1992 …2019
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Professor of Forest Pathology since 2007. My research interests and technologies applied are broad and diverse and includes among others; Molecular Tree - Microbe Interaction, Tree microbiomes, Metagenomics and Forest microbiology, Fungal genomics, Fungal population biology, Biological control of forest pathogens, Tropical forest pathology, Infection biology of phytopathogenic fungi and Resistance biology of forest trees. Our research acknowledges that the major threats to the sustainable supply of forest tree products (timber, bioenergy, biodiversity, recreation etc.) are climate change, pests and diseases. Today, the need to increase and safeguard those resources of renewable materials and bioenergy present major challenges for tree health biotechnology and bioeconomy programs. Our major research focus therefore has been the application of biotechnology knowledge and tools for the determination of ecological, molecular and biochemical pathways required by emerging fungal and forest pathogens to spread, infect and cause disease to trees worldwide. In addition, understanding the basal mechanisms on how forest trees resist infection is also our primary research goal.

More specific goals have been deciphering fungal pathogenicity factors by functional analysis of effector-like proteins of phytopathogenic fungi using the conifer tree pathogen (Heterobaisidon annosum) as a model. A major research question however is, why are certain fungi pathogenic whereas others are obligate saprotrophs or mutualists like mycorrhizal fungi?

Additional specific research focus is on the application of metabolomics and genomics approaches for screening conifer tree genotypes and clonal materials for resistance against the root and butt rot pathogen (Heterobasidion spp.).  A further research objective  explores the impact of tree microbiomes on forest tree health. Equally, we are also interested in understanding how forest trees are able to recognise some microbes as pathogen whereas they are able to form intimate beneficial association with others.

The result of this research will hopefully contribute to the design of novel disease control and management strategies for fungal pathogens of trees as well as form a necessary basis for selecting tree genotypes for resistance breeding and research.

Besides, I have been a member of the faculty interdisciplinary Master's Programme in Biotechnology. I am also an invited professor at Nanjing Forestry University in China

For further information about our research on the Forest Pathology Research Lab website.

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Biotechnology, PhD

1 elokuuta 198830 lokakuuta 1991

Applied Microbiology & Plant Pathology, MSc

1 syyskuuta 198423 tammikuuta 1985

Botany, BSc

1 syyskuuta 19791 toukokuuta 1983

Keywords

  • 4112 Metsätiede

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Julkaisut 1992 2019

Chlorophyll fluorescence imaging for monitoring effects of Heterobasidion parviporum small secreted protein induced cell death and in planta defense gene expression.

Wen, Z., Raffaello, T., Zeng, Z., Pavicic Venegas, M. V. & Asiegbu, F. O., 22 toukokuuta 2019, julkaisussa : Fungal Genetics and Biology. 126, s. 37-49 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Dual RNA-seq analysis provides new insights into interactions between Norway spruce and necrotrophic pathogen Heterobasidion annosum s.l.

Kovalchuk, A., Zeng, Z., Ghimire, R. P., Kivimäenpää, M., Raffaello, T., Liu, M., Mukrimin, M., Kasanen, R. A. O., Sun, H., Julkunen-Tiitto, R., Holopainen, J. K. & Asiegbu, F. O., 3 tammikuuta 2019, julkaisussa : BMC Plant Biology. 19, 2, 17 Sivumäärä, 2.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Forest Tree Microbiomes and Associated Fungal Endophytes: Functional Roles and Impact on Forest Health

Terhonen, E., Blumenstein, K., Kovalchuk, A. & Asiegbu, F. O., tammikuuta 2019, julkaisussa : Forests. 10, 1, 32 Sivumäärä, 42.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuKatsausartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome description of Phlebia radiata 79 with comparative genomics analysis on lignocellulose decomposition machinery of phlebioid fungi

Mäkinen, M., Kuuskeri, J., Laine, P., Smolander, O-P., Kovalchuk, A., Zeng, Z., Asiegbu, F., Paulin, L., Auvinen, P. & Lundell, T., 28 toukokuuta 2019, julkaisussa : BMC Genomics. 20, 22 Sivumäärä, 430.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Genome-wide DNA methylation and transcriptomic profiles in the lifestyle strategies and asexual development of the forest fungal pathogen Heterobasidion parviporum

Zeng, Z., Wu, J., Kovalchuk, A., Raffaello, T., Wen, Z., Liu, M. & Asiegbu, F. O., 2 tammikuuta 2019, julkaisussa : Epigenetics. 14, 1, s. 16-40 25 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Projektit 2010 2015

Aktiviteetit 1998 2018

  • 23 Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
  • 16 Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)
  • 4 Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
  • 2 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Engineered Plant Immunity: Mini-symposium part 2

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Frederick Obioma Asiegbu (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kirk Loren Overmyer (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kristiina Maria Mäkinen (Tieteellisen komitean puheenjohtaja)
17 huhtikuuta 201819 huhtikuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Engineered Plant Immunity: Mini-symposium part 1

Karen Sims-Huopaniemi (Järjestäjätoimikunnan jäsen), Frederick Obioma Asiegbu (Tieteellisen komitean jäsen), Kirk Loren Overmyer (Tieteellisen komitean puheenjohtaja), Kristiina Maria Mäkinen (Tieteellisen komitean puheenjohtaja)
13 maaliskuuta 201814 maaliskuuta 2018

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Antagonistic and Synergistic effects on wood deconstruction by co-fungal cultures.

Fred Asiegbu (Ohjaaja)
2017

Aktiviteetti: TutkimustyypitMuun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)

Conifer pathosystem: physiological and molecular responses to a pathogen infection.

Fred Asiegbu (Ohjaaja)
2016

Aktiviteetti: TutkimustyypitMuun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)

Molecular analysis of the interaction between white rot pathogen (Rigidoporus microporus) and rubber tree (Hevea brasiliensis)

Fred Asiegbu (Ohjaaja)
15 tammikuuta 2016

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja