), Maljanen, K. J. (osallistuja), Marchi, G. (osallistuja), Martikainen, E. M. (osallistuja), Meriranta, L. (osallistuja), Metsäranta, N. A. C. (osallistuja), Miihkinen, M. S. (osallistuja), Moradi, N. (osallistuja), Nader, K. M. (osallistuja), Nagaraj, A. (osallistuja), Nguyen, M. (osallistuja), Niemeyer, F. (osallistuja), Niemiec, I. (osallistuja), Nylén, M. M. (osallistuja), Palin, K. (osallistuja), Palva, A. (osallistuja), Parsons, A. O. (osallistuja), Perez Villatoro, F. R. (osallistuja), Pietiäinen, V. (osallistuja), Pirinen, I. E. (osallistuja), Pirttikoski, A. A. (osallistuja), Pitko, I. M. (osallistuja), Polianskyte-Prause, Z. (osallistuja), Puhka, M. (osallistuja), Quintero, I. B. (osallistuja), Rachidi, S. E. (osallistuja), Rajalaakso, M. T. (osallistuja), Rodosthenous, R. (osallistuja), Saad, J. (osallistuja), Sanjaya, P. (osallistuja), Seppälä, T. T. (osallistuja), Seref Vujaklija, C. (osallistuja), Shah, S. (osallistuja), Sorri, S. P. (osallistuja), Suni, V. (osallistuja), Suutala, A. (osallistuja), Suvela, M. (osallistuja), Udayani, J. E. (osallistuja), Verkasalo, H. M. (osallistuja), Viiri, L. E. (osallistuja), Vilkkavaara Cancocak, Y. (osallistuja), Vähärautio, A. (osallistuja), Vänttinen, I. M. (osallistuja), Västrik, I. (osallistuja), Väänänen, J. (osallistuja), Wang, W. (osallistuja) & Zhang, X. (osallistuja)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Suomen Akatemia
01/09/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Lippulaivaohjelma