Valokuva: Jon Atherton
Julkinen CV - 12/3/18

Jon Atherton

 https://orcid.org/0000-0002-7670-2928

  • Viikinkaari 1, Biocentre 3

    00790 Helsinki

    Suomi

  • PL 27 (Latokartanonkaari 7)

    00014

    Suomi

20132019
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Current areas of research interest:

  • Remote sensing:
  1. Chlorophyll fluorescence, from leaf to landscape
  2. Field and automated canopy spectroscopy 
  3. Physiological optics (e.g. Photochemical Reflectance Index)
  4. Physically-based modelling techniques
  • Ecophysiology:
  1. Photosynthesis
  2. BVOCs
  • Modern software and hardware in Environmental Science:
  1. Data science and associated languages (Python numerical stack and R)
  2. Affordable instrumentation development (e.g. RPI) 
  3. Promoting up-to-date software practice (e.g. version control)

I am instructing on "Environmental Data Science" which covers some of the practical aspects of working with data in R and Python. We use Jupyter notebooks for course content which you can find on our lab's github:

https://github.com/OptPhotLab/EnvDataSciNotebooks

https://github.com/OptPhotLab/EnvDataSciNotebooksPython

 

 

Keywords

  • 1172 Ympäristötiede
  • 4112 Metsätiede

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Julkaisut 2013 2019

  • 12 Artikkeli
  • 7 Konferenssiartikkeli
  • 1 Väitöskirja

A mechanistic model of winter stem diameter dynamics reveals the time constant of diameter changes and the elastic modulus across tissues and species

Lindfors, L., Atherton, J., Riikonen, A. & Holtta, T., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Agricultural and Forest Meteorology. 272, s. 20-29 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Diurnal and Seasonal Solar Induced Chlorophyll Fluorescence and Photosynthesis in a Boreal Scots Pine Canopy

Nichol, C. J., Drolet, G., Porcar-Castell, A., Wade, T., Sabater, N., Middleton, E. M., MacLellan, C., Levula, J., Mammarella, I., Vesala, T. & Atherton, J., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Remote Sensing. 11, 3, 22 Sivumäärä, 273.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Leaf-Level Spectral Fluorescence Measurements: Comparing Methodologies for Broadleaves and Needles

Rajewicz, P. A., Atherton, J., Alonso, L. & Porcar-Castell, A., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Remote Sensing. 11, 5, 20 Sivumäärä, 532.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Nocturnal Light Emitting Diode Induced Fluorescence (LEDIF): A new technique to measure the chlorophyll a fluorescence emission spectral distribution of plant canopies in situ

Atherton, J., Liu, W. & Porcar-Castell, A., 27 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Remote Sensing of Environment.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Simulating solar-induced chlorophyll fluorescence in a boreal forest stand reconstructed from terrestrial laser scanning measurements

Liu, W., Atherton, J., Mõttus, M., Gastellu-Etchegorry, J-P., Malenovský, Z., Raumonen, P., Åkerblom, M., Mäkipää, R. & Porcar-Castell, A., 2 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Remote Sensing of Environment.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Projektit 2014 2016

  • 1 Päättynyt

ATM: 'Ilmakehäntutkimuksen huippuyksikkö - molekyyli- ja biologisista prosesseista globaaliin ilmastotutkimukseen'

Bäck, J., Vesala, T., Mäki, M., Heinonsalo, J., Ojala, A., Matkala, L., Kaukolehto, M., Häme (o.s. Häkkinen), S., Nikinmaa, E., Kulmala, L., Hölttä, T., Paljakka, T. V. S., Salmon, Y., Aalto, J., Porcar-Castell, A., Kieloaho, A., Hari, P., Lintunen, A., Korhonen, J., Pihlatie, M., Pumpanen, J., Juurola, E., Olascoaga Gracia, B., Riikonen, A., Mäkelä, A., Kolari, P., Schiestl-Aalto, P., Peltomaa, E., Berninger, F., Taipale, D., Joensuu, J., Kasurinen, V., Dominguez Carrasco, M., Vanhatalo, A., Lindfors, L., Köster, K., Köster, E., Atherton, J. & Rissanen, K.

01/01/2014 → 31/12/2016

Projekti: Tutkimusprojekti

Aktiviteetit 2013 2017

Remote Sensing (Lehti)

Jon Atherton (Arvioitsija (reviewer))
2017

Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi

Birmingham Institute of Forest Research Free-Air Carbon Dioxide Enrichment (FACE) experiment

Jon Atherton (Vieraileva tutkija)
18 syyskuuta 2017 → 23 syyskuuta 2017

Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypit › Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon

Upscaling the Optical Properties of leaves to model their contribution to canopy light use efficiency and carbon assimilation over vertical and horizontal profiles of spectral irradiance

T Matthew Robson (Ohjaaja), Jonathan Mark Atherton (Ohjaaja), Anu Heikkilä (Ohjaaja)
1 huhtikuuta 2017 → 1 syyskuuta 2021

Aktiviteetti: Tutkimustyypit › Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja

Advanced Analysis of Atmospheric Processes and Feedbacks and Atmosphere-Biosphere Interactions (Winter school 2015)

Jon Atherton (Osallistuja)
16 maaliskuuta 2015 → 26 maaliskuuta 2015

Aktiviteetti: Muiden aktiviteettien tyypit › Tyypit: Muut aktiviteetit - Muu opetustyö

Annual seminar of The Centre of Excellence in Atmospheric Science - From Molecular and Biological processes to The Global Climate

Jon Atherton (Puhuja: esitelmän pitäjä)
22 syyskuuta 2015

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen