Ei valokuvaa Liisa Holm

Liisa Holm

  • Suomi

  • PL 56 (Viikinkaari 5)

    00014

    Suomi

20032021

Research output per year

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tieteenalat

  • 1184 Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut

Novel NGS Pipeline for Virus Discovery from a Wide Spectrum of Hosts and Sample Types

Pljusnin, I., Kant, R., Jääskeläinen, A. J., Sironen, T., Holm, L., Vapalahti, O. & Smura, T., 2020, julkaisussa : bioRxiv : the preprint server for biology .

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen

Benchmarking fold detection by DaliLite v.5

Holm, L., 15 joulukuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 24, s. 5326-5327 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

DALI and the persistence of protein shape

Holm, L., 13 marraskuuta 2019, julkaisussa : Protein Science. 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Novel comparison of evaluation metrics for gene ontology classifiers reveals drastic performance differences

Plyusnin, I., Holm, L. & Toronen, P., marraskuuta 2019, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 15, 11, 27 Sivumäärä, 1007419.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens

Zhou, N., Jiang, Y., Bergquist, T. R., Lee, A. J., Kacsoh, B. Z., Crocker, A. W., Lewis, K. A., Georghiou, G., Nguyen, H. N., Hamid, M. N., Davis, L., Dogan, T., Atalay, V., Rifaioglu, A. S., Dalkiran, A., Atalay, R. C., Zhang, C., Hurto, R. L., Freddolino, P. L., Zhang, Y. & 147 muuta, Bhat, P., Supek, F., Fernandez, J. M., Gemovic, B., Perovic, V. R., Davidovic, R. S., Sumonja, N., Veljkovic, N., Asgari, E., Mofrad, M. R. K., Profiti, G., Savojardo, C., Martelli, P. L., Casadio, R., Boecker, F., Schoof, H., Kahanda, I., Thurlby, N., McHardy, A. C., Renaux, A., Saidi, R., Gough, J., Freitas, A. A., Antczak, M., Fabris, F., Wass, M. N., Hou, J., Cheng, J., Wang, Z., Romero, A. E., Paccanaro, A., Yang, H., Goldberg, T., Zhao, C., Holm, L., Törönen, P., Medlar, A. J., Zosa, E., Borukhov, I., Novikov, I., Wilkins, A., Lichtarge, O., Chi, P-H., Tseng, W-C., Linial, M., Rose, P. W., Dessimoz, C., Vidulin, V., Dzeroski, S., Sillitoe, I., Das, S., Lees, J. G., Jones, D. T., Wan, C., Cozzetto, D., Fa, R., Torres, M., Vesztrocy, A. W., Rodriguez, J. M., Tress, M. L., Frasca, M., Notaro, M., Grossi, G., Petrini, A., Re, M., Valentini, G., Mesiti, M., Roche, D. B., Reeb, J., Ritchie, D. W., Aridhi, S., Alborzi, S. Z., Devignes, M-D., Koo, D. C. E., Bonneau, R., Gligorijevic, V., Barot, M., Fang, H., Toppo, S., Lavezzo, E., Falda, M., Berselli, M., Tosatto, S. C. E., Carraro, M., Piovesan, D., Rehman, H. U., Mao, Q., Zhang, S., Vucetic, S., Black, G. S., Jo, D., Suh, E., Dayton, J. B., Larsen, D. J., Omdahl, A. R., McGuffin, L. J., Brackenridge, D. A., Babbitt, P. C., Yunes, J. M., Fontana, P., Zhang, F., Zhu, S., You, R., Zhang, Z., Dai, S., Yao, S., Tian, W., Cao, R., Chandler, C., Amezola, M., Johnson, D., Chang, J-M., Liao, W-H., Liu, Y-W., Pascarelli, S., Frank, Y., Hoehndorf, R., Kulmanov, M., Boudellioua, I., Politano, G., Di Carlo, S., Benso, A., Hakala, K., Ginter, F., Mehryary, F., Kaewphan, S., Bjorne, J., Moen, H., Tolvanen, M. E. E., Salakoski, T., Kihara, D., Jain, A., Smuc, T., Altenhoff, A., Ben-Hur, A., Rost, B., Brenner, S. E., Orengo, C. A., Jeffery, C. J., Bosco, G., Hogan, D. A., Martin, M. J., O'Donovan, C., Mooney, S. D., Greene, C. S., Radivojac, P. & Friedberg, I., 19 marraskuuta 2019, julkaisussa : Genome Biology. 20, 1, 23 Sivumäärä, 244.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Projektit

HiLIFE Grand Challenge "Combatting microbial drug resistance"

Hiltunen, T. & Holm, L.

01/10/2018 → 30/09/2021

Projekti: Tutkimusprojekti

HiLIFE Grand Challenge consortium "Combatting antimicrobial resistance"

Hiltunen, T. & Holm, L.

01/10/2018 → 30/09/2021

Projekti: Muu projekti

HiLIFE Grand Challenge: Combatting Antimicrobial Drug Resistance

Virta, M. & Holm, L.

01/10/2018 → 31/12/2021

Projekti: Tutkimusprojekti

Bugsy: Leikkausalueen patogeenien tunnistus metagenomiikan menetelmiä hyödyntäen (Bugsy)

Kankainen, M., Holm, L., Kankuri, E., Varmanen, P., Savijoki, K., Ojala, T., Medlar, A. & Vuola, J.

01/09/2015 → 31/08/2019

Projekti: Tutkimusprojekti

Glanville fritillary butterfly genomics and genetics

Lehtonen, R., Ahola, V., Somervuo, P. J., Frilander, M., Auvinen, P., Paulin, L. & Holm, L.

02/02/2009 → 30/03/2013

Projekti: Tutkimusprojekti

Aktiviteetit

  • 4 Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa
  • 1 Jäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä
  • 1 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon

Science Foundation Ireland (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Jäsen)
16 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli arviointiryhmässä

Tieteellinen valtuuskunta (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Jäsen)
1 tammikuuta 2011 → 30 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Suomen Akatemia (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Puheenjohtaja)
14 lokakuuta 2011

Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Knut och Alice Wallenbergs stiftelse (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Asiantuntija)
12 joulukuuta 2011

Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

ESF (Ulkoinen yksikkö)

Liisa Holm (Jäsen)
2009 → 2012

Aktiviteetti: Jäsenyystyypit › Jäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa