Henkilökohtainen profiili
Tieteenalat
- 3111 Biolääketieteet
Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta
-
LazypipeX: Customizable Virome Analysis Pipeline Enabling Fast and Sensitive Virus Discovery from NGS data
Pljusnin, I., Vapalahti, O., Kant, R. & Smura, T., 19 tammik. 2026, (Jätetty) julkaisussa: bioRxiv : the preprint server for biology .Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Time-series sewage metagenomics distinguishes seasonal, human-derived and environmental microbial communities potentially allowing source-attributed surveillance
Becsei, A., Fuschi, A., Otani, S., Kant, R., Weinstein, I., Alba, P., Steger, J., Visontai, D., Brinch, C., de Graaf, M., Schapendonk, C. M. E., Battisti, A., De Cesare, A., Oliveri, C., Troja, F., Vapalahti, O., Pasquali, F., Banyai, K., Mako, M. & Pollner, P. & 6 muuta, , 30 elok. 2024, julkaisussa: Nature Communications. 15, 7551, 13 Sivumäärä, 7551.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Enhanced Viral Metagenomics with Lazypipe 2
Pljusnin, I., Vapalahti, O., Sironen, T., Kant, R. & Smura, T., 2023, julkaisussa: Viruses (Basel). 15, 2, 13 Sivumäärä, 431.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access -
Partial genome characterization of a novel potentially zoonotic parapoxvirus in a horse, Finland
Virtanen, J. M. E., Hautaniemi, M., Dutra, L., Pljusnin, I., Smura, T., Vapalahti, O., Sironen, T., Kant, R. & Kinnunen, P. M., 29 syysk. 2023, julkaisussa: Emerging Infectious Diseases. 29, 9, s. 1941-1944 4 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
ClusTRace, a bioinformatic pipeline for analyzing clusters in virus phylogenies
Pljusnin, I., Truong, P., Sironen, T., Vapalahti, O., Smura, T. & Kant, R., 28 toukok. 2022, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 23, 1, 16 Sivumäärä, 196.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Projektit
- 6 Aktiivinen
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (osallistuja)
01/12/2025 → …
Projekti: Tutkimusprojekti
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (osallistuja) & Kant, R. (Principal Investigator)
01/12/2025 → …
Projekti: Rahastot ja säätiöt
-
SELS 24-25 Ilja Weinstein
Pljusnin, I. (Projektinjohtaja)
Suomen eläinlääketieteen säätiö
01/12/2024 → 31/12/2026
Projekti: Rahastot ja säätiöt
-
JAES Vapalahti 12/24 - 11/27
Vapalahti, O. (Projektinjohtaja), Erdin, M. (osallistuja), Kirjalainen, L. M. (osallistuja), Martikainen, J. K. (osallistuja), Olander, V. (osallistuja), Pljusnin, I. (osallistuja), Sironen, E. V. (osallistuja), Smura, T. (osallistuja) & Vauhkonen, H. K. (osallistuja)
01/12/2024 → 30/11/2027
Projekti: Rahastot ja säätiöt
-
DURABLE EU Vapalahti Olli 2/23-1/27
Vapalahti, O. (Projektinjohtaja), Ahvenainen, E. R. (osallistuja), Alburkat, H. A. T. (osallistuja), Bogacheva, M. (osallistuja), Erdin, M. (osallistuja), Kirjalainen, L. M. (osallistuja), Pljusnin, I. (osallistuja), Smura, T. (osallistuja), Suomalainen, N. (osallistuja) & Vauhkonen, H. K. (osallistuja)
01/02/2023 → 31/01/2027
Projekti: EU4Health programme: EU4H-PJG
Aktiviteetit
- 1 Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)
-
haracterization of species-level feline Helicobacter population using 16S MinION nanopore sequencing
Pljusnin, I. (Ohjaaja), Sironen, T. (Ohjaaja) & Kant, R. (Ohjaaja)
2024 → 2025Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)
Lehtileikkeet
-
University of Helsinki researchers developed a sequence analysis pipeline for virus discovery
Pljusnin, I., Kant, R., Smura, T., Sironen, T. & Vapalahti, O.
03/12/2020
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media