Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Olen tutkijatohtori Tietojenkäsittelytieteen laitoksella. Tutkimukseni liittyy merkkijonoalgoritmeihin ja bioinformatiikkaan. Erityisesti työskentelen tällä hetkellä genomin kokoamiseen liittyvien ongelmien parissa.

Keywords

  • 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
  • Merkkijonoalgoritmit
  • Bioinformatiikka

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut 2003 2019

Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs

Salmela, L., Walve, R., Rivals, E. & Ukkonen, E., 15 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 6, s. 799-806 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Disentangled long-read de Bruijn graphs via optical maps

Alipahani, B., Salmela, L., Puglisi, S. J., Muggli, M. & Boucher, C., 2017, 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, WABI 2017. Schwartz, R. & Reinert, K. (toim.). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1:1-1:14 14 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics; Vuosikerta 88).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Variant genotyping with gap filling

Walve, R., Salmela, L. & Mäkinen, V., 8 syyskuuta 2017, julkaisussa : PLoS One. 12, 9, 12 Sivumäärä, e0184608.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Colib'read on galaxy: a tools suite dedicated to biological information extraction from raw NGS reads

Le Bras, Y., Collin, O., Monjeaud, C., Lacroix, V., Rivals, E., Lemaitre, C., Miele, V., Sacomoto, G., Marchet, C., Cazaux, B., El Aabidine, A. Z., Salmela, L., Alves-Carvalho, S., Andrieux, A., Uricaru, R. & Peterlongo, P., 11 helmikuuta 2016, julkaisussa : GigaScience. 5, 14 Sivumäärä, 9.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Gap Filling as Exact Path Length Problem

Salmela, L., Sahlin, K., Mäkinen, V. & Tomescu, A. I., 9 toukokuuta 2016, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 23, 5, s. 347-361 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Palkinnot

Award for best paper submitted to HiTSeq 2010

Leena Salmela (Vastaanottaja), 10 heinäkuuta 2010

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Aktiviteetit 2009 2018

ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics (Tapahtuma)

Leena Salmela (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
20 elokuuta 201723 elokuuta 2017

Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypitKäsikirjoitusten vertaisarviointi

University of Florida

Leena Salmela (Vieraileva tutkija)
24 elokuuta 20171 syyskuuta 2017

Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypitAkateeminen vierailu toiseen organisaatioon

International Workshop on Combinatorial Algorithms

Leena Salmela (Järjestäjätoimikunnan puheenjohtaja)
17 elokuuta 201619 elokuuta 2016

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

International Symposium on String Processing and Information Retrieval (Tapahtuma)

Leena Salmela (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
2016 → …

Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypitKäsikirjoitusten vertaisarviointi

Colorado State University

Leena Salmela (Vieraileva tutkija)
23 huhtikuuta 20165 toukokuuta 2016

Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypitAkateeminen vierailu toiseen organisaatioon

Lehdistö/media