Andreas Scherer

Julkaisut

Tutkimustuotoksia vuodessa 1995 2009 2014 2017 2021 2023

• 52 Artikkeli
• 8 Kirjan luku tai artikkeli

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2023

  Glomerular proteomic profiling of kidney biopsies with hypertensive nephropathy reveals a signature of disease progression

  Mikkelsen, H., Vikse, B. E., Eikrem, O., Scherer, A., Finne, K., Osman, T. & Marti, H-P., 2023, julkaisussa: Hypertension Research. 46, s. 144–156 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2022

  A multiomics disease progression signature of low‑risk ccRCC

  Strauss, P., Rivedal, M., Scherer, A., Eikrem, O., Nakken, S., Beisland, C., Bostad, L., Flatberg, A., Skandalou, E., Beisvag, V., Furriol, J. & Marti, H-P., 5 elok. 2022, julkaisussa: Scientific Reports. 12, 1, 15 Sivumäärä, 13503.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Assessing reproducibility of inherited variants detected with short-read whole genome sequencing

  Pan, B., Ren, L., Onuchic, V., Guan, M., Kusko, R., Bruinsma, S., Trigg, L., Scherer, A., Ning, B., Zhang, C., Glidewell-Kenney, C., Xiao, C., Donaldson, E., Sedlazeck, F. J., Schroth, G., Yavas, G., Grunenwald, H., Chen, H., Meinholz, H., Meehan, J., & 35 muutaWang, J., Yang, J., Foox, J., Shang, J., Miclaus, K., Dong, L., Shi, L., Mohiyuddin, M., Pirooznia, M., Gong, P., Golshani, R., Wolfinger, R., Lababidi, S., Sahraeian, S. M. E., Sherry, S., Han, T., Chen, T., Shi, T., Hou, W., Ge, W., Zou, W., Guo, W., Bao, W., Xiao, W., Fan, X., Gondo, Y., Yu, Y., Zhao, Y., Su, Z., Liu, Z., Tong, W., Xiao, W., Zook, J. M., Zheng, Y. & Hong, H., 3 tammik. 2022, julkaisussa: Genome Biology. 23, 1, 26 Sivumäärä, 2.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Tackling the translational challenges of multi-omics research in the realm of European personalised medicine: A workshop report

  Oldoni, E., Saunders, G., Bietrix, F., Garcia Bermejo, M. L., Niehues, A., 't Hoen, P. A. C., Nordlund, J., Hajduch, M., Scherer, A., Kivinen, K., Pitkänen, E., Mäkelä, T. P., Gut, I., Scollen, S., Kozera, L., Esteller, M., Shi, L., Ussi, A., Andreu, A. L. & van Gool, A. J., 13 lokak. 2022, julkaisussa: Frontiers in Molecular Biosciences. 9, 11 Sivumäärä, 974799.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2021

  AGAP2-AS1 as a prognostic biomarker in low-risk clear cell renal cell carcinoma patients with progressing disease

  Nakken, S., Eikrem, O., Marti, H-P., Beisland, C., Bostad, L., Scherer, A., Flatberg, A., Beisvag, V., Skandalou, E., Furriol, J. & Strauss, P., 20 jouluk. 2021, julkaisussa: Cancer Cell International. 21, 1, 12 Sivumäärä, 690.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• A verified genomic reference sample for assessing performance of cancer panels detecting small variants of low allele frequency

  Jones, W., Gong, BS., Novoradovskaya, N., Li, D., Kusko, R., Richmond, TA., Johann, DJ., Bisgin, H., Sahraeian, SME., Bushel, PR., Pirooznia, M., Wilkins, K., Chierici, M., Bao, WJ., Basehore, LS., Lucas, AB., Burgess, D., Butler, DJ., Cawley, S., Chang, CJ., & 54 muutaChen, GC., Chen, T., Chen, YC., Craig, DJ., Del Pozo, A., Foox, J., Francescatto, M., Fu, YT., Furlanello, C., Giorda, K., Grist, KP., Guan, MJ., Hao, YY., Happe, S., Hariani, G., Haseley, N., Jasper, J., Jurman, G., Kreil, DP., Labaj, P., Lai, K., Li, JY., Li, QZ., Li, YL., Li, ZG., Liu, ZC., Lopez, MS., Miclaus, K., Miller, R., Mittal, VK., Mohiyuddin, M., Pabon-Pena, C., Parsons, BL., Qiu, FJ., Scherer, A., Shi, TL., Stiegelmeyer, S., Suo, C., Tom, N., Wang, D., Wen, ZN., Wu, LH., Xiao, WZ., Xu, C., Yu, Y., Zhang, JY., Zhang, YF., Zhang, ZH., Zheng, YT., Mason, CE., Willey, JC., Tong, WD., Shi, LM. & Xu, J., 16 huhtik. 2021, julkaisussa: Genome Biology. 22, 1, 38 Sivumäärä, 111.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Cross-oncopanel study reveals high sensitivity and accuracy with overall analytical performance depending on genomic regions

  Gong, BS., Li, D., Kusko, R., Novoradovskaya, N., Zhang, YF., Wang, SZ., Pabon-Pena, C., Zhang, ZH., Lai, K., Cai, WS., LoCoco, JS., Lader, E., Richmond, TA., Mittal, VK., Liu, LC., Johann, DJ., Willey, JC., Bushel, PR., Yu, Y., Xu, C., & 130 muutaChen, GC., Burgess, D., Cawley, S., Giorda, K., Haseley, N., Qiu, FJ., Wilkins, K., Arib, H., Attwooll, C., Babson, K., Bao, LL., Bao, WJ., Lucas, AB., Best, H., Bhandari, A., Bisgin, H., Blackburn, J., Blomquist, TM., Boardman, L., Burgher, B., Butler, DJ., Chang, CJ., Chaubey, A., Chen, T., Chierici, M., Chin, CR., Close, D., Conroy, J., Coleman, JC., Craig, DJ., Crawford, E., del Pozo, A., Deveson, IW., Duncan, D., Eterovic, AK., Fan, XH., Foox, J., Furlanello, C., Ghosal, A., Glenn, S., Guan, MJ., Haag, C., Hang, XY., Happe, S., Hennigan, B., Hipp, J., Hong, HX., Horvath, K., Hu, JH., Hung, LY., Jarosz, M., Kerkhof, J., Kipp, B., Kreil, DP., Lapunzina, P., Li, P., Li, QZ., Li, WH., Li, ZG., Liang, Y., Liu, SQ., Liu, ZC., Ma, C., Marella, N., Martin-Arenas, R., Megherbi, DB., Meng, QC., Mieczkowski, PA., Morrison, T., Muzny, D., Ning, BT., Parsons, BL., Paweletz, CP., Pirooznia, M., Qu, WB., Raymond, A., Rindler, P., Ringler, R., Sadikovic, B., Scherer, A., Schulze, E., Sebra, R., Shaknovich, R., Shi, Q., Shi, TL., Silla-Castro, JC., Smith, M., Lopez, MS., Song, P., Stetson, D., Strahl, M., Stuart, A., Supplee, J., Szankasi, P., Tan, HW., Tang, LY., Tao, YH., Thakkar, S., Thierry-Mieg, D., Thierry-Mieg, J., Thodima, VJ., Thomas, D., Tichy, B., Tom, N., Garcia, EV., Verma, S., Walker, K., Wang, C., Wang, JW., Wang, YX., Wen, ZN., Wirta, V., Wu, LH., Xiao, CL., Xiao, WZ., Xu, SB., Yang, M., Ying, JM., Yip, SH., Zhang, GL., Zhang, S., Zhao, MR., Zheng, YT., Zhou, XY., Mason, CE., Mercer, T., Tong, WD., Shi, LM., Jones, W. & Xu, JS., 16 huhtik. 2021, julkaisussa: Genome Biology. 22, 1, 23 Sivumäärä, 109.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Establishing community reference samples, data and call sets for benchmarking cancer mutation detection using whole-genome sequencing

  SEQC (US-FDA guided consortium), Fang, L. T., Zhu, B. & Scherer, A., syysk. 2021, julkaisussa: Nature Biotechnology. 39, 9, s. 1151-1160 27 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Evaluating the analytical validity of circulating tumor DNA sequencing assays for precision oncology

  SEQC2 Oncopanel Sequencing Working, Deveson, I. W., Gong, B. & Lai, K., syysk. 2021, julkaisussa: Nature Biotechnology. 39, 9, s. 1115-1128 19 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• FC 019 PROTEOMIC PROFILING OF GLOMERULI FROM KIDNEYS WITH HYPERTENSIVE NEPHROPATHY REVEALS SIGNATURE OF DISEASE PROGRESSION

  Mikkelsen, H., Vikse, B. E., Scherer, A., Finne, K. & Marti, H-P., 1 toukok. 2021, julkaisussa: Nephrology Dialysis Transplantation. 36, Supplement_1, 2 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Reporting guidelines for human microbiome research: the STORMS checklist

  Genomic Stand Consortium, Massive Anal Quality Control Soc, Mirzayi, C., Renson, A., Zohra, F. & Scherer, A., marrask. 2021, julkaisussa: Nature Medicine. 27, 11, s. 1885-1892 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• The SEQC2 epigenomics quality control (EpiQC) study

  SEQC (Sequencing Quality Consortium), Foox, J., Nordlund, J., Lalancette, C. & Scherer, A., 6 jouluk. 2021, julkaisussa: Genome Biology. 22, 1, 30 Sivumäärä, 332.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Toward best practice in cancer mutation detection with whole-genome and whole-exome sequencing

  Xiao, W., Ren, L., Chen, Z., Fang, L. T., Zhao, Y., Lack, J., Guan, M., Zhu, B., Jaeger, E., Kerrigan, L., Blomquist, T. M., Hung, T., Sultan, M., Idler, K., Lu, C., Scherer, A., Kusko, R., Moos, M., Xiao, C., Sherry, S. T., & 70 muutaAbaan, O. D., Chen, W., Chen, X., Nordlund, J., Liljedahl, U., Maestro, R., Polano, M., Drabek, J., Vojta, P., Koks, S., Reimann, E., Madala, B. S., Mercer, T., Miller, C., Jacob, H., Truong, T., Moshrefi, A., Natarajan, A., Granat, A., Schroth, G. P., Kalamegham, R., Peters, E., Petitjean, V., Walton, A., Shen, T-W., Talsania, K., Vera, C. J., Langenbach, K., de Mars, M., Hipp, J. A., Willey, J. C., Wang, J., Shetty, J., Kriga, Y., Raziuddin, A., Tran, B., Zheng, Y., Yu, Y., Cam, M., Jailwala, P., Cu Nguyen, Meerzaman, D., Chen, Q., Yan, C., Ernest, B., Mehra, U., Jensen, R., Jones, W., Li, J-L., Papas, B. N., Pirooznia, M., Chen, Y-C., Seifuddin, F., Li, Z., Liu, X., Resch, W., Wang, J., Wu, L., Yavas, G., Miles, C., Ning, B., Tong, W., Mason, C. E., Donaldson, E., Lababidi, S., Staudt, L. M., Tezak, Z., Hong, H., Wang, C. & Shi, L., syysk. 2021, julkaisussa: Nature Biotechnology. 39, 9, s. 1141-+ 27 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Whole genome and exome sequencing reference datasets from a multi-center and cross-platform benchmark study

  Zhao, Y., Fang, L. T., Shen, T. W., Choudhari, S., Talsania, K., Chen, X., Shetty, J., Kriga, Y., Tran, B., Zhu, B., Chen, Z., Chen, W., Wang, C., Jaeger, E., Meerzaman, D., Lu, C., Idler, K., Ren, L., Zheng, Y., Shi, L., & 18 muutaPetitjean, V., Sultan, M., Hung, T., Peters, E., Drabek, J., Vojta, P., Maestro, R., Gasparotto, D., Kõks, S., Reimann, E., Scherer, A., Nordlund, J., Liljedahl, U., Foox, J., Mason, C. E., Xiao, C., Hong, H. & Xiao, W., 9 marrask. 2021, julkaisussa: Scientific data . 8, 1, 14 Sivumäärä, 296.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2020

  Biomarker Research and Development for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): European Medical Research Infrastructures Call for Global Coordination

  Oldoni, E., van Gool, A., Garcia Bermejo, L. M., Scherer, A., Mayrhofer, M. T., Florindi, F., Demotes, J., Kubiak, C., Fauvel, A-C., Bietrix, F., Ussi, A. & Andreu, A. L., toukok. 2020, julkaisussa: Clinical Infectious Diseases. 72, 10, s. 1838-1842 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Exploration of databases and methods supporting drug repurposing: a comprehensive survey

  Rehman, Z. U., Seemab, U., Scherer, A., Wennerberg, K., Tang, J. & Vähä-Koskela, M., 14 helmik. 2020, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 22, 2, s. 1656-1678 23 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2019

  AXL targeting reduces fibrosis development in experimental unilateral ureteral obstruction

  Landolt, L., Furriol, J., Babickova, J., Ahmed, L., Eikrem, O., Skogstrand, T., Scherer, A., Suliman, S., Leh, S., Lorens, J. B., Gausdal, G., Marti, H. P. & Osman, T., toukok. 2019, julkaisussa: Physiological Reports. 7, 10, s. e14091 20 Sivumäärä, 14091.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Transcriptome-proteome integration of archival human renal cell carcinoma biopsies enables identification of molecular mechanisms

  Koch, E., Finne, K., Eikrem, O., Landolt, L., Beisland, C., Leh, S., Delaleu, N., Granly, M., Vikse, B. E., Osman, T., Scherer, A. & Marti, H-P., toukok. 2019, julkaisussa: American Journal of Physiology. Renal Physiology. 316, 5, s. F1053-F1067 15 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2018

  Expanding the Utilization of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Archives: Feasibility of miR-Seq for Disease Exploration and Biomarker Development from Biopsies with Clear Cell Renal Cell Carcinoma

  Strauss, P., Marti, H-P., Beisland, C., Scherer, A., Vegard, L., Leh, S., Flatberg, A., Koch, E., Beisvag, V., Landolt, L., Skogstrand, T. & Eikrem, O. S., maalisk. 2018, julkaisussa: International Journal of Molecular Sciences. 19, 3, 18 Sivumäärä, 803.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2017

  Bridging the translational innovation gap through good biomarker practice

  van Gool, A. J., Bietrix, F., Caldenhoven, E., Zatloukal, K., Scherer, A., Litton, J-E., Meijer, G., Blomberg, N., Smith, A., Mons, B., Heringa, J., Koot, W-J., Smit, M., Hajduch, M., Rijnders, T. & Ussi, A., 28 huhtik. 2017, julkaisussa: Nature reviews. Drug discovery. 16, 9, s. 587-588 2 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Clear Cell Renal Cell Carcinoma is linked to Epithelial‐to‐Mesenchymal Transition and to Fibrosis

  Landolt, L., Eikrem, O., Strauss, P., Scherer, A., Lovett, D. H., Finne, K., Osman, T., Ibrahim, M., Gausdal, G., Ahmed, L., Lorens, J., Thiery, J. P., Tan, T. Z., Sekulic, M., Marti, H-P. & Beisland, C., 8 kesäk. 2017, julkaisussa: Physiological Reports. 5, 11, e13305.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Matched preclinical designs for improved translatability

  Aittokallio, T., Scherer, A., Poutanen, M. & Freedman, L. P., 10 toukok. 2017, julkaisussa: Science translational medicine. 9, 389, 2 Sivumäärä, 4101.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Renal carcinoma/kidney progenitor cell chimera organoid as a novel tumourigenesis gene discovery model

  Xu, Q., Scherer, A., Junttila, S., Giri, K. R., Kivelä, O., Skovorodkin, I., Röning, J., Quaggin, S. E., Marti, H-P., Shan, J., Samoylenko, A. & Vainio, S. J., 26 lokak. 2017, julkaisussa: Disease Models & Mechanisms. 10, 12, s. 1503-1515 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Reproducibility in biomarker research and clinical development: a global challenge

  Scherer, A., huhtik. 2017, julkaisussa: Biomarkers in Medicine. 11, 4, s. 309-312 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Tiedosto
• 2016

  Development and confirmation of potential gene classifiers of human clear cell renal cell carcinoma using next-generation RNA sequencing

  Eikrem, O. S., Strauss, P., Beisland, C., Scherer, A., Landolt, L., Flatberg, A., Leh, S., Beisvag, V., Skogstrand, T., Hjelle, K., Shresta, A. & Marti, H-P., 2016, julkaisussa: Scandinavian Journal of Urology. 50, 6, s. 452-462 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Proteomic Analysis of Minimally Damaged Renal Tubular Tissue from Two-Kidney-One-Clip Hypertensive Rats Demonstrates Extensive Changes Compared to Tissue from Controls

  Finne, K., Marti, H-P., Leh, S., Skogstrand, T., Vethe, H., Tenstad, O., Berven, F. S., Scherer, A. & Vikse, B. E., 2016, julkaisussa: Nephron Journals. 132, 1, s. 70-80 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Renal Fibrosis mRNA Classifier: Validation in Experimental Lithium-Induced Interstitial Fibrosis in the Rat Kidney

  Marti, H-P., Jeffs, A., Scherer, A., Leader, J., Leader, C., Bedford, J. & Walker, R., 2016, julkaisussa: PLoS One. 11, 12, 19 Sivumäärä, 0168240.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Transcriptome Sequencing (RNAseq) Enables Utilization of Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Biopsies with Clear Cell Renal Cell Carcinoma for Exploration of Disease Biology and Biomarker Development

  Eikrem, O., Beisland, C., Hjelle, K., Flatberg, A., Scherer, A., Landolt, L., Skogstrand, T., Leh, S., Beisvag, V. & Marti, H-P., 2016, julkaisussa: PLoS One. 11, 2, 19 Sivumäärä, 0149743.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2015

  Distinct protein signature of hypertension-induced damage in the renal proteome of the two-kidney, one-clip rat model

  Vethe, H., Finne, K., Skogstrand, T., Vaudel, M., Vikse, B. E., Hultström, M., Placier, S., Scherer, A., Tenstad, O. & Marti, H-P., 2015, julkaisussa: Journal of Hypertension. 33, 1, s. 126-135 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2014

  A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, reproducibility and information content by the Sequencing Quality Control Consortium

  SEQC (US-FDA guided consortium) & Scherer, A., 2014, julkaisussa: Nature Biotechnology. 32, 9, s. 903-914

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Gene expression profiling of immunomagnetically separated cells directly from stabilized whole blood for multicenter clinical trials.

  Letzkus, M., Luesink, E., Starck-Schwartz, S., Bigaud, M., Mirza, F., Hartmann, N., Gerstmayer, B., Janssen, U., Scherer, A., Schumacher, M. M., Verles, A., Vitaliti, A., Nirmala, N., Johnson, K. J. & Staedtler, F., 13 marrask. 2014, julkaisussa: Clinical and translational medicine. 3, 13 Sivumäärä, 36.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Tiedosto

• Metzincins and related genes in experimental renal ageing: towards a unifying fibrosis classifier across species

  Marti, H-P., Fuscoe, J. C., Kwekel, J. C., Anagnastopoulou, A. & Scherer, A., kesäk. 2014, julkaisussa: Nephrology, Dialysis, Transplantation. 29, 6, s. 1177-1185 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• The concordance between RNA-seq and microarray data depends on chemical treatment and transcript abundance

  MAQC (US FDA-guided consortum) & Scherer, A., 2014, julkaisussa: Nature Biotechnology. 32, 9, s. 926-932

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• The use of haplotype-specific transcripts improves sample annotation consistency

  Hartmann, N., Luesink, E., Khokhlovich, E., Szustakowski, J. D., Baeriswyl, L., Peterson, J., Scherer, A., Nanguneri, N. R. & Staedtler, F., 30 syysk. 2014, julkaisussa: Biomarker Research. 2, 9 Sivumäärä, 17.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2013

  Alteration of Human Blood Cell Transcriptome in Uremia

  Scherer, A., Gunther, O., Balshaw, R., Hollander, Z., Wilson McManus, J., Ng, R., McMaster, R., McManus, B. & Keown, P., 2013, julkaisussa: BMC Medical Genomics. 6, 1, s. 23 12 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Clinical and ethical considerations of massively parallel sequencing in transplantation science

  Scherer, A., 24 jouluk. 2013, julkaisussa: World Journal of Transplantation. 3, 4, s. 62-67 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Tiedosto

• Robust and tissue independent gender-specific transcript biomarkers

  Staedtler, F., Hartmann, N., Scherer, A., Letzkus, M., Bongiovanni, S., Marc, P., Johnson, K. & Schumacher, M., 2013, julkaisussa: Biomarkers. 18, 5, s. 436-445

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2012

  Gene expression is differently affected by pimecrolimus and betamethasone in lesional skin of atopic dermatitis.

  Jensen, J. M., Scherer, A., Wanke, C., Bräutigam, M., Bongiovanni, S., Letzkus, M., Staedtler, F., Kehren, J., Zuehlsdorf, M., Schwarz, T., Weichenthal, M., Fölster-Holst, R. & Proksch, E., 2012, julkaisussa: Allergy : European journal of allergy and clinical immunology. 67, 3, s. 413-423 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2011

  A Subset of Metzincins and Related Genes Constitutes a Marker of Human Solid Organ Fibrosis

  Rödder, S., Scherer, A., Körner, M. & Marti, H-P., 2011, julkaisussa: Virchows Archiv. 458, 4, s. 487-496 20 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Differential suppression of epidermal antimicrobial protein expression in atopic dermatitis and in EFAD mice by pimecrolimus compared to corticosteroids

  Jensen, J-M., Ahrens, K., Meingassner, J., Scherer, A., Bräutigam, M., Stuetz, A., Schwarz, T., Fölster-Holst, R., Harder, J., Gläser, R. & Proksch, E., 2011, julkaisussa: Experimental Dermatology. 20, 10, s. 783-788 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2010

  A Comparison of Batch Effect Removal Methods for Enhancement of Cross-Batch Prediction Performance Using MAQC-II Microarray Gene Expression Data

  Luo, J., Schumacher, M. M., Scherer, A., Sanoudou, D., Megherbi, D., Davison, T., Shi, T., Tong, W., Shi, L., Hong, H., Zhao, C., Elloumi, F., Shi, W., Thomas, R., Lin, S., Tillinghast, G., Liu, G., Zhou, Y., Herman, D., Li, Y., & 5 muutaDeng, Y., Fang, H., Bushel, P., Woods, M. & Zhang, J., 2010, julkaisussa: Pharmacogenomics Journal. 10, 4, s. 247-257 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• The MAQC-II study of common practices for the development and validation of microarray-based predictive models

  MAQC (US FDA-guided consortum) & Scherer, A., 2010, julkaisussa: Nature Biotechnology. 28, s. 827-838

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2009

  Functional Genomic Analysis of Peripheral Blood During Early Acute Renal Allograft Rejection

  Gunther, O., Balshaw, R., Scherer, A., Hollander, Z., Mui, A., Triche, T., Freue, G., Li, G., Ng, R., Wilson McManus, J., McMaster, R., McManus, B. & Keown, P., 2009, julkaisussa: Transplantation. 88, 7, s. 942-951

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Meta-Analyses Qualify Metzincins and Related Genes as Acute Rejection Markers in Renal Transplant Patients

  Rödder, S., Scherer, A., Körner, M., Eisenberger, U., Hertig, A., Raulf, F., Rondeau, E. & Marti, H-P., 2009, julkaisussa: American Journal of Transplantation. 10, 2, s. 288-297

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Renal Allografts with Interstitial Fibrosis/Tubular Atrophy (IF/TA) display Distinctive Expression Profiles of Metzincins and Related Genes

  Rödder, S., Scherer, A., Raulf, F., Hertig, A., Marti, H-P., Berthier, C. C., Couzi, L., Durrbach, A. & Rondeau, E., 2009, julkaisussa: American Journal of Transplantation. 9, s. 517-526

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Transcriptome Changes in Renal Allograft Protocol Biopsies at Three Months Precede the Onset of Interstitial Fibrosis/Tubular Atrophy (IF/TA) at Six Months

  Scherer, A., Gwinner, W., Mengel, M., Kirsch, T., Raulf, F., Szustakowski, J. D., Hartmann, N., Staedtler, F., Engel, G., Klupp, J., Korn, A., Kehren, J. & Haller, H., 2009, julkaisussa: Nephrology, Dialysis, Transplantation. 24, s. 2567-2575

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2007

  MDQC: a new quality assessment method for microarrays based on quality control reports

  Cohen Freue, G., Hollander, Z., Shen, E., Zamar, R. H., Balshaw, R., Scherer, A., McManus, B., Keown, P., McMaster, R. & Ng, R., 2007, julkaisussa: Bioinformatics. 23, s. 3162-3169

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2005

  An Accelerated In-vivo Drug Discovery Approach to Rapidly Predict the Biologic, Druglike Activity of Compounds, Proteins or Genes

  Papoian, R., Scherer, A., Saulnier, M., Staedtler, F., Cordier, A., Legay, F., Maurer, G., Staeheli, J., Vonderscher, J. & Chibout, S-D., 2005, julkaisussa: Pharmaceutical Research. 22, 10, s. 1597-1613

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access
• 2003

  Early Prognosis of the Development of Renal Chronic Allograft Rejection by Gene Expression Profiling of Human Protocol Biopsies

  Scherer, A., Krause, A., Walker, J. R., Korn, A., Niese, D. & Raulf, F., 2003, julkaisussa: Transplantation. 75, 8, s. 1323-1330

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Optimized Protocol for Linear RNA Amplification and Application to Expression Profiling of Human Renal Biopsies

  Scherer, A., Krause, A., Walker, J. R., Sutton, S. E., Seron, D., Raulf, F. & Cooke, M. P., 2003, julkaisussa: BioTechniques. 34, s. 546-556

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu