Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus
Olen tutkijatohtori Tietojenkäsittelytieteen laitoksella. Tutkimukseni liittyy merkkijonoalgoritmeihin ja bioinformatiikkaan. Erityisesti työskentelen tällä hetkellä genomin kokoamiseen liittyvien ongelmien parissa.
Tieteenalat
- 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
- Merkkijonoalgoritmit
- Bioinformatiikka
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Julkaisut
-
Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs
Salmela, L., Walve, R., Rivals, E. & Ukkonen, E., 15 maalisk. 2017, julkaisussa: Bioinformatics. 33, 6, s. 799-806 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Disentangled long-read de Bruijn graphs via optical maps
Alipahani, B., Salmela, L., Puglisi, S. J., Muggli, M. & Boucher, C., 2017, 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, WABI 2017. Schwartz, R. & Reinert, K. (toim.). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1:1-1:14 14 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics; Vuosikerta 88).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Variant genotyping with gap filling
Walve, R., Salmela, L. & Mäkinen, V., 8 syysk. 2017, julkaisussa: PLoS One. 12, 9, 12 Sivumäärä, e0184608.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Colib'read on galaxy: a tools suite dedicated to biological information extraction from raw NGS reads
Le Bras, Y., Collin, O., Monjeaud, C., Lacroix, V., Rivals, E., Lemaitre, C., Miele, V., Sacomoto, G., Marchet, C., Cazaux, B., El Aabidine, A. Z., Salmela, L., Alves-Carvalho, S., Andrieux, A., Uricaru, R. & Peterlongo, P., 11 helmik. 2016, julkaisussa: GigaScience. 5, 14 Sivumäärä, 9.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Gap Filling as Exact Path Length Problem
Salmela, L., Sahlin, K., Mäkinen, V. & Tomescu, A. I., 9 toukok. 2016, julkaisussa: Journal of Computational Biology. 23, 5, s. 347-361 15 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Palkinnot
-
Award for best paper submitted to HiTSeq 2010
Salmela, Leena (Vastaanottaja), 10 heinäk. 2010
Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset
Aktiviteetit
-
ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics (Tapahtuma)
Leena Salmela (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
20 elok. 2017 → 23 elok. 2017Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
University of Florida
Leena Salmela (Vieraileva tutkija)
24 elok. 2017 → 1 syysk. 2017Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypit › Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon
-
International Workshop on Combinatorial Algorithms
Leena Salmela (Järjestäjätoimikunnan puheenjohtaja)
17 elok. 2016 → 19 elok. 2016Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypit › Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
-
International Symposium on String Processing and Information Retrieval (Tapahtuma)
Leena Salmela (Ohjelmatoimikunnan jäsen)
2016 → …Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypit › Käsikirjoitusten vertaisarviointi
-
Colorado State University
Leena Salmela (Vieraileva tutkija)
23 huhtik. 2016 → 5 toukok. 2016Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypit › Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon