• PL 27 (Latokartanonkaari 7)

    00014

    Suomi

  • Viikinkaari 1, Biocentre 3

    00790 Helsinki

    Suomi

  • Viikinkaari 1, Biokeskus 3

    00790 Helsinki

    Suomi

1992 …2020

Research output per year

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Professor of Forest Pathology since 2007. My research interests and technologies applied are broad and diverse and includes among others; Molecular Tree - Microbe Interaction, Tree microbiomes, Metagenomics and Forest microbiology, Fungal genomics, Fungal population biology, Biological control of forest pathogens, Tropical forest pathology, Infection biology of phytopathogenic fungi and Resistance biology of forest trees. Our research acknowledges that the major threats to the sustainable supply of forest tree products (timber, bioenergy, biodiversity, recreation etc.) are climate change, pests and diseases. Today, the need to increase and safeguard those resources of renewable materials and bioenergy present major challenges for tree health biotechnology and bioeconomy programs. Our major research focus therefore has been the application of biotechnology knowledge and tools for the determination of ecological, molecular and biochemical pathways required by emerging fungal and forest pathogens to spread, infect and cause disease to trees worldwide. In addition, understanding the basal mechanisms on how forest trees resist infection is also our primary research goal.

More specific goals have been deciphering fungal pathogenicity factors by functional analysis of effector-like proteins of phytopathogenic fungi using the conifer tree pathogen (Heterobaisidon annosum) as a model. A major research question however is, why are certain fungi pathogenic whereas others are obligate saprotrophs or mutualists like mycorrhizal fungi?

Additional specific research focus is on the application of metabolomics and genomics approaches for screening conifer tree genotypes and clonal materials for resistance against the root and butt rot pathogen (Heterobasidion spp.).  A further research objective  explores the impact of tree microbiomes on forest tree health. Equally, we are also interested in understanding how forest trees are able to recognise some microbes as pathogen whereas they are able to form intimate beneficial association with others.

The result of this research will hopefully contribute to the design of novel disease control and management strategies for fungal pathogens of trees as well as form a necessary basis for selecting tree genotypes for resistance breeding and research.

Besides, I have been a member of the faculty interdisciplinary Master's Programme in Biotechnology. I am also an invited professor at Nanjing Forestry University in China

For further information about our research on the Forest Pathology Research Lab website.

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Biotechnology, PhD

1 elokuuta 198830 lokakuuta 1991

Applied Microbiology & Plant Pathology, MSc

1 syyskuuta 198423 tammikuuta 1985

Botany, BSc

1 syyskuuta 19791 toukokuuta 1983

Tieteenalat

  • 4112 Metsätiede

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut

Bacterial Community Structure of Pinus Thunbergii Naturally Infected by the Nematode Bursaphelenchus Xylophilus

Ma, Y., Qu, Z-L., Liu, B., Tan, J-J., Asiegbu, F. O. & Sun, H., helmikuuta 2020, julkaisussa : Microorganisms. 8, 2, 16 Sivumäärä, 307.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome sequencing of Rigidoporus microporus provides insights on genes important for wood decay, latex tolerance and interspecific fungal interactions

Oghenekaro, A. O., Kovalchuk, A., Raffaello, T., Camarero, S., Gressler, M., Henrissat, B., Lee, J., Liu, M., Martínez, A. T., Miettinen, O., Mihaltcheva, S., Pangilinan, J., Ren, F., Riley, R., Ruiz-Dueñas, F. J., Serrano, A., Thon, M. R., Wen, Z., Zeng, Z., Barry, K. & 3 muuta, Grigoriev, IV., Martin, F. & Asiegbu, F. O., 23 maaliskuuta 2020, julkaisussa : Scientific Reports. 10, 1

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The microbial diversity and structure in peatland forest in Indonesia

Liu, B., Talukder, M. J. H., Terhonen, E., Lampela, M., Vasander, H., Sun, H. & Asiegbu, F., tammikuuta 2020, julkaisussa : Soil Use and Management. 36, 1, s. 123-138 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cellulolytic activity of brown-rot Antrodia sinuosa at the initial stage of cellulose degradation

Sugano, J., Linnakoski, R., Huhtinen, S., Pappinen, A., Niemela, P. & Asiegbu, F. O., heinäkuuta 2019, julkaisussa : Holzforschung : international journal of the biology, chemistry, physics and technology of wood. 73, 7, s. 673-680 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Chlorophyll fluorescence imaging for monitoring effects of Heterobasidion parviporum small secreted protein induced cell death and in planta defense gene expression.

Wen, Z., Raffaello, T., Zeng, Z., Pavicic Venegas, M. V. & Asiegbu, F. O., 22 toukokuuta 2019, julkaisussa : Fungal Genetics and Biology. 126, s. 37-49 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Projektit

Aktiviteetit

  • 23 Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
  • 16 Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)
  • 4 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
  • 4 Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Fungal Interactions, Theme I: Multitrophic interactions

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Fred Asiegbu (Järjestäjätoimikunnan puheenjohtaja)
15 toukokuuta 201917 toukokuuta 2019

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Fungal Interactions, Theme II: Mutualistic and Pathogenic Interactions

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Fred Asiegbu (Järjestäjätoimikunnan puheenjohtaja)
13 kesäkuuta 201914 kesäkuuta 2019

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Engineered Plant Immunity: Mini-symposium part 1

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Frederick Obioma Asiegbu (Tieteellisen komitean jäsen), Kirk Loren Overmyer (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kristiina Maria Mäkinen (Tieteellisen komitean puheenjohtaja)
13 maaliskuuta 201814 maaliskuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Engineered Plant Immunity: Mini-symposium part 2

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Frederick Obioma Asiegbu (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kirk Loren Overmyer (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kristiina Maria Mäkinen (Tieteellisen komitean puheenjohtaja)
17 huhtikuuta 201819 huhtikuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Antagonistic and Synergistic effects on wood deconstruction by co-fungal cultures.

Fred Asiegbu (Ohjaaja)
2017

Aktiviteetti: TutkimustyypitMuun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)