Valokuva Janne Ravantti
  • PL 65 (Viikinkaari 1)

    00014

    Suomi

  • Viikinkaari 5, Biocenter 2

    00790 Helsinki

    Suomi

19992020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Julkaisut

Suodatin
Artikkeli
2020

Adapting a phage to combat phage resistance

Laanto, E., Mäkelä, K., Hoikkala, V., Ravantti, J. & Sundberg, L-R., 29 toukokuuta 2020, julkaisussa : Antibiotics. 9, 6, 11 Sivumäärä, 291.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2019

Complete genome sequence of the fish pathogen Flavobacterium columnare strain B185, originating from Finland

Ravantti, J., Laanto, E., Papponen, P. & Sundberg, L-R., 5 joulukuuta 2019, julkaisussa : Microbiology Resource Announcements. 8, 49, e01285-19.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Ribosome profiles and riboproteomes of healthy and Potato virus A- and Agrobacterium-infected Nicotiana benthamiana plants

Eskelin, K., Varjosalo, M., Ravantti, J. & Makinen, K., 2019, julkaisussa : Molecular Plant Pathology. 20, 3, s. 392-409 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Structural comparison strengthens the higher-order classification of proteases related to chymotrypsin

Mönttinen, H. A. M., Ravantti, J. & Poranen, M., 17 toukokuuta 2019, julkaisussa : PLoS One. 14, 5, 16 Sivumäärä, 0216659.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

Complete genome sequence of an aquaculture associated phage FL-1 infecting Flavobacterium species

Laanto, E., Ravantti, J. J. & Sundberg, L-R., 2017, julkaisussa : Genome Announcements. 5, 23, e00014-17.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Long-term genomic coevolution of host-parasite interaction in the natural environment

Laanto, E., Hoikkala, V., Ravantti, J. & Sundberg, L-R., 24 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 8 Sivumäärä, 111.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Nucleic and Amino Acid Sequences Support Structure-Based Viral Classification

Sinclair, R. M., Ravantti, J. J. & Bamford, D. H., huhtikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Virology. 91, 8, 13 Sivumäärä, 02275.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Virus found in a boreal lake links ssDNA and dsDNA viruses

Laanto, E., Mantynen, S., De Colibus, L., Marjakangas, J., Gillum, A., Stuart, D. I., Ravantti, J. J., Huiskonen, J. T. & Sundberg, L-R., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114, 31, s. 8378-8383 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

Archaeal Haloarcula californiae Icosahedral Virus 1 highlights conserved elements in icosahedral membrane-containing DNA viruses from extreme environments

Demina, T., Pietilä, M. K., Svirskaite, J., Ravantti, J. J., Atanasova, N. S., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., 2016, julkaisussa : mBio. 7, 4, 12 Sivumäärä, e00699-16.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Common structural core of three-dozen residues reveals intersuperfamily relationships

Mönttinen, H. A. M., Ravantti, J. J. & Poranen, M. M., 2016, julkaisussa : Molecular Biology and Evolution. 33, 7, s. 1697-1710 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The complete genome of a viable archaeum isolated from 123-million-year-old rock salt

Jaakkola, S. T., Pfeiffer, F., Ravantti, J. J., Guo, Q., Liu, Y., Chen, X., Ma, H., Yang, C., Oksanen, H. M. & Bamford, D. H., helmikuuta 2016, julkaisussa : Environmental Microbiology. 18, 2, s. 565-579 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

New enveloped dsRNA phage from freshwater habitat

Mäntynen, S., Laanto, E., Kohvakka, A., Poranen, M. M., Bamford, J. K. H. & Ravantti, J. J., toukokuuta 2015, julkaisussa : Journal of General Virology. 96, s. 1180-1189 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The use of phage FCL-2 as an alternative to chemotherapy against columnaris disease in aquaculture

Laanto, E., Bamford, J. K. H., Ravantti, J. J. & Sundberg, L-R., 2015, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 6, 829, 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2014

Automated structural comparisons clarify the phylogeny of the right-hand-shaped polymerases

Mönttinen, H. A. M., Ravantti, J. J., Stuart, D. I. & Poranen, M. M., 2014, julkaisussa : Molecular Biology and Evolution. 31, 10, s. 2741-2752 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2013

Automatic comparison and classification of protein structures

Ravantti, J., Bamford, D. & Stuart, D. I., heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Structural Biology. 183, 1, s. 47-56 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Plate tectonics of virus shell assembly and reorganization in phage phi8, a distant relative of mammalian reoviruses

El Omari, K., Sutton, G., Ravantti, J. J., Zhang, H., Walter, T. S., Grimes, J. M., Bamford, D. H., Stuart, D. I. & Mancini, E. J., 2013, julkaisussa : Structure. 21, 8, s. 1384-1395 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2012

Evidence for a Non-Catalytic Ion-Binding Site in Multiple RNA-Dependent RNA Polymerases

Mönttinen, H. A. M., Ravantti, J. J. & Poranen, M. M., 2012, julkaisussa : PLoS One. 7, 7, s. e40581 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2010

An Ancient Mechanism for Splicing Control: U11 snRNP as an Activator of Alternative Splicing

Verbeeren, J., Niemelä, E., Turunen, J., Will, C. L., Ravantti, J., Luehrmann, R. & Frilander, M. J., 2010, julkaisussa : Molecular Cell. 37, 6, s. 821-833 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2009

Geminiviruses: a tale of a plasmid becoming a virus

Krupovic, M., Ravantti, J. J. & Bamford, D. H., 2009, julkaisussa : BMC Evolutionary Biology. 9, 112, 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Insights into the pre-initiation events of bacteriophage phi6 RNA-dependent RNA polymerase: towards the assembly of a productive binary complex

Sarin, L. P., Poranen, M. M., Lehti, N. M., Ravantti, J. J., Koivunen, M. R. L., Aalto, A. P., Van Dijk, A. A., Stuart, D. I., Grimes, J. M. & Bamford, D. H., 2009, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 37, 4, s. 1182-1192 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The single substitution I259T, conserved in the plasminogen activator pla of pandemic Yersinia pestis branches, enhances fibrinolytic activity

Haiko, J., Kukkonen, M., Ravantti, J. J., Westerlund-Wikström, B. & Korhonen, T. K., 2009, julkaisussa : Journal of Bacteriology. 191, 15, s. 4758-4766 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2008

Global transcriptional responses of Pseudomonas aeruginosa to phage PRR1 infection

Ravantti, J. J., Ruokoranta, T. M., Alapuranen, A. M. & Bamford, D. H., 2008, julkaisussa : Journal of Virology. 82, 5, s. 2324-2329 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2006

Complete genome sequence of the broad host range single-stranded RNA phage PRR1 places it in the Levivirus genus with characteristics shared with alloleviviruses

Ruokoranta, T. M., Grahn, A. M., Ravantti, J. J., Poranen, M. M. & Bamford, D. H., 2006, julkaisussa : Journal of Virology. 80, 18, s. 9326-9330 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Global changes in cellular gene expression during bacteriophage PRD1 infection

Poranen, M. M., Ravantti, J. J., Grahn, A. M., Gupta, R., Auvinen, P. & Bamford, D. H., 2006, julkaisussa : Journal of Virology. 80, 16, s. 8081-8088 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2005

A snapshot of viral evolution from genome analysis of the Tectiviridae family

Saren, A. M., Ravantti, J. J., Benson, S. D., Burnett, R. M., Paulin, L., Bamford, D. H. & Bamford, J. K. H., 2005, julkaisussa : Journal of Molecular Biology. 350, 3, s. 427-440 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Constituents of SH1, a novel lipid-containing virus infecting the halophilic euryarchaeon Haloarcula hispanica

Bamford, D., Ravantti, J., Rönnholm, G., Laurinavicius, S., Kukkaro, P., Dyall-Smith, M., Somerharju, P., Kalkkinen, N. & Bamford, J., 2005, julkaisussa : Journal of Virology. 79, 14, s. 9097-9107 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2003

Comparative analysis of bacterial viruses Bam35, infecting a gram-positive host, and PRD1, infecting gram-negative hosts, demonstrates a viral lineage.

Ravantti, J. J., Gaidelyte, A., Bamford, D. H. & Bamford, J. K. H., 1 syyskuuta 2003, julkaisussa : Virology. 313, 2, s. 401-414 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2000

Local average intensity-based method for identifying spherical particles in electron micrographs

Kivioja, T., Ravantti, J., Verkhovsky, A., Ukkonen, E. & Bamford, D., elokuuta 2000, julkaisussa : Journal of Structural Biology. 131, 2, s. 126-134 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

1999

A data mining approach for analyzing density maps representing macromolecular structures

Ravantti, J. J. & Bamford, D. H., 1999, julkaisussa : Journal of Structural Biology. 125, s. 216-222 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu