Community-led, integrated, reproducible multi-omics with anvi'o

Eren, A. M., Kiefl, E., Shaiber, A., Veseli, I., Miller, S. E., Schechter, M. S., Fink, I., Pan, J. N., Yousef, M., Fogarty, E. C., Trigodet, F., Watson, A. R., Esen, O. C., Moore, R. M., Clayssen, Q., Lee, M. D., Kivenson, V., Graham, E. D., Merrill, B. D., Karkman, A. & 14 muuta, Blankenberg, D., Eppley, J. M., Sjodin, A., Scott, J. J., Vazquez-Campos, X., McKay, L. J., McDaniel, E. A., Stevens, S. L. R., Anderson, R. E., Fuessel, J., Fernandez-Guerra, A., Maignien, L., Delmont, T. O. & Willis, A. D., tammikuuta 2021, julkaisussa: Nature Microbiology. 6, s. 3-6 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Pääkirjoitus › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Contrasting microbiotas between Finnish and Estonian infants: exposure to Acinetobacter may contribute to the allergy gap

Ruokolainen, L., Parkkola, A., Karkman, A., Sinkko, H., Peet, A., Hämäläinen, A-M., von Hertzen, L., Tillmann, V., Koski, K., Virtanen, S. M., Niemelä, O., Haahtela, T. & Knip, M., syyskuuta 2020, julkaisussa: Allergy : European journal of allergy and clinical immunology. 75, 9, s. 2342-2351 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Immune-microbiota interaction in Finnish and Russian Karelia young people with high and low allergy prevalence

Ruokolainen, L., Fyhrquist, N., Laatikainen, T., Auvinen, P., Fortino, V., Scala, G., Jousilahti, P., Karisola, P., Vendelin, J., Karkman, A., Markelova, O., Mäkelä, M. J., Lehtimäki, S., Ndika, J., Ottman, N., Paalanen, L., Paulin, L., Vartiainen, E., von Hertzen, L., Greco, D. & 2 muuta, Haahtela, T. & Alenius, H., lokakuuta 2020, julkaisussa: Clinical and Experimental Allergy. 50, 10, s. 1148-1158 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Long-term application of Swedish sewage sludge on farmland does not cause clear changes in the soil bacterial resistome

Rutgersson, C., Ebmeyer, S., Lassen, S. B., Karkman, A., Fick, J., Kristiansson, E., Brandt, K. K., Flach, C-F. & Larsson, D. G. J., huhtikuuta 2020, julkaisussa: Environment International. 137, 12 Sivumäärä, 105339.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Predicting clinical resistance prevalence using sewage metagenomic data

Karkman, A., Berglund, F., Flach, C-F., Kristiansson, E. & Larsson, D. G. J., marraskuuta 2020, julkaisussa: Communications Biology. 3, 10 Sivumäärä, 711.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu