Esa Pitkänen

Näytä Scopus-profiili

Puhelin+358503254823, +358294125823
Sähköpostiesa.pitkanenhelsinkifi

PL 20 (Tukholmankatu 8)
00014
Suomi

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tieteenalat

113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
1184 Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia

53 Artikkeli
10 Konferenssiartikkeli
1 Kirja
1 Kirjan luku tai artikkeli
Muut aineistot

A Unified Review of Deep Learning for Automated Medical Coding
Ji, S., Li, X., Sun, W., Dong, H., Taalas, A., Zhang, Y., Wu, H., Pitkänen, E. & Marttinen, P., jouluk. 2024, julkaisussa: ACM Computing Surveys. 56, 12, 41 Sivumäärä, 306.
Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu

Open access
Novel loci and biomedical consequences of iron homoeostasis variation
DBDS Genomic Consortium, FinnGen Consortium, Allara, E., Bell, S., Wang, F., Palotie, A., Daly, M., Mäkelä, T. P., Kaprio, J., Perola, M., Partanen, J., Raivio, T., Ripatti, S., Carpén, O., Raivio, M., Tienari, P., Partanen, J., Färkkilä, M., Koskela, J. & Pikkarainen, S. & 86 muuta, Eklund, K., Mars, N., Kauppi, P., Vaura, F., Gordin, D., Sinisalo, J., Taskinen, M.-R., Tuomi, T., Hiltunen, T., Reeve, M. P., Ruotsalainen, S., Meretoja, T., Joensuu, H., Mattson, J., Salminen, E., Karihtala, P., Pitkänen, E., Turunen, J. A., Ollila, T., Karjalainen, J., Hannula-Jouppi, K., Pussinen, P., Salminen, A., Salo, T., Rice, D., Nieminen, P., Palotie, U., Laivuori, H., Kurra, V., Heikinheimo, O., Kalliala, I., Aaltonen, L., Djousse, L., Cho, K., Inouye, M., Burgess, S., Benyamin, B., Oexle, K., Swinkels, D. W., Stefansson, K., Magnusson, M., Ganna, A., Gaziano, M., Ivey, K., Danesh, J., Pereira, A., Wood, A. M., Butterworth, A. S., Di Angelantonio, E., Kivinen, K., Tukiainen, T., Ollila, H., Saarentaus, E., Åberg, F., Kurki, M., Havulinna, A., Mehtonen, J., Palta, P., Hassan, S., Della Briotta Parolo, P., Lemmelä, S., Liu, A., Lehisto, A., Llorens, V., Heyne, H., Rämö, J., Rodosthenous, R., Strausz, S., Lee, J., Kajanne, R., Aavikko, M., Cooper, H., Öller, D., Leinonen, R., Lahtela, L. E., Kaunisto, M., Kilpeläinen, E., Sipilä, T. P., Dada, O. A., Ghazal, A., Kytölä, A., Weldatsadik, R., Donner, K. M., Luo, S., Padmanabhuni, S. S. & Hovatta, I., 2024, julkaisussa: Communications Biology. 7, 1, 17 Sivumäärä, 1631.
Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
Single-cell transcriptomes identify patient-tailored therapies for selective co-inhibition of cancer clones
Ianevski, A., Nader, K., Driva, K., Senkowski, W., Bulanova, D., Moyano-Galceran, L., Ruokoranta, T., Kuusanmäki, H., Ikonen, N., Sergeev, P., Vähä-Koskela, M., Giri, A. K., Vähärautio, A., Kontro, M., Porkka, K., Pitkänen, E., Heckman, C. A., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., jouluk. 2024, julkaisussa: Nature Communications. 15, 1, 16 Sivumäärä, 8579.
Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
Blood has never been thicker: Cell-free DNA fragmentomics in the liquid biopsy toolbox of B-cell lymphomas
Meriranta, L., Pitkänen, E. & Leppä, S., heinäk. 2023, julkaisussa: Seminars in Hematology. 60, 3, s. 132-141 10 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
DeepIFC: Virtual fluorescent labeling of blood cells in imaging flow cytometry data with deep learning
Timonen, V. A., Kerkelä, E., Impola, U., Penna, L., Partanen, J., Kilpivaara, O., Arvas, M. & Pitkänen, E., lokak. 2023, julkaisussa: Cytometry. Part A. 103, 10, s. 807-817 11 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

2 Aktiivinen
3 Päättynyt

SPR 25-26 Pitkänen
Pitkänen, E. (Projektinjohtaja)
Suomen Punainen Risti, Veripalvelu Ostoreskontra
01/01/2025 → 31/12/2026
Projekti: Rahastot ja säätiöt
EDOC-PCB-LB Syöpäsäätiö 2022 Pitkänen
Pitkänen, E. (Projektinjohtaja), Huttunen, A. T. (osallistuja), Langohr, L. (osallistuja), Nebelung, H. S. (osallistuja) & Timonen, V. A. (osallistuja)
Syöpäsäätiö sr Cancerstiftelsen sr
01/01/2023 → 31/12/2025
Projekti: Rahastot ja säätiöt
Somaattisten mutageneesin mallintaminen syvillä probabilistisilla neuroverkoilla
Pitkänen, E. (Projektinjohtaja), Mapar, P. (osallistuja), Sanjaya, P. (osallistuja) & Timonen, V. A. (osallistuja)
Suomen Akatemia
01/09/2022 → 31/08/2024
Projekti: Suomen Akatemia: Akatemiatutkijan tutkimuskulut
Modelling Functional Shifts in Enzyme Evolution
Pitkänen, E. (Osallistuja), Astikainen, K. (Osallistuja), Rousu, J. (Projektinjohtaja) & Szedmak, S. (Osallistuja)
01/01/2006 → 31/12/2008
Projekti: Tutkimusprojekti
Experimental and computational analysis of physiological regulation at transcriptome, proteome and metabolome level
Rousu, J. (Projektinjohtaja), Rantanen, A. J. (Osallistuja), Pitkänen, E. (Osallistuja) & Heinonen, M. (Osallistuja)
01/01/2004 → 31/12/2007
Projekti: Tutkimusprojekti

1 Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
1 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon

EMBL
Pitkänen, E. (Vieraileva tutkija)
4 lokak. 2016 → 31 toukok. 2019
Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypit › Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon
Doctoral thesis supervision / Kaasinen
Pitkänen, E. (Ohjaaja)
2012 → 26 syysk. 2014
Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja

Meilahti Biodata (LS-RIA/ BIODATA)
Pitkänen, E. (Johtaja)
Suomen molekyylilääketieteen instituutti
Laitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö

Esa Pitkänen

Henkilökohtainen profiili

Tieteenalat

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö

Sukella yksityiskohtiin

A Unified Review of Deep Learning for Automated Medical Coding

Novel loci and biomedical consequences of iron homoeostasis variation

Single-cell transcriptomes identify patient-tailored therapies for selective co-inhibition of cancer clones

Blood has never been thicker: Cell-free DNA fragmentomics in the liquid biopsy toolbox of B-cell lymphomas

DeepIFC: Virtual fluorescent labeling of blood cells in imaging flow cytometry data with deep learning

SPR 25-26 Pitkänen

EDOC-PCB-LB Syöpäsäätiö 2022 Pitkänen

Somaattisten mutageneesin mallintaminen syvillä probabilistisilla neuroverkoilla

Modelling Functional Shifts in Enzyme Evolution

Experimental and computational analysis of physiological regulation at transcriptome, proteome and metabolome level

EMBL

Doctoral thesis supervision / Kaasinen

Meilahti Biodata (LS-RIA/ BIODATA)

Esa Pitkänen

Henkilökohtainen profiili

Tieteenalat

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö

Julkaisut

Projektit

Aktiviteetit

Laitteet