ScType enables fast and accurate cell type identification from spatial transcriptomics data

Nader, K., Tasci, M., Ianevski, A., Erickson, A., Verschuren, E. W., Aittokallio, T. & Miihkinen, M., 1 heinäk. 2024, julkaisussa: Bioinformatics. 40, 7, 4 Sivumäärä, btae426.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer

Kiviaho, A., Eerola, S. K., Kallio, H. M. L., Andersen, M. K., Hoikka, M., Tiihonen, A. M., Salonen, I., Spotbeen, X., Giesen, A., Parker, C. T. A., Taavitsainen, S., Hantula, O., Marttinen, M., Hermelo, I., Ismail, M., Midtbust, E., Wess, M., Devlies, W., Sharma, A. & Krossa, S. & 27 muuta, Häkkinen, T., Afyounian, E., Vandereyken, K., Kint, S., Kesseli, J., Tolonen, T., Tammela, T. L. J., Viset, T., Størkersen, Ø., Giskeødegård, G. F., Rye, M. B., Murtola, T., Erickson, A., Latonen, L., Bova, G. S., Mills, I. G., Joniau, S., Swinnen, J. V., Voet, T., Mirtti, T., Attard, G., Claessens, F., Visakorpi, T., Rautajoki, K. J., Tessem, M. B., Urbanucci, A. & Nykter, M., 16 marrask. 2024, julkaisussa: Nature Communications. 15, 1, 16 Sivumäärä, 9949.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

PP2A methylesterase PME-1 suppresses anoikis and is associated with therapy relapse of PTEN-deficient prostate cancers

Aakula, A., Isomursu, A., Rupp, C., Erickson, A., Gupta, N., Kauko, O., Shah, P., Padzik, A., Pokharel, Y. R., Kaur, A., Li, S.-P., Trotman, L., Taimen, P., Rannikko, A., Lammerding, J., Paatero, I., Mirtti, T., Ivaska, J. & Westermarck, J., kesäk. 2023, julkaisussa: Molecular oncology. 17, 6, s. 1007-1023 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Prognostic impact of kallikrein-related peptidase transcript levels in prostate cancer

Lehto, T.-P. K., Kovanen, R.-M., Lintula, S., Malén, A. M. X., Stürenberg, C., Erickson, A., Pulkka, O.-P., Stenman, U. H., Diamandis, E. P., Rannikko, A., Mirtti, T. & Koistinen, H., 15 elok. 2023, julkaisussa: International Journal of Cancer. 153, 4, s. 867-881 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Prognostic impact of prostate cancer grade inflation in targeted biopsies

Batouche, A. O., Czeizler, E., Lehto, T.-P., Erickson, A., Shadbahr, T., Mirtti, T., Pohjonen, J. S. & Rannikko, A. S., helmik. 2023, julkaisussa: European Urology. 83, s. S1371-S1372 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiesitelmän abstrakti › vertaisarvioitu