Henkilökohtainen profiili
Tieteenalat
- 3111 Biolääketieteet
Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta
-
Dynamic and Ongoing De Novo L1 Retrotransposition Contributes to Genome Plasticity and Intrapatient Heterogeneity in Ovarian Cancer
Pradhan, B., Oikkonen-Köngäs, J., Zhang, K., Botto, J. M., Eriksson, M. R., Sundaresan, S., Genç, F., Pisanic, T. R., Marín Falco, M., Li, Y., Pikkusaari, S., Lavikka, K., Micoli, G., Marchi, G., Muranen, T. A., Huhtinen, K., Vähärautio, A., Badge, R., Burns, K. H. & Hietanen, S. & 4 muuta, , 16 helmik. 2026, julkaisussa: Cancer Research. 86, 4, s. 1073-1088 16 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Decoding the Genomic and Functional Landscape of Emerging Subtypes in Ovarian Cancer
Micoli, G., Lavikka, K., Li, Y., Pirttikoski, A., Afenteva, D., Senkowski, W., Marchi, G., Vähärautio, A., Muranen, T. A., Joutsiniemi, T., Virtanen, A., Wennerberg, K., Hynninen, J., Oikkonen, J. & Hautaniemi, S., 3 marrask. 2025, julkaisussa: Cancer Discovery. 15, 11, s. 2262-2277 16 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
Afenteva, D., Yu, R., Rajavuori, A., Salvadores, M., Launonen, I. M., Lavikka, K., Zhang, K., Pirttikoski, A., Marchi, G., Jamalzadeh, S., Isoviita, V.-M., Li, Y., Micoli, G., Erkan, E. P., Falco, M. M., Ungureanu, D., Lahtinen, A., Oikkonen, J., Hietanen, S. & Vähärautio, A. & 7 muuta, , 16 syysk. 2025, julkaisussa: Cell Reports Medicine. 6, 9, 24 Sivumäärä, 102316.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Deciphering cancer genomes with GenomeSpy: a grammar-based visualization toolkit
Lavikka, K., Oikkonen, J., Li, Y., Muranen, T., Micoli, G., Marchi, G., Lahtinen, A., Huhtinen, K., Lehtonen, R., Hietanen, S., Hynninen, J., Virtanen, A. & Hautaniemi, S., 5 elok. 2024, julkaisussa: GigaScience. 13, 15 Sivumäärä, giae040.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Extensive mutational ctDNA profiles reflect High-grade serous cancer tumors and reveal emerging mutations at recurrence
Marchi, G., Rajavuori, A., Nguyen, M. T. N., Huhtinen, K., Oksa, S., Hietanen, S., Hautaniemi, S., Hynninen, J. & Oikkonen, J., tammik. 2024, julkaisussa: Translational oncology. 39, 8 Sivumäärä, 101814.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Projektit
- 1 Aktiivinen
-
iCAN - Digitaalisen yksilöllistetyn syöpälääketieteen lippulaiva
Mäkelä, T. (Projektinjohtaja), Adhikari, S. (osallistuja), Aldahdooh, J. M. F. (osallistuja), Ariotta, V. (osallistuja), Arjama, M. A. (osallistuja), Atarsaikhan, G. (osallistuja), Bao, J. (osallistuja), Barreiro, K. (osallistuja), Bhalke, M. S. (osallistuja), Bollepalli, S. (osallistuja), Brandt, J. A. J. (osallistuja), Chernenko, A. (osallistuja), Dashi, G. (osallistuja), Eloranta, K. (osallistuja), Eriksson, M. R. (osallistuja), Feodoroff, M. J. (osallistuja), Fey, E. (osallistuja), Gerber, L. J. (osallistuja), Grönholm, M. (osallistuja), Hannula, S. A. (osallistuja), Heistman, V. (osallistuja), Henriksson, M. E. J. (osallistuja), Hiitola, E. T. J. (osallistuja), Huttunen, A. T. (osallistuja), Hyyppä, S. P. P. (osallistuja), Högel-Starck, C. S. P. (osallistuja), Ianevski, A. (osallistuja), Ikonen, N. (osallistuja), Jansouz, S. (osallistuja), Jha, S. (osallistuja), Junquera Mencía, A. (osallistuja), Kalashnikov, I. (osallistuja), Kampanellou, E. (osallistuja), Karabayev, D. (osallistuja), Karhemo, P.-R. (osallistuja), Karling, T. S. (osallistuja), Kekkonen, J. (osallistuja), Kolikova, Y. (osallistuja), Krami Senhaji, O. (osallistuja), Kuijjer, M. (osallistuja), Kuisma-van der Linden, M. S. (osallistuja), Kumari, R. (osallistuja), Kuosmanen, A. (osallistuja), Kurki, V. (osallistuja), Kuusela, S. (osallistuja), Kücükel, H. (osallistuja), Langohr, L. (osallistuja), Lavikka, K. A. (osallistuja), Le Joncour, V. (osallistuja), Lehto, T.-P. (osallistuja), Leivonen, S.-K. (osallistuja), Liljeström, M. (osallistuja), Lindfors, I. S. (osallistuja), Lindgren, H. (osallistuja), Luck, T. J. (osallistuja), Lähdeniemi, I. A. K. (osallistuja), Maarala, A. I. (osallistuja), Maljanen, K. J. (osallistuja), Marchi, G. (osallistuja), Martikainen, E. M. (osallistuja), Meriranta, L. (osallistuja), Metsäranta, N. A. C. (osallistuja), Miihkinen, M. S. (osallistuja), Moradi, N. (osallistuja), Nader, K. M. (osallistuja), Nagaraj, A. (osallistuja), Nguyen, M. (osallistuja), Niemeyer, F. (osallistuja), Niemiec, I. (osallistuja), Nylén, M. M. (osallistuja), Palin, K. (osallistuja), Palva, A. (osallistuja), Parsons, A. O. (osallistuja), Peltonen, J. H. H. (osallistuja), Perez Villatoro, F. R. (osallistuja), Pietiäinen, V. (osallistuja), Pirinen, I. E. (osallistuja), Pirttikoski, A. A. (osallistuja), Pitko, I. M. (osallistuja), Polianskyte-Prause, Z. (osallistuja), Puhka, M. (osallistuja), Quintero, I. B. (osallistuja), Rachidi, S. E. (osallistuja), Rajalaakso, M. T. (osallistuja), Rodosthenous, R. (osallistuja), Saad, J. (osallistuja), Sanjaya, P. (osallistuja), Seppälä, T. T. (osallistuja), Seref Vujaklija, C. (osallistuja), Shah, S. (osallistuja), Sorri, S. P. (osallistuja), Suni, V. (osallistuja), Suutala, A. (osallistuja), Suvela, M. (osallistuja), Sysivirta, L. K. M. (osallistuja), Udayani, J. E. (osallistuja), Verkasalo, H. M. (osallistuja), Viiri, L. E. (osallistuja), Vilkkavaara Cancocak, Y. (osallistuja), Vähärautio, A. (osallistuja), Vänttinen, I. M. (osallistuja), Västrik, I. (osallistuja), Väänänen, J. (osallistuja), Wang, W. (osallistuja) & Zhang, X. (osallistuja)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Suomen Akatemia
01/09/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Lippulaivaohjelma