Valokuva: Marko Virta
  • PL 56 (Viikinkaari 9)

    00014

    Suomi

  • Viikinkaari 5, Biocenter 2

    00790 Helsinki

    Suomi

19942019
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Julkaisut 1994 2019

Suodatin
Artikkeli
2019

Antibiotic Resistance Genes in the Human-Impacted Environment: A One Health Perspective

Tiedje, J. M., Wang Fang, Manaia, C. M., Virta, M., Sheng Hongjie, Ma Liping, Zhang Tong & Topp, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Pedosphere. 29, 3, s. 273-282 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Antibiotic resistance in European wastewater treatment plants mirrors the pattern of clinical antibiotic resistance prevalence

Parnanen, K. M. M., Narciso-da-Rocha, C., Kneis, D., Berendonk, T. U., Cacace, D., Thi Thuy Do, Elpers, C., Fatta-Kassinos, D., Henriques, I., Jaeger, T., Karkman, A., Luis Martinez, J., Michael, S. G., Michael-Kordatou, I., O'Sullivan, K., Rodriguez-Mozaz, S., Schwartz, T., Sheng, H., Sorum, H., Stedtfeld, R. D. & 6 muutaTiedje, J. M., Varela Della Giustina, S., Walsh, F., Vaz-Moreira, I., Virta, M. & Manaia, C. M., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Science Advances. 5, 3, 10 Sivumäärä, 9124.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Field-compatible protocol for detecting tetracyclines with bioluminescent bioreporters without pipetting steps

Muurinen, J., Pasupulate, A., Lappalainen, J. & Virta, M., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Luminescence. 34, 2, s. 249-254 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Occurrence of sul and tet(M) genes in bacterial community in Japanese marine aquaculture environment throughout the year: Profile comparison with Taiwanese and Finnish aquaculture waters

Suzuki, S., Nakanishi, S., Tamminen, M., Yokokawa, T., Sato-Takabe, Y., Ohta, K., Chou, H-Y., Muziasari, W. I. & Virta, M., 15 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Science of the Total Environment. 669, s. 649-656 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Unraveling the diversity of sedimentary sulfate-reducing prokaryotes (SRP) across Tibetan saline lakes using epicPCR

Qin, H., Wang, S., Feng, K., He, Z., Virta, M. P. J., Hou, W., Dong, H. & Deng, Y., 4 toukokuuta 2019, julkaisussa : Microbiome. 7, 12 Sivumäärä, 71.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Construction and characterization of synthetic bacterial community for experimental ecology and evolution

Cairns, J., Jokela, R., Hultman, J., Tamminen, M., Virta, M. & Hiltunen, T., 14 elokuuta 2018, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 9, 12 Sivumäärä, 312.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Ecology determines how low antibiotic concentration impacts community composition and horizontal transfer of resistance genes

Cairns, J., Ruokolainen, L., Hultman, J., Tamminen, M., Virta, M. & Hiltunen, T., 19 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Communications Biology. 1, 8 Sivumäärä, 35.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent

Hultman, J., Tamminen, M., Pärnänen, K., Cairns, J., Karkman, A. & Virta, M., 1 huhtikuuta 2018, julkaisussa : FEMS Microbiology Ecology. 94, 4, s. 1-10 10 Sivumäärä, fiy038.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Maternal gut and breast milk microbiota affect infant gut antibiotic resistome and mobile genetic elements

Pärnänen, K., Karkman, A., Hultman, J., Lyra, C., Bengtsson-Palme, J., Larsson, D. G. J., Rautava, S., Isolauri, E., Salminen, S., Kumar, H., Satokari, R. & Virta, M., 24 syyskuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 11 Sivumäärä, 3891.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

Antibiotic Resistance in Aquatic Systems: Editorial

Suzuki, S., Pruden, A., Virta, M. & Zhang, T., 25 tammikuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 8, 3 Sivumäärä, 14.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Comparison of Metals and Tetracycline as Selective Agents for Development of Tetracycline Resistant Bacterial Communities in Agricultural Soil

Song, J., Rensing, C., Holm, P. E., Virta, M. & Brandt, K. K., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Environmental Science & Technology. 51, 5, s. 3040-3047 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Development of Highly Sensitive, Automatized and Portable Whole-Cell Hg Biosensor Based on Environmentally Relevant Microorganisms

Rijavec, T., Zrimec, J., Oven, F., Virsek, M. K., Somrak, M., Podlesek, Z., Gostincar, C., Leedjarv, A., Virta, M., Tratnik, J. S., Horvat, M. & Lapanje, A., 2017, julkaisussa : Geomicrobiology Journal. 34, 7, s. 596-605 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Influence of Manure Application on the Environmental Resistome under Finnish Agricultural Practice with Restricted Antibiotic Use

Muurinen, J., Stedtfeld, R., Karkman, A., Parnanen, K., Tiedje, J. & Virta, M., 6 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Environmental Science & Technology. 51, 11, s. 5989-5999 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The Resistome of Farmed Fish Feces Contributes to the Enrichment of Antibiotic Resistance Genes in Sediments below Baltic Sea Fish Farms

Muziasari, W. I., Pitkänen, L. K., Sorum, H., Stedtfeld, R. D., Tiedje, J. M. & Virta, M., 6 tammikuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 7, 10 Sivumäärä, 2137.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

Aquaculture changes the profile of antibiotic resistance and mobile genetic element associated genes in Baltic Sea sediments

Muziasari, W. I., Parnanen, K., Johnson, T. A., Lyra, C., Karkman, A. V., Stedtfeld, R. D., Tamminen, M., Tiedje, J. M. & Virta, M., huhtikuuta 2016, julkaisussa : FEMS Microbiology Ecology. 92, 4, 7 Sivumäärä, fiw052.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Evaluating the mobility potential of antibiotic resistance genes in environmental resistomes without metagenomics

Pärnänen, K., Karkman, A., Tamminen, M., Lyra, C., Hultman, J., Paulin, L. & Virta, M., 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, s. 35790 9 Sivumäärä, 35790.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

"Every Gene Is Everywhere but the Environment Selects": Global Geolocalization of Gene Sharing in Environmental Samples through Network Analysis

Fondi, M., Karkman, A., Tamminen, M. V., Bosi, E., Virta, M., Fani, R., Alm, E. & McInerney, J. O., toukokuuta 2016, julkaisussa : Genome Biology and Evolution. 8, 5, s. 1388-1400 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fertilizing with Animal Manure Disseminates Antibiotic Resistance Genes to the Farm Environment

Ruuskanen, M., Muurinen, S. J., Meierjohan, A., Pärnänen, K. M. M., Tamminen, M. V., Lyra, C. D., Kronberg, L. & Virta, M. P. J., 2016, julkaisussa : Journal of Environmental Quality. 45, 2, s. 488-493 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

High-throughput quantification of antibiotic resistance genes from an urban wastewater treatment plant

Karkman, A., Johnson, T. A., Lyra, C., Stedtfeld, R. D., Tamminen, M., Tiedje, J. M. & Virta, M., maaliskuuta 2016, julkaisussa : FEMS Microbiology Ecology. 92, 3, 7 Sivumäärä, 014.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Massively parallel sequencing of single cells by epicPCR links functional genes with phylogenetic markers

Spencer, S. J., Tamminen, M. V., Preheim, S. P., Guo, M. T., Briggs, A. W., Brito, I. L., A Weitz, D., Pitkanen, L. K., Vigneault, F., Virta, M. P. J. & Alm, E. J., 2016, julkaisussa : ISME Journal. 10, 2, s. 427-436 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Seasonality of antibiotic prescriptions for outpatients and resistance genes in sewers and wastewater treatment plant outflow

Caucci, S., Karkman, A. V., Cacace, D., Rybicki, M., Timpel, P., Voolaid, V., Gurke, R., Virta, M. & Berendonk, T. U., toukokuuta 2016, julkaisussa : FEMS Microbiology Ecology. 92, 5, 10 Sivumäärä, fiw060.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
2015

Discovery of bacterial polyhydroxyalkanoate synthase (PhaC)-encoding genes from seasonal Baltic Sea ice and cold estuarine waters

Pärnänen, K., Karkman, A., Virta, M., Eronen-Rasimus, E. & Kaartokallio, H., tammikuuta 2015, julkaisussa : Extremophiles. 19, 1, s. 197-206 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Single gene-based distinction of individual microbial genomes from a mixed population of microbial cells

Tamminen, M. & Virta, M., 11 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 6, 10 Sivumäärä, 195.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2014

Abundances of Tetracycline, Sulphonamide and Beta-Lactam Antibiotic Resistance Genes in Conventional Wastewater Treatment Plants (WWTPs) with Different Waste Load

Laht, M., Karkman, A., Voolaid, V., Ritz, C., Tenson, T., Virta, M. & Kisand, V., 1 elokuuta 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 8, 8 Sivumäärä, 103705.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Monitoring bisphenol A and estrogenic chemicals in thermal paper with yeast-based bioreporter assay

Rajasarkka, J., Koponen, J., Airaksinen, R., Kiviranta, H. & Virta, M., 2014, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 406, 23, s. 5695-5702 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Sulphonamide and Trimethoprim Resistance Genes Persist in Sediments at Baltic Sea Aquaculture Farms but Are Not Detected in the Surrounding Environment

Muziasari, W. I., Managaki, S., Pärnänen, K. M. M., Karkman, A., Lyra, C., Tamminen, M., Suzuki, S. & Virta, M., 20 maaliskuuta 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 3, 7 Sivumäärä, 92702.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2013

Bioluminescent Yeast Assay for Detection of Organotin Compounds

Kabiersch, G., Rajasarkka, J., Tuomela, M., Hatakka, A., Virta, M. & Steffen, K., 2013, julkaisussa : Analytical Chemistry. 85, 12, s. 5740-5745 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Biotests for environmental quality assessment of composted sewage sludge

Kapanen, A., Vikman, M., Rajasarkka, J., Virta, M. & Itavaara, M., 2013, julkaisussa : Waste Management. 33, 6, s. 1451-1460 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Characterization of a Bisphenol A Specific Yeast Bioreporter Utilizing the Bisphenol A-Targeted Receptor

Rajasärkkä, J. & Virta, M., 2013, julkaisussa : Analytical Chemistry. 85, 21, s. 10067–10074 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2012

Antibiootit, ihminen ja ympäristö

Virta, M., 2012, julkaisussa : Ympäristö ja terveys. 43, 2, s. 58-60 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliAmmatillinen

Impact of copper and zinc on the growth of saprotrophic fungi and extracellular enzyme activities.

Hartikainen, E. S., Lankinen, P., Rajasärkkä, J., Koponen, H., Virta, M., Hatakka, A. & Kähkönen, M., 2012, julkaisussa : Boreal Environment Research. 17, s. 210-218

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Impact of copper and zinc on the growth of saprotrophic fungi and the production of extracellular enzymes

Hartikainen, E. S., Lankinen, P., Rajasärkkä, J., Koponen, H., Virta, M., Hatakka, A. & Kähkönen, M. A., 29 kesäkuuta 2012, julkaisussa : Boreal Environment Research. 17, 3-4, s. 210-218 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Large scale analysis of plasmids relationships through gene sharing networks.

Tamminen, M., Virta, M., Fani, R. & Fondi, M., 2012, julkaisussa : Molecular Biology and Evolution. 29, 4, s. 1225-1240

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2011

Analytical strategies for improving the robustness and reproducibility of bioluminescent microbial bioreporters

Roda, A., Roda, B., Cevenini, L., Michelini, E., Mezzanotte, L., Reschiglian, P., Hakkila, K. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 401, s. 201-211 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cd-Specific Mutants of Mercury-Sensing Regulatory Protein MerR, Generated by Directed Evolution

Hakkila, K. M., Nikander, P. A., Junttila, S. M., Lamminmaki, U. J. & Virta, M. P., 2011, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 77, s. 6215-6224 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cold Temperature Decreases Bacterial Species Richness in Nitrogen-Removing Bioreactors Treating Inorganic Mine Waters

Karkman, A., Mattila, K., Tamminen, M. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Biotechnology and Bioengineering (Print). 108, s. 2876-2883 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Developing a Compound-Specific Receptor for Bisphenol A by Directed Evolution of Human Estrogen Receptor alpha

Rajasarkka, J., Hakkila, K. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Biotechnology and Bioengineering (Print). 108, s. 2526-2534 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Differences in bacterial community composition in Baltic Sea sediment in response to fish farming

Tamminen, M., Karkman, A., Corander, J., Paulin, L. G. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Aquaculture. 313, s. 15-23

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Fate of bisphenol A during treatment with the litter-decomposing fungi Stropharia rugosoannulata and Stropharia coronilla

Kabiersch, G., Rajasarkka, J., Ullrich, R., Tuomela, M., Hofrichter, M., Virta, M., Hatakka, A. & Steffen, K., 2011, julkaisussa : Chemosphere. 83, s. 226-232 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Fish farming affects the abundance and diversity of the mercury resistance gene merA in marine sediments

Pitkänen, L., Tamminen, M., Hynninen, A., Karkman, A., Corander, J., Kotilainen, A. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Microbes & Environments. 26, 3, s. 205-211

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Luminescent bacteria-based sensing method for methylmercury specific determination

Rantala, A., Utriainen, M., Kaushik, N., Virta, M., Valimaa, A-L. & Karp, M., 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, s. 1041-1049 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Miniaturisation of the luminescent yeast cell based assay for Estrogen receptor ligands

Rajasärkkä, J. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 14, 1, s. 47-54 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Miniaturization of a Panel of High Throughput Yeast-Cell-Based Nuclear Receptor Assays in 384-and 1536-Well Microplates

Rajasärkkä, J. & Virta, M., tammikuuta 2011, julkaisussa : Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 14, 1, s. 47-54 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Tetracycline Resistance Genes Persist at Aquaculture Farms in the Absence of Selection Pressure

Tamminen, M., Karkman, A., Lohmus, A., Muziasari, W. I., Takasu, H., Wada, S., Suzuki, S. & Virta, M., 2011, julkaisussa : Environmental Science & Technology. 45, 2, s. 386–391 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The effect of nickel contamination on the growth of litter-decomposing fungi, extracellular enzyme activities and toxicity in soil

Lankinen, P., Kähkönen, M., Rajasärkkä, J., Virta, M. & Hatakka, A., 2011, julkaisussa : Boreal Environment Research. 16, s. 229-239

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2010

Improving the sensitivity of bacterial bioreporters for heavy metals

Hynninen, A., Tonismann, K. & Virta, M., 2010, julkaisussa : Bioengineered Bugs. 1, 2, s. 132-138 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Single gene-based distinction of individual microbial genomes from a mixed population of microbial cells

Tamminen, M. & Virta, M., 2010, julkaisussa : Nature Precedings. 13.8.2010

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

2009

An efflux transporter PbrA and a phosphatase PbrB cooperate in a lead-resistance mechanism in bacteria

Hynninen, A., Touzé, T., Pitkänen, L., Mengin-Lecreulx, D. & Virta, M. P. J., 2009, julkaisussa : Molecular Microbiology. 74, 2, s. 384-394 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Development of a denaturation/renaturation-based production process for ferritin nanoparticles

Jääskeläinen, A., Soukka, T., Lamminmäki, U., Korpimäki, T. & Virta, M., 2009, julkaisussa : Biotechnology and Bioengineering (Print). 102, 4, s. 1012-1024 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2008

A sensitive recombinant cell-based bioluminescent assay for detection of androgen-like compounds

Michelini, E., Cevenini, L., Mezzanotte, L., Leskinen, P., Virta, M., Karp, M. & Roda, A., 2008, julkaisussa : Nature Protocols. 3, 12, s. 1895 - 1902

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu