Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus
My research as a doctoral student was on the nitrogen-fixing symbiosis between the rhizobium Neorhizobium galegae and its host plant species Galega orientalis and Galega officinalis. Making use of molecular biology, genome sequencing and comparative genomics, I studied symbiosis-related genes important for nitrogen fixation in N. galegae strains.
During postdoc projects I have been involved in bioinformatic analyses of fungal and plant genomes. More specifically, genome and transcriptome assembly and annotation of the plant pathogen Podosphaera plantaginis; annotation of the Melitaea cinxia genome; genome and transcriptome assembly and gene co-expression network analysis of the ornamental plant Gerbera hybrida. Currently, I am working with bioinformatics in the Fungco research group led by Dr. Taina Lundell, focusing on wood-decaying forest fungi.
Tieteenalat
- 11832 Mikrobiologia ja virologia
- 11831 Kasvibiologia
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
Complete mitochondrial genome sequence of the Agaricomycetes brown rot fungus Fomitopsis pinicola isolate FBCC1181
Österman-Udd, J. & Lundell, T., jouluk. 2023, julkaisussa: Microbiology Resource Announcements. 12, 12, 3 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Basidiomycota fungi and ROS: genomic perspective on key enzymes involved in generation and mitigation of reactive oxygen species
Mattila, H., Österman-Udd, J., Mali, T. & Lundell, T., 23 maalisk. 2022, julkaisussa: Frontiers in Fungal Biology. 3Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Improved chromosome-level genome assembly of the Glanville fritillary butterfly (Melitaea cinxia) integrating Pacific Biosciences long reads and a high-density linkage map
Smolander, O.-P., Blande, D., Ahola, V., Rastas, P., Tanskanen, J., Kammonen, J., Oostra, V., Pellegrini, L., Ikonen, S., Dallas, T., DiLeo, M. F., Duplouy, A., Duru, I. C., Halimaa, P., Kahilainen, A., Kuwar, S. S., Karenlampi, S. O., Lafuente, E., Luo, S. & Makkonen, J. & 13 muuta, , 12 tammik. 2022, julkaisussa: GigaScience. 11, 14 Sivumäärä, 097.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Genomic features separating ten strains of Neorhizobium galegae with different symbiotic phenotypes
Österman, J. M., Mousavi, S. A., Koskinen, J. P., Paulin, L. G. & Lindström, A. K., 2 toukok. 2015, julkaisussa: BMC Genomics. 16, 14 Sivumäärä, 348.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Molecular factors and genetic differences defining symbiotic phenotypes of Galega spp. and Neorhizobium galegae strains
Österman, J. M., 2015, Helsinki: University of Helsinki. 60 SivumääräTutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
-
ForMic: Lahopuun mikrobisto: tuntematon luonnonvara metsäekosysteemin hiilen kierrossa ja luonnontuotteiden muuntamisessa
Lundell, T. (Projektinjohtaja), Hietanen, N. L. E. (osallistuja), Kazanaviciute, A. (osallistuja), Kiviniemi, E. A. (osallistuja), Qurashi, M. (osallistuja) & Österman-Udd, J. (osallistuja)
01/09/2022 → 31/08/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Akatemiahanke
-
Biofungi - kääpäsienten fermentaatiokyvyn ja aineenvaihdunnan reittien avaus jätteiden muuntamisessa
Lundell, T. (Projektinjohtaja), Christodoulou, M. (osallistuja), Kiviniemi, E. A. (osallistuja), Laine, T. A. K. (osallistuja), Mikkola, A. H. (osallistuja), Pulkkanen, R. E. (osallistuja), Österman-Udd, J. (osallistuja), Kiviniemi, E. A. (Osallistuja) & Mattila, H. (Osallistuja)
01/01/2019 → 31/08/2022
Projekti: Rahastot ja säätiöt
-
Molecular mechanisms affecting symbiotic effectiveness in rhizobium - legume symbioses
Österman-Udd, J. (Osallistuja), Lindström, K. (Principal Investigator), Mousavi, S. A. (Osallistuja), Paulin, L. (Osallistuja), Alatalo, R. M. E. (Osallistuja) & Laine, P. (Osallistuja)
01/01/2010 → 31/12/2013
Projekti: Tutkimusprojekti
Aktiviteetit
-
Next Generation Genomics 2018 Symposium & Workshop
Österman-Udd, J. (Osallistuja)
23 lokak. 2018 → 24 lokak. 2018Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
10th European Nitrogen Fixation Congress (ENFC)
Österman, J. (Posteriesitys)
2 syysk. 2012 → 5 syysk. 2012Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
Workshop “Genomics of Nitrogen Fixing Bacteria”
Österman, J. (Puhuja: esitelmän pitäjä)
2 syysk. 2012Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
The European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics
Österman, J. (Posteriesitys)
18 syysk. 2011 → 21 syysk. 2011Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
17th International Conference on Nitrogen Fixation
Österman, J. (Posteriesitys)
27 marrask. 2011 → 1 jouluk. 2011Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen