Johanna Kondelin

Julkaisut

Tutkimustuotoksia vuodessa 2010 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2021

• 20 Artikkeli
• 1 Väitöskirja

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2021

  No evidence of EMAST in whole genome sequencing data from 248 colorectal cancers

  Kondelin, J., Martin, S., Katainen, R., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Koskensalo, S., Böhm, J., Mecklin, J-P., Cajuso, T., Hänninen, U. A., Välimäki, N., Ravantti, J., Rajamäki, K., Palin, K. & Aaltonen, L. A., heinäk. 2021, julkaisussa: Genes, Chromosomes & Cancer. 60, 7, s. 463-473 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2019

  Association analyses identify 31 new risk loci for colorectal cancer susceptibility

  PRACTICAL Consortium, Law, P. J., Timofeeva, M., Fernandez-Rozadilla, C., Palin, K., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Eriksson, J. G., Jousilahti, P., Ripatti, S., Palotie, A., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Aaltonen, L. A., Rissanen, H., Salomaa, V., & 3 muutaBöhm, J., Mecklin, J-P. & Pukkala, E., 14 toukok. 2019, julkaisussa: Nature Communications. 10, 15 Sivumäärä, 2154.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Impact of constitutional TET2 haploinsufficiency on molecular and clinical phenotype in humans

  Kaasinen, E., Kuismin, O., Rajamäki, K., Ristolainen, H., Aavikko, M., Kondelin, J., Saarinen, S., Berta, D. G., Katainen, R., Hirvonen, E. A. M., Karhu, A., Taira, A., Tanskanen, T., Alkodsi, A., Taipale, M., Morgunova, E., Franssila, K., Lehtonen, R., Mäkinen, M., Aittomäki, K., & 15 muutaPalotie, A., Kurki, M., Pietiläinen, O., Hilpert, M., Saarentaus, E., Niinimäki, J., Junttila, J., Kaikkonen, K., Vahteristo, P., Skoda, R. C., Seppänen, M. R. J., Eklund, K. K., Taipale, J., Kilpivaara, O. & Aaltonen, L. A., 19 maalisk. 2019, julkaisussa: Nature Communications. 10, 17 Sivumäärä, 1252.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Novel insights into the genetic background of microsatellite unstable colorectal cancer

  Kondelin, J., 2019, Helsinki : [J. Kondelin]. 92 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma

  Open access

• Retrotransposon insertions can initiate colorectal cancer and are associated with poor survival

  Cajuso, T., Sulo, P., Tanskanen, T., Katainen, R., Taira, A., Hanninen, U. A., Kondelin, J., Forsstrom, L., Valimaki, N., Aavikko, M., Kaasinen, E., Ristimaki, A., Koskensalo, S., Lepisto, A., Renkonen-Sinisalo, L., Seppala, T., Kuopio, T., Bohm, J., Mecklin, J-P., Kilpivaara, O., & 3 muutaPitkanen, E., Palin, K. & Aaltonen, L. A., 6 syysk. 2019, julkaisussa: Nature Communications. 10, 9 Sivumäärä, 4022.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2018

  Comprehensive evaluation of coding region point mutations in microsatellite-unstable colorectal cancer

  Kondelin, J., Salokas, K., Saarinen, L., Ovaska, K., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M., Hamberg, J., Liu, X., Yadav, L., Gylfe, A. E., Cajuso, T., Hänninen, U. A., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Tanskanen, T., Aavikko, M., Taipale, M., Taipale, J., & 17 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Koskensalo, S., Böhm, J., Mecklin, J-P., Ongen, H., Dermitzakis, E. T., Kilpivaara, O., Vahteristo, P., Turunen, M., Hautaniemi, S., Tuupanen, S., Karhu, A., Välimäki, N., Varjosalo, M., Pitkänen, E. & Aaltonen, L. A., 2018, julkaisussa: EMBO molecular medicine. 10, 9, 20 Sivumäärä, e8552.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer

  Palin, K., Pitkänen, E., Turunen, M., Sahu, B., Pihlajamaa, P., Kivioja, T., Kaasinen, E., Välimäki, N., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Aavikko, M., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., van den Berg, L., Kondelin, J., Tanskanen, T., Katainen, R., Grau, M., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M., & 20 muutaTaira, A., Sulo, P., Hartonen, T., Dave, K., Schmierer, B., Botla, S., Sokolova, M., Vähärautio, A., Gladysz, K., Ongen, H., Dermitzakis, E., Bramsen, J. B., Orntoft, T. F., Andersen, C. L., Ristimäki, A., Lepistö, A., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Taipale, J. & Aaltonen, L. A., 10 syysk. 2018, julkaisussa: Nature Communications. 9, 9 Sivumäärä, 3664.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Genome-wide association study and meta-analysis in Northern European populations replicate multiple colorectal cancer risk loci

  Tanskanen, T., van den Berg, L., Valimaki, N., Aavikko, M., Ness-Jensen, E., Hveem, K., Wettergren, Y., Lindskog, E. B., Tonisson, N., Metspalu, A., Silander, K., Orlando, G., Law, P. J., Tuupanen, S., Gylfe, A. E., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Kondelin, J., Sarin, A-P., Pukkala, E., & 40 muutaJousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A., Jarvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Tenesa, A., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J., Jenkins, M. A., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F. R., Casey, G., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P., Houlston, R. S., Palin, K. & Aaltonen, L. A., 1 helmik. 2018, julkaisussa: International Journal of Cancer. 142, 3, s. 540-546 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2017

  Comprehensive Evaluation of Protein Coding Mononucleotide Microsatellites in Microsatellite-Unstable Colorectal Cancer

  Kondelin, J., Gylfe, A. E., Lundgren, S., Tanskanen, T., Hamberg, J., Aavikko, M., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Jarvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Aaltonen, L. A. & Pitkanen, E., 1 elok. 2017, julkaisussa: Cancer Research. 77, 15, s. 4078-4088 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Mendelian randomisation implicates hyperlipidaemia as a risk factor for colorectal cancer

  Rodriguez-Broadbent, H., Law, P. J., Sud, A., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Ripatti, S., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Palotie, A., & 36 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Passarelli, M. N., Figueiredo, J. C., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Tomlinson, I. P., Dunlop, M. G. & Houlston, R. S., 15 kesäk. 2017, julkaisussa: International Journal of Cancer. 140, 12, s. 2701-2708 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

• Pro-inflammatory fatty acid profile and colorectal cancer risk: A Mendelian randomisation analysis

  May-Wilson, S., Sud, A., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A., & 34 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Böhm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Fisher, D., Kerr, R., Kerr, D., Passarelli, M. N., Figueiredo, J. C., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Tomlinson, I. P., Dunlop, M. G. & Houlston, R. S., lokak. 2017, julkaisussa: European Journal of Cancer. 84, s. 228-238 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2016

  Mendelian randomisation analysis strongly implicates adiposity with risk of developing colorectal cancer

  Jarvis, D., Mitchell, J. S., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Kaprio, J., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., & 37 muutaPalotie, A., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Farrington, S. M., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Taipale, J., Aaltonen, L. A., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P. & Houlston, R. S., 12 heinäk. 2016, julkaisussa: British Journal of Cancer. 115, 2, s. 266-272 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Variation at 2q35 (PNKD and TMBIM1) influences colorectal cancer risk and identifies a pleiotropic effect with inflammatory bowel disease

  Orlando, G., Law, P. J., Palin, K., Tuupanen, S., Gylfe, A., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Kaprio, J., Eriksson, J. G., Rissanen, H., Knekt, P., Pukkala, E., Jousilahti, P., Salomaa, V., Ripatti, S., Palotie, A., & 37 muutaJärvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Bohm, J., Mecklin, J-P., Al-Tassan, N. A., Palles, C., Martin, L., Barclay, E., Tenesa, A., Farrington, S., Timofeeva, M. N., Meyer, B. F., Wakil, S. M., Campbell, H., Smith, C. G., Idziaszczyk, S., Maughan, T. S., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Buchanan, D. D., Win, A. K., Hopper, J., Jenkins, M., Lindor, N. M., Newcomb, P. A., Gallinger, S., Conti, D., Schumacher, F., Casey, G., Taipale, J., Cheadle, J. P., Dunlop, M. G., Tomlinson, I. P., Aaltonen, L. A. & Houlston, R. S., 1 kesäk. 2016, julkaisussa: Human Molecular Genetics. 25, 11, s. 2349-2359 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2015

  3 '-UTR poly(T/U) repeat of EWSR1 is altered in microsatellite unstable colorectal cancer with nearly perfect sensitivity

  Kondelin, J., Tuupanen, S., Gylfe, A. E., Aavikko, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Andersen, C. L., Vahteristo, P., Pitkanen, E. & Aaltonen, L. A., syysk. 2015, julkaisussa: Familial Cancer. 14, 3, s. 449-453 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer

  Katainen, R., Dave, K., Pitkänen, E., Palin, K., Kivioja, T., Valimaki, N., Gylfe, A. E., Ristolainen, H., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Kondelin, J., Tanskanen, T., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Kaasinen, E., Kilpivaara, O., Tuupanen, S., Enge, M., & 2 muutaTaipale, J. & Aaltonen, L. A., 1 heinäk. 2015, julkaisussa: Nature Genetics. 47, 7, s. 818-+

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2014

  Exome sequencing reveals frequent inactivating mutations in ARID1A, ARID1B, ARID2 and ARID4A in microsatellite unstable colorectal cancer

  Julkaisun otsikon käännös: Exome sequencing reveals frequent inactivating mutations in ARID1A, ARID1B, ARID2 and ARID4A in microsatellite unstable colorectal cancerCajuso Pons, T., Hänninen, U. A., Kondelin, J., Gylfe, A. E., Tanskanen, T., Katainen, R., Pitkanen, E., Ristolainen, H., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Bohm, J., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Jarvinen, H., Tuupanen, S., Kilpivaara, O. & Vahteristo, P., 1 elok. 2014, julkaisussa: International Journal of Cancer. 135, 3, s. 611-623 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Identification of 33 candidate oncogenes by screening for base-specific mutations

  Tuupanen, S., Hanninen, U. A., Kondelin, J., von Nandelstadh, P., Cajuso, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Tanskanen, T., Ristolainen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Andersen, C. L., Taipale, M., Taipale, J., Vahteristo, P., Lehti, K., Pitkanen, E. & Aaltonen, L. A., 14 lokak. 2014, julkaisussa: British Journal of Cancer. 111, 8, s. 1657-1662 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2013

  Eleven Candidate Susceptibility Genes for Common Familial Colorectal Cancer

  Gylfe, A. E., Katainen, R., Kondelin, J., Tanskanen, T., Cajuso Pons, T., Hänninen, U., Taipale, J., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Kilpivaara, O., Pitkänen, E., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Karhu, A. & Aaltonen, L. A., 18 lokak. 2013, julkaisussa: PLoS Genetics. 9, 10, 8 Sivumäärä, e1003876.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Identification of Candidate Oncogenes in Human Colorectal Cancers With Microsatellite Instability

  Gylfe, A. E., Kondelin, J., Turunen, M., Ristolainen, H., Katainen, R., Pitkänen, E., Kaasinen, E., Rantanen, V., Tanskanen, T., Varjosalo, M., Lehtonen, H., Palin, K., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Ristimäki, A., Kilpivaara, O., & 4 muutaTuupanen, S., Karhu, A., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., syysk. 2013, julkaisussa: Gastroenterology. 145, 3, s. 540-+ 26 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2011

  High frequency of TTK mutations in microsatellite-unstable colorectal cancer and evaluation of their effect on spindle assembly checkpoint

  Niittymaki, I., Gylfe, A., Laine, L., Laakso, M., Lehtonen, H. J., Kondelin, J., Tolvanen, J., Nousiainen, K., Pouwels, J., Jarvinen, H., Nuorva, K., Mecklin, J-P., Makinen, M., Ristimaki, A., Orntoft, T. F., Hautaniemi, S., Karhu, A., Kallio, M. J. & Aaltonen, L. A., 2011, julkaisussa: Carcinogenesis. 32, 3, s. 305-311 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
• 2010

  Somatic mutations and germline sequence variants in patients with familial colorectal cancer

  Gylfe, A. E., Sirkiä, J., Ahlsten, M., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Karhu, A. & Aaltonen, L. A., 2010, julkaisussa: International Journal of Cancer. 127, 12, s. 2974-2980 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu