Arto Orpana

Julkaisut

Tutkimustuotoksia vuodessa 1995 1995 1996 1997 1999 2000 2001 2002 2003 2024

• 53 Artikkeli
• 6 Konferenssiartikkeli
• 2 Katsausartikkeli
• 1 Konferenssiesitelmän abstrakti
• 1 Muut aineistot
  • 1 Kommentti

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2024

  Moni potilas hyötyisi farmakogeneettisestä testauksesta

  Litonius, K., Kulla, N., Falkenbach, P., Kristiansson, K., Tarkiainen, E. K., Ukkola-Vuoti, L., Cajanus, K., Korhonen, M., Khan, S., Sistonen, J., Orpana, A., Lindstedt, M., Nyrönen, T., Perola, M., Turpeinen, M., Kytö, V., Tornio, A. & Niemi, M., 2024, julkaisussa: Duodecim. 140, 21, 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Kommentti › Ammatillinen

• Solanidine is a sensitive and specific dietary biomarker for CYP2D6 activity

  Kiiski, J. I., Neuvonen, M., Kurkela, M., Hirvensalo, P., Hämäläinen, K., Tarkiainen, E. K., Sistonen, J., Korhonen, M., Khan, S., Orpana, A., Filppula, A. M., Lehtonen, M. & Niemi, M., 1 helmik. 2024, julkaisussa: Human Genomics. 18, 1, 16 Sivumäärä, 11.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Value of Pharmacogenetic Testing Assessed with Real-World Drug Utilization and Genotype Data

  Litonius, K., Kulla, N., Falkenbach, P., Kristiansson, K., Tarkiainen, E. K., Ukkola-Vuoti, L., Cajanus, K., Korhonen, M., Khan, S., Sistonen, J., Orpana, A., Lindstedt, M., Nyrönen, T., Perola, M., Turpeinen, M., Kytö, V., Tornio, A. & Niemi, M., 2024, julkaisussa: Clinical Pharmacology and Therapeutics. 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2020

  Evaluation of the expression levels of BRAFV600E mRNA in primary tumors of thyroid cancer using an ultrasensitive mutation assay

  Tran, T. V., Dang, K. X., Pham, Q. H., Nguyen, U. D., Trinh, N. T. T., Hoang, L. V., Ho, S. A., Nguyen, B. V., Nguyen, D. T., Trinh, D. T., Tran, D. N., Orpana, A., Stenman, U.-H., Stenman, J. & Ho, T. H., 1 toukok. 2020, julkaisussa: BMC Cancer. 20, 1, 9 Sivumäärä, 368.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2019

  Warfarin dose requirement in patients having severe thrombosis or thrombophilia

  Helin, T. A., Joutsi-Korhonen, L., Asmundela, H., Niemi, M., Orpana, A. & Lassila, R., elok. 2019, julkaisussa: British Journal of Clinical Pharmacology. 85, 8, s. 1684-1691 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2018

  No Tissue Expression of KRAS or BRAF Mutations in 61 Adult Patients Treated for Esophageal Atresia in Early Childhood

  Dang, K. X., Ho, T., Sistonen, S., Koivusalo, A., Pakarinen, M., Rintala, R., Stenman, U.-H., Orpana, A. & Stenman, J., lokak. 2018, julkaisussa: European Journal of Pediatric Surgery. 28, 5, s. 413-419 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2017

  EGFR gene copy number predicts response to anti-EGFR treatment in RAS wild type and RAS/BRAF/PIK3CA wild type metastatic colorectal cancer

  Algars, A., Sundstrom, J., Lintunen, M., Jokilehto, T., Kytölä, S., Kaare, M., Vainionpää, R., Orpana, A., Österlund, P., Ristimäki, A., Carpen, O. & Ristamäki, R., 2017, julkaisussa: International Journal of Cancer. 140, 4, s. 922-929 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2015

  Prospective immunohistochemical analysis of BRAF V600E mutation in melanoma

  Thiel, A., Moza, M., Kytola, S., Orpana, A., Jahkola, T., Hernberg, M., Virolainen, S. & Ristimaki, A., helmik. 2015, julkaisussa: Human Pathology. 46, 2, s. 169-175 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2014

  Automation of diagnostic genetic testing: Mutation detection by cyclic minisequencing

  Alagrund, K. & Orpana, A. K., 2014, julkaisussa: Scandinavian Journal of Clinical & Laboratory Investigation. 74, 1, s. 44-52 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2013

  BRAF mutation in sporadic colorectal cancer and Lynch syndrome

  Thiel, A., Heinonen, M. M., Kantonen, J., Gylling, A., Lahtinen, L., Korhonen, M., Kytola, S., Mecklin, J.-P., Orpana, A., Peltomäki, P. T. & Ristimäki, A., marrask. 2013, julkaisussa: Virchows Archiv. 463, 5, s. 613-621 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Novel Heat Pulse Extension-PCR-Based Method for Detection of Large CTG-Repeat Expansions in Myotonic Dystrophy Type 1

  Orpana, A. K., Ho, T. H., Alagrund, K., Ridanpaa, M., Aittomäki, K. & Stenman, J., tammik. 2013, julkaisussa: Journal of Molecular Diagnostics. 15, 1, s. 110-115 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2012

  Multiple heat pulses during PCR extension enables amplification of GC-rich sequences and reduces amplification bias.

  Orpana, A. K., Ho, T. H. & Stenman, J., 2012, julkaisussa: Analytical Chemistry. 84, 4, s. 2081-2087 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Technique for strand-specific gene-expression analysis and monitoring of primer-independent cDNA synthesis in reverse transcription

  Feng, L., Lintula, S., Ho, T. H., Anastasina, M., Paju, A., Haglund, C., Stenman, U. H., Hotakainen, K., Orpana, A., Kainov, D. & Stenman, J., 2012, julkaisussa: BioTechniques. 52, 4, s. 263-270 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2011

  High serum angiogenin at diagnosis predicts for failure on long-term treatment response and for poor overall survival in non-Hodgkin lymphoma

  Fang, S., Repo, H., Joensuu, H., Orpana, A. & Salven, P., 2011, julkaisussa: European Journal of Cancer. 47, 11, s. 1708-1716 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2010

  Use of Cancer-Specific Genomic Rearrangements to Quantify Disease Burden in Plasma from Patients with Solid Tumors

  McBride, D. J., Orpana, A., Sotiriou, C., Joensuu, H., Stephens, P. J., Mudie, L. J., Hämäläinen, E., Stebbings, L. A., Andersson, L. C., Flanagan, A. M., Durbecq, V., Ignatiadis, M., Kallioniemi, O., Heckman, C. A., Alitalo, K., Edgren, S. H. T., Futreal, P. A., Stratton, M. R. & Campbell, P. J., 2010, julkaisussa: Genes, Chromosomes & Cancer. 49, 11, s. 1062-1069 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2008

  Haemostatic gene polymorphism in severe acute pancreatitis

  Kemppainen, E., Tukiainen, E., Kylanpaa, M.-L., Repo, H., Orpana, A., Methuen, T., Salaspuro, M., Haapiainen, R. & Puolakkainen, P., 2008, julkaisussa: Pancreas. 36, s. 223-224 2 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 2006

  Genome-controlled reverse transcriptase-polymerase chain reaction for targeted gene-expression analysis

  Stenman, J., Rasanen, J., Tenkanen, T., Haglund, C., Salo, J., Orpana, A. & Paju, A., 2006, julkaisussa: Scandinavian Journal of Clinical & Laboratory Investigation. 66, 7, s. 597-606 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2005

  Transcriptional downregulation of the lactase (LCT) gene during childhood

  Rasinpera, H., Kuokkanen, M., Kolho, K. L., Lindahl, H., Enattah, N. S., Savilahti, E., Orpana, A. & Jarvela, I., 2005, julkaisussa: Gut. 54, 11, s. 1658-1666

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen
• 2004

  Novel splice site CACNA1A mutation causing episodic ataxia type 2

  Kaunisto, M. A., Harno, H., Kallela, M., Somer, H., Sallinen, R., Hämäläinen, E., Miettinen, P. J., Vesa, J., Orpana, A., Palotie, A., Färkkilä, M. & Wessman, M., 2004, julkaisussa: Neurogenetics. 5, s. 69-73 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2003

  Bronchoalveolar lavage findings from persons exposed to moulds in water-damaged houses

  Mussalo-Rauhamaa, H., Suomalainen, H., Helin, T., Elg, P. & Orpana, A., 2003, julkaisussa: Indoor and Built Environment. 12, s. 235-237 3 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Geenitestit - miksi, kenelle, miten ja missä?

  Orpana, A. & Järvelä, I., 2003, julkaisussa: Suomen lääkärilehti. 58, s. 4707-4709

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu

• Quantitative detection of low-copy-number mRNAs differing at single nucleotide positions

  Stenman, J., Lintula, S., Rissanen, O., Finne, P., Hedstrom, J., Palotie, A. & Orpana, A., 2003, julkaisussa: BioTechniques. 34, s. 172-+ 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Serum levels of mast cell tryptase, vascular endothelial growth factor and basic fibroblast growth factor in patients with acute pancreatitis

  Mentula, P., Kylanpaa, M. L., Kemppainen, E., Eklund, K. K., Orpana, A., Puolakkainen, P., Haapiainen, R. & Repo, H., 2003, julkaisussa: Pancreas. 27, s. E29-E33 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Transcriptional regulation of the lactase-phlorizin hydrolase gene by polymorphisms associated with adult-type hypolactasia

  Kuokkanen, M., Enattah, N. S., Oksanen, A., Savilahti, E., Orpana, A. & Jarvela, I., 2003, julkaisussa: Gut. 52, s. 647-652 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 2002

  Angiogenic and lymphangiogenic molecules in hematological malignancies

  Orpana, A. & Salven, P., 2002, julkaisussa: Leukemia & lymphoma. 43, s. 219-224 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu

• A prospective study of inflammation markers in patients at risk of indirect acute lung injury

  Takala, A., Jousela, I., Takkunen, O., Kautiainen, H., Jansson, S. E., Orpana, A., Karonen, S. L. & Repo, H., 2002, julkaisussa: Shock (Philadelphia). 17, s. 252-257 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• CD14 and TNF alpha promoter polymorphisms in patients with acute arthritis - Special reference to development of chronic spondyloarthropathy

  Repo, H., Anttonen, K., Kilpinen, S. K., Palotie, A., Salven, P., Orpana, A. & Leirisalo-Repo, M., 2002, julkaisussa: Scandinavian Journal of Rheumatology. 31, s. 355-361 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Four novel mutations in the OFD1 (Cxorf5) gene in Finnish patients with oral-facial-digital syndrome 1

  Rakkolainen, A., Ala-Mello, S., Kristo, P., Orpana, A. & Järvelä, I., huhtik. 2002, julkaisussa: Journal of Medical Genetics. 39, 4, s. 292-296 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Four novel mutations in the OFD1 (Cxorf5) gene in the Finnish patients with oral-facial-digital syndrome 1

  Ala-Mello, S., Rakkolainen, A., Kristo, P., Orpana, A. & Jarvela, I., toukok. 2002, julkaisussa: European Journal of Human Genetics. 10, s. 232-232 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiesitelmän abstrakti › vertaisarvioitu

• Raltitrexed treatment promotes systemic inflammatory reaction in patients with colorectal carcinoma

  Osterlund, P., Orpana, A., Elomaa, I., Repo, H. & Joensuu, H., 2002, julkaisussa: British Journal of Cancer. 87, s. 591-599 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Transcriptional regulation of the lactase-phlorizin hydrolase (LPH) gene by polymorphisms associated with adult-type hypolactasia.

  Kuokkanen, M., Enattah, N. S., Oksanen, A., Savilahti, E., Orpana, A. & Jarvela, I., 2002, julkaisussa: Gut. 52, s. 647-652

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 2001

  Accuracy in amplification

  Stenman, J. & Orpana, A., 2001, julkaisussa: Nature Biotechnology. 19, s. 1011-1012 2 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• CD14 and TNF alpha promoter polymorphisms in genetic susceptibility to development of chronic arthritis.

  Repo, H., Anttonen, K., Orpana, A., Hamalainen, F., Wessman, M., Palotie, A. & Leinsalo-Repo, M., 2001, julkaisussa: Arthritis & Rheumatism. 44, s. S238-S238 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Endotoxins induce and interferon alpha suppresses vascular endothelial growth factor (VEGF) production in human peripheral blood mononuclear cells

  Salven, P., Anttonen, K., Repo, H., Joensuu, H. & Orpana, A., 2001, julkaisussa: FASEB Journal. 15, s. 1318-1320 3 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Procalcitonin, soluble interleukin-2 receptor, and soluble E-selectin in predicting the severity of acute pancreatitis

  Kylanpaa-Back, M. L., Takala, A., Kemppainen, E. A., Puolakkainen, P. A., Leppaniemi, A. K., Karonen, S. L., Orpana, A., Haapiainen, R. K. & Repo, H., 2001, julkaisussa: Critical Care Medicine. 29, s. 63-69 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Promoter polymorphism of the CD14 endotoxin receptor gene as a risk factor for alcoholic liver disease

  Jarvelainen, H. A., Orpana, A., Perola, M., Savolainen, V. T., Karhunen, P. J. & Lindros, K. O., 2001, julkaisussa: Hepatology. 33, s. 1148-1153 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Relative levels of SCCA2 and SCCA1 mRNA in primary tumors predicts recurrent disease in squamous cell cancer of the head and neck

  Stenman, J., Hedstrom, J., Grenman, R., Leivo, I., Finne, P., Palotie, A. & Orpana, A., 2001, julkaisussa: International Journal of Cancer Research. 95, s. 39-43 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• SNP-TRAP, a simplified method for detecting SNPs.

  Orpana, A., Pajukanta, P., Palotie, A. & Peltonen, L., 2001, julkaisussa: American Journal of Human Genetics. 69, s. 516-516 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 2000

  Exclusion of CACNA1A and KCNN1 as candidate genes for migraine in three 19p13-linked Finnish families.

  Kaunisto, M., Hamalainen, E., Kallela, M., Harno, H., Marttila, P., Hovatta, I., Orpana, A., Peltonen, L., Farkkila, M., Palotie, A. & Wessman, M., 2000, julkaisussa: American Journal of Human Genetics. 67, s. 329-329 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Plasma IL-8 concentration may predict the outcome of In-111 granulocyte scintigraphy

  Kairemo, K. J. A., Karonen, S. L., Repo, H., Stromberg, S. & Orpana, A., 2000, julkaisussa: European Journal of Nuclear Medicine. 27, s. S83-S83 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Simultaneous elevation in the serum concentrations of the angiogenic growth factors VEGF and bFGF is an independent predictor of poor prognosis in non-Hodgkin lymphoma: a single-institution study of 200 patients

  Salven, P., Orpana, A., Teerenhovi, L. & Joensuu, H., 2000, julkaisussa: Blood. 96, s. 3712-3718 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Systemic inflammation in hemorrhagic fever with renal syndrome correlates with hypotension and thrombocytopenia but not with renal injury

  Takala, A., Lahdevirta, J., Jansson, S. E., Vapalahti, O., Orpana, A., Karonen, S. L. & Repo, H., 2000, julkaisussa: Journal of Infectious Diseases. 181, s. 1964-1970 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Transhepatic neutrophil and monocyte activation during clinical liver transplantation

  Pesonen, E. J., Hockerstedt, K., Makisalo, H., Vuorte, J., Jansson, S. E., Orpana, A., Karonen, S. L. & Repo, H., 2000, julkaisussa: Transplantation. 69, s. 1458-1464 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 1999

  Accurate determination of relative messenger RNA levels by RT-PCR

  Stenman, J., Finne, P., Stahls, A., Grenman, R., Stenman, U. H., Palotie, A. & Orpana, A., 1999, julkaisussa: Nature Biotechnology. 17, s. 720-722 3 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Genetic studies on Finnish families with familial hemiplegic migraine.

  Kaunisto, M., Kallela, M., Marttila, P., Farkkila, M., Havanka, H., Hamalainen, E., Hovatta, I., Orpana, A., Peltonen, L., Palotie, A. & Wessman, M., 1999, julkaisussa: American Journal of Human Genetics. 65, s. A257-A257 1 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Human vascular endothelial cells produce tumor necrosis factor-alpha in response to proinflammatory cytokine stimulation

  Ranta, V., Orpana, A., Carpen, O., Turpeinen, U., Ylikorkala, O. & Viinikka, L., 1999, julkaisussa: Critical Care Medicine. 27, 10, s. 2184-2187 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Leukocytes and platelets of patients with cancer contain high levels of vascular endothelial growth factor

  Salven, P., Orpana, A. & Joensuu, H., 1999, julkaisussa: Clinical Cancer Research. 5, s. 487-491 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Markers of systemic inflammation predicting organ failure in community-acquired septic shock

  Takala, A., Jousela, I., Jansson, J.-E., Olkkola, K. T., Takkunen, O., Orpana, A., Karonen, S.-L. & Repo, H., 1999, julkaisussa: Clinical Science. 97, s. 529-538 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Vascular endothelial growth factor is bound in amniotic fluid and maternal serum

  Vuorela-Vepsalainen, P., Alfthan, H., Orpana, A., Alitalo, K., Stenman, U. H. & Halmesmaki, E., 1999, julkaisussa: Human Reproduction. 14, 5, s. 1346-1351 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• 1998

  Peripheral blood platelets express VEGF-C and VEGF which are released during platelet activation

  Wartiovaara, U., Salven, P., Mikkola, H., Lassila, R., Kaukonen, J., Joukov, V., Orpana, A., Ristimaki, A., Heikinheimo, M., Joensuu, H., Alitalo, K. & Palotie, A., 1998, julkaisussa: Journal of thrombosis and haemostasis. 80, s. 171-175 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu