Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus
Novel purification and analysis methods for macromolecular complexes.
Asymmetric flow field-flow fractionation (AF4) is a subtechnique of field-flow fractionation. It separates molecules according to differences in their diffusion coefficients, which in turn reflects their size and shape. AF4 is applicable to a broad range of molecular masses and sizes and molecules with sizes that range from 2 nm to 50 μm can be analyzed.
My research focuses on the development of optimized methods to purify large macromolecular complexes such as ribosomes (a complex of 80 ribosomal proteins and three ribosomal RNAs), viral assemblies as well as intact viruses of various sizes and morphologies. Furthermore, my research aims to use AF4 for detailed analysis of large macromolecular complexes. This can be achieved by analyzing complexes that have been treated with various chemicals, enzymes, temperatures etc.
I am combining the AF4 purification to other methods that include monolithic anion chromatography and centrifugation methods to enable large-scale purification of macromolecular complexes to detailed biochemical and structural analysis.
My previous research included studies on two different plant viruses (Cocksfoot mottle virus and Potato virus A) and applied projects on heterologous protein production in plants.
Tieteenalat
- 1183 Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
Analysis and purification of ssRNA and dsRNA molecules using asymmetrical flow field flow fractionation
Eskelin , K., Lampi, M., Coustau, C., Imani, J., Kogel, K.-H. & Poranen, M., 8 marrask. 2022, julkaisussa: Journal of Chromatography. A. 1683, 15 Sivumäärä, 463525.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Archaeal viruses: production of virus particles and vesicle-like viruses and purification using asymmetrical flow field-flow fractionation
Eskelin , K. & Oksanen, H. M., 21 syysk. 2022, Methods in Molecular Biology - Archaea: methods and protocols. Ferreira-Cerca, S. (toim.). Humana New York, NY, s. 449-465 (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 2522).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Inline-tandem purification of viruses from cell lysate by agarose-based chromatography
Andersson Schönn, M., Eskelin , K., Bamford, D. H., Poranen, M., Unoson, C. & Oksanen, H. M., 1 maalisk. 2022, julkaisussa: Journal of Chromatography. B. 1192, 9 Sivumäärä, 123140.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Native RNA purification method for small RNA molecules based on asymmetrical flow field-flow fractionation
Levanova, A., Lampi, M., Kalke, K., Hukkanen, V., Poranen, M. & Eskelin , K., helmik. 2022, julkaisussa: Pharmaceuticals. 15, 2, 22 Sivumäärä, 261.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Isolating, culturing, and purifying viruses with a focus on bacterial and archaeal viruses
Eskelin , K. & Oksanen, H. M., 2021, Encyclopedia of Virology. Zuckerman, M. & Bamford, D. (toim.). 4 toim. Oxford: Academic Press, Vuosikerta 1. s. 162-174Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Ensyklopedia-artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Integrated Structural Biology Infrastructure-European Research Infrastructure Consortium (Instruct-ERIC) / Consortium FINStruct and Instruct-ERIC
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja), Eskelin , K. (Osallistuja), Lehtiö, L. (Principal Investigator), Salminen, T. A. (Osallistuja) & Papageorgiou, A. C. (Osallistuja)
01/01/2022 → 31/12/2026
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
SusCrop - ERA-NET, Target-specific RNA-based bioprotectants for sustainable crop production in a changing climate
Heinlein, M. (Projektinjohtaja), Poranen, M. (Projektinjohtaja), Kogel, K.-H. (Principal Investigator), Patel, A. (Principal Investigator), Eskelin , K. (osallistuja), Korhonen, S. M. (osallistuja), Levanova, A. (osallistuja), Westerholm, T. T. (osallistuja) & Zaytseva, A. (osallistuja)
01/06/2021 → 31/05/2025
Projekti: Ministeriön rahoitus
-
Instruct-HiLIFE: Integrated structural cell biology research infrastructure platform, HiLIFE, University of Helsinki
Poranen, M. (Projektinjohtaja), Butcher, S. (Principal Investigator), Iwai, H. (Principal Investigator), Kajander, T. (Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja) & Eskelin , K. (Osallistuja)
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Muu projekti
-
Structural Biology Finland (FINStruct) & Instruct-ERIC Centre FI / Research Infrastructure Roadmap 2021-2024
Butcher, S. (Principal Investigator), Poranen, M. (Co-Principal Investigator), Kajander, T. (Co-Principal Investigator), Iwai, H. (Co-Principal Investigator), Varjosalo, M. (Co-Principal Investigator), Lehtiö, L. (Co-Principal Investigator), Rouvinen, J. (Co-Principal Investigator), Salminen, T. A. (Co-Principal Investigator), Papageorgiou, A. C. (Co-Principal Investigator), Oksanen, H. M. (Osallistuja) & Eskelin , K. (Osallistuja)
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekti: Suomen Akatemia: Tutkimusinfrastruktuuri
-
Integrated Structural Biology Infrastructure / Consortium: Instruct-Suomi
Butcher, S. (Projektinjohtaja), Kajander, T. (Principal Investigator), Lehtiö, L. (Principal Investigator), Määttä, J. A. E. (Principal Investigator), Papageorgiou, A. (Principal Investigator), Rouvinen, J. (Principal Investigator), Salminen, T. (Principal Investigator), Iwai, H. (Principal Investigator), Poranen, M. (Principal Investigator), Eskelin , K. (Osallistuja) & Oksanen, H. M. (Osallistuja)
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Muu projekti
Aktiviteetit
-
Robert Mildner
Eskelin , K. (Isäntä)
26 syysk. 2022 → 28 syysk. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Non-academic visit at UH
-
Membranes (Lehti)
Eskelin , K. (Arvioitsija (reviewer))
lokak. 2022Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Miguel Cantero Riviejo
Oksanen, H. M. (Isäntä), Poranen, M. (Isäntä) & Eskelin , K. (Isäntä)
tammik. 2022 → heinäk. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Catarina Paiva
Oksanen, H. M. (Isäntä), Butcher, S. (Isäntä), Poranen, M. (Isäntä) & Eskelin , K. (Isäntä)
elok. 2022 → marrask. 2022Aktiviteetti: Vierailijan isännöinnin tyypit › Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
-
Structural Biology Platform FINStruct and Instruct-ERIC Centre Finland 2022 Annual Meeting, November 30th, 2022 in
Eskelin , K. (Puhuja)
30 marrask. 2022Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypit › Suullinen esitys
Laitteet
-
FINStruct Structural Biology Finland
Butcher, S. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut), Poranen, M. (Muut), Eskelin , K. (Muut), Kajander, T. (Muut), Permi, P. (Muut), Lehtiö, L. (Muut), Rouvinen, J. (Muut), Salminen, T. A. (Muut) & Papageorgiou, A. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Coordination office
-
Instruct-ERIC Structural Biology European Research Infrastructure Centre Finland
Butcher, S. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut), Poranen, M. (Muut), Eskelin , K. (Muut), Permi, P. (Muut), Varjosalo, M. (Muut), Lehtiö, L. (Muut) & Rouvinen, J. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Coordination office
-
Instruct-HiLIFE Biomolecular Complex Purification Core Facility (Biocomplex)
Poranen, M. M. (Johtaja), Oksanen, H. M. (Muut) & Eskelin, K. J. (Muut)
Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekuntaLaitteistot/tilat: Keskuspalveluyksikkö