Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Research projects

The research group works in close collaboration with experts in bioinformatics, music education and in clinical research to identify genetic variants underlying traits affecting both normal and abnormal brain development.

I Biological basis of musical aptitude

The project represent an interdisciplinary project where the modern methods of molecular and statistical genetics, bioinformatics and music education are combined to elucidate the cross-talk between genes and cultural inheritance in music perception and production. The study represents a pioneer work at international level in aiming to understand the evolution of human cognitive functions in music.

II Molecular genetics of intellectual disability

Intellectual disability (IQ<70) is present in 2-3% of the populations. Genetic factors are responsible for 50 % of severe mental retardation. We use exome sequencing to identify novel genes and mutations in Finnish families with ID of unknown cause. Several mutations have been identified to date.

Members of the group

Chakravarthi Kanduri, MSc

Preethy Nair, DVet, MSc

Jaana Oikkonen, MSc

Anju Philips, MSc

Laboratory: Department of Medical Genetics
Office: Room B311b
Tel: 050 544 7030 mobile
Tel: 02941 25506 laboratory

Collaborators

Intellectual disability:

MD Tuomo Määttä, Disability Services, Joint Authority for Kainuu, Kajaani

Professor James Lupski, Baylor College of Medicine, Houston, Texas

Professor Suzanne McLeal, Baylor College of Medicine, Houston, Texas

PhD Isabelle Schrauwen, Baylor College of Medicine, Houston, Texas

Professor Jozef Gecz, Adelaide Children’s hospital, Adelaide

Professor Hans van Bokhoven, Department of Human Genetics, Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour, Radboud University Medical Center, Nijmegen

MD PhD Elisa Rahikkala, Department of Clinical Genetics, PEDEGO Research Unit and Medical Research Center Oulu, Oulu University Hospital and University of Oulu, Oulu

Docent Raija Vanhala, Helsinki university hospital

Professor Maria Arvio, Turku and Oulu University

MD PhD Kristiina Avela, Helsinki University Hospital

Docent Teppo Varilo, The Department of Medical genetics, University of Helsinki

MUSGEN:

Professor Tuire Kuusi, Helsinki University of Arts

MuD Pirre Raijas, Joensuu Conservatoire

Professor (emer) Kai Karma, Helsinki University of Arts

 

 

Funding

 

The Academy of Finland

Biomedicum Helsinki Foundation

The Finnish Medical Society (Finska Läkaresällskapet)

 

List of five recent publications profiling research activities of the group

group Philips AK, Siren A, Avela K, Doagu F, Ahvenainen M, Arvio M, Somer M, Kääriainen H,  van Esch H, Haas S, Hu H, Froyen G, Kalscheuer V, Järvelä I. X-Exome sequencing in Finnish families with  intellectual disability ? Five novel mutations and two syndromic phenotypes found. Orphanet J Rare Dis 9:49, 2014

 

Oikkonen J, Huang Y, Onkamo P, Ukkola-Vuoti L, Raijas P, Karma K, Vieland VJ, Järvelä I. A genome-wide linkage and association study of musical aptitude identifies genetic variants related to inner ear development and neurocognitive functions. Mol Psychiatry 2014 Mar 11. doi: 10.1038/mp.2014.8. [Epub ahead of print].

 

Hautamäki A, Kivioja J, Seitsonen S,  Savolainen ER, Liinamaa MJ, Luoma A, Järvelä I, Immonen I. The IL-8, VEGF and CFH Polymorphisms and Bevacizumab in Age-Related Macular Degeneration. Ophthalmology 121(4):973-974.e2, 2014.

 

Kanduri C, Ukkola-Vuoti L, Oikkonen J, Buck G, Blancher C, Raijas P,  Karma K, Lähdesmäki H, Järvelä I. The genome wide landscape of copy  number variations in the MUSGEN study provides evidence for a founder  effect in the isolated Finnish population. Eur J Hum Genet 2013, Apr  17. [Epub ahead of print].

 

Ukkola-Vuoti L, Kanduri C, Oikkonen J, Buck G, Blancher C, Raijas P,  Karma K, Lähdesmäki H, Järvelä I. Genome wide copy number variation  analysis in extended families and unrelated individuals characterized  for musical aptitude and creativity in music. PLoS ONE 8(2): e56356, 2013

 

Possible URL address to lab's home page or/and EU/other project project

http://www.hi.helsinki.fi/music/english/members.htm

Ansioluettelo

Kliininen opettaja, Lääketieteellisen genetiikan osasto 01.08.2010>, lääketieteellisen genetiikan professori määräaikainen 01.03.2010-31.12.2011

Ansioluettelo

Head of the Department

Keywords

  • 3112 Neurotieteet
  • genomiikka

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Julkaisut 1989 2019

  • 171 Artikkeli
  • 19 Katsausartikkeli
  • 8 Kirjan luku tai artikkeli

The effect of music performance on the transcriptome of professional musicians

Kanduri, C., Kuusi, T., Ahvenainen, M., Philips, A. K., Lahdesmaki, H. & Jarvela, I., 25 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Scientific Reports. 5, 7 Sivumäärä, 9506.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A genome-wide linkage and association study of musical aptitude identifies loci containing genes related to inner ear development and neurocognitive functions

Oikkonen, J., Huang, Y., Onkamo, P., Ukkola-Vuoti, L., Raijas, P., Karma, K., Vieland, V. J. & Jarvela, I., helmikuuta 2015, julkaisussa : Molecular Psychiatry. 20, 2, s. 275-282 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The effect of listening to music on human transcriptome

Kanduri, C., Raijas, P., Ahvenainen, M., Philips, A. K., Ukkola-Vuoti, L., Lahdesmaki, H. & Jarvela, I., 12 maaliskuuta 2015, julkaisussa : PeerJ. 3, 17 Sivumäärä, 830.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Creative Activities in Music - A Genome-Wide Linkage Analysis

Oikkonen, J., Kuusi, T., Peltonen, P., Raijas, P., Ukkola-Vuoti, L., Karma, K., Onkamo, P. & Jarvela, I., 24 helmikuuta 2016, julkaisussa : PLoS One. 11, 2, 21 Sivumäärä, 0148679.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Detecting signatures of positive selection associated with musical aptitude in the human genome

Liu, X., Kanduri, C., Oikkonen, J., Karma, K., Raijas, P., Ukkola-Vuoti, L., Teo, Y-Y. & Jarvela, I., 16 helmikuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 9 Sivumäärä, 21198.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Projektit 2011 2015

  • 1 Päättynyt

Musikaalisuuden biologisen perustan tutkimus

Järvelä, I., Oikkonen, J. & Ukkola-Vuoti, L.

Unknown funder

01/01/201131/10/2015

Projekti: Tutkimusprojekti

Palkinnot

Helsingin Liike- ja Virkanaisten yhdistys

Irma Järvelä (Vastaanottaja), 31 lokakuuta 1991

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Helsinki university, international evaluation of research and teaching

Irma Järvelä (Vastaanottaja) & Kaija-Leena Kolho (Vastaanottaja), 2012

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

The Docent of the Year 2018, University of Helsinki

Irma Järvelä (Vastaanottaja), 21 maaliskuuta 2018

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Aktiviteetit 1997 2018

Genetic diagnostics in clinic - ethical principles

Irma Järvelä (Kutsuttu puhuja)
21 helmikuuta 2018

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

The most common genetic diseases in primary health care

Irma Järvelä (Puhuja)
27 syyskuuta 2018

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

Kokemusasiantuntijuus - olennainen osa harvinaisiin sairauksiin liittyvää opetusta

Irma Järvelä (Osallistuja)
4 syyskuuta 2018

Aktiviteetti: Muiden aktiviteettien tyypitTyypit: Muut aktiviteetit - Muu opetustyö

Molecular genetic background of musical aptitude

Irma Järvelä (Pääpuhuja)
14 kesäkuuta 2018

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

Genomics approaches to study musical aptitude, music perception and practice

Irma Järvelä (Kutsuttu puhuja)
11 kesäkuuta 2018

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

Lehdistö/media

Musiikki tuo tehoa työntekoon - Talouselämän haastattelu

Irma Järvelä

12/10/2018

1 median myötävaikutus

Lehdistö/media

Musiikin kuuntelu

Irma Järvelä

03/06/2015

1 median myötävaikutus

Lehdistö/media

Studio55: Terveys

Irma Järvelä

21/04/2015

1 median myötävaikutus

Lehdistö/media

Yle TV1 uutiset

Irma Järvelä

05/04/2015

1 median myötävaikutus

Lehdistö/media

Äiti tekee muusikon

Irma Järvelä

01/03/2014

1 median myötävaikutus

Lehdistö/media