• PL 56 (Viikinkaari 5)

    00014

    Suomi

20012020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Ansioluettelo

My background is in biology and I did my M.Sc. thesis on population genetics. During my Ph.D. I moved to computational analysis and continued on sequence analysis and methods development during my stay at the EMBL-European Bioinformatics Institute.

My research interests are in evolutionary sequence analysis, both the development of advanced analysis methods and their application to biological questions of special importance. Current topics include phylogenetic sequence alignment and homology inference for evolutionary analyses, and the development of methods for comparative analysis of high-throughput sequencing data. Many of these methods are provided for the users through the Wasabi graphical interface available at http://wasabiapp.org.

Koulutustiedot

Ph.D. in Molecular Biology, Université libre de Bruxelles, Belgium (2003)
M.Sc. in Biology, University of Oulu, Finland (1999)

Asemat yliopiston ulkopuolella

staff member, post-doctoral researcher, EMBL-European Bioinformatics Institute

15 elokuuta 200331 heinäkuuta 2011

Tieteenalat

  • 1181 Ekologia, evoluutiobiologia
  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia
  • 1184 Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut

  • 31 Artikkeli
  • 2 Kirjan luku tai artikkeli

An inducible genome editing system for plants

Wang, X., Ye, L., Lyu, M., Ursache, R., Löytynoja, A. & Mähönen, A. P., 29 kesäkuuta 2020, julkaisussa : Nature plants. 6, s. 766–772 24 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A High-Quality Assembly of the Nine-Spined Stickleback (Pungitius pungitius) Genome

Varadharajan, S., Rastas, P., Löytynoja, A., Matschiner, M., Calboli, F. C. F., Guo, B., Nederbragt, A. J., Jakobsen, K. S. & Merilä, J., marraskuuta 2019, julkaisussa : Genome Biology and Evolution. 11, 11, s. 3291-3308 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Effects of marker type and filtering criteria on QST-FST comparisons

Li, Z., Löytynoja, A., Fraimout, A. & Merilä, J., marraskuuta 2019, julkaisussa : Royal Society Open Science. 6, 11

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Mechanistic insights into the evolution of DUF26-containing proteins in land plants

Vaattovaara, A., Brandt, B., Rajaraman, S., Safronov, O., Veidenberg, A., Luklová, M., Kangasjärvi, J., Löytynoja, A., Hothorn, M., Salojärvi, J. & Wrzaczek, M., 8 helmikuuta 2019, julkaisussa : Communications Biology. 2, 18 Sivumäärä, 56.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Bracketing phenogenotypic limits of mammalian hybridization

Savriama, Y., Valtonen, M., Kammonen, J. I., Rastas, P., Smolander, O-P., Lyyski, A., Häkkinen, T. J., Corfe, I. J., Gerber, S., Salazar-Ciudad, I., Paulin, L., Holm, L., Löytynoja, A., Auvinen, P. & Jernvall, J., 28 marraskuuta 2018, julkaisussa : Royal Society Open Science. 5, 11, 12 Sivumäärä, 180903.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Aktiviteetit

  • 9 Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen
  • 7 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
  • 3 Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
  • 2 Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)

PhD examining committee member

Ari Löytynoja (Ohjaaja)

9 marraskuuta 2018

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen

Supervision of MSc thesis

Ari Löytynoja (Ohjaaja)

5 lokakuuta 201815 huhtikuuta 2019

Aktiviteetti: TutkimustyypitMuun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)

PhD follow-up group member

Ari Löytynoja (Ohjaaja)

1 tammikuuta 201731 joulukuuta 2020

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen

Co-supervisor of Mikko Kivikoski's doctoral thesis

Ari Löytynoja (Ohjaaja)

joulukuuta 2017 → …

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja

Co-supervisor of Xueyun Feng's doctoral thesis

Ari Löytynoja (Ohjaaja)

tammikuuta 2017 → …

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja