!!Research output per year
!!Research output per year
Henkilökohtainen profiili
Tieteenalat
- 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
Multi-modal data integration reveals functionally credible predictive biomarkers in ovarian cancer
Muranen, T. A., Hainari, A. M. R., Afenteva, D., Senkowski, W., Oikkonen-Köngäs, J. M., Dréo, J., Driva, K., Holmström, S. K., Isoviita, V.-M., Lahtinen, A., Lavikka, K. A., Li, Y., Lovino, M., Maarala, A. I., Marchi, G., Miccolis, F., Micoli, G., Najm, M., Ostwaldt, A.-C. U. & Rodríguez-Mier, P. & 10 muuta, , 3 heinäk. 2026, (Hyväksytty/In press) julkaisussa: Genome medicine.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Jellyfish: integrative visualization of spatio-temporal tumor evolution and clonal dynamics
Lavikka, K., Maarala, A. I., Oikkonen, J. & Hautaniemi, S., 11 maalisk. 2025, julkaisussa: Bioinformatics. 41, 3, 4 Sivumäärä, btaf091.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Distributed hybrid-indexing of compressed pan-genomes for scalable and fast sequence alignment
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Mäkinen, V. & Heljanko, K., 3 elok. 2021, julkaisussa: PLoS One. 16, 8, 19 Sivumäärä, 0255260.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Scalable computational methods for high-throughput sequencing data analytics in population genomics
Maarala, A. I., 17 jouluk. 2021Tutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
Open access -
Scalable Reference Genome Assembly from Compressed Pan-Genome Index with Spark
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Heljanko, K. & Mäkinen, V., 18 syysk. 2020, Big Data -- BigData 2020. Nepal, S., Cao, W., Nasridinov, A., Bhuiyan, M. Z. A., Guo, X. & Zhang, L.-J. (toim.). Cham: Springer International Publishing, s. 68-84 17 Sivumäärä ( Lecture Notes in Computer Science ; Vuosikerta 12402).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Projektit
- 4 Aktiivinen
-
Transskriptiotekijöiden säätely munasarjasyövän yksilöllisen hoidon kohteena
Hautaniemi, S. (Projektinjohtaja), Afenteva, D. (osallistuja), Maarala, A. I. (osallistuja), Micoli, G. (osallistuja) & Oikkonen, J. (osallistuja)
01/03/2025 → 29/02/2028
Projekti: Suomen Akatemia: Kansainvälinen yhteisrahoitteinen ohjelma
-
Syöpähoitojen yksilöiminen ja hoitotuloksen ennustaminen nestebiopsian avulla
Hautaniemi, S. (Projektinjohtaja), Maarala, A. I. (osallistuja), Muranen, T. A. (osallistuja), Nguyen, M. (osallistuja) & Pirttikoski, A. A. (osallistuja)
01/01/2025 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: : Suunnattu akatemiahanke
-
MULTISTANC: Kemoterapiaresistenssin voittaminen laskennallisilla menetelmillä ja monimuotoisella aineistolla
Hautaniemi, S. (Projektinjohtaja), Lehtonen, J. O. (osallistuja), Maarala, A. I. (osallistuja) & Pirttikoski, A. A. (osallistuja)
Suomen Akatemia Talous/Paula Pesola
01/01/2025 → 31/12/2027
Projekti: Suomen Akatemia: : Suunnattu akatemiahanke
-
iCAN - Digitaalisen yksilöllistetyn syöpälääketieteen lippulaiva
Mäkelä, T. (Projektinjohtaja), Adhikari, S. (osallistuja), Aldahdooh, J. M. F. (osallistuja), Ariotta, V. (osallistuja), Arjama, M. A. (osallistuja), Atarsaikhan, G. (osallistuja), Bao, J. (osallistuja), Barreiro, K. (osallistuja), Bhalke, M. S. (osallistuja), Bollepalli, S. (osallistuja), Brandt, J. A. J. (osallistuja), Chernenko, A. (osallistuja), Dashi, G. (osallistuja), Eloranta, K. (osallistuja), Eriksson, M. R. (osallistuja), Feodoroff, M. J. (osallistuja), Fey, E. (osallistuja), Gerber, L. J. (osallistuja), Grönholm, M. (osallistuja), Hannula, S. A. (osallistuja), Heistman, V. (osallistuja), Henriksson, M. E. J. (osallistuja), Hiitola, E. T. J. (osallistuja), Huttunen, A. T. (osallistuja), Hyyppä, S. P. P. (osallistuja), Högel-Starck, C. S. P. (osallistuja), Ianevski, A. (osallistuja), Ikonen, N. (osallistuja), Jansouz, S. (osallistuja), Jha, S. (osallistuja), Junquera Mencía, A. (osallistuja), Kalashnikov, I. (osallistuja), Kampanellou, E. (osallistuja), Karabayev, D. (osallistuja), Karhemo, P.-R. (osallistuja), Karling, T. S. (osallistuja), Kekkonen, J. (osallistuja), Kolikova, Y. (osallistuja), Krami Senhaji, O. (osallistuja), Kuijjer, M. (osallistuja), Kuisma-van der Linden, M. S. (osallistuja), Kumari, R. (osallistuja), Kuosmanen, A. (osallistuja), Kurki, V. (osallistuja), Kuusela, S. (osallistuja), Kücükel, H. (osallistuja), Langohr, L. (osallistuja), Lavikka, K. A. (osallistuja), Le Joncour, V. (osallistuja), Lehto, T.-P. (osallistuja), Leivonen, S.-K. (osallistuja), Liljeström, M. (osallistuja), Lindfors, I. S. (osallistuja), Lindgren, H. (osallistuja), Luck, T. J. (osallistuja), Lähdeniemi, I. A. K. (osallistuja), Maarala, A. I. (osallistuja), Maljanen, K. J. (osallistuja), Marchi, G. (osallistuja), Martikainen, E. M. (osallistuja), Meriranta, L. (osallistuja), Metsäranta, N. A. C. (osallistuja), Miihkinen, M. S. (osallistuja), Moradi, N. (osallistuja), Nader, K. M. (osallistuja), Nagaraj, A. (osallistuja), Nguyen, M. (osallistuja), Niemeyer, F. (osallistuja), Niemiec, I. (osallistuja), Nylén, M. M. (osallistuja), Palin, K. (osallistuja), Palva, A. (osallistuja), Parsons, A. O. (osallistuja), Peltonen, J. H. H. (osallistuja), Perez Villatoro, F. R. (osallistuja), Pietiäinen, V. (osallistuja), Pirinen, I. E. (osallistuja), Pirttikoski, A. A. (osallistuja), Pitko, I. M. (osallistuja), Polianskyte-Prause, Z. (osallistuja), Puhka, M. (osallistuja), Quintero, I. B. (osallistuja), Rachidi, S. E. (osallistuja), Rajalaakso, M. T. (osallistuja), Rodosthenous, R. (osallistuja), Saad, J. (osallistuja), Sanjaya, P. (osallistuja), Seppälä, T. T. (osallistuja), Seref Vujaklija, C. (osallistuja), Shah, S. (osallistuja), Sorri, S. P. (osallistuja), Suni, V. (osallistuja), Suutala, A. (osallistuja), Suvela, M. (osallistuja), Sysivirta, L. K. M. (osallistuja), Udayani, J. E. (osallistuja), Verkasalo, H. M. (osallistuja), Viiri, L. E. (osallistuja), Vilkkavaara Cancocak, Y. (osallistuja), Vähärautio, A. (osallistuja), Vänttinen, I. M. (osallistuja), Västrik, I. (osallistuja), Väänänen, J. (osallistuja), Wang, W. (osallistuja) & Zhang, X. (osallistuja)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Suomen Akatemia
01/09/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Lippulaivaohjelma