Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2025
Batched k-mer lookup on the Spectral Burrows-Wheeler Transform
Alanko, J., Biagi, E., Puglisi, S. & Mackenzie, J., 7 tammik. 2025, 2025 Proceedings of the Symposium on Algorithm Engineering and Experiments (ALENEX). Chowdhury, R., Berry, J., Hanauer, K. & Ren, B. (toim.). Society for Industrial and Applied Mathematics, s. 95 - 106 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
2024
Computing the LCP Array of a Labeled Graph
Alanko, J., Cenzato, D., Cotumaccio, N., Kim, S.-H., Manzini, G. & Prezza, N., 2024, Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (CPM). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 296).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2023
Longest Common Prefix Arrays for Succinct k-Spectra
Alanko, J. N., Biagi, E. & Puglisi, S. J., 2023, String Processing and Information Retrieval - 30th International Symposium, SPIRE 2023, Proceedings. Nardini, F. M., Pisanti, N. & Venturini, R. (toim.). Cham: Springer, s. 1-13 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 14240).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Small Searchable k-Spectra via Subset Rank Queries on the Spectral Burrows-Wheeler Transform
Alankot, J. N., Puglisit, S. J. & Vuohtoniemi, J. M., 2023, SIAM Conference on Applied and Computational Discrete Algorithms (ACDA23). Berry, J., Shmoys, D., Cowen, L. & Naumann, U. (toim.). Society for Industrial and Applied Mathematics, s. 225-236 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Subset Wavelet Trees
Alanko, J. N., Biagi, E., Puglisi, S. J. & Vuohtoniemi, J. M., 19 heinäk. 2023, 21st International Symposium on Experimental Algorithms (SEA 2023). Georgiadis, L. (toim.). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 4:1-4:14 14 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics; Vuosikerta 265).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2022
Eulertigs: Minimum Plain Text Representation of k-mer Sets Without Repetitions in Linear Time
Schmidt, S. S. & Alanko, J., 2022, 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022). Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 2:1-2:21 (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 242).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Linear-time Minimization of Wheeler DFAs
Alanko, J., Cotumaccio, N. & Prezza, N., 2022, DCC 2022: 2022 DATA COMPRESSION CONFERENCE (DCC). Bilgin, A., Marcellin, M., Serra-Sagrista, J. & Storer, J. (toim.). IEEE, s. 53-62 10 Sivumäärä (IEEE Data Compression Conference).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2021
Algorithms and Complexity on Indexing Elastic Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Mäkinen, V., 30 marrask. 2021, 32nd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2021). Ahn, H.-K. & Sadakane, K. (toim.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 18 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 212).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2020
Regular Languages meet Prefix Sorting
Alanko, J., Prezza, N., Policriti, A. & D’Agostino, G., 2020, SODA '20: Proceedings of the Thirty-First Annual ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithm. Philadelphia: Society for Industrial and Applied Mathematics, s. 911–930Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
2019
Tunneling on Wheeler Graphs
Alanko, J., Gagie, T., Navarro, G. & Benkner, L. S., 2019, 2019 DATA COMPRESSION CONFERENCE (DCC). New York: IEEE, s. 122-131 10 Sivumäärä (IEEE Data Compression Conference).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2017
Greedy Shortest Common Superstring Approximation in Compact Space
Alanko, J. & Norri, T., 6 syysk. 2017, String Processing and Information Retrieval: 24th International Symposium, SPIRE 2017, Palermo, Italy, September 26-29, 2017, Proceedings. Fici, G., Sciortino, M. & Venturini, R. (toim.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 1-13 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 10508).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto